Résumé projet de thèse CIFRE CREAVIA-UMR BIOEPAR

Henri.Seegers

Description

Projet de thèse CIFRE Date limite de réception des candidatures : 30 novembre 2010 Titre Valeur informative du budget-temps de la vache laitière pour la détection précoce des troubles de santé et des événements de reproduction Laboratoire d’accueil UMR ONIRIS - INRA « Biologie, Epidémiologie et Analyse de Risques en Santé Animale » http://www.angers-nantes.inra.fr/unites_de_recherche_unites_experimentales/bio_agression_epidemiologie_et_analyse_de_risque_bioepar Entreprise partenaire et financeur Bourse CIFRE – Entreprise CREAVIA http://www.creavia.fr/ Informations sur le dispositif CIFRE Association Nationale de la Recherche et de la Technologie http://www.anrt.asso.fr/fr/espace_cifre/accueil.jsp Personnes-contact pour renseignements – acte de candidature Henri Seegers : [e-mail] ; ; 02 40 68 76 47 Jean-Michel Philipot : [e-mail] ; 02 99 87 95 95 Début souhaité de la thèse Janvier-février 2011 Diplôme et compétences initiales attendues chez le doctorant Master2 (ou équivalence) en agronomie/zootechnie/sciences animales ou vétérinaires et, si possible (mais non exigé), expérience de premier niveau en bases de données/ traitement de l’information /statistiques bayésiennes Ou Master2 (ou équivalence) en sciences du traitement de l’information /systèmes d’information et, si possible (mais non exigé), expérience partielle en problématique analogue ou proche de celle envisagée dans la thèse ...

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Projet de thèse CIFRE Date limite de réception des candidatures : 30 novembre 2010 Titre Valeur informative du budgettemps de la vache laitière pour la détection précoce des troubles de santé et des événements de reproduction Laboratoire d’accueil UMR ONIRIS  INRA « Bioloie, Epidémioloie et Analse de Risques en Santé Animale » htt ://www.an ers-nantes.inra.fr/unites_de_recherche_unites_ex erimentales/bio_a ression_e idemiolo ie_et_anal se_de_ris ue_bioe ar Entreprise partenaire et financeur Bourse CIFRE – Entreprise CREAVIA htt ://www.creavia.fr/ Informations sur le disositif CIFRE Association Nationale de la Recherche et de la Technoloie htt ://www.anrt.asso.fr/fr/es ace_cifre/accueil.s Personnescontact pour renseignements – acte de candidature Henri Seegers :henri.seegers@onirisnantes.fr; ; 02 40 68 76 47 JeanMichel Philipot :[e-mail]; 02 99 87 95 95 Début souhaité de la thèse Janvierfévrier 2011 Diplôme et compétences initiales attendues chez le doctorant Master2 (ou équivalence)en agronomie/zootechnie/sciences animales ou vétérinaires et, si possible (mais non exigé), expérience de premier niveau en bases de données/ traitement de l’information /statistiques bayésiennes Ou Master2 (ou équivalence) en sciences du traitement de l’information /systèmes d’information et, si possible (mais non exigé), expérience partielle en problématique analogue ou proche de celle envisagée dans la thèse Dans tous les cas: goût suffisant pour les bases de données et statistiques et les interactions avec les acteurs professionnels Composition du dossier de candidature CV détaillé + lettre de motivation montrant l’adéquation de la candidature + pdf de mémoire de master2 ou autre Résumé du su et En élevae bovin laitier, le temps consacré à la surveillance du troupeau diminue tandis que le nombre de vaches par troupeau augmente. En conséquence, l’efficacité de la conduite de la reproduction diminue et la prévalence cumulée des troubles de santé au mente, notamment du fait de leur détection trop tardive. C’est pourquoi les s stèmesd’information aptes à détecter des événements de reproduction et de santé, ou au minimum, àénérer des alertes fiables deviennent une réponse pertinente aux besoins, vu le développement de nouvelles technologies prometteuses les supportant. Plusieurs approches ont en effet été en a ées au plan des techniquesénérant l’information de base relative à l’indicateur ou aux indicateurs utilisé(s) pour le monitoring et la détection. Récemment, il a été montré que les indicateurs décrivant le budgettemps des femelles bovines (notamment le niveau d’activitéénérale et le temps passé à ruminersont modifiés en cas de maladie nutritionnelle, de maladie infectieuse, de vêlage, et lors de l’œstrus. La thèse proposée vise donc, en s’appuyant, entre autres, sur l’information générée pour chaque vache du troupeau, par un outil collectant ces 2 informationsactivité énéraleet temps passé à rumineren continu, à construire et évaluer des algorithmes permettent de détecter ou générer des alertes pertinentes pour les événements de santé et de reproduction. Schématiquement, les étapes prévues sont:i)de jeux de production données dans des fermes expérimentales avec collecte en parallèle des événements de reproduction et santé avec une bonne pression et qualité d’observation; ii)des données pour identifier les profils de signal et analyse signatures d’intérêt et formulation des algorithmes d’exploitation;iii)de la valeur informative en évaluation conditions de terrain par tests en élevaes commerciaux. Il est attendu aussi de mobiliser d’autres informations disponibles dans les exploitations laitières, sur le troupeau et les individus, qui apporteraient une plus value informative, et de contribuer ainsi à l’avancement d’un concept de monitoring global pour ces exploitations. Encadrement de la thèse Henri Seegers, Professeur & Nathalie Bareille, Maître de conférences HDR, ONIRIS Ecole doctorale / Etablissement d’inscription EDBiologie Santé Nantes Angers, Inscription en thèse à ONIRISNantes