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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 336 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 7 Mo |
Extrait
THESE
Présentée à
L’UNIVERSITE BORDEAUX 1
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé
Par
Jawad MERHEJ
Pour obtenir le grade de
DOCTEUR
Discipline: Microbiologie
Mécanismes moléculaires contrôlant la biosynthèse de mycotoxines
par le champignon micromycète Fusarium graminearum
Soutenue le 10 décembre 2010, après avis de:
M. BRUEL Christophe Professeur Rapporteur
(Université Lyon 1)
M. LANGIN Thierry Directeur de Recherche
(INRA – Clermont Ferrand)
Devant la commision d’examen formée de:
M. BARREAU Christian Chargé de Recherche CNRS Directeur de thèse
M. COTTIN Patrick Professeur Bordeaux 1 Examinateur
M. NOEL Thierry Professeur Bordeaux 2
M. PUEL Olivier Ingénieur de Recherche INRA
Mon travail de thèse a été effectué au sein de l’Equipe des Mycotoxines, de l’Unité
MycSA (Mycologie et Sécurité Alimentaire), à l’Institut National de la Recherche
Agronomique (INRA) de Bordeaux. Ce travail a été réalisé dans le cadre d’une bourse
INRA - Région Aquitaine.
J’adresse mes remerciements les plus sincères à Christian BARREAU pour m’avoir
accordé sa confiance et pour avoir guidé cette recherche. Son accompagnement, ses conseils
avisés et sa disponibilité ont été précieux.
Je marque particulièrement ma profonde reconnaissance envers Florence FORGET pour
m’avoir accueilli au sein de son équipe. Ses encouragements et son soutien ont toujours été
présents au cours de ces années.
Je tiens à exprimer ma profonde gratitude à Kim-Hammond-Kosack , Directrice
adjointe de « Department of Plant Pathology and Microbiology – Rothamsted Research
Institute – UK », pour m’avoir donner l’opportunité de réaliser une partie de ce travail au
sein de son laboratoire. Je remercie sincèrement Martin Urban, chercheur à Rothamsted
Research Institute, pour ses conseils et sa disponibilité tout au long de mon séjour en
Angleterre.
Je remercie vivement Sonja Vorwerk , chercheur à « Febit GMBH – Allemagne », pour
la réalisation des expériences de « Microarrays ». Sa contribution s’est avérée déterminante
pour compléter ce travail.
Tous mes respects aux membres du jury, tout particulièrement Mr. Thierry LANGIN,
Directeur de recherche à l’INRA de clermont-Ferrand et Mr. Christophe BRUEL,
Professeur à l’université Lyon 1, qui m’ont fait l’honneur d’accepter d’évaluer mon travail
de thèse. J’espère être à la hauteur de leurs espérances.
Je remercie de tout coeur Vessela et Laetitia pour la sympathie qu’elles m’ont témoignées
durant mon séjour a MycSA. Leurs conseils scientifiques et techniques m’ont été
indispensables.
Un grand merci à Françoise, Marie-Noëlle, Christine et Gisèle pour leur aide dans les
différentes tâches quotidiennes. Merci également à l’ensemble du personnel de MycSA qui
m’a permis d’effectuer cette thèse dans de très bonnes et très agréables conditions de travail.
Tous mes remerciements vont également à Sébastien, Adeline, Denis, Carlos ainsi que
tous les stagiaires de MycSA, spécialement Sylvain, Laetitia et Ludovic qui ont contribué à
ce travail, pour leur amitié, leur bonne humeur et leur soutien qui m’ont permis de
travailler dans une ambiance des plus agréables. Publications Scientifiques
Articles en cours préparation
1- Merhej J, Richard-Forget F and Barreau C. Regulation of trichothecene production in
Fusarium: Recent advances and new insights Applied Microbiology and Biotechnology
(Revue bibliographique soumise pour publication).
2- Merhej J, Vorwerk S, Richard-Forget F, Barreau C. Genome-wide transcriptional
response to ambient pH and Pac1 regulatory factor in Fusarium graminearum.
(Article rédigé).
3- Merhej J, Saint-Felix L, Urban M, Richard-Forget F, Barreau C The velvet gene,
FgVe1, affects development and positively regulates trichothecene biosynthesis and
pathogenicity in Fusarium graminearum. (Article rédigé).
Article accepté
4- Merhej J, Richard-Forget F, Barreau C. The pH regulatory factor Pac1 regulates Tri
gene expression and trichothecene production in Fusarium graminearum. Fungal
Genetics and Biology. 2010. (accepté pour publication).
Article publié
5- Merhej J, Boutigny AL, Pinson-Gadais L, Richard-Forget F, Barreau C. Acidic pH as a
determinant of Tri gene expression and trichothecenes B biosynthesis in Fusarium
graminearum. 2010. Food Additives Contaminnants. 27(5):710-7.
Communications Scientifiques
Communication orale
1- Merhej J, Boutigny AL, Pinson-Gadais L, Forget-Richard F, Barreau C. Biosynthesis of
trichothecenes B in Fusarium graminearum is controlled by the Pac1 pH regulatory
factor. International Society of Mycotoxicology Conference. Tulln-Autriche, 9-11 Sept
2009.
Présentation poster
2- Merhej J, Vorwerk S, Cheng Y, Forget-Richard F, Barreau C. Analyse du transcriptome
des souches de Fusarium graminearum mutantes dans Pac1, le gène régulateur de
l’homéostasie du pH. Journée des Microbiologistes de l’INRA 2010. Futuroscope, 5 – 7
mai 2010.
3- Merhej J, Vorwerk S, Cheng Y, Forget-Richard F, Barreau C. Transcriptional analysis
of the response to extracellular pH changes in Fusarium graminearum Pac1 mutants
thand effect on trichothecenes B accumulation. Présentation poster. 10 European
Conference on Fungal Genetics. Leeuwenhorst - Pays-Bas, 29 mars - 1 avril 2010.
4- Merhej J, Forget-Richard F, Barreau C. Mécanismes de régulation de la production de
trichothécènes B chez Fusarium graminearum : Pac1, un nouveau régulateur
moléculaire pH-dépendant. Journées Jean Chevaugeon 2010. Aussois - France, 25 – 29
Janvier 2010.
Abréviations
ADN Acide désoxyribonucléique
ADNc ADN complémentaire
ADON Acétyldéoxynivalenol
ACN Acétonitrile
ARN Acide ribonucléique
CMC Carboxymethyl cellulose
DAD Diode Array Detector
DJ-PCR Double joint – Polymerase chain reaction
DON Déoxynivalenol
EC European Commission
ECD Electron Capture Detector
ESI Electrospray ionisation
FPP Farnésyl pyrophosphate
FX Fusarenone X
GFP Green Fluorescent Protein
GYEP Glucose Yeast Extract Peptone
HGT Horizontal gene transfer
HPLC High Performance Liquid Chromatography
NIV Nivalenol
PCR Polymerase Chain Reaction
PDA Potato Dextrose Agar
ppb Parties par billion
ppm Parties par million
rpm Rotation minute
RT Reverse Transcription
Taq Thermophillus aquaticus
TCT Trichothécène
TCT B Trichothécène de type B