BIOSTATISTIQUES AVANCEES

Description

Master Biologie Intégrative et Physiologie
ère1 année
BIOSTATISTIQUES
AVANCEES
Yves Desdevises
Laboratoire Arago, Banyuls-sur-Mer (www.obs-banyuls.fr)
04 68 88 73 13
[e-mail]
http://desdevises.free.fr
http://www.edu.upmc.fr/sdv/desdevises
2009-2010PLAN
1. Rappels : données, tests, plans d’expérience, distributions
2. Comparaison de 2 groupes : variances et moyennes
3. Comparaison de plus de 2 groupes : test d’homogénéité des
variances, analyse de variance à 1 et 2 facteurs
4. ANOVA à 2 facteurs avec répétitions, ANOVA hiérarchique
5. Relations entre variables : corrélation, régression simple et
multiple
6. Analyse de covariance
7. Analyse multivariable : matrices d’associations, groupement
8. Analyse multivariable : ordination, test de Mantel
9. Analyse de survieQuelques références
Générales•
rdSokal RR & Rohlf FJ. 1995. Biometry. 3 Edition, Freeman and •
co., New York.
rdZar JH. 1996. Biostatistical Analysis. 3 Edition, Prentice-Hall •
International, Inc.
Frontier S, Davoult D, Gentilhomme V & Lagadeuc Y. 2001. •
Statistique pour les sciences de la vie et de l’environnement.
Cours et exercices corrigés. Dunod.
Triola MM & Triola MF. 2006. Biostatistics for the Biological •
and Health Science. Pearson. Traduction française en 2009 :
Biostatistiques pour les sciences de la vie et de la santé.
Samuels ML & Witmer JA. 2003. Statistics for the Life •
rdSciences. 3 Edition. Prentice Hall, Pearson.
Blair RC & Taylor RA. 2008. Biostatistics for the Health ...

Sujets

• Dérogation (zonage)
• Population des provinces italiennes
• Loisy
• Transformation complexe
• Variable aléatoire
• Test d'hypothèse

Informations

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Extrait

Master Biologie Intégrative et Physiologie 1 ère année

BIOSTATISTIQUES AVANCEES

Yves Desdevises Laboratoire Arago, Banyuls-sur-Mer (www.obs-banyuls.fr) 04 68 88 73 13 [e-mail] http://desdevises.free.fr http://www.edu.upmc.fr/sdv/desdevises

2009-2010

1.

2.

3.

4.

5.

6.

7.

8.

9.

PLAN Rappels : données, tests, plans dexpérience, distributions

Comparaison de 2 groupes : variances et moyennes

Comparaison de plus de 2 groupes : test dhomogénéité des variances, analyse de variance à 1 et 2 facteurs

ANOVA à 2 facteurs avec répétitions,ANOVA hiérarchique

Relations entre variables : corrélation, régression simple et multiple

Analyse de covariance

Analyse multivariable : matrices dassociations, groupement

Analyse multivariable : ordination, test de Mantel

Analyse de survie

uel références  Générales  Sokal RR & Rohlf FJ. 1995. Biometry. 3 rd  andEdition, Freeman co., New York.  Zar JH. 1996. Biostatistical Analysis. 3 rd Edition, Prentice-Hall International, Inc.   Gentilhomme D, & Lagadeuc V 2001. Y.Frontier S, Davoult Statistique pour les sciences de la vie et de lenvironnement. Cours et exercices corrigés. Dunod.  Triola MM & Triola MF. 2006. Biostatistics for the Biological and Health Science. Pearson.Traduction française en 2009 : Biostatistiques pour les sciences de la vie et de la santé.   JA. WitmerSamuels ML & for the Life 2003. Statistics Sciences. 3 rd Edition. Prentice Hall, Pearson.  Blair RC & Taylor for the Health RA. 2008. Biostatistics Sciences. Prentice Hall, Pearson.

 Simplifiées   2003. Choosing and Using Statistics.A BiologistsDytham C. Guide. 2 nd Edition. Blackwell Publishing.   2005. Statistics Explained.McKillup S. University Cambridge Press.   2008. Statisticsvan Emden H. Biologists. Terrified for Blackwell Publishing.

 Plus spécialisées  Legendre P & Legendre L. Ecology. 1998. Numerical 2 nd  English Edition. Development in Environmental Modelling, 20. Elsevier.   in Ecology. CambridgeUnderwood AJ. 1997. Experiments University Press.

 

     

Quelques logiciels

R (www.r-project.org)

Page web de Pierre Legendre (www.bio.umontreal.ca/ legendre)

Statdisk (http://statdisk.com/)

XLStat (www.xlstat.com)

Minitab (www.minitab.com)

JMP (www.jmp.com)

Statistica (www.statsoft.com)

SAS (www.sas.com/technologies/analytics/stat)

1. INTRODUCTION RAPPELS

  Etude scientifique des donnéesStatistique : numériques décrivant les variations naturelles  Biatsotsiteuqi  Application à la biologie  Biometry   décider de la méthode à utiliserImportant : savoir  naîtconBienohtésedlermsensioco:itnd dutilisation, limitations, ...  Penser aux statistiquesavantde collecter les données

Utilité et utilisation des statisti en biolo ie  Description Vue synthétique et rationnelle des données

  Inférence  Economie de travail par létude déchantillons représentatifs  Décision  Test dhypothèse

Pourquoi utiliser les statistiques en biologie?

  des résultats expérimentauxBiologie : incertitude ou des observations  Variabilité génétique  Variabilité de réaction individuelle  Variabilité du développement

Définitions

 Objet = observation = élément = unité déchantillonnage : élément sur lequel on mesure des caractéristiques (variables)

  ensembleEchantillon : des objets  Population cible : ensemble des objets visés par une étude scientifique  Population statistique : ensemble des objets représentés par léchantillon. Cest sur elle que se fait linférence

 Variable = descripteur = facteur = trait : caractéristique mesurée ou observée sur les objets. Ex : longueur, température, ...  Variable dépendante (Y) = réponse  Variable indépendante (X) = explicative   dun processusVariable aléatoire : résultat aléatoire, valeur précise inconnue avant la mesure

  par lexpérimentateur, décidéeVariable contrôlée : erreur = mesure seulement