1Thèse présentée par

Flavie Robert

Description

Niveau: Supérieur

• revision

1Thèse présentée par Flavie ROBERT Pour obtenir le titre de Docteur en Sciences de l'Université Louis Pasteur de Strasbourg Sciences du Vivant – Aspects Moléculaires et Cellulaires de la Biologie TRRAP, une protéine plateforme : Fonction d'un co-facteur de l'acétylation des histones dans la réparation des cassures double brin de l'ADN. Soutenue publiquement le 15 juin 2005 JURY : Directeur de Thèse : Dr Làszlò Tora, IGBMC, Illkirch Rapporteur interne : Dr Gilbert De Murcia, ESBS, Illkirch Rapporteur externe : Dr Annick Harel-Bellan, Institut A Lwoff, Villejuif Rapporteur externe : Dr Zhao-Qi Wang, IACR, Lyon Examinateur : Pr Stéphane Viville, IGBMC, Illkirch

• contribution des services communs de l'igbmc


• camille merci


• enzymes de modifications post-transcriptionnelles


• régulation de la transcription par les séquences d'adn entourant le gène


• merci


• brin de l'adn


• initiation de la transcription


• étape fondamentale de régulation de l'expression génique

Sujets

• Révision
• Chambon
• Laszlo
• Eberlin
• Louis Pasteur University
• Viville
• Alsace
• Robert
• Didier

Informations

• Publié par: profil-nechor-2012
• Publié le: 01 juin 2005
• Nombre de lectures: 177
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 64 Mo

