Caracterización de un virus que infecta al hongo Endofítico Epichloë festucae

Vaquero Romo, María

Description

Colecciones : TD. Ciencias biosanitariasDMG. Tesis del Departamento de Microbiología y Genética
Fecha de publicación : 26-nov-2010
[ES] Epichloë festucae (Ascomycota) infecta a la gramínea Festuca rubra. La infección a en gramíneas confiere a la planta una serie de beneficios, entre otros ser más resistentes a herbívoros. E. festucae está infectado a su vez por un genoma vírico de 5109bp RNAbc, dicho genoma fue secuenciado, y adicionalmente se estudió su incidencia en poblaciones naturales, al igual que su modo de transmisión. En función a las características que presenta el genoma viral, se ha caracterizado como miembro de la familia Totiviridae. Está formado por dos ORFs que están solapados por un tetranucleótido; el ORF1 codifica para una posible proteína de la cápsida con una longitud de 765 aminoácidos; por su parte el ORF2 (en desfase de lectura de -1 con respecto al ORF1, codifica para una posible proteína RNA polimerasa RNA dependiente de una longitud de 826 aminoácidos. Este virus es denominado Epichloë festucae virus 1 (EfV1), y está relacionado con los miembros del género Victorivirus que infecta a hongos filamentosos, y que es deducido por medio de un análisis filogenético de la CPs y la RdRps. En dos poblaciones naturales de Epichloë festucae, el 36.4% de los aislados están infectados por EfV1. El virus fue transmitido por esporas asexuales (conidios) con una eficiencia del 100%, mientras que no se produce nunca transmisión por ascosporas procedentes del cruce sexual entre individuos con virus y sin virus.[EN] Festucae Epichloë (Ascomycota) infects the grass Festuca rubra. The infection of grasses gives the plant a number of benefits, including more resistant to herbivores. E. festucae turn is infected by a RNAbc 5109bp viral genome, this genome was sequenced, and further studied its effect on natural populations, as well as their mode of transmission. According to the features found in the viral genome has been characterized as Totiviridae family member. It consists of two ORFs which are overlapping by a tetranucleotide, the ORF1 coding for a possible coat protein with a length of 765 amino acids, for its part, the ORF2 (in reading lag of -1 with respect to ORF1, encodes a possible RNA-dependent RNA polymerase protein of 826 amino acids long. This virus is called Epichloë festucae virus 1 (EfV1), and is related to members of the genus Victorivirus infecting filamentous fungi, and is inferred by a phylogenetic analysis of the CPs and RdRps. Two natural populations of Epichloë festucae, 36.4% of isolates are infected EfV1. The virus was transmitted through asexual spores (conidia) with an efficiency of 100%, while transmission never occurs by sexual ascospores from the cross between individuals with and without virus virus.

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• Sciences et techniques

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• Publié par: Salamanca
• Publié le: 26 novembre 2010
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• Langue: Español
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Extrait

UNIVERSIDAD DE SALAMANCA
FACULTAD DE BIOLOGÍA
Departamento de Microbiología y Genética










CARACTERIZACIÓN DE UN VIRUS QUE INFECTA AL HONGO
ENDOFÍTICO Epichloë festucae


















María Romo Vaquero
2010

UNIVERSIDAD DE SALAMANCA
FACULTAD DE BIOLOGÍA
Departamento de Microbiología y Genética











CARACTERIZACIÓN DE UN VIRUS QUE INFECTA AL
HONGO ENDOFÍTICO Epichloë festucae







Memoria que presenta la
Licenciada en Biología
María Romo Vaquero
para optar al grado de
Doctor por la Universidad
de Salamanca





Salamanca, Octubre de 2010

“Primero te ienoran, después se ríen de ti,
luego te atacan, entonces eanas”
Mahatma Gandhi.

