M1 ESPRC 2011 Mise en pratique 22

Description

Niveau: Supérieur, Master, Bac+4
1 M1 ESPRC 2011?2012  Mise en pratique 22/02/2012  Concepts de base en épidémiologie, enquêtes de cohorte  JL FAILLIE    Exercice n° 1  Le Costa Rica et  la Finlande sont deux pays disposant de registres nationaux de cancer. On  souhaite comparer les taux d'incidence de cancer chez les hommes pour ces deux pays.    On a les données suivantes pour l'année 2002 (source : Cancer Incidence in Five Continents,  Vol. IX, 2007) :    Costa Rica hommes  0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans  60?74 ans  75 ans et +   Taux d'incidence  pour 100 000 PA 14,2  37,0  194,1  1166,8  2859,3    PA  842293  651146  359078  105244  36757    %  42,2%  32,7%  18,0%  5,3%  1,8%    nouveaux cas   120  241  697  1228  1051  Finlande hommes  0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans  60?74 ans  75 ans et +   Taux d'incidence  pour 100 000 PA 17,2  43,5  264,7  1600,5  3510,6    PA  647064  694665  763250  318343  106848    %  25,6%  27,4%  30,2%  12,6%  4,2%    nouveaux cas  111  302  2020  5095  3751  PA : Personnes?années    1. Calculez le taux d'incidence brut de cancer chez les hommes pour l'année 2002 et  pour les deux pays (donnez le taux pour 100 000 PA).  Taux d'incidence brut (Costa Rica) = M/PA = 3337/1994518 = 167.3 pour 100 000 PA  Taux d'incidence brut (Finlande) = M/PA = 11279/2530170 = 445.

• age  cas  obs 


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• Publié par: larec
• Publié le: 01 février 2012
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Extrait

M1ESPRC2011‐2012 Miseenpratique22/02/2012 Conceptsdebaseenépidémiologie,enquêtesdecohorte JLFAILLIE Exercicen°1 LeCostaRicaetlaFinlandesontdeuxpaysdisposantderegistresnationauxdecancer.On souhaitecomparerlestauxd'incidencedecancerchezleshommespourcesdeuxpays. Onalesdonnéessuivantespourl’année2002(source:CancerIncidenceinFiveContinents, Vol.IX,2007): CostaRicahommes0‐19ans 20‐39ans 40‐59ans60‐74ans75anset+ Tauxd'incidencepour100000PA 14,237,0194,11166,82859,3 PA84229365114635907810524436757 %42,2%32,7%18,0%5,3%1,8% nouveauxcas12024169712281051 Finlandehommes0‐19ans 20‐39ans 40‐59ans60‐74ans75anset+ Tauxd'incidencepour100000PA 17,243,5264,71600,53510,6 PA647064694665763250318343106848 %25,6%27,4%30,2%12,6%4,2% nouveauxcas111302202050953751 PA:Personnes‐années 1.Calculezletauxd'incidencebrutdecancerchezleshommespourl’année2002et pourlesdeuxpays(donnezletauxpour100000PA). Tauxd’incidencebrut(CostaRica)=M/PA=3337/1994518=167.3pour100000PA Tauxd’incidencebrut(Finlande)=M/PA=11279/2530170=445.8pour100000PA 2.Lasimplecomparaisondestauxbrutsd'incidencevousparait‐elleadaptée?Justifiez. Ladistributiondel'âgesembledifférenteauCostaRicaparrapportàlaFinlandeetl'âgeest unfacteurderisquedecancer.Lasimplecomparaisondestauxbrutsd'incidencesansprise encomptedel'âgeneparaitpasadaptée. 3.Quelleméthodeallez‐vousalorsutiliserpourrendrecettecomparaisoninformative? Justifiezvotreréponseetexpliquezlaméthodeenquelqueslignes. Ils'agitdestandardisationdirecte. Onchoisitunepopulationderéférencedontonconnaîtladistributiondel'âge. Oncalculelestauxd’incidencestandardisésdesdeuxpopulationsàcomparerenappliquant auxtauxd’incidencespécifiquesparâgeladistributiond'âgedelapopulationderéférence. OncalculeleCMFquiestlerapportdestauxd’incidencestandardisés. Oncalculel'intervalledeconfianceà95%duCMF.

