CARACTERISATION DE L'ECOSYSTEME CAECAL ET SANTE DIGESTIVE DU LAPIN: CONTROLE NUTRITIONNEL ET INTERACTION AVEC LA LEVURE PROBIOTIQUE SACCHAROMYCES CEREVISIAE

Kimse Moussa

Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
THÈSE En vue de l'obtention du DOCTORAT DE L'UNIVERSITÉ DE TOULOUSE Délivré par Institut National Polytechnique de Toulouse Discipline ou spécialité : Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition JURY Directeur de thèse: T. GIDENNE Rapporteur : L. MAERTENS Président : D. MORGAVI Examinateur : JP MARDEN Ecole doctorale : Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingénieries Unité de recherche : UMR 1289 TANDEM (Tissus, Animaux, Nutrition, Ecosystème, Métabolisme) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) à Auzeville (31) Directeur(s) de Thèse : T. GIDENNE (Directeur) & C. BAYOURTHE (Co-Directrice) Rapporteurs : L. MAERTENS & D. MORGAVI Présentée et soutenue par Moussa KIMSE Le 23-02-2009 Titre : CARACTERISATION DE L'ECOSYSTEME CAECAL ET SANTE DIGESTIVE DU LAPIN: CONTROLE NUTRITIONNEL ET INTERACTION AVEC LA LEVURE PROBIOTIQUE SACCHAROMYCES CEREVISIAE

• comparaison des caracteristiques caecales entre lapins conventionnels


• biotope


• tableau lesionnel des lapins atteints de troubles digestifs


• performances de croissance du lapin


• taux de survie dans le tube digestif du lapin


• levure


• sacrifices des animaux

Sujets

• Aymard
• Segura
• Institut national polytechnique de Toulouse
• Toulouse

Informations

• Publié par: profil-feym-2012
• Nombre de lectures: 46
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 3 Mo

Extrait

THÈSE


En vue de l'obtention du

DOCTORAT DE L ’UNIVERSITÉ DE TOULOUSE

Délivré par Institut National Polytechnique de Toulouse
Discipline ou spécialité : Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition


Présentée et soutenue par Moussa KIMSE
Le 23-02-2009

Titre : CARACTERISATION DE L'ECOSYSTEME CAECAL ET SANTE DIGESTIVE DU LAPIN:
CONTROLE NUTRITIONNEL ET INTERACTION AVEC LA LEVURE PROBIOTIQUE
SACCHAROMYCES CEREVISIAE

JURY

Directeur de thèse: T. GIDENNE
Rapporteur : L. MAERTENS
Président : D. MORGAVI
Examinateur : JP MARDEN

Ecole doctorale : Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingénieries
Unité de recherche : UMR 1289 TANDEM (Tissus, Animaux, Nutrition, Ecosystème, Métabolisme)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) à Auzeville (31)
Directeur(s) de Thèse : T. GIDENNE (Directeur) & C. BAYOURTHE (Co-Directrice)
Rapporteurs : L. MAERTENS & D. MORGAVI

REMERCIEMENTS

Le travail présenté dans ce mémoire de thèse a été réalisé à l’UMR 1289 TANDEM
(Tissus, Animaux, Nutrition, Ecosystème, Métabolisme) l’Institut National de la Recherche
Agronomique (INRA) à Auzeville (31), et a bénéficié de la collaboration de SA LFA
(Lesaffre Feed Additive) à Marcq-en Baroeul (59).

Je tiens dans un premier temps à rendre Grâce à Dieu pour m’avoir accordé la santé, le
Moral et surtout sa bénédiction pour la réalisation de mes études jusqu’à cet aboutissement.

