Genomique comparative et Alignement de sequences biologiques

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Genomique comparative et Alignement de sequences biologiques Catherine Matias CNRS - Laboratoire Statistique & Genome, Evry Etats de la Recherche de la SMF-oct 2009

  • biologie moleculaire

  • etats de la recherche de la smf-oct

  • alignement

  • alignement de sequences biologiques

  • genomique comparative


Publié le : jeudi 1 octobre 2009
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G´enomique comparative et Alignement de
s´equences biologiques
Catherine Matias
´CNRS - Laboratoire Statistique & G´enome, Evry
´Etats de la Recherche de la SMF-oct 2009Sommaire :
Introduction `a la biologie mol´eculaire
Partie II : Alignement par fonction de score
Partie III : Alignement statistique
Partie IV : Alignement multiplePremi`ere partie I
Introduction `a la biologie mol´eculaireSommaire : Introduction `a la biologie mol´eculaire
Biologie mol´eculaire
G´enomique comparative
Alignement
Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equencesSommaire
Biologie mol´eculaire
G´enomique comparative
Alignement
Repr´esentation graphique de l’alignement de deux s´equencesLa cellule (avec ou sans noyau)L’information g´en´etique : les chromosomes
Chez l’Homme, 22 paires de chromosomes plus une paire de
chromosomes sexuelsL’information g´en´etique : l’ADN
Chez l’Homme, 3,4 milliards de paires de bases
4 bases diff´erentes : A,C, G et
T
Appariement C/G et A/TL’expression des g`enes
Un g`ene = une petite unit´e d’ADN, qui code une prot´eineAu final
I De nos jours, on est capables
I de «s´equencer les g´enomes des organismes»
I de connaˆıtre la s´equence d’une prot´eine
I Les s´equences biologiques = soit des s´equences d’ADN, soit
des s´equences d’acides amin´es
I On ne sait rien sur la plupart des s´equences (fonction,
structure...)
I La g´enomique comparative consiste `a comparer une
s´equence inconnue avec une base de donn´ees de s´equences
connues pour tenter d’en tirer de l’information

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