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4.Effectuezlescalculsenprécisantlesétapesintermédiaires.Onprendralapopulation mondialecommepopulationderéférence. Monde0‐19ans20‐39ans40‐59ans60‐74ans75anset+Total Personnes‐années40000280002100090002000100000 Calculdutauxd'incidencestandardiséduCostaRica(TIsA) AgeTIPA(monde)Casthéoriques 0‐1914,20400005,68 20‐3937,002800010,36 40‐59194,102100040,76 60‐741166,809000105,01 75et+2859,30200057,19 somme100000219,00 TIsA=219.0pour100000PA Calculdutauxd'incidencestandardisédelaFinlande(TIsB) AgeTIPA(monde)Casthéoriques 0‐1917,20400006,88 20‐3943,502800012,18 40‐59264,702100055,59 60‐741600,509000144,05 75et+3510,60200070,21 somme100000288,91 TIsB=288.91pour100000PA CalculduCMF CMF=TIsA/TIsB=219.0/288.91=0.758 5.L'intervalledeconfianceà95%duparamètreest[0.729‐0.789].Donnezvotre conclusion. L’intervalledeconfiancenecontientpas1.LeCMFestsignificativementinférieurà1.Après ajustementsurl’âge,letauxd’incidencedecancerchezleshommesestplusbasauCosta RicaparrapportàlaFinlande.

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Exercicen°2 Alasuited'unaccidentindustrielsurvenuen2001,leréseaudedistributiond'eaupotable d'unevilleestcontaminéparunproduitconnupourêtrecancérigène.Ondésireétudierle risquedecancerparmilesenfantsnésdanscettevilleentre2001et2005. Unebasededonnéesestconstituéeprospectivementàpartirdetouslesenfantsnésdansla maternitédecettevilleentrele1erjanvier2001etle31décembre2005.Uncroisementde cefichieravecleregistrenationaldescancerspédiatriquesesteffectuélepremierjanvier 2006,permettantderepérerquatrecancerssurvenusentre0et4anschezlesenfantsnés danslamaternité. Letableausuivantindique:lenombredenaissancesvivantesenregistréesparannéedansla basededonnéesdelamaternitéetlesdonnéesnationalesderéférenceparâgepourletaux d'incidencedecancerpédiatrique.Lesquatrecasdecancerssurvenuschezlesenfantsnés danslamaternitésontégalementindiqués. Maternitédel'étude 1.01.011.01.021.01.031.01.041.01.05Taux Bilanau auauauauaud'incidence 01.01.06 31.12.0131.12.0231.12.0331.12.0431.12.05national 6 Nombrede pour10 naissances650600550550500PA PA vivantes 0‐1an?223.1 1‐2ans1cancer1cancer?187.2 2‐3ans?195.1 3‐4ans2cancers?185.8 4‐5ans?136.0 Total0‐5ans?? PA:Personnes‐années 1‐Dequeltyped'études'agit‐il? Ils'agitd'uneétudeépidémiologiqueobservationnelledecohorteprospective. 2‐Quelestlegroupederéférence?S'agit‐ild'ungroupederéférenceinterneouexterne? Engénéral,quellesdoiventêtrelescaractéristiquesdugroupederéférencedansune étudedecohorte? LegroupederéférenceestconstituédetouslesenfantsnésenFrancependantentrele1er janvier2001etle31décembre2005.Ils'agitd'ungroupederéférenceexterne. Lescaractéristiquesdugroupederéférencedansuneétudedecohortesont: ‐nonexposéaufacteurétudié ‐issusdelamêmepopulationsourcequelegroupeexposé ‐fortesimilitudeaveclegroupeexposésurtouteslescaractéristiquesayantunlienavecla maladieétudiée(souventauminimum:âge,sexeetcatégoriesocio‐professionnelle) ‐lesdifférenceséventuelles(facteursdeconfusionpotentiels)devrontêtreprisesencompte aumomentdel'analyse(diminuentlapuissancedel'enquête).

