Etude épidémiologique descriptive des mortalités exceptionnelles d 'huîtres creuses enregistrées

Miossec L., Allain G., Arzul I., François C., Garcia C. & A. Cameron

Description

Etude épidémiologique descriptive des mortalités exceptionnelles d’huîtres creuses enregistrées sur le littoral français en 20081 1 1Laurence Miossec , Gwenhael Allain , Isabelle Arzul , Cyrille 1 1 2François , Céline Garcia et Angus Cameron1 : Ifremer, Laboratoire Génétique et Pathologie, La Tremblade2 : AusVet Animal Health Services, Cuiseaux, FranceJournées AEEMA – AESA4 et 5 juin 20099999ContexteMortalité massive d’huîtres creuses quasi-simultanément dans tous les bassins ostréicoles français en juin-juillet 2008Premiers bilansPas d’organisme pathogène exotique connuDétections fréquentes d’OsHV-1 et différents Vibrio, souvent en associationDes conditions environnementales particulières mais n’expliquant pas le phénomène (hiver doux, printemps humide, brusque remontée des températures en mai,…)Pas d’hypothèse « algues toxiques ou nuisibles pour la faune marine » à une échelle pluri-régionaleJournées AEEMA – AESA4 et 5 juin 200999Objectif de l’étude :Décrire le phénomène et tenter d’identifier la (ou les) cause(s) de ces mortalités à partir des données récoltées sur le terrain au cours de l’épisode de mortalitéEtude en 2 partiesEnquête épidémiologique descriptiveEnquête analytiqueJournées AEEMA – AESA4 et 5 juin 200999Objectifs de l’enquête épidémiologique descriptiveDécrire la distribution des mortalités dans le temps et dans l’espaceIdentifier et caractériser la population affectée au sein de la population générale ...

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Extrait

Etude épidémiologique descrip ’ tive des  mortalités exceptionnelles d huîtres creuses enregistrées sur le littoral français en 2008

Laurence Miossec 1 , Gwenhael Allain 1 , Isabelle Arzul 1 , Cyrille François 1 , Céline Garcia 1 et Angus Cameron 2

1 : Ifremer, Laboratoire Génétique et Pathologie, La Tremblade 2 : AusVet Animal Health Services, Cuiseaux, France

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

Pd sa f snoitcetéD unn HVOsd’s teenquré taohemp nasio’gre cotiqu exogène taicnoi ne ossa ioit enss Dendco ffrénest1-e  tid souvent Vibrio, l  ep san’exais uantpliqucitrap m serèilneonirnvesalntme our es psibl nui suoqieut xougseal «sehèotyp’h dsaP

Premiers bilans 9 9 9 phénomène (hiver doux, printemps humide, brusque remontée des températures en mai,…)

9 échelle pluri-régionale

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

Mortalité massive d’huîtres creuses quasi-simultanément dans tous les bassins ostréicoles français en juin-juillet 2008

Contexte

un»àe ram  enif alenua

’ Objectif de l étude :

Décrire le phénomène et tenter d’identifier la (ou les) cause(s) de ces mortalités à partir des données récoltées sur le terrain au cours de l’épisode de mortalité

9

Etude en 2 parties

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

9

equtilyna a etêuipé qnE Eqnêuet rcpiitevique desdémiolog

ctée au ion affeal esnid  etéacar cetr ieiftalupop al resir  dans ettemp le  edtn ec I seap s’l

9

9 population générale d’huîtres creuses

But de cette présentation

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

’ Objectifs de l enquête épidémiologique descriptive

écDa  lreritali mordanstés irubidtsd seitno

Matériel et Méthodes

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

APOM,acxu( ER sieé sap rel sfAs de visite réalirfa es d seénseaexuR séDonanoitan ol te xurvsue  dceanllei

2. Constitution d une base de données ’

1 déclaration/constat = 1 lieu (concession) + dates (constat, période) + taux + âge origine + données d’élevage +

1. Recueil des données

9 septembre 2008, enregistrées aux Affaires Maritimes locales ou collectées par les sections régionales conchylicoles (SRC) 9 Maritimes avec le soutien d’Ifremer 9 REMORA, CREAA (17), SMEL (50))

t anvier ene sjertoisslenn pesfero pes larumélf roilétroatde mons ratiéclaD s des commissionCmotpser-neud

Codage des données :

’ Classe d âge 1 : Naissain ( ≤ 12 mois) 2 : Juvéniles (>12 – ≤ 24 mois) 3 : Adultes (> 24 mois)   

Origine du naissain

1 : Captage 2 : Ecloserie

mois JUIN Unité temporelle Période = cycle de marée ME-VE (15 j environ) - Date de déclaration - Date de début de mortalité Période - Date d’observation - Période de mortalité Unité spatiale Concession conchylicole ou coordonnées géographiques

JUILLET

jour 28 29 30 1 2 3 4 5

10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27

coef 54 57 63 72 82 90 95 96 93 86 76 65 53   40 37 40 47 55 63 70 76 80 82 81 78 72 65 57 53

période n°11

n°12

3. Géoréférencemen ’ tet représentation cartographique des données  sous Arcview 9.2 à l aide des coordonnées cadastrales

Résultats de l’étude descriptive

Journées AEEMA – AESA 4 et 5 juin 2009

1. Base de données déclaratives

Une base de données constituée de 7237 données (données de qualité variable). Les résultats qui suivent sont basés sur l’ensemble de ces résultats.

Affaires Autres sources Régions Maritimes Sec o t n io al n e s s     (Réseaux SMEL, (déclarations o R n é c g h i CREAA, Ifremer Conchylicoles constats) c ylicoles et divers contacts)

Normandie Bretagne Nord Bretagne Sud Pays de Loire Poitou Charentes Aquitaine Méditerranée Total

100 125 161 77 3612 109 723 4907

775 642 351 36 0 157 0 1961

131 3 33 63 105 17 17 369

Total

1006 770 545 176 3717 283 740 7237

N entreprises avec surfaces pour HC (2008 -   Données CNC)

353 468 714 405 1273 455 494 4162

On fait l’hypothèse que si il y a déclaration de mortalité d’huîtres creuses , il y a mortalité Un « cas » : lot d’huîtres creuses, de l’espèce Crassostrea gigas, cultivées sur le territoire français en 2008 et touchées par un phénomène de mortalité entre le début janvier et la mi-septembre.

2. Dynamique temporelle des mortalités 2008 11 11

9

11

11

observations en fonction de R ’ épartition des  l unité temporelle (n = 7237)

11

9

13

9 : 24 mai - 8 juin 11 : 24 juin – 8 juillet

11-12

9

10-11

12 : 9 – 24 juillet 13 : 25 juil – 7 août

’ 3. Taux de mortalité en fonction de l âge

Ages 1 : Naissain ( ≤ 12 mois) 2 : Juvéniles (>12 ; ≤ 24 mois) 3 : Adultes (> 24 mois)

Toutes les classes d âge sont touchées ’ Les lots de naissain ont présenté les plu

Les lots de naissain ont présenté les plus forts taux de mortalité dans toutes les régions