Module de Base Microbiologie Infections Urinaires Diagnostic techniques et interprétation de l'examen cyto bactériologique des urines ECBU

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Niveau: Elémentaire, Primaire, CE2, CM1, CM2
Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprétation de l'examen cyto-bactériologique des urines(ECBU) 1 Faculté de Médecine Montpellier-Nîmes Octobre 2005 J.P. LAVIGNE ED Infections Urinaires Diagnostic, Techniques et Interprétation de l'Examen Cyto-Bactériologique des Urines (ECBU) Objectifs 1. Définir les termes : leucocyturie, hématurie, bactériurie, cystite, pyélonéphrite 2. Expliquer les principaux mécanismes physiopathologiques de l'infection urinaire 3. Citer les principales indications de l'ECBU 4. Décrire les conditions de prélèvement d'un ECBU 5. Argumenter les intérêts et les limites de la bandelette urinaire 6. Expliquer le principe de l'ECBU 7. Interpréter un compte-rendu d'un ECBU 8. Connaître les principales bactéries responsables d'infections urinaires chez l'homme : Bactéries à Gram positif : S. aureus, Enterococcus spp. Bactéries à Gram négatif : Entérobactéries (E. coli +++), P. aeruginosa Plan de cours I- Introduction .........................................................................................................................2 II- Physiopathologie des infections urinaires......................................................................2 II.1- Infection ascendante ................................................................................................................ 2 II.2- Infection hématogène............................................................................................................... 2 II.3- Infections iatrogènes nosocomiales....................................................................................... 2 III- Indications de l'ECBU.......................................................................................................2 IV- Prélèvements ....................................................................................................................3 V- La Bandelette Urinaire.......................................................................................................3 VI- L'ECBU...............................................................................................................................4 VI.

