Biogéochimie benthique : processus communs et divergences entre les sédiments littoraux et ceux des marges continentales : comparaison entre le Bassin d’Arcachon et le Golfe de Gascogne

Aurélia Mouret

Description

Sous la direction de Pierre Anschutz
Thèse soutenue le 02 octobre 2009: Bordeaux 1
Les processus biogéochimiques benthiques liés à la dégradation de la matière organique sont étudiés depuis 30 ans. Beaucoup de travaux ont mesuré soit un grand nombre de paramètres sur quelques carottes, soit un nombre restreint de paramètres sur de nombreuses carottes. Dans le Golfe de Gascogne, 29 paramètres diagénétiques sont étudiés à de multiples stations depuis 1997 et dans le Bassin d’Arcachon depuis 2005. Ainsi la banque de données biogéochimiques benthiques constituée est actuellement la plus importante à notre connaissance. Les similarités et divergences entre l’environnement côtier de la lagune mésotidale d’Arcachon et la marge continentale du Golfe de Gascogne ont pu être discutées. Une étude de l’hétérogénéité spatiale à l’échelle de l’échantillonnage a permis de préciser la méthodologie d’échantillonnage dans le Bassin d’Arcachon et de discuter de la représentativité saisonnière des données de la banque de données du Golfe de Gascogne. Les carottes de la banque de données ne peuvent pas être réellement interprétées en terme de variabilité saisonnière, alors qu’une saisonnalité des apports a bien été mise en évidence par l’étude des particules en suspension dans la colonne d’eau. L’oxygène dissous est très sensible à la variabilité de ces apports et l’étude de sa distribution à l’aide de la banque de données du Golfe de Gascogne, ainsi que des teneurs en carbone organique particulaire (COP) montre que les flux de matière organique labile représentent la plus grande partie du carbone exporté au fond et que, pour une zone géographique peu étendue comme le Golfe de Gascogne, l’efficacité d’enfouissement du COP varie de 50% à 10%. La banque de données a également permis l’étude de la géochimie benthique du manganèse, ce qui a donné l’occasion de proposer une méthode de calcul du taux d’accumulation sédimentaire basée sur la géochimie de cet élément à l’état stationnaire. Enfin, des carottes longues réalisées dans les deux environnements ont permis de caractériser les processus diagénétiques anoxiques profonds dans un environnement à l’état stationnaire (le Golfe de Gascogne) et un autre à l’état transitoire (le Bassin d’Arcachon).
-Diagenèse précoce
-Sédiments marins
-Golfe de Gascogne
-Bassin d'Arcachon
-Hétérogénéité spatiale
-Variabilité temporelle
-Etat stationnaire
-Etat transitoire
-Processus benthiques
Benthic biogeochemical processes due to organic matter degradation have been studied for 30 years. Many works have investigated either multiple parameters on a few cores, or a couple of parameters on numerous cores. In the Bay of Biscay, 29 diagenetic parameters have been investigated at numerous stations since 1997, and in Arcachon Bay since 2005. Thereby, our benthic biogeochemical database is currently the most important to our knowledge. Similarities and differences between the coastal mesotidal lagoon of the Arcachon Bay and the continental margin of the Bay of Biscay have been discussed. Study of sampling-scale spatial heterogeneity has clarified the sampling methodology in the Arcachon Bay and allowed to consider the question of data seasonal signal in the Bay of Biscay database. The cores of the database cannot really be interpreted in terms of seasonal variability, while a seasonal signal has been demonstrated by the study of suspended particles in the water column. Dissolved oxygen is very sensitive to the variability of these inputs. Oxygen distributions and particulate organic carbon (POC) contents from Bay of Biscay database shows that labile organic matter flux represents most of the carbon exported to the bottom. The burial efficiency of POC varies from 50% to 10% for a narrow geographical area like the Bay of Biscay. The database has also allowed the study of benthic geochemistry of manganese, which has provided a method for the determination of mass accumulation rate based on the steady state. Finally, piston cores have been used to characterize the deep anoxic diagenetic processes in a steady state (Bay of Biscay) and a transition state (Arcachon Bay) environment.
-Early diagenesis
-Marine sediment
-Bay of Biscay
-Arcachon Bay
-Spatial heterogeneity
-Temporal variability
-Steady state
-Transient state
-Benthic processes
Source: http://www.theses.fr/2009BOR13844/document

Sujets

• Golfe de Gascogne
• Bassin d'Arcachon
• État stationnaire
• État transitoire

Informations

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• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 26 Mo

