Une histoire de la résistance aux antibiotiques

Yvon Michel-Briand

Description

Collection : Acteurs de la Science

La résistance aux antibiotiques est apparue peu après la prescription de ces molécules. Cependant, dès l'aube du vingtième siècle, des médecins avaient mis en garde contre l'apparition de la résistance aux antibactériens de synthèse. Les bactéries pathogènes (pneumocoque, staphylocoque, entérocoque, colibacille…) mirent alors en œuvre des stratégies de résistance particulières. Cette histoire passionnante s'adresse aux étudiants, biologistes, vétérinaires, pharmaciens, médecins.

Sujets

• Santé
• Médecine

Informations

• Publié par: L'Harmattan
• Date de parution: 01 décembre 2009
• Nombre de lectures: 489
• EAN13: 9782296244337
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 19 Mo

Extrait

Lettreduprofesseur Y.A.Chabbert
Jevous livre quelques ré fexions que me suggèrevotre ouvrage.
La résistance aux antibiotiques est clairement apparue ilyasoixante ans
avec le Staphylocoque producteur de pénicillinase. Dans les années
cinquante, la recherche industrielle,àpartir des sources naturelles aboutit à
une foraison d'agents antibactériens si nombreux que l'on peut en faireun
dictionnaire touffu. Mais l'antibiothérapie évolua vers la mise au point de
dérivés (bêta-lactamines, quinolones) avec un succès considérable en
matière d'activité et généralité. L'histoiredelarésistance montreclairement
qu'aujourd'hui de très nombreux mécanismes affectent tous ces dérivés et
des échecs thérapeutiquesgraves leur sont imputables. Devantcette
situation, on peut certes en réduireles conséquences par un meilleur choix,
mais on est en droit de se demander s'il ne faut pas recommencer à
interroger la nature, autrefois si prolixe, pour lui demander de fournir de
nouvelles bases pour une nouvelle èreantibiotique.Jenepeux
qu'encourager à fondvotre projet.
DocteurYvesAChabbert
ProfesseurHonoraireàl'InstitutPasteur
9mars 2009
Le professeur Chabbert est né à Bordeaux en 1921, ville où ilaeffectué
toutes ses études etson internat en médecine. Sa thèseenmédecine,
soutenue en 1947,concernait déjà l'étude des antibiotiques et lesrelations
avec la clinique(miseau point du dosage de la pénicilline). En cettemême
année, Yves A. Chabbert entreà l'Institut Pasteur où il exerce son activité
dans le laboratoirede l'Hôpital Pasteur,puis dans le laboratoire qui
deviendra l'UnitédesAgentsAntibactériens.Il fut le premierà quanti feretà
standardiser l'antibiogramme,àendonnerune lecture interprétative et à
mettre au point lestechniques d' étude des associations d'antibiotiques. Il fut
aussi undes premiers àidenti fer la résistance dustaphylocoqueàla
méticilline et à rapporter la multirésistance des Salmonellaàla présence de
plasmide. Il initia une véritable épidémiologie moléculaire.
Pendanttrentesixans,iln'auradecessedemultiplierlestravauxpourassurerunemeilleure
prescription antibiotiqueet prévenir lesrésistances. Il a étéle Maître
incontesté etrespectédel'étudedel'action des antibiotiquessur le monde
bactérien, unMaîtrepleind'humouretdebon sens.
5BÊTA-LACTAMINES PRÉSENTES (+) SUR LE MARCHÉ EN FRANCE,DEPUIS L'ORIGINE DES
ANTIBIOTIQUES (d'aprèslaconsultationdesdictionnairesVidal ;pourlesdates,onn'apas
tenu comptedes compléments envoyés en cours d'année). Le nombrede vingt-neuf
bêtalactaminesmisesàladispositiondesmédecinsenFrance,en 2008,estmatièreà ré fexion.
6AVANT-PROPOS
L'histoiredela résistance aux antibiotiques devrait commencer à partir
de la découvertedeces molécules,l'année1929, datedela découverte de la
pénicilline oul'année 1940,dateoùl'onacruaux vertus thérapeutiquesde la
pénicilline, alors même queEdwardAbraham décrivait pour la premièrefois
l'inactivationdelapénicillinepar unepénicillinase.
Nous avons choisidelafairedébutertrenteans plus tôt,lors des
premiers pas de la chimiothérapie anti-infectieuse, parce quebeaucoupde
considérations et de conseils de prudence résultant de travaux et
d'observations minutieuses avaient déjà étéémis. C’est pourquoi il est
regrettable queces avertissements n’aient pas étépris en considération dès
ces années. On tentera quelques explications dans le dernier chapitredecet
ouvrage.
Ce livreest basé sur la listedes publications concernant les principales
