BIOSTATISTIQUES AVANCEES

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Master Biologie Intégrative et Physiologie
ère1 année
BIOSTATISTIQUES
AVANCEES
Yves Desdevises
Laboratoire Arago, Banyuls-sur-Mer (www.obs-banyuls.fr)
04 68 88 73 13
desdevises@obs-banyuls.fr
http://desdevises.free.fr
http://www.edu.upmc.fr/sdv/desdevises
2009-2010 PLAN
1. Rappels : données, tests, plans d’expérience, distributions
2. Comparaison de 2 groupes : variances et moyennes
3. Comparaison de plus de 2 groupes : test d’homogénéité des
variances, analyse de variance à 1 et 2 facteurs
4. ANOVA à 2 facteurs avec répétitions, ANOVA hiérarchique
5. Relations entre variables : corrélation, régression simple et
multiple
6. Analyse de covariance
7. Analyse multivariable : matrices d’associations, groupement
8. Analyse multivariable : ordination, test de Mantel
9. Analyse de survie Quelques références
Générales•
rdSokal RR & Rohlf FJ. 1995. Biometry. 3 Edition, Freeman and •
co., New York.
rdZar JH. 1996. Biostatistical Analysis. 3 Edition, Prentice-Hall •
International, Inc.
Frontier S, Davoult D, Gentilhomme V & Lagadeuc Y. 2001. •
Statistique pour les sciences de la vie et de l’environnement.
Cours et exercices corrigés. Dunod.
Triola MM & Triola MF. 2006. Biostatistics for the Biological •
and Health Science. Pearson. Traduction française en 2009 :
Biostatistiques pour les sciences de la vie et de la santé.
Samuels ML & Witmer JA. 2003. Statistics for the Life •
rdSciences. 3 Edition. Prentice Hall, Pearson.
Blair RC & Taylor RA. 2008. Biostatistics for the Health ...
Nombre de pages : 54
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Master Biologie Intégrative et Physiologie 1èreannée
BIOSTATISTIQUES AVANCEES
Yves Desdevises Laboratoire Arago, Banyuls-sur-Mer (www.obs-banyuls.fr) 04 68 88 73 13 desdevises@obs-banyuls.fr http://desdevises.free.fr http://www.edu.upmc.fr/sdv/desdevises
2009-2010
1.
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8.
9.
PLAN Rappels : données, tests, plans dexpérience, distributions
Comparaison de 2 groupes : variances et moyennes
Comparaison de plus de 2 groupes : test dhomogénéité des variances, analyse de variance à 1 et 2 facteurs
ANOVA à 2 facteurs avec répétitions,ANOVA hiérarchique
Relations entre variables : corrélation, régression simple et multiple
Analyse de covariance
Analyse multivariable : matrices dassociations, groupement
Analyse multivariable : ordination, test de Mantel
Analyse de survie
uel références Générales Sokal RR & Rohlf FJ. 1995. Biometry. 3rd andEdition, Freeman co., New York. Zar JH. 1996. Biostatistical Analysis. 3rdEdition, Prentice-Hall International, Inc.  Gentilhomme D, & Lagadeuc V 2001. Y.Frontier S, Davoult Statistique pour les sciences de la vie et de lenvironnement. Cours et exercices corrigés. Dunod. Triola MM & Triola MF. 2006. Biostatistics for the Biological and Health Science. Pearson.Traduction française en 2009 : Biostatistiques pour les sciences de la vie et de la santé.  JA. WitmerSamuels ML & for the Life 2003. Statistics Sciences. 3rdEdition. Prentice Hall, Pearson. Blair RC & Taylor for the Health RA. 2008. Biostatistics Sciences. Prentice Hall, Pearson.
Simplifiées  2003. Choosing and Using Statistics.A BiologistsDytham C. Guide. 2ndEdition. Blackwell Publishing.  2005. Statistics Explained.McKillup S. University Cambridge Press.  2008. Statisticsvan Emden H. Biologists. Terrified for Blackwell Publishing.
Plus spécialisées Legendre P & Legendre L. Ecology. 1998. Numerical 2ndEnglish Edition. Development in Environmental Modelling, 20. Elsevier.  in Ecology. CambridgeUnderwood AJ. 1997. Experiments University Press.
Quelques logiciels
R (www.r-project.org)
Page web de Pierre Legendre (www.bio.umontreal.ca/ legendre)
Statdisk (http://statdisk.com/)
XLStat (www.xlstat.com)
Minitab (www.minitab.com)
JMP (www.jmp.com)
Statistica (www.statsoft.com)
SAS (www.sas.com/technologies/analytics/stat)
1. INTRODUCTION RAPPELS
 Etude scientifique des donnéesStatistique : numériques décrivant les variations naturelles Biatsotsiteuqi Application à la biologie Biometry  décider de la méthode à utiliserImportant : savoir naîtconBienohtésedlermsensioco:itnd dutilisation, limitations, ... Penser aux statistiquesavantde collecter les données
Utilité et utilisation des statisti en biolo ie Description Vue synthétique et rationnelle des données
Inférence Economie de travail par létude déchantillons représentatifs Décision Test dhypothèse
Pourquoi utiliser les statistiques en biologie?
 des résultats expérimentauxBiologie : incertitude ou des observations Variabilité génétique Variabilité de réaction individuelle Variabilité du développement
Définitions
Objet = observation = élément = unité déchantillonnage : élément sur lequel on mesure des caractéristiques (variables)
 ensembleEchantillon : des objets Population cible : ensemble des objets visés par une étude scientifique Population statistique : ensemble des objets représentés par léchantillon. Cest sur elle que se fait linférence
Variable = descripteur = facteur = trait : caractéristique mesurée ou observée sur les objets. Ex : longueur, température, ... Variable dépendante (Y) = réponse Variable indépendante (X) = explicative  dun processusVariable aléatoire : résultat aléatoire, valeur précise inconnue avant la mesure
 par lexpérimentateur, décidéeVariable contrôlée : erreur = mesure seulement
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