Extrait

N° d’ordre : 3844






THÈSE

PRÉSENTÉE A

L’UNIVERSITÉ BORDEAUX 1

ÉCOLE DOCTORALE DES SCIENCES ET ENVIRONNEMENTS

Par Aurélia MOURET

POUR OBTENIR LE GRADE DE

DOCTEUR
SPÉCIALITÉ : Biogéochimie et Ecosystèmes

BIOGEOCHIMIE BENTHIQUE : PROCESSUS COMMUNS ET
DIVERGENCES ENTRE LES SEDIMENTS LITTORAUX ET
CEUX DES MARGES CONTINENTALES
Comparaison entre le Bassin d’Arcachon et le Golfe de Gascogne

Directeur de thèse : Pierre Anschutz



Soutenue le : 2 octobre 2009

Après avis de :

M. RAGUENEAU, Olivier Directeur de recherche CNRS, UBO-IUEM, Brest Rapporteur
M. LUDWIG, Wolfgang Professeur, Université de Perpignan Rapporteur

Devant la commission d’examen formée de :

M. LECROART, Pascal Professeur, Université Bordeaux 1 Président du jury
M. ANSCHUTZ, Pierre Professeur, Université Bordeaux 1 Directeur de thèse
M. RAGUENEAU, Olivier Directeur de recherche CNRS, UBO-IUEM, Brest Rapporteur
M. LUDWIG, Wolfgang Professeur, Université de Perpignan Rapporteur
Mme HOWA, Hélène Maître de conférence, Université d’Angers Examinatrice
M. VIOLLIER, Eric Maître de conférence, LGE-IPGP, Paris VII Examinateur
Mme SCHMIDT, Sabine Chargée de recherche CNRS, Université Bordeaux I Membre invitée
Université Bordeaux 1
Les Sciences et les Technologies au service de l’Homme et de l’environnement
!


Remerciements


Trois années ont passé, trois années à la découverte du milieu scientifique et de
l’enseignement, trois années dans un laboratoire ponctuées de très très belles rencontres, trois
années qui m’ont permis d’apprendre, de grandir et d’évoluer.
Il y a de nombreuses personnes que j’aimerais remercier. Mais la première qui va
inaugurer ces pages c’est Pierre Anschutz. Tout d’abord, c’est grâce à lui que j’ai eu envie de
econtinuer en géochimie à la fin de ma 3 année de licence et, de retour d’une année au Canada
qui a confirmé mes choix, c’est après notre rencontre fortuite dans les couloirs d’EPOC que la
grande aventure a démarré. Pierre, tu as été plus qu’un directeur de thèse, tu as été le meilleur
des « grands chefs ». Ton humanité, ta gentillesse, ta simplicité et ton grand respect des autres
font l’unanimité chez tous tes nombreux stagiaires, thésards, membres de ton équipe et
collaborateurs. Merci pour tout ce que tu m’as appris, mais aussi pour ton écoute, tes conseils,
ta bonne humeur et tous les litres de café qui m’ont permis de tenir la barre jusqu’au bout (et
je vais la faire avant toi, non pas « le bar »… je t’entends déjà te marrer).
Je voudrais également remercier Hélène Howa, THE chef de mission, notre maman poule à
tous sur les bateaux comme en témoigne notre œuvre picturale de Forclim 7 et qui a accepté
d’être membre de mon jury de thèse. Tu as toujours su motiver tes troupes quels que soient les
conditions climatiques et les problèmes techniques (et pourtant on en a essuyé des tempêtes et
des câbles électroporteurs qui ne marchaient pas…). Merci pour tout ce que tu m’as appris sur
les bateaux, mais également pour ton enthousiasme, ta franchise, ta confiance, tes
encouragements, ton soutien et tes conseils qui m’ont été très utiles dans les moments de
doute…
Un grand merci également à Bruno Deflandre, alias mister high-tech. Depuis nos premières
manips ensemble à Cassy, tu m’as appris et tu m’apprends encore beaucoup de choses sur le
monde de la géochimie et c’est toujours avec plaisir que je viens dans ton bureau taper la
discut tout en partageant un p’tit repas maison et quelques princes.
Et qu’auraient été ces 3 années sans mon p’tit Domi !!! Ah Domi, tu es la coqueluche de
etous les stagiaires et notre rayon de soleil du couloir est du 2 étage grâce à ta bonne humeur
et tes blagues ! Merci pour ta gentillesse, ton écoute, ton aide et ton soutien dans les moments
difficiles. Tu es vraiment quelqu’un de formidable et je te souhaite encore tout plein de
bonheur à toi et ta p’tite famille et puis… viva la vaca libre !!!
Un grand merci également à Jonathan Deborde. C’est grâce à toi que j’ai fait mes
premières armes au laboratoire et dans la vase de Cassy. Tu as été un super prof et je te
remercie également pour toute ton aide et tes conseils quand j’ai débuté la thèse et le
monitorat. Continue à profiter de la vie et du surf et à bientôt j’espère !
Merci également à Pascal Lecroart, président de mon jury et grand sage parmi les sages, à
Gwen Abril, le baroudeur de l’équipe et Henri Etcheber et ses espadrilles devenues célèbres.
Quelle ambiance dans cette équipe !! Bravo à vous tous et continuez longtemps comme ça !
Un grand merci également à l'ensemble des autres membres de mon jury pour leurs
remarques, leurs conseils et leur intérêt au cours de la soutenance. Merci à Wolfgang Ludwig
et Olivier Ragueneau d'avoir accepté d'être rapporteurs de ces travaux, à Eric Viollier et
Sabine Schmidt qui ont examiné cette thèse.
Et puis ces trois années ont été ponctuées de grands moments de science et de fous rires
avec les nombreux p’tits loulous stagiaires qui sont passés par là ! Un clin d’oeil plus
particulier à la p’tite Marie, alias ma pitchounette, j’espère que tu continueras à rire et à
chanter chez m’sieur hulot à Paris et je vous souhaite que du bonheur à toi et Arnaud ton
namoureux. Merci également à Célinette la mistinguette qui bosse déjà comme un chef,
!