Je tiens aussi à remercier vivement les membres du jury de cette thèse :
L. MAERTENS (ILVO, Animal Science Unit Scheldeweg 68 9090 Melle-Belgium) et D.
MORGAVI (INRA, Centre Clermont-Theix Unité de Recherche sur les Herbivores 63122
Saint-Genès-Champanelle) tous deux Rapporteurs
E. AUCLAIR (Lesaffre feed Additives A division of Société Industrielle Lesaffre 1, rue
du Haut Touquet 59520 Marquette-Lez-Lille)

J’adresse mes sincères remerciements à tous ceux qui ont contribué à la réalisation de ces
travaux :
C. MARTIN, (Unité de Recherches sur les Herbivores Equipe Digestion Microbienne et
Absorption INRA Centre de Clermont-Ferrand Theix 63122 Saint-Genès Champanelle), pour
ces précieuses propositions pour l’avancement de la thèse
V. THEODOROU et toute son équipe (UMR1054 Neurogastroentérologie et nutrition
NGN 180 chemin de Tournefeuille BP 93173, 31027 Toulouse Cedex 3) pour ses
participations aux comités de thèse et la mise au point de la mesure de la MPO chez le lapin
T GIDENNE, Directeur, C. BAYOURTHE co-Directrice et V. MONTEILS co-
Encadrante de cette thèse, pour m’avoir accueillie dans l’unité, pour avoir encadré ces travaux
et pour la confiance qu’ils m’ont témoignée au cours de ces 3 années.
C. LENOIR, Responsable laboratoire contrôle qualité SI Lesaffre et toute son équipe
JP. MARDEN, Responsable développement ruminant LFA.

J'exprime également toute ma reconnaissance à l'ensemble de l’équipe TANDEM, sans qui ce
travail n’aurait pu voir le jour :

~ 1 ~
Viviane BATAILLER et Véronique TARTIE, la première pour son aide administrative au
cours de ces 3 années, mais aussi pour sa perpétuelle bienveillance et son aide précieuse
apportée à la touche finale du document, et la seconde pour l’ensemble de toutes les
« manips » très contraignantes à faire (analyses levure, sacrifices des animaux) et également
pour sa contribution à la touche finale à la rédaction du document. Muriel SEGURA, Carole
BANNELIER, Béatrice GABINAUD pour leur patience et leur motivation à m'enseigner les
notions essentielles des analyses de laboratoire, pour leurs aides chaleureuses et leur bonne
humeur. Laurence FORTUN-LAMOTHE pour ses conseils éclairés et sa capacité à expliquer
et à faire comprendre ce qui semble au début incompréhensible grâce à sa grande pédagogie.
Laurent CAUQUIL et Sylvie COMBES pour leurs aides notamment en microbiologie (SSCP),
en Stat et en informatique. André LAPANOUSE, Patrick AYMARD, Jean DE DAPPER et
Jacques DE DAPPER pour leur appui technique à l’élevage et lors des sacrifices des animaux.
Michèle THEAU-CLEMENT pour ses encouragements et JM PEREZ. Aux stagiaires et
thésards (collègues) pour le temps que nous avons passé ensemble ce sont Rory
MICHELLAND, Mélanie MARTIGNON, Asma ZENED, Samer MOURE, Elena… à vous, je
dirai ceci : c’est dur la thèse, mais on arrive toujours à la fin ; courage !
Je remercie particulièrement le Directeur de l’UMR X. FERNANDEZ et JF GRONGNET
UMR-CENAH (Reine)


Enfin, je voudrais remercier tout particulièrement ma grande famille pour son soutien
constant tout au long de mes études. Mes pensées vont vers mes deux charmantes filles (Ange
Nsissa G.E KIMSE et Priscille A. KIMSE) et à leur mère Charlotte KAMENAN qui ont
passées tout ce temps sans leur père. Je remercie sincèrement Mlle F. AKE à l’INAPG de
Paris, Mes amis proches à Toulouse, JP. MONEY, M. NGUESSAN, H. AKIN, B. KOFFI,
ERIC etc. et les Amis de la promotion 2000 de la filière Productions Animales de l’Université
d’Abobo-Adjamé, pensée particulière à ceux qui nous ont quittés.


