L'évolution biologique regroupe un ensemble de phénomènes dictés par le hasard des mutations et la nécessité d'être adapté à son environnement. Connaître l'histoire de la vie à partir de ses origines apporte un éclairage essentiel en médecine moderne et constitue un élément important de décision pour les professionnels de santé. Biologie de l'évolution et Médecine a pour vocation d'être le premier ouvrage à introduire les éléments essentiels de la biologie de l'évolution dans l'enseignement de la biologie médicale. Les auteurs décrivent dans un premier temps l'histoire de la vie sur Terre et l'apport des techniques nouvelles de systématique pour définir l'arbre du vivant. Cette présentation relativise la place de l'homme au sein des autres espèces vivantes et remet en question une vue trop anthropocentrique de la médecine. Les mécanismes de l'évolution sont exposés dans un deuxième temps. Les sources de la diversité génétique sont illustrées à partir d'exemples fournis par la génétique moléculaire. Les mécanismes de sélection par dérive génétique (hasard pur) ou sous l'effet de la sélection naturelle dite darwinienne sont détaillés. La dernière partie aborde l'évolution récente de la lignée évolutive qui conduit à l'homme et développe quelques applications de la médecine évolutionniste. Biologie de l'évolution et Médecine ouvrage destiné à l'enseignement, comporte de nombreux encadrés sur des notions clés ou des applications directes ainsi que des illustrations d'une grande clarté pour permettre au lecteur de maîtriser les concepts importants. Il est écrit par deux auteurs complémentaires qui utilisent depuis longtemps le concept évolutionniste dans leurs recherches biomédicales. Préfaces. Introduction. PARTIE I. DESCRIPTION. Histoire de la Terre et de la vie : l'évolution
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Extrait
Publications Médecine Sciences
BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION et MÉDECINE
Christian Frelin Bernard Swynghedauw
Médecine Sciences Publications
BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION ET MÉDECINE
Chez le même éditeur
Dans la collection « De la biologie à la clinique » Biologie moléculaire et médecine, par J.C. Kaplan et M. Delpech Immunologie, par J.F. Bach et L. Chatenoud Biochimie et biologie moléculaire, par P. Kamoun, A. Lavoinne et H. de Verneuil Biochimie pathologique, par J. Delattre, G. Durand et J.C. Jardilliet Virologie humaine, par L. Collier et J. Oxford Histologie, par J.P. Dadoune Bactériologie, par P. Berche, J.L. Gaillard et M. Simonet Génétique médicale – Thompson & Thompson, par M.W. Thompson, R.R. McInnes et H. Willard Éléments de sécurité en biologie moléculaire, par J.C. David
Dans d’autres collections Biologie moléculaire de la cellule, par B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts et P. Walter Biologie moléculaire de la cellule– Livre d’exercices, par J. Wilson et T. Hunt L’essentiel de la biologie cellulaire, par B. Alberts, D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts et P. Walter Manuel de poche de biologie cellulaire, par H. Plattner et J. Hentschel Manuel de poche de microbiologie médicale, par F.H. Kayser, E.C. Böttger, R.M. Zinkernagel, O. Haller, J. Eckert et P. Deplazes Biochimie, par L. Stryer, J. Berg et J. Tymoczko Atlas de poche de biochimie, par J. Koolman et K.H. Röhm Biochimie humaine, par F. Horn, G. Lindenmeier, C. Grillhöst, I. Moc, S. Berghold, N. Schneider et B. Münster Aidemémoire de biochimie et biologie moléculaire, par P. Kamoun Exercices et problèmes de biochimie, par P. Kamoun, C. Dode, M. Jeanpierre et D. Rabier Génétique moléculaire humaine, par T. Strachan et A. Read Génomes, par T.A. Brown Atlas de poche de biotechnologie et de génie génétique, par R.D. Schmid Génétique des populations, par D.L. Hartl Exercices et problèmes de génétique, par G. Broussal, B. M’Batchi et P. Viaud Introduction à la neurobiologie moléculaire, par Z.W. Hall Traité de médecine, par P. Godeau, S. Herson et J.Ch. Piette Principes de médecine interne Harrison, par E. Braunwald, A.S. Fauci, D.L. Kasper, S.L. Hauser, D.L. Longo et J.L. Jameson Traité de médecine hospitalière, sous la direction de J.P. Grünfeld La petite encyclopédie médicale Hamburger, par M. Leporrier Guide du bon usage du médicament, par G. Bouvenot et C. Caulin Le Flammarion médical, par M. Leporrier Dictionnaire françaisanglais/anglaisfrançais des termes médicaux et biologiques et des médica ments, par G.S. Hill L’anglais medical : spoken and written medical english, par C. Coud et X.F. Coud
BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION ET MÉDECINE
Christian FRELIN et Bernard SWYNGHEDAUW
Préfaces de Michel MORANGE et de JeanLuc DUMAS
Direction éditoriale :Emmanuel Leclerc Édition :Agns Aubert Couverture :Isabelle Godenche
Composition :Nord Compo, Villeneuved’Ascq Impression et façonnage :Corlet, CondsurNoireau
Christian FRELIN Docteur s Sciences, Directeur de Recherches au CNRS, CNRS UMR 6543, Universit de Nice SophiaAntipolis, Nice.