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3‐S'agit‐ild'uneétudemixte,dynamiqueoufixe? Ils'agitd'uneétudedecohortedynamique(ououverte):l'inclusiondessujetssepoursuit aufuretàmesurequelespremièrespersonnessontsuivies,letempsdeparticipationde chacundessujetsestvariable.Dansunecohortefixe(oufermée),touslessujetssontinclus audébutdel'étudesurunecourtepériode. 4‐Quelindicateurutilise‐t‐onpourévaluerlatailled'unecohorte? Onutiliselespersonnes‐temps.Cetindicateurcorrespondàlasommedestempsde participationdessujetsdelacohorte(tempsdeparticipation=duréeoùlesujetestàrisque dedevenirmalade).Onutiliseleplussouventlespersonnes‐années. 5‐Quelestl'avantagedecetindicateur? Ilprendencomptelessujetsquientrentdemanièredifféréedanslacohorte,lessujets décédés,lessujetsperdusdevue.Chaquesujetauntempsdeparticipationdansl'étude. 6‐Pourcalculercetindicateurlorsquel'ondisposeuniquementdeseffectifsdesujetsà risqueendébutd'annéeetdunombredenouveauxcasparan,quellessontles hypothèsesnécessaires? Onfaitl'hypothèsequelesdatesdesurvenuedesévénements(maladie,entréeousortie d'étude)sontrépartiesuniformémentsurl'année.Danscecas,lesévénementssurviennent enmoyenneenmilieud'année. 7‐Effectuezlecalcul.Onconsidérerapourcecalculquelesnaissancessontsurvenuesde manièrerégulièretoutaulongdel'année. Maternitédel'étude 1.01.011.01.021.01.031.01.041.01.05Taux Bilanau auauauauaud'incidence 01.01.06 31.12.0131.12.0231.12.0331.12.0431.12.05national 6 Nombrede pour10 naissances650600550550500PA PA vivantes 0‐1an3253002752752501425223.1 1‐2ans0649.5(1K)600549.5(1K)5502349187.2 2‐3ans006496005491798195.1 3‐4ans00648(2K)6001248185.8 4‐5ans00647647136.0 Total0‐5ans7467? LasommedesPAestde7467.

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8‐Calculezletauxd'incidencebrutdecancerobservédanslacohortependantlapériode 2001‐2005etsonintervalledeconfianceà95%. 6 TI=M/PA=4/7467=535.7pour10PA 2‐8 Var(TI)=M/PA =7.17x10 ‐6‐8 IC95%TI=TI+/‐1.96racine(Var(TI))=535.7x10+/‐1.96racine(7.17*10 ) 6 IC95%TI=[12.7‐1062.3]pour10PA 9‐Aprèsstandardisationsurl'âge,letauxd'incidenceobservéchezlesenfantsdela maternitéest‐ildifférentdutauxd'incidencenational? OncalculeleSMR. AgeCasTInationalNbattde PA 6 obspour10PAcas 0‐1an01425223.10,32 1‐2ans22349187.20,44 2‐3ans01798195.10,35 3‐4ans21248185.80,23 4‐5ans0647136.00,09 SMR=O/E=4/1.43=2.80 TestdesignificationduSMR: H 0 :SMR=1;H 1 :SMR≠1 2 SousH 0 ,(|O‐E|‐0.5) /Esuituneloiduχ2à1ddl. 2 2 chi2=(|O‐E|‐0.5)/E=(|4‐1.43|‐0.5)/1.43=3.00<3.84 (testduchi2à1ddl,seuilalpha=0.05). p>0.05 Onconclutqueletauxd'incidenceobservéchezlesenfantsdelamaternitén’estpas significativementdifférentdutauxd'incidencenational(leSMRn’estpassignificativement différentde1). 10‐Peut‐onaffirmeràpartirdecesdonnéesquelerisquedecancerestaugmentéchezles enfantsdelamaternité?Justifiezvotreréponse. Non,letauxd'incidenceobservéàpartird'uneétudedecohorten’estpassignificativement différentdutauxd'incidencenationalaprèsajustementsurl’âge. 11‐Peut‐onaffirmeràpartirdecesdonnéesquel'accidentindustrielayantentraînéla pollutiondel'eaudelavilleestàl'origined'uneaugmentationdelasurvenuedescancers pédiatriqueschezcesenfants?Justifiezvotreréponse. Non,letauxd'incidenceobservéàpartird'uneétudedecohorten’estpassignificativement différentdutauxd'incidencenationalaprèsajustementsurl’âge.Deplus,uneétude observationnellenepermetpasdeconclureàunliencausalentreuneexpositionetune maladie.