  • pertes vaginales

  • bactérie

  • méthode courante en raison du risque infectieux

  • vessie

  • bandelettes urinaires

  • infections urinaires

  • femme en raison de l'urètre court

  • microbiologie- infections urinaires - diagnostic

  • femme en période d'activité génitale

  • bactéries responsables des infections urinaires


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Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
ED Infections Urinaires Diagnostic, Techniques et Interprtation de lExamen Cyto-Bactriologique des Urines (ECBU) Objectifs 1. Dfinir les termes : leucocyturie, hmaturie, bactriurie, cystite, pylonphrite 2. Expliquer les principaux mcanismes physiopathologiques de linfection urinaire 3. Citer les principales indications de lECBU 4. Dcrire les conditions de prlvement dun ECBU 5. Argumenter les intrts et les limites de la bandelette urinaire 6. Expliquer le principe de lECBU 7. Interprter un compte-rendu dun ECBU 8. Connatre les principales bactries responsables dinfections urinaires chez lhomme :  Bactries  Gram positif :S. aureus, Enterococcusspp. Bactries  Gram ngatif : Entrobactries (E. coli+++),P. aeruginosa Plan de cours I- Introduction .........................................................................................................................2 II- Physiopathologie des infections urinaires ......................................................................2 II.1- Infection ascendante ................................................................................................................ 2 II.2- Infection hmatogne ............................................................................................................... 2 II.3- Infections iatrognes nosocomiales ....................................................................................... 2 III- Indications de l'ECBU .......................................................................................................2 IV- Prlvements ....................................................................................................................3 V- La Bandelette Urinaire.......................................................................................................3 VI- L'ECBU...............................................................................................................................4 VI.1- Cytologie urinaire .................................................................................................................... 4 VI.2- Culture, Interprtation des Rsultats .................................................................................... 4 VI.3- Bactries responsables des Infections Urinaires ................................................................ 5VII- Antibiotiques oraux pour Infections Urinaires .............................................................6 VIII- Ouvrages et site de rfrence .......................................................................................6 Annexe 1 .................................................................................................................................7 Annexe 2 .................................................................................................................................8 Annexe 3………………………………………………………………………………………………9
J.P. LAVIGNE
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Facult de Mdecine Montpellier-Nmes
Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
I- Introduction L'urine est strile en dehors de toute infection. Elle peut tre souille lors de la miction par les microorganismesdelapeauetdesmuqueusesetlesscrtionsurtrales.Leserreursdi'nterprtationsont nombreuses si le prlvement est incorrect. II- Physiopathologie des infections urinaires Ilexiste3typesprincipauxdi'nfectionsurinaires:II-1 Infection ascendante: les facteurs favorisants sont : - les anomalies de l'arbre urinaire, congnitales ou acquises, - la contamination du mat urinaire par les bactries commensales d'origine fcale ou prinale, - plus frquente chez la femme en raison de l'urtre court (proximit du vagin avec risque de contamination par la flore vaginale). II-2 Infection hmatogne:fait suite  une bactrimie. II-3Infections iatrognes - nosocomiales:  la suite de manœuvres endoscopiques, de sondages, de cathtrismes. *Les facteurs prdisposantsont: - la prsence de calculs rnaux et vsicaux - l'existence d'un reflux urtral - la grossesse - l'hypertrophie prostatique - les problmes neurologiques retentissant sur la vessie par perte du contrle sphinctrien - l'urtre court chez la femme - le cathtrisme de la voie urinaire *Les facteurs de virulence bactrienssont: - l'adhsion de la bactrie  l'pithlium vsical (rle des pili chezE. coli), - au niveau rnal: l'existence d'une capsule bactrienne, la production d'une hmolysine ou d'une urase(Proteusspp.), - la colonisation du mat urinaire. III- Indications de lECBU Un examen des urines est ncessaire :  en cas de signes decystite(infection superficielle de la paroi vsicale induisant brlures mictionelles, envie imprieuses et frquentes, pollakiurie, dysurie…), depylonphrite(infection du bassinet avec envahissement intersticiel du rein entranant la mme symptomatologie que la cystite associe  de la fivre et des douleurs lombaires) ou de prostatite(fivre, frisson, douleurs pelviennes, tnesme rectal et troubles fonctionnels urinaires) la si bandelette urinaireest positive, ou en cas depyurieou dhmaturie lors defivre suprieure  39C(notamment chez le nourrisson) de lors contrledun traitement antibiotique aprs une infection urinaire dans certainescirconstancescliniques : femme enceinte, diabte sucr, immunodpression, malformation urologique, sondage urinaire, tat grabataire…