Bernard SWYNGHEDAUW Docteur en mdecine, Docteur s Sciences, Directeur de Recherches (mrite) à l’INSERM, Unit INSERM 942, Hôpital Lariboisire, Paris. Membre correspondant de l’Acadmie nationale de Mdecine.
Remerciements Nous voudrions remercier ric Faure (Facult des Sciences, Marseille), le Docteur Jacques Duchier, Christian Braendle (Charg de recherche au CNRS, Universit de Nice, Sophia Antipolis) qui ont bien voulu accepter de relire ce manuscrit et Pierre Pontarotti (CNRS, Marseille) qui a bien voulu nous fournir leurs prcieux conseils. Nous remercions la revue d’pistmologie,Matière première, et sa direction, GrardLambert et Marc Silberstein (ditions Matriologiques, Paris, materiologiques.com), de nous avoir autoris à reproduire certains lments de notre article publi en 2009 (nouvelle srie, n° 1/2010 : « pistmologie de la mdecine et de la sant »), notamment dans les chapitres Introduction et L’volution chez l’homme et en pra tique clinique.
Notes En italique les noms en anglais et les noms des espèces vivantes et des gènes. Pour simplifier nous avons supprimé le – dans les datations avant JC (–140 Ma devient ainsi 140 Ma). Eu comme dans eumétazoaires signifie que le clade considéré n’est pas fossile et est encore vivant. Quand on parle des métazoaires cela signifie que l’on parle du clade dans son ensemble, fossile ou vivant. La seule exception à la règle concerne les eucaryotes.
Peuton dfinir la vie simplement ?............................................................... 3 Les preuves de l’volution............................................................................. 5 Structures communes à tous les êtres vivants............................................ 5 Arbres phylogéniques et classification hiérarchique, morphologique et fonctionnelle........................................................................................ 5 Distribution géographique........................................................................ 5 Ordre des principaux groupes fossiles....................................................... 6 Évolution expérimentale........................................................................... 6 Arguments fournis par les fossiles............................................................. 7 Historique..................................................................................................... 7 Avant Darwin........................................................................................... 8 Charles Robert Darwin (18091882)......................................................... 9 AprèsDarwin : hérédité et synthèse évolutionniste (19001950)............. 10 AprèsDarwin (> 1950) : avènement de la biologie moléculaire............... 12 Pour résumer............................................................................................ 13
PA R T I E I D E S C R I P T I O N
1. Histoire de la Terre et de la vie : l’évolution, verticalement.......................... 19
Histoire de la Terre........................................................................................ 20 Le temps et la tectonique des plaques...................................................... 20 Les catastrophes........................................................................................ 22 Environnement......................................................................................... 23 Changements environnementaux d’origine anthropogénique................... 24 Histoire de la vie sur Terre............................................................................. 27 Origines de la vie...................................................................................... 27 La vie au précambrien...............31................................................................ Transitions................................................................................................ 32 Explosion cambrienne..........................................33..................................... Effets des extinctions de masse................................................................. 34 Histoire particulière des plantes et des champignons................................ 35
VII
VIII
S O M M A I R E
Après le cambrien..................................................................................... 36 Effets des déplacements de continents...................................................... 36 Paléogène (6523,8 Ma), néogène (23,81,8 Ma) et quaternaire (1,8 Ma à nos jours)........................................................... 38 Stase et ponctuations................................................................................ 38
2. Classification des êtres vivants : l’évolution horizontale et la classification dite hennigienne............................................................. 40
Dfinitions et mthodes................................................................................ 41 Procaryotes : eubactries et arches.............................................................. 45 Premires radiations des eucaryotes .............................................................. 48 Plantes.......................................................................................................... 48 Champignons ............................................................................................... 50 Mtazoaires .................................................................................................. 52 Mammifres ................................................................................................. 55
PA R T I E I I M É C A N I S M E S
3. Mécanismes générant la diversité................................................................ 59
Modifications du matriel gntique............................................................. 63 Mutations ponctuelles.............................................................................. 63 Duplications géniques et réarrangements chromosomiques...................... 64 Quelques exemples de plasticité génotypique.......................................... 66 Rôle particulier des duplications génomiques et de la polyploïdisation.... 68 Consquences fonctionnelles des mutations.................................................. 70 Mutations ponctuelles dans les séquences codantes................................. 70 Mutations au niveau des sites d’épissage.................................................. 72 Mutations au niveau des séquences régulatrices....................................... 74 Consquences fonctionnelles des duplications gniques................................ 74 Principaux types de conséquences............................................................ 74 Propriétés globales du génome................................................................. 78 Relation gne/environnement....................................................................... 79 Héritabilité............................................................................................... 79 Normes de réaction................................................................................... 81
4. Comment la sélection agitelle ?.................................................................. 85
Fonction ou trait clinique .............................................................................. 88 Slection d’un caractre et slection d’une espce (ou spciation) : ncessit et hasard........................................................................................ 90 Preuves moléculaires de la sélection naturelle.......................................... 92 Sélection sexuelle..................................................................................... 94