étapes de la découverted'unmécanisme de résistance, la bactérie choisie
étant celle où ce mécanisme s'exprime le mieux. Le texteest là pour fairele
lienentrecespremièresobservations.
Le nombredepublications sur un thème donné est considérable. En
interrogeant la basededonnées PubMed avec la question Streptococcus
pneumoniae penicillin resistance on obtient3.728 références de publications
en janvier2009, pour un sujet plus restreint (Pseudomonas aeruginosa ef fux
antibiotic)on recueille 304 références.
Le choix des publications n'est donc pas aisé. Ilaété basé sur la
nouveautédel'information etsur l'importance des résultats présentés. On a
toujours recherché la première référence relatantunfait nouveau (par
exemple le passage d'un gène de résistance du chromosome vers un
plasmide) en évitant de mentionner lesréférences de travaux ultérieurs sur le
même sujet, sauf sides informations nouvelles et importantes étaient
apportées. Certes, tous lestravaux cités n'ont pas la valeur novatrice
souhaitée, mais ils participent néanmoinsàlacompréhension de l'apparition
et de la persistance desrésistances. Le nombrede publications portantsur
des sujetsvoisins devientviteimpressionnant (ily enapar exemple, un
foisonnement en 1952,au début de l'utilisation de l'isoniazide (INH) comme
traitement de la tuberculose). Le choix est encoreplus dif fcile pour les
années les plus récentes,l'absence de reculnepermettant pastoujours de
7juger de l'importance et duretentissement desrésultats. La très grande
majorité desréférences aété récoltée dans la consultationdes articles
originaux, avec parfoisquelquessurprises,certaines publications ayant des
titres différents de celuihabituellement cité, ou avec une listedes auteurs
dans unordredifférent de celuidonné dans lestables,ou encoreavec des
titres de publication de Pasteur retraduits de l'anglais,dansunfrançaisqui
n'est plus celui du grand homme!Mais je suis aussiconscientquedes
erreursontpu seglisserdansmon texte.
Le texte, on l’adit,n'est présentquepour faire unlien entre toutes ces
publications, mais parfois la rédaction empruntedes chemins ardus,
témoignant de la complexitédes mécanismes de résistance et pouvant
émerveiller ceux qui vont au-delà desinteractionsmoléculaires. D'après telle
publication, on serait parfoistentéd'en fairela une d'unchapitre, d'attirer
l'attention, de piquer la curiosité, de susciter la polémique, mais la
consultation d'autres travaux permetsouvent de moduler les premières
af frmations,de tempérerl'éclatdelapremièredémonstration.
Lesréférences sont présentées sous une forme inhabituelle. Elles sont
classées par année croissantedepublications de manièreà mieux objectiver
l'histoire de la résistance. Par exemple la miseenévidence des gènes
sauteurs par Hedges et Jacobaétépubliée en 1974, alors queces gènes
avaient déjà été décrits chez le maïs en 1950 par BarbaraMcClintock
(chapitre 1).Al'intérieur d'une même année, lesréférences ont étéclassées
parordrealphabétiquedunomdupremierauteur.
La datedelapublication est souvent très postérieureà celle de la
découverte. Par exemple, dans le chapitre 2,David Hansmanaobservéla
résistance d'unpneumocoqueà la pénicilline en 1967,mais il n’apublié son
observation qu'en 1971. Dans certains cas,cetteparticularitéest spéci fée en
écrivant1967/1971.
Onaajouté, aux termes habituels d'une référence, l'adressedu premier
auteur, sans préciser le service ou le département,maisseulement
l'université ou l'hôpital et la ville. C'étaitun dessoucis de l'auteur de
distinguer le lieu oùs'est déroulée la recherche, en se référant àla
publication originale. Mais les références les plus anciennes ne donnent
parfois pas d'information. Quelques anomalies peuvent êtreconstatées. Le
libellé de l'adressed'unmême auteur peut êtreparfois différent d'une
publication àl'autre: on a respectéles indications portées dans la
publication. La précision du lieuresteappropriée jusquedans les années
1985,maissapertinenceestpeutêtremoinsgrandeaucoursdecesdernières
années quand les auteurs sont nombreux et appartiennentàplusieurs centres
de recherche:lestravaux exigent la mise en œuvre de techniques de plus en
plus complexes,effectuées par plusieurs équipesrésidant dans des lieux
8différents. Néanmoins cette indication permet de situer le chercheur le plus