Iwr1 directs RNA polymerase II nuclear import [Elektronische Ressource] / Elmar Geza Czeko

Elmar Czeko

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• Publié par: ludwig-maximilians-universitat_munchen
• Publié le: 01 janvier 2010
• Nombre de lectures: 41
• Poids de l'ouvrage: 8 Mo

Extrait

Dissertation  zur  Erlangung  des  Doktorgrades  der  Fakultät  für  Chemie  
und  Pharmazie  der  Ludwig -­‐Maximilians -­‐Universität  München  
 
 
 
 
 
 
Iwr1  directs  RNA  polymerase  II  
nuclear  import  
 
 
 
 
 
 
 
Elmar  Geza   Czeko  
aus  
Temeschburg,  Rumänien  
 
2010  
   
 
Erng  
Diese  Dissertation  wurde  im  Sinne  von  §13  Abs.  ro3  mdoetri  oPnsordnung  vom  
29.  Januar  1998  von  Herrn  Prof.  Dr.  Patrick  Cramer  be  treut.
 
 
Ehrenwörtliche  Versicherung  
Diese  Dissertation  wurde  selbständig  und  ohne  unerlaubte  Hilf  e  erarbeitet.
 
München,  am  14.  Dezember  2010  
 
 
 
 
_______________________________ ________  
Elmar  Czeko  
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Dissertation  eingereich  14.t  a  mDezember  2010  
 
1.  Gutachter:  Prof.  Dr.  Patrick  Cr   amer
2.  Gutachter:  Prof.  Dr.  Dietmar  M  artin
 
Mündliche  Prüfung  am  10.  Februar  2011  
I  
uräkl  
Acknowledg ements  
 
Life  science  research  is  indeed  a  socWiialth  osucti  eoncteh.e  rs,  nobody  would  s  ucceed.
Therefore,  I  was  glad  to  spend  my  PhD  thesis  in  Patrick  Cramer’ths  el  aboGenreat  oCreyn  teat  r  in  
Munich  –  undoubtedly  a  social  plac  e.
I  want  to  thank  ,y  Paotru ick ,  not  only  for  letting  me  contribute  to  this  environment  over  
the  last  years,  but  also  for  learning  from  you  beyond  science.  The  way  you  are,    leading  your  lab  is
as  I  thi  nbaks,ed  on  trus.  truTst  in  the  capabilities,  potential  and  motivationpl  oef.  yIo  uar  m  peo
confidentot  benefit  from  this  experience  in  my  future  profe  sThsainkona  lyo  lu  ifeo.r  giving  me  
complete  freedom  over  my  project,  for  the  chance  to  go  to  divers  seminars  and  conferences  and  
once  t  haove  the  honou  rer  ofpresentin  youg  as  a  speaker  at  a  workshop  in  Barcel  ona.
Dietmar ,  I  want  to  thank  you  for  your  ongoing  interest  in  my  project  as  well  as  for  your  
advice.  I  very  much  enjoyed  our  bike  e;  xcitu  rsision  just  a  pity  that  we  did  not  do  them  more  
frequently.  
For  my  projectgot  I    a  lotf    ado vice  and  help  from  people  in  o  Thur  anklab  .you:  Alan  for  
discussion  and  first  aid  crystallographic  processing  of  this  tiny  an  And   dretaswinn  efod   r  crystal.
having  the  right  feeling  about  -­‐ChItheP-­‐  abnionlity  of  Iwr1,  we  saved  a  lot  of  timeou  t  here  and  y
had  the  chance  to  bea  tfa  mtohe us  Struhl  labAn.s   elm  for  disuscsions  he, lp  with  cr-­‐yEMo  and  
computing:  You  have  the  bri,  dgNeumber  1.  Christian  –  whom  else–  for  extinguishing  the  fire  on  
my   bench.  Not   to   forget   the   talks   about   politics   and    tClhaudiea   ec  o(Bnloamttny. er)   for  
temporarily  sharing  the  enthusiasm  fo-­‐r  dilsotnagnce  run.  sClaudia  (Buchen)  for  keeping  the  lab  
chaos  at  ba  yElisa.beth  for  our  informal  group  meetings  and  your  unmatched  e  xGeperkrtis  fo er.  
parentalad   vic.e  Kerstin  (Maier)  forhe   lp  with  gene  expression  profiling  and  An  dye  fasotr  .finding  
a   way   back   from   Barcelona   against   all    odLaurednt s.  and  Martin  for   discussions  foandr  
challenging  questi.  oRinseke  forbe   stowing  some  coloupur  on  our  bay.  Sarah  forTB   P  and  TFIIB  
and  also  for  dihanng  over  the  b.  aStteonfan  (Benkert)  for  fermenting  this  slowly  growing  yeast  
strain  .Stefan  (Jennebach)  for    PI  oland  the  occasioqui nzal  question.  Tobias  foral   ways  sharing  
your  knowledge,  especially  when  I  was  new  to    tandh  ef  lora  bhelp  with  R/Biocucon todr.    
Also  I  want  to  thank  my  stuChdriestiannts  ,  Julia  and  Simon .  They  all  helped  me  to  
advance   my   project.   Even   more,   they   challenged   me   to   grow   into   the   responsibilities   of   a  
supervisor.  Christ,  I  iawnant  to  thank  you  for  your  interest  and  yiloitur  yr.eliab
In  additionth,  eor  people  from  the  Gene  Center  supporteThadnk  m  ey.o  u  Achim  for  the  
transcription  factor  comparisChorinstoph.e    for  introducing  me  to  the  fluorescent  microscope.  
Heidi  and  Lina  for   advice   on   yeast.   Also,   I   havAte  lanta to    tCookhank    from   the   MPI   of  
Biochemistry  for  kathreyopherin  proteins  and  for  thpreiv   ate  lecture  on  nuclear  t  raffic.
M einen   Eltern   und   meiner   Odaman  ke  ich   für   die   Unterstützung   während   meines  
Studiums   und   meiner   Auslandsaufenthaltein.e  mM  eVater   danke   ich   dafür,üh  zefritig  mein  
Interesse  für  Nwiatusrsenschaften  geweckt  zu  h  aben.
Nina ,  danke  für  Dein  Verständnis  und  Deinen  Rat.  Für  unsere  Familie  Ju.  Ulius n.  d  für
II    
Summary  
 
Pol  II  is  the  conserv-­‐suedbu  n1i2t  enzyme  that  transcribes  mRNA  from  pro-­‐cotediinng  
genes  in  t  nucheleus  of  eukaryotic  cells.  Whe  eresatsr  uctthure  and  function  o  II  f  Phoavle  been  
extensively  studied,  its  biogenesis  is  notod    welanld    utnheder  smteochanism  of  how  II    Piols  
imported  into  the  nucleus  remains  elusive.  This  work  establissehesrv  t ehda  tp  trohtee  cin  oInwr1  
specifically  binds    II  Pobletweeitn  s  two  largest  subuRpnbit1  sa  nd  Rpb2,  and  directs  its  nuclear  
import.  
Iwr1  was  previously  identified-­‐pur  inif