« Je pense que la vie est une chance ou une bénédiction divine ; utilisons donc chaque
seconde, chaque minute et chaque jour pour rendre service à sa famille, sa communauté, son
pays, son continent, au monde entier et si possible à l’univers tout entier… »


Yes,
I did it !
~ 2 ~

LISTE DES TABLEAUX
TABLEAU 1: COMPOSITION CHIMIQUE DES CAECOTROPHES ET DES FECES DURES EN %MS (GIDENNE & LEBAS, 2006) ................ 33
TABLEAU 2: COMPARAISON DES CARACTERISTIQUES CAECALES ENTRE LAPINS CONVENTIONNELS SAINS ET LAPINS DIARRHEIQUES
(BENNEGADI, 2002) .......................................................................................................................................... 39
TABLEAU 3: PRINCIPALES TECHNIQUES D’ECOLOGIES MOLECULAIRES POUR L’ETUDE DE L’ECOSYSTEME MICROBIEN, AVANTAGES ET
INCONVENIENTS (ZOETENDAL ET AL., 2004) ........... 41
TABLEAU 4: COMPOSITION CHIMIQUE D’UNE CELLULE DE LEVURE....................................................................................... 48
TABLEAU 5: SYNTHESE DE TRAVAUX DE RECHERCHE SUR L’ACTION DES LEVURES PROBIOTIQUES CHEZ LE LAPIN ........................... 60
TABLEAU 6: SYNTHESE DES EFFETS DE LA LEVURE PROBIOTIQUE S. CEREVISIAE, UTILISEE SEULE OU EN ASSOCIATION, SUR LES
PERFORMANCES DE CROISSANCE DU LAPIN. ............................................ 64
TABLEAU 7: EFFET DE LA SUPPLEMENTATION EN LEVURE SUR LA COMPOSITION SANGUINE DU LAPIN AGE DE 56 JOURS ................ 70
TABLEAU 8: POTENTIELS DES ELECTRODES DE REFERENCE (MV) EN FONCTION DE LA TEMPERATURE ET DE LA CONCENTRATION DE
CHLORURE DE POTASSIUM D’APRES (NORDSTORM, 1977) ....................................................................................... 78
TABLEAU 9: DILUTION ET CONCENTRATION DE CHAQUE SOLUTION DANS LES TUBES* ............................................................. 91
TABLEAU 10: COMPOSITION CENTESIMALE ET CHIMIQUE DE L’ALIMENT SELON LE FOURNISSEUR (RABLO FORMAX SALINO) ....... 107
TABLEAU 11: ALIMENTS EXPERIMENTAUX: INGREDIENTS ET COMPOSITION CHIMIQUE THEORIQUE ......................................... 112
TABLEAU 12: INGREDIENT DES MELANGES DE BASE (G/100G) ......................................................................................... 116
TABLEAU 13: ALIMENTS EXPERIMENTAUX: INGREDIENTS ET COMPOSITION CHIMIQUE THEORIQUE ......... 127
TABLEAU 14: EFFET DE LA METHODE ET DE LA PERIODE DE MESURE SUR LES VALEURS D'E , DE PH ET DE TEMPERATURE DU CONTENU H
CAECAL .......................................................................................................................... 137
TABLEAU 15: CARACTERISTIQUES DE L’ACTIVITE FERMENTAIRE CÆCALE EN FONCTION DE LA METHODE ET DE L’HEURE DE LA MESURE
.................................................................................................................................................................... 140
TABLEAU 16: TABLEAU CLINIQUE DES ANIMAUX DECEDES ............................................................... 146
TABLEAU 17: MORTALITE ET MORBIDITE EN FONCTION DU TYPE D’ALIMENT ENTRE 28 ET 56 JOURS D’AGE ............................. 147
TABLEAU 18: VARIATION DES PARAMETRES PHYSIQUES ET CHIMIQUES DU CAECUM EN FONCTION DE L’AGE ET DU REGIME DES LAPINS
SAINS ............................................................................................. 151
2
TABLEAU 19: CORRELATION (R ) ENTRE LES PARAMETRES DU BIOTOPE ET DU TAUX D'HAPTOGLOBINE ................................... 153
TABLEAU 20: CORRELATIONS ENTRE LA DIVE