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12‐Onvouspréciseque5%deshabitantsdelavilleontdéménagéentre2001et2005. Celapeut‐ilavoirunimpactsurl'estimationdel'incidence?Comments'appellecebiais? Quepouvez‐vousproposerpourl'éviter? Oui,biaisdesélection(biaisdeperdusdevue).Celapeutavoirunimpactsurl'incidencesila causedudéménagementestenlienavecl'expositionet/oulamaladie. Parexemple,onpeutsupposerquelesparentsdéménagentcarleurenfantestmalade;ainsi lediagnosticdecancerestfaitdansuneautreville.Pourl'éviter,onpeutfairedes recherchescomplémentairespourpréciserledevenirdecespersonnes.  5%onpeutconsidérerquelebiaisn'apasd'impactimportant 13‐Commentprendreencomptelesenfantsde0à5ansayantemménagédanslaville entre2001et2005? Cesenfantsnesontpasinclusdanslacohorte.Ilsnesontpasexposésauproduit cancérigènedepuislanaissance. Exercicen°3 Pourétudierlerôleprotecteuréventueldel'aspirinesurlasurvenuedecancer,uneétudea étéentrepriseàpartirdessujetsvenusconsulterpourunbilandesantéàlasuited'une propositionquileuraétéenvoyée.Plusieursmilliersdeconsultantsontacceptéde participeretontétésuivienmoyenne12ans.Lesuivicomprenaitunquestionnaireà5ans et10ansaprèsl'inclusion.Lasurvenuedecancerétaitrepéréeparlesregistres d'hospitalisationdelarégiond'habitation. Al'inclusion,oninterrogeaitlessujetssurleurconsommationd'aspirinedes12derniers moisetdes30derniersjours.Dansl'analyse,onaconsidérécommeconsommateur d'aspirinelessujetsquiontdéclaréavoirprisaumoinsunefoisdel'aspirineles30derniers joursavantl'inclusion:59%étaientdanscecas. 1‐Dequeltyped'études'agit‐il? Ils'agitd'uneétudeépidémiologiqueobservationnelledecohorte(historico)‐prospective exposé‐nonexposé. 2‐Lorsdel'analysedulienentrelaconsommationd'aspirineetlasurvenuedecancer,les sujetsatteintsdecanceràlavisited'inclusionoudansles2premièresannéesdesuiviont étéexclus.Pourquoi? Respectdelachronologieexposition/maladie.Unintervallede0à2ansentreexpositionet survenuedecancersembleunepériodetropcourtepourimputerlasurvenued'uncancerà laprised'aspirine.Laprised'aspirinepeut‐êtredanscecasuneconséquencedelamaladie ennonsacause(silepatientprésentedesdouleursparexemple).

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