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Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8

  • mémoire


Thèse présentée à l'École Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé de l'Université Louis Pasteur de Strasbourg pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Louis Pasteur Strasbourg I par Sebastian M.C. CHARBONNIER Étude structurale et cinétique des interactions entre l'oncoprotéine E6 du virus du papillome humain et les domaines PDZ Soutenue publiquement le 28.11.2006 Membres du jury Directeur de Thèse : Dr Gilles Travé Rapporteur Interne : Dr Arnaud Poterszman Rapporteur Externe : Prof Dr Lawrence Banks Rapporteur Externe : Prof Dr Arnt Raae Examinateur : Prof Dr Bruno Kieffer

  • interactions entre l'oncoprotéine e6 du virus du papillome humain

  • personnes du département biotechnologie des interactions macromoléculaires

  • structure de protéine

  • interaction

  • précieux conseils

  • cha-cha

  • conseils concernant la rmn


Sujets

Informations

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Nombre de lectures 121
Langue Français
Poids de l'ouvrage 29 Mo

Extrait







Thèse présentée à l’École Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé de
l’Université Louis Pasteur de Strasbourg pour obtenir le grade de


Docteur de l’Université Louis Pasteur Strasbourg I

par

Sebastian M.C. CHARBONNIER

Étude structurale et cinétique des interactions entre
l’oncoprotéine E6 du virus du papillome humain et les
domaines PDZ


















Soutenue publiquement le 28.11.2006

Membres du jury

Directeur de Thèse : Dr Gilles Travé
Rapporteur Interne : Dr Arnaud Poterszman
Rapporteur Externe : Prof Dr Lawrence Banks
Rapporteur Externe : Prof Dr Arnt Raae
Examinateur : Prof Dr Bruno Kieffer Remerciements
REMERCIEMENTS
Les recherches qui font l’objet de ce mémoire ont été menées au sein de l’UMR CNRS/ULP
7175-LC1 IFR Gilbert Laustriat « Biomolécules et Innovations thérapeutiques », dirigée par le
Professeur Claude Kédinger, dans l’équipe Oncoprotéines, dirigée par le Dr. Georges
Orfanoudakis.

Je remercie la Ligue Nationale Contre le Cancer pour avoir financé les trois premières années
de ma thèse, l’Association pour la Recherche sur le Cancer pour m’avoir accordé une
quatrième année de financement et la Federation of European Biochemical Societies pour
m’avoir financé une formation pour la construction de vecteur d’expression à l’EMBL
Heidelberg.

Je tiens à remercier les membres de mon jury de thèse : le Professeur Lawrence Banks, le
Professeur Arnt Raae, le Dr. Arnaud Poterszman ainsi que le Professeur Bruno Kieffer d’avoir
bien voulu me faire l’honneur de juger mon travail. Je remercie particulièrement les
Professeurs Lawrence Banks et Anrt Raae pour avoir fait le long voyage d’Italie et de
Norvège, respectivement, pour assister à ma soutenance.

Je remercie sincèrement le Professeur Claude Kédinger pour m’avoir accueilli au sein de
l’UMR 7175-LC1, anciennement UMR 7100, pour l’intérêt qu’il a toujours porté à mon travail
ainsi que pour son soutien au cours des presque 5 années de mon séjour.

Je souhaite dédier ce paragraphe au Dr. Gilles Travé mon directeur de thèse. Gilles, je te
remercie du fond du cœur pour la confiance que tu m’as accordée durant ces 4 ans et demi
de chemin commun. Je te serais toujours reconnaissant pour ton excellent encadrement et
ta disponibilité continue. Je te dois la majorité de mes connaissances en matière de
biochimie et de biophysique. C’est grâce à toi que j’ai découvert la fascination pour le détail
atomique d’une structure de protéine, fascination qui ne m’a pas lâchée depuis. En outre, j’ai
également bénéficié et appris énormément concernant la rédaction scientifique. Je
n’oublierais jamais les nuits blanches ou tu m’as assisté en chambre froide ou les longues
nuits de rédaction de publications. Mais je te remercie surtout de m’avoir fait découvrir ta
façon parfois non-conventionelle de voir les choses, qui souvent a été source de créativité et
d’inspiration. Merci également de m’avoir fait voyager et découvrir la façon de travailler dans
des laboratoires allemands et norvégiens. Ces expériences à tes côtés m’ont certainement
2 Remerciements
ouvert l’esprit et m’ont beaucoup fait évoluer dans ma façon de travailler et de réfléchir. Je
te suis aussi reconnaissant pour ton optimisme chronique qui m’a toujours motivé et qui m’a
appris à ne pas baisser les bras après un échec, mais plutôt de le voir comme un défi. Bien
que nos relations professionnelles étaient très proches, tu m’as également appris à prendre
des initiatives et finalement à devenir indépendant. Je te remercie encore une fois pour
l’énergie et la confiance que tu as investies en moi et comme tu me reprochais d’être trop
modeste, je déclare que je pense ne pas t’avoir déçu à ce sujet. Je ne peux parler que pour
moi, mais je ne regrette aucune minute que j’ai passé en tant que stagiaire ingénieur ainsi
que doctorant à tes côtés et tiens à maintenir nos relations autant professionnelles que
personnelles également après la fin du doctorat.