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Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
IV- PrlvementsLors de la miction, l'urine peut tre souille par les microorganismes et les produits des scrtions dcolles au niveau du segment terminal de l'urtre et du mat. Le sondage vsical, longtemps considr comme indispensable, doit tre cart comme mthode courante en raison du risque infectieux (jusque 4 %).
La qualit du prlvement conditionne la qualit de l'examen.
3 situations de recueil: *Miction normale:jet (Le 2 milieu du jet) est recueilli lematindans unrcipient strile; le 1 jet peut tre conserv en cas de suspicion d'urtrite ou de prostatite. Unetoilette soigneuse doit prcder le recueil avec un antiseptique doux ou de leau savonneuse suivi dun rinage  leau. - Femme: toilette vulvaire, position accroupie ou gyncologique, grandes lvres cartes. Sil y a des pertes vaginales, mme minimes, la mise en place dune protection vaginale est indispensable - Homme: toilette du gland et du mat urinaire - nouveau-n: mise en place d'une poche adhsive aprs toilette soigneuse du prine. Le risquedi'ntroduiredesgermesfcauxestimportant.Lesacnedoitpastrelaissenplaceplus de 20 min. Renouveler le sac au-del de ce temps. *Sonde  demeure: Ne jamais prlever dans le sac collecteur.Clamper la sonde pendant 10 min. Dsinfecter la sonde et ponctionner la sonde. Ne pas ouvrir la tubulure. *Ponction sus-pubienne:idal pour recueillir une urine strile. L'urine, recueillie dans un pot strile, doit tre transmise au laboratoire dans les 2h suivant le prlvement ou conserve  + 4 C. Un dlai maximum de 24 h  + 4 C permet de conserver toute la validit de l'examen cytologique. Un dlai plus long entrane des modifications de la population bactrienne. V- La Bandelette Urinaire Lintrt essentiel du dpistage par les bandelettes urinaires rside dans sa possibilit de ralisation au lit du malade et dans sa valeur prdictive ngative (VPN> 95%).
Le prlvement est identique  celui dun ECBU.
La bandelette urinaire sert  dpister :
une leucocyturie, par la dtection de lactivit estrasique
une bactriurie, par la dtection de nitrites
La bandelette urinaire ne peut pas tre utilise pour le dpistage dune bactriurie chez un patient porteur de sonde. La prsence de nitrites est une caractristique des entrobactries qui transforme le nitrate en nitrite. Les autres bactries nont pas cette capacit et ne sont donc pas dtectes par la bandelette (Ex :Pseudomonas aeruginosa,Staphylococcus aureus…)
Lutilisation de la bandelette chez le sujet g non sond est une mthode fiable sous rserve du respect des conditions dutilisation de la bandelette.
J.P. LAVIGNE
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Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
Lors dun premier pisode de cystite aigu non complique (chez une jeune fille), une bandelette urinaire positive suffit pour le diagnostic dinfection urinaire sans faire dECBU.
VILECBU VI-1CYTOLOGIEURINAIRE(SCHMAI) Le comptage des cellules seffectue  ltat frais, dans une cellule  numration (Kova slide). La prparation est observe au microscope avec lobjectif X25. *Hmaties - leucocytes4 normalement:hmaties < 10 /ml 4 leucocytes < 10 /ml * Cellules pithliales - il existe quelques cellules pithliales rnales et vsicales  l'tat normal, - leur prsence est augmente en cas de nphropathies tubulo-interstitielles aigus. * Cylindres Les cylindres sont forms dans la lumire du nphron par prcipitation de la muco-protine de Tamm-Horsfall scrte par ces mmes cellules pour tre limines dans l'urine. .c. hyalins: normal, sans signification pathologique, .c. leucocytaires: signe une raction inflammatoire aigu du parenchyme rnal,  .c. pithliaux: forms des cellules de l'pithlium tubulaire lors d'une desquamation massive du nphron, .c. granuleux: agglomrat de dbris cellulaires, .c. cireux: stade ultime de la dgnrescence des cylindres granuleux aprs une stase prolonge:encasdi'nsuffisancernalechroniqueavance.* Cristaux - l'urine est normalement sature en sels de calcium, phosphate, acide urique. - leur prsence n'a pas de signification pathologique sauf: .a.urique:encasdi'nsuffisancernaleaigudonnantunehyperuricmie..cystine : en cas de cystinurie. VI-2CULTURE-INTERPRTATION DESRSULTATS(SCHMAII) - il est conseill de dnombrer les bactries prsentes dans l'urine afin de distinguer les germes contaminants des germes potentiellement responsables d'une infection urinaire. Le seuil significatif est 5 fix 10 bactries/ml. Un milieu densemencement CPS (bioMrieux) permet cette numration des germes.Une ou deux espces isoles sont  lorigine de linfection urinaire. Au del, le prlvement est considr comme contamin par une flore polymicrobienne. Il doit tre effectu  nouveau. - la numration bactrienne est prise en dfaut : . lors des mictions nombreuses et rptes, empchant la multiplication massive des bactries dans la vessie. .lorsqueli'nfectionestailleursquedanslavessie(bassinet,prostate,tissupara-urtral).. en cas de pH basique des urines. . en cas de prsence de substances antibactriennes dans les urines. . lors des infections par des bactries  croissance lente -unrsultatd'urinesi'nterprteenassociantlacytologieetlabactriologie.
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Module de Base 3 Microbiologie- Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
