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Modèles bayésiens et Campylobacter

22 pages
Campylobacter / poulet
Réseaux bayésiens
Approche statistique bayésienne
Jean- B aptiste D enis (Mi a / Mi aJ à Jouy )
Isabelle A lbert (Mi a / Mét @r isk à Par is)
ABARI – 14 oct obre 20 0 5
Campylobacter, réseaux bayésiens, approche statistique bayésienne. <1/22> contexte
● Groupe de travail Afssa dans le cadre du CES
microbiologie
● Groupe campylo autour de la thèse d'E. Grenier
● Isa belle Albert,
● Je an-B aptiste Denis,
● Emmanuel Grenier (I SAB ),
● Ju dith R ousseau (Paris- D auphine).
Campylobacter, réseaux bayésiens, approche statistique bayésienne. <2/22> PLA N
1. Campylobacter, campylobactérioses
2. Ré seaux bayésiens
– Généralités
– Modélisation pour la ca mpylobactériose
3. Statistique bayésienne
– Généralités
– Traitement de la cha îne m odélisée
4.L ogiciels
Campylobacter, réseaux bayésiens, approche statistique bayésienne. <3/22> (1) C ampylobacter / campylobactérioses
Campylobacter, réseaux bayésiens, approche statistique bayésienne. <4/22> Contamination par campylobacter
● D e n ombreuses origines mais poulet cru
● Contamination croisée (ou barbecue)
● Quelle incidence sur la population française ?
Campylobacter, réseaux bayésiens, approche statistique bayésienne. <5/22> Le pb campylobacter
● Cité comme 1ère cause d'entérite b actérienne (2 à
8 millions aux USA, avec ~ 800 morts par an),
● Trè s m al identifié au niveau épidémiologique,
● In capacité d'éradiquer le danger au niveau de la
production,
● En jeux économiques majeurs (ré glementation, ...
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CCampylobacter / pouletRéseaux bayésiensApproche statistique bayésienneABARI – 14 octobre 2005maplyoabtcre ,éresaxub yaséein,sa pporhc etsaitIJseaabne-lBlea pAtilsbteer tD (eMniisa  (/ MMiaé t/ @MriisakJ  àà  JPoauriys))tsqieub yaséeinen.</122>
Cmaplyoabtccontexte Groupe de travail Afssa dans le cadre du CES microbiologie  Groupe campylo autour de la thèse d'E. Grenierre ,Isabelle Albert,Jean-Baptiste Denis,Emmanuel Grenier (ISAB),Judith Rousseau (Paris-Dauphine).éresaxub yaséein,sa pporhc etsaittsqieub yaséeinen.</222>
nemetiarTsétilarénéGesoirétcabolypmac al ruop noitasilédoMsétilarénéG.enneiséyab euqitsitats ehcorppa ,sneiséyab xuaesér ,retcabolypmaC>22/3<4.Logiciels3. Statistique bayésienne2. Réseaux bayésiensNALP1. Campylobacter, campylobactérioseseésilédom enîahc al ed t
)1( CmaplyoabtcCre ,raséaemxub pyaéyiseln,soa pbporahcecs ttaitetsirqeu  /ba éyciseanenm.pyolbacétri<o/4s22e>s
CmapylobContamination par campylobacterDe nombreuses origines mais poulet cruContamination croisée (ou barbecue)caQuelle incidence sur la population française ?et,rr séaexub yaséein,sa pporhc etsaittsqieub yaséeinen.</522>
CmapyolbLe pb campylobacterCité comme 1ère cause d'entérite bactérienne (2 à 8 millions aux USA, avec ~ 800 morts par an),Très mal identifié au niveau épidémiologique,Incapacité d'éradiquer le danger au niveau de la production,Enjeux économiques majeurs (réglementation, protection sanitaire).caet,rr séaexub yaséein,sa pporhc etsaittsqieub yaséeinen.</622>
Cmaplyquelle approche edm doléias peu ou pas de données, hétérogènes.ito phénomènes rares, mal connus variables. beaucoup d’interlocuteurs.o? n modélisation probabiliste, globale et doublement bayésienne !abtcre ,éresaux byaséein,sa pporhc etsaittsqieub yaséeinen.</722>
CmapA(pas de cycles)lyoabtcre ,éresaxub yaé)2(isne,s Cappr oRhc eséattssiitequa ebuyaséi bayésienBneen.ED</822>
Cma[A,B,C,D,E] = [A] . [B] . [C|A,B] . [D] . [E|C,D]plyoabtceA,rr séaexub yaséein,s Capporhc etsaittsqieub yaséiBneen.ED</922>
Dd.Cd.Bd.Ad . ]E,D,C,B,A[ Cd . ]B,A|C[ . ]D,C|E[  = ]D,B,A|E[.enneiséyab euqitsitats ehcorppa ,sneiséyab xuaesér ,retcabolypmaC>22/01<DFEB[A,B,C,D,E,F] = [A,B,C,D,E] . [F|D,E]C[E] = A [E|A,B,C,D] = [E|C,D]
Cmaplyoabtcre,A Béresaxub yaFLÈCHES ≠ CAUSEséein,sa pporhc ets[A].[B|A][A,=B]=[B].[A|B]aittsqieub yaséeinen.AB<11/22>
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