J’exprime ma gratitude envers le Dr. Andrew Atkinson pour avoir toujours travaillé avec moi
sur la structure de MAGI-1 PDZ1. Merci de m’avoir initié à l’utilisation du spectromètre RMN
et des logiciels d’attribution. Merci également pour toutes les réponses à mes nombreuses
questions et pour n’avoir jamais perdu patience.

Je remercie le Dr. Georges Orfanoudakis pour son soutien en tant que directeur de l’équipe
Oncoprotéines et pour les discussions variées et très stimulantes que nous avons pu avoir au
long des années que j’ai passé au laboratoire.

Je souhaite faire un commentaire global concernant mon environnement de travail à l’ESBS,
qui était l’ancienne UMR 7100 et à présent, l’équipe Oncoprotéines. J’ai bénéficié d’un cadre
collégial sympathique, chaleureux et dynamique, basé sur l’interaction et le dialogue
constructif et non pas sur un esprit de compétition ou de concurrence, ce qui m’a permis de
m’épanouir et de me donner à 100% de mes capacités. Mes visites dans d’autres
laboratoires de recherche et les discussions que j’ai pu avoir avec de jeunes collègues m’ont
conforté dans le fait que j’ai bénéficié d’un environnement de travail exceptionnel.

Je tiens à te dire merci, Dr. Murielle Masson, pour ta disponibilité et les interactions
quotidiennes, en tant que voisine de paillasse et de bureau, qui ont souvent dépassé le cadre
professionnel, ainsi que pour les conseils et corrections (last minute) de ce manuscrit. « Elle
est adorable, notre Murielle… », citation souvent entendue au laboratoire, que je ne peux
que confirmer.

3 Remerciements
Je souhaite exprimer ma gratitude envers le Dr. Yves Nominé pour sa collaboration
rapprochée et son encadrement durant sa dernière année de thèse et les interactions tant
professionnelles que privées que nous avons depuis son retour des « states ».

Merci à mes collègues du fameux bureau D-304 : Dr. Murielle Masson (ah, ben ça
alors… ?!?), the Doc Robinson (He’s the best there is…, actually he is the only one !),
Abdellahi ould M’hammed ould Sidi et le grand mignon, alias Sadek Fournane, pour les
discussions (rarement scientifiques, quoique souvent biologiques…) et les fou rires que nous
avons pu partager.

Plus généralement, je souhaite dire merci à toutes les personnes du département
Biotechnologie des Interactions Macromoléculaires qui ont contribué de près ou de loin à
l’aboutissement de mes travaux. Je souhaite remercier le Professeur Etienne Weiss pour sa
disponibilité et ses précieux conseils aussi bien qu’en tant que Professeur durant mes années
à l’ESBS, mais aussi et surtout durant mes années de doctorat. J’ai beaucoup apprécié les
longues discussions scientifiques très enrichissantes ainsi que les échanges de jeux de mots
que nous avons pu avoir, « auch wenn ich mich manchmal durch Ihre Äusserungen geistig
überfordert gefühlt habe. ». Je dis « grazie » au Dr. Katia Zanier pour les collaborations
étroites que nous avons pu avoir, ainsi que pour ses conseils concernant la RMN et le
Biacore. Je remercie le Dr François Deryckère pour les discussions variées et pour mon
initiation au ski de descente. Merci au Dr. Annie-Paul Sibler et au Dr. Dominique Desplancq
pour leurs conseils, leurs disponibilité et leur aide tout au long de mon doctorat, ainsi que
Denise Stuber pour les nombreuses bouteilles d’eau stérile avec lesquelles elle m’a dépanné.
Je souhaite remercier Danièle Altschuh pour sa disponibilité et ses conseils précieux au long
de mes études. Merci au Dr. Mireille Balzinger, au Dr. Susanna Shochat et au Dr. Laurence
Choulier pour leurs conseils et les longues et intéressantes discussions. Merci également au
Dr. Gabrielle Zeder-Lutz pour les explications et les coups de main pratiques concernant le
Biacore.
Je souhaite remercier le Professeur Bruno Kieffer pour la collaboration étroite et les réponses
à mes innombrables questions. Depuis la notion de « filtre » a pris une nouvelle dimension
(ça ne sert pas qu’à faire du café…) et je me réjouis de continuer notre collaboration
« dynamique ». Merci à Claude Ling et à Sylvie Bulot pour les dé

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