*Exemples de rsultats:4 Cas 1 : leucocyturie: < 10 /ml 4 bactriurie:10 /ml Etiologie : urine normale, ne pas refaire l'ECBU 4 Cas 2 : leucocyturie: < 10 /ml 5 bactriurie10 /ml 1 espce = - infection dbutante, refaire ECBU aprs un traitement ATB (J3)  -terrain immuno-dprim : infection urinaire  - infection chronique  - infection sur sonde plusieurs espces (> 2): contamination 4 Cas 3 : leucocyturie: > 10 /ml 5 bactriurie > 10 /ml 1 espce ou 2 espces dans 2 prlvements Etiologie : infection urinaire 4 Cas 4 : leucocyturie: > 10 /ml 4 bactriurie:10 /ml Etiologies : infection urinaire traite et  poursuivre  tuberculose urinaire  infection urtrale: 1jet (gonocoque,Chlamydia trachomatis,  Mycoplasme)  souillure vaginale:  refaire  causes non bactriennes: mdicaments(= phnactine: leucocyturie interstitielle chronique) malformations urologiques maladie nphrologique avec rein inflammatoire ou traumatique leucmie, tumeur infection virale ou parasitaire (candidurie) VI- 3 BACTRIES RESPONSABLES D'INFECTIONSURINAIRES*Milieu Hospitalier : Escherichia coli(40%)Proteusindole + Providencia, Klebsiella, Serratia, S. aureus Pseudomonas *Milieu Communautaire : E. coli(80%)Proteus mirabilis Entrocoques *Femme en priode d'activit gnitale: Streptocoque BStaphylococcus saprophyticus*Recherches particulires  signaler au laboratoire: - leptospires - B.K. - anarobies - gonocoque
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VII- Antibiotiques Oraux pour Infections Urinaires(Tableau I)Utilisation dantibiotiques  limination urinaire Ampicilline, amoxicilline: 37  50% des bacilles  Gram ngatif sont rsistants par production deβ-lactamases. Trs utile chez la femme enceinte. Amoxicilline+acide clavulanique: actif contre la plupart des bacilles  Gram ngatif rsistant  l'ampicilline. Trs utile chez la femme enceinte. re e Cphalosporine de 1 et 3 gnration: spectre plus large que l'ampicilline mais inactif vis  vis des streptocoques. Utile chez la femme enceinte. Cotrimoxazole: intressant pour les traitements sans diagnostic bactriologique prcis. Rsistance en nette progression : Ne sont plus utiliss en premire intention. Nitrofurantoine et drivs: antiseptiques actifs  pH acide (pas pour les infections Proteus), pour les infections urinaires non compliques. Utiliss en monodose. Acide nalidixique: pour les infections non compliques  bacilles  Gram ngatif ou aprs un chec dun traitement monodose. Inactif sur les Gram positif. Contre-Indiques chez la femme enceinte. Fluoro-quinolones (+++): trs large spectre. Actif sur la majorit des germes responsables dinfections urinaires, aprs un chec dun traitement monodose, pour les infections svres, dont celles Pseudomonas aeruginosa. Inactif sur les entrocoques (>50% de rsistance). Contre-Indiques chez la femme enceinte. VIII- Ouvrage et site de rfrence PILLY, Ed. 2M2 Abrg de bactriologie, Ed. MASSON Internat 2004, Maladies Infectieuses, Ed. Vernazobres Grego http://lyon-sud.univ-lyon1.fr - Rubrique Cours en ligne DES bactriologie
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Annexe 1 Schma I: Principe de lECBU
                          !       "# $%&' ( %&'  ) ( %&'
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Annexe 2 Schma II: Interprtation dun ECBU * &
 "$ 
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J.P. LAVIGNE
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Module de Base 3 Microbiologie
 Infections Urinaires - Diagnostic, techniques et interprtation de lexamen cyto-bactriologique des urines(ECBU)
Annexe 3 Tableau I: JP Lavigne, V Le Moing, A Sotto.: Principaux types dinfections urinaires et leur traitement. Tir de Quels antibiotiques utiliser en pratique courante dans les infections urinaires communautaires en France ?. Spectra Biologie. 2005 re1 Formes cliniques Antibiothrapie de 1 intention Dure Commentaires Utilisation dAB  limination urinaire prolonge. Infection urinaire basse non complique de la pfloxacine 800mg Indications : femme de moins de 65 ans, non femme jeune ou ofloxacine 400 mg enceinte, sans fivre ni douleur lombaire, voluant  ou cirpofloxacine 500 mg depuis moins de trois jours, sans antcdents ou fosfomycine-tromtamol 3g monodose- po urologiques ou nphrologiques, en labsence de ou nitrofurantone 50  100 mg pathologie sous-jacente svre (diabte sucr, ou cotrimoxazole 1g immunodpression…) et sans intervention ou endoscopie urologique rcente. norfloxacine 800 mg/jlomfloxacine 400 mg/j 3 jours - po Echec du traitement court, femme > 65 ans, terrain Infection urinaire basse de la femme Quinolone (acide nalidixique 100mg x2) (diabte sucr, immunodpression…) (autres situations) ou FQ (norfloxacine 400mg x2) po 7  10 jours ou C3G (cfixime 200mg x2) po ou AMC (500mg x2) po Pylonphrite non complique C3G (cefotaxime 1g x3/j ou ceftriaxone 1g) iv 10  21 jours  ou FQ (ofloxacine 200 mg x2/j (po ou iv) ou ciprofloxacine 750mg x2/J po ou 200mg x2/j iv) Association dun traitement urologique Pylonphrite complique Aminoside 3  5 mg/kg 1 injection (7  10 jours) 21 jours au moins 2 + C3G inj ou FQ Infection urinaire basse au cours de la grossesse Pni A (500mg x3) ou cphalosporine (cfuroxime Courte : 3 jours  500mg x2) Conventionnelle : 10 jours 3 Traitement initi  lhpital Pylonphrite au cours de la grossesse C3G iv puis po 15  21 jours ECBU 1/mois jusqu laccouchement Prostatite aigu C3G iv ou FQ po  aminosides 4  6 semaines Le choix se porte surtout sur les FQ, Prostatite chronique Fonction de lantibiogramme 12 semaines ventuellement le cotrimoxazole ; les cyclines sont indiques en cas dinfection ChlamydiaCf Confrence de Consensus 2002 Bactriurie asymptomatique Selon le contexte 1 Lantibiothrapie est guide secondairement par lantibiogramme. Lorsque le traitement a t initi par voie intra-veineuse, le relaisper os est habituellement pris aprs 2 3 rmission des signes infectieux. Le choix de la C3G ou de la FQ est le mme que pour la pylonphrite non complique. Le choix de la C3G est le mme que pour la pylonphrite non complique. e iv : administration intra-veineuse ; po : per os ; AMC : amoxicilline + acide clavulanique ; FQ : fluoroquinolone; C3G : Cphalosporine de 3 gnration
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