Brubru avec qui on a dompté l’AX (pas toujours avec succès !) et bravé les tempêtes à
Marennes Oléron, Sandrinette, Alexandre, Elodie, Thomas, Géraud, David, Adrien, Jessy…
Et puis bien sûr il y a les incontournables, les compagnons des bons moments comme des
moins bons, ceux avec qui on a ri, on a pleuré et on a (beaucoup) bu aussi, mes p’tits
poulets !!! Grâce à vous ces trois années ont été bien plus que l’apprentissage du monde
scientifique, ça a été une superbe aventure humaine avec des moments forts et de très belles
amitiés !!! Tout d’abord, une spéciale dédicace à mes copaings du bureau Caraïbes, Caro et
son Soulac qui réchauffe les cœurs, Aurélie qui attend les extraterrestres à Arès avec Tonio et
la p’tite Irène et Rafoufou et ses inoubliables rafaelleries. Je n’oublierai jamais nos karaokés
du midi sur Marylou, nos quarts d’heures de folie sur Franky ou un bon vieux morceau de
disco ou de funk (hein foufounet !), les très fameux apéros Caraïbes et j’en passe !!!! Et tous
ces moments de joie, de délire (comme par exemple l’histoire devenue célèbre de
Pegggyyyyyyy !!!!!), de danses endiablées (aie aie aie le genou…) avec Juju et le Sidyhouff
power, Elo ma poulette relookeuse préférée, Fifine qui s’est occupée de moi comme une p’tite
maman quand mon genou m’a lâché la première fois, Nico qui boit la bière plus vite que son
ombre, Lolo le mérignacais, Mr Chassagne ou l’homme qui a toujours la classe, Mathieu
organisateur de sorties terrain dans des conditions terribles (dur dur les huîtres/loupiac/foie
gras sur le bassin !!), Emilie membre de l’expédition bretonne avec feu la batmobile, Manu et
ses bébés pigeons, Samy et Mariiiiine, la p’tite Marion, François le râleur au cœur tendre, la
p’tite Marie Lisette, Laurie, Aurélie, Samuel, Florient, Florent, Pierre, Laurent, Bruno, les
Vincents, Filipa, Cons… Que de belles rencontres !! Et même si pour le moment nos chemins
à tous se séparent et que vous allez tous me manquer, je suis sure qu’on se retrouvera tôt ou
tard (le plus tôt possible quand même !!).
Un grand merci aussi à toutes les personnes avec qui j’ai partagé de bons moments pendant
les missions et sur le terrain. Merci tout d’abord aux marins du Côtes de la Manche, du
Téthys, de la Thalia et du Sarmiento de Gamboa. Merci ensuite aux habitués des missions
PECH, FORCLIM et BEHEMOTH (et oui y en a qui aiment ça !!), c’est à dire les Sophie