Agradecimientos
Esta tesis doctoral, si bien ha requerido de esfuerzo y mucha dedicación por parte
de la autora durante seis años, no hubiese sido posible su finalización sin la cooperación
desinteresada de todas y cada una de las personas que a continuación citaré.
Quiero expresar mi agradecimiento al Dr. Iñigo Zabalgogeazcoa González, director
de esta Tesis Doctoral, por darme la oportunidad de llevarla a cabo , así como por sus
sugerencias sin las cuales no hubiera sido posible la elaboración de este trabajo.
Igualmente quisiera agradecer a todo el Departamento de Pastos del Instituto de
Recursos Naturales y Agrobiología de Salamanca su cooperación en la realización de esta
tesis doctoral. Agradecer también al Dr Balbino García Criado y la Dr. Mª Antonia García
Ciudad su apoyo en el logro de la beca de tres años, con la cual se financió ésta tesis.
De igual forma, quiero mencionar la valiosísima ayuda desinteresada de la Dr. Rosa
Esteban, cuya orientación fue clave para la consecución de resultados favorables.
Especialmente, también quisiera dar mi más sincero agradecimiento a D. José Matías
Hernández Sánchez, por su colaboración y aliento así como por su implicación personal en
todo momento.
Agradecer a la Dra. María Teresa García Conesa, que me brindara la oportunidad de
seguir disfrutando de la investigación, pudiendo compaginar mi trabajo en Murcia con la
finalización de esta tesis doctoral, así como el apoyo de todos los compañeros del
departamento de Ciencia y Tecnología de Alimentos del Centro de Edafología y Biología
Aplicada del Segura.
Por último, me gustaría resaltar la comprensión, la paciencia y el cariño de mi familia.
A mis padres que siempre me enseñaron la honestidad y la perseverancia en el trabajo, les
doy las gracias por sus esfuerzos. A mi padre, que desde donde esté nunca dejó de estar a
mi lado. A mi madre por la eterna confianza que siempre depositó en mí y por compartir
todas mis penas y alegrías. A mi hermano Julián y su esposa Almudena, que siempre me
alentaron y me supieron ayudar. A mis tíos que siempre me desearon lo mejor.
No menos importantes son todos aquellos amigos: Carlos, Manolo, Cristina, Virginia,
Teresa, Sandra, María, Marta, Carolina, Jesús, Yolanda, Carmen, Eva, Lorena, Paula, María,
Abigail, Patricia, Luis, Roberto, Manuel, José Antonio, Mar, Pepa, María, Pilar, Macarena,
Natali, Devora, Laura, Luna, Alicia, Victoria, Choni, Ana, David, Paco, Juan, LLoao, Santiago,
Fernando, Juan Carlos y Pedro, que no desfallecieron en sus ánimos, cariño y apoyo.

Doy gracias a Dios por fortalecer mi corazón e iluminar mi mente.

VIRUS DE RNA DE DOBLE CADENA EN EPICHLOË FESTUCAE 2010

Índice
Introducción ...................................................................................................................... 11
I. Los hongos endófitos ............................... 11
II. Los hongos endófitos de gramíneas ..................................................................... 12
III. Los endofitos sistémicos de gramíneas: Neotyphodium y Epichloë spp ...... 13
 Taxonomía .......................................................................................................... 15
 Ciclos de vida .... 16
 Mutualismo en las interacciones entre endofitos sistémicos y
gramíneas ........................................................................................................... 20
IV. Epichloë festucae .... 22
V. Los Virus .................................................................................................................... 23
VI. Origen de los virus de RNA ................... 24
VII. Los micovirus ............................................................................................................. 26
 Características de los micovirus .. 26
 Diversidad y clasificación en micovirus ...................................................... 27
 Efectos producidos por infecciónes micovíricas ...................................... 29
VIII. Los micovirus de Epichloë festucae .............................................................. 31
IX. Bibliografía ................................................................................................................ 32
Objetivos ............................ 39
I. Objetivo general ...................................................................................................... 39
II. Objetivos específicos ............................. 39
Capítulo 1: Incidencia de RNAbc en poblaciones de E. festucae . 41
I. Introducción ............................................................................................................. 41
II. Materiales y métodos ............................................................................................. 43
 Recolección de plantas y aislamiento de E. festucae. 43
 Extracción de RNAbc. .................................................................................... 45
III. Resultados y discusión ............................ 46
 Incidencia de RNAbc en aislados de E. festucae. .................................... 47
IV. Conclusiones .............................................................................. 51
Índice 5

2010 VIRUS DE RNA DE DOBLE CADENA EN EPICHLOË FESTUCAE

V. Bibliografía ................................................................................................................ 52
Capítulo 2: Mecanismos de transmisión y persistencia de los virus
de Epichloë festucae .................................................................................................. 55
I. Introducción ............. 55
 Transmisión por anastomosis ........................................................................ 55
 Transmisión a esporas sexuales y asexuales ............. 56
II. Materiales y métodos ............................................................................................. 58
 Análisis de la transmisión por medio de esporas asexuales ................... 58
 Transmisión por medio de esporas sexuales .............................................. 59
 Relación entre la distancia genética y la presencia de virus en aislados
de Epichloë festucae ....................................................... 60
III. Resultados y discusión ............................................................ 60
 Transmisión vertical por esporas asexuales .............................................. 60
 Transmisión por esporas sexuales ............................... 61
 Persistencia de RNAbc en aislados de E. festucae .................................. 62
IV. Conclusiones .............................................................................. 64
V. Bibliografía ................................................ 65
Capítulo 3: Efectos fenotípicos de la infección de EfV1 y EfV2 .. 69
I. Introducción ............................................................................................................. 69
II. Materiales y métodos ............................................................................................. 71
 Crecimiento radial ............................ 71
 Efecto de la temperatura sobre el crecimiento de Epichloë festucae72
 Efecto de en la concentración celular de RNAbc ........ 72
III. R