Extrait

Thèse présentée par
Flavie ROBERT
Pour obtenir le titre de
Docteur en Sciences de l’Université Louis Pasteur de Strasbourg
Sciences du Vivant – Aspects Moléculaires et Cellulaires de la Biologie
TRRAP, une protéine plateforme :
Fonction d’un co-facteur de l’acétylation des histones
dans la réparation des cassures double brin de l’ADN.
Soutenue publiquement le 15 juin 2005
JURY :
Directeur de Thèse : Dr Làszlò Tora, IGBMC, Illkirch
Rapporteur interne : Dr Gilbert De Murcia, ESBS, Illkirch
Rapporteur externe : Dr Annick Harel-Bellan, Institut A Lwoff, VillejuifDr Zhao-Qi Wang, IACR, Lyon
Examinateur : Pr Stéphane Viville, IGBMC, Illkirch
1AVANT PROPOS
Ce manuscrit sera divisé en trois parties distinctes, les deux premières portant sur les axes
principaux de mon travail, et la dernière sur des études en collaboration.
La première partie décrit l’étude de la protéine TRRAP, et de sa fonction dans la réparation des
cassures double brin de l’ADN. Dans un souci de clarté, l’introduction, les résultats et la discussion ont
été regroupés. Les résultats expérimentaux comprennent un manuscrit de publication soumis récemment, et
actuellement en révision.
La deuxième partie est consacrée à la caractérisation d’une modification post-traductionnelle
d’histone spécifique de la mitose. De même que pour la première partie, une courte introduction précède
les données expérimentales et la discussion. Cette étude représente une part mineure de mon travail, et une
étape seulement d’un projet plus large mené au laboratoire du Dr TORA par Adrien Eberlin. Malgré cela,
j’ai souhaité l’inclure à ce manuscrit car elle a nécessité la mise en œuvre d’une démarche analytique
originale, basée sur l’utilisation raisonnée de la spectrométrie de masse.
Enfin, la dernière partie présente deux publications auxquelles j’ai participé, dans le cadre de
collaborations avec des équipes indépendantes. Toutes deux restent dans la thématique historique du
laboratoire du Dr TORA, qui est l’étude des mécanismes de régulation de l’expression des gènes codant
pour des protéines.
2Merci !
Mes premiers remerciements vont aux Dr Harel-Bellan, De Murcia, et Wang, et au Pr Viville, qui ont
acceptés de juger mon travail et pris la peine de lire ce manuscrit.
Je remercie Le CNRS et la Région Alsace pour avoir supporter financièrement mon travail pendant 3 ans.
Je dois un grand remerciement au Dr Laszlo TORA, pour le temps consacré à accompagner mes premiers pas
en biologie, et surtout pour avoir fait un pari risqué, il y a 4 ans, en m’accueilliant dans son laboratoire. J’ai beacoup
apprécié sa disponibilité et ses qualités humaines autant que scientifiques.
La première personne qui m’ait réellement parlé de recherche est le Dr Alain Van Dorsselaer. Il m’en a
donné le goût et la méthode, je lui en suis toujours reconnaissante.
Cette thèse n’aurait pas été un plaisir sans quelques personnes formidables :
Merci Sara, pour avoir été un binôme agréable et efficace, pour les bons moments de sciences et les bons
moments d’amitié : sans toi, je confondrai encore les introns et les exons, les orthologues et les paralogues… et je
serai passer à coté de Murakami et JK Toole !
Je remercie sincèrement Manuela, à qui je dois un entretien avec le Pr Chambon un jour de novembre 2001 !
Et cette complicité autour d’un MALDI qui nous a permis des discussions très intéressantes.
Merci Eli pour ta disponibilité sans pareil, pour les touches de légèreté dans une journée grisouille… et les
bredele de Noël… et encore plein de choses !
Merci Maté, (you’ll say you don’t deserve it but it’s false !) parce que j’ai pu parler régulièrement anglais
grâce à toi et parce que tu as été d’une grande efficacité pour me tirer un sourire les jours de manip foireuse ! Et enfin,
Deus ex machina, Köszönöm Neked a Sainte Hélène 13 szàm alatt töltött estét. Don’t give up !
Merci Adrien (pour tout le matériel que tu m’as régulièrement fourni dans le projet 2H12, et pour avoir
accepté de discuter avec une « téléphobe » comme moi), Laure (tant d’humour caustique dans une petite personne : te
laisse pas faire par les affreux de 4016), Traci (for the « genuine american cookies » recipe, and for committed
political discussions before W second mandate), Mattia (les morceaux de glace dans le dos, aïe !, mais aussi tous ces
merveilleux petits trucs, coups de main, gracie !), Zita (Cher ange, je promets de tenter la cuisine hongroise). Emese
(un rire si communicatif, et une franchise sans pareil), et Antoinette (Un jour j’irai au Liban).
Merci aussi à Philippe KK (on aurait pu s’échanger nos chapitres de thèse, mais on l’a pas fait !) Merci aux
anciens du labo, Claire, Bill, Brendan, Elmar, et Sonja (sans qui je ne saurais même pas faire un WB). Et au nouveau
(Bienvenu Didier !). Aux personnes rencontrées au hasard des couloirs…Un sourire, trois mots… Merci pour cela
aussi, Florence, Marielle, Gabrielle, Raphaella, Aurélie, Annass, Konstantin, Gaëtan, Nathalie, Irene, Philippe C,
Nicolas C, Marie C, Fabrice, Hélène, Dominique H…(et j’en oublie surement, qu’ils m’excusent).
Je remercie enfin l’équipe de Dora Papadopoulo, et plus particulièrement Céline J et Céline B qui ont permis
à Sara et moi de débuter un projet ardu. Sarah S, Chrystel, Sophie, François, Elsa, Christine C, et Jean Marc du
LSMBO ont toujours été disponibles, pour un coup de main ou un conseil, un grand Merci !
Beaucoup de choses n’auraient pas été possibles sans la contribution des services communs de l’IGBMC :
Pascal Eberlin au service peptides, Mustapha pour les anticorps monoclonaux, Isabelle et Jean Luc au service
baculovirus, Didier et M Vonesh au service microscopie, Claudine et Jochen au service de tri cellulaire, Mais aussi
Maïté, Doris, Hélène, Evelyne, et l’ensemble du personnel du secrétariat.
Pour finir, M. JM Fétrot m’a encadré au printemps 2005 dans le protocole de Valorisation de Compétences
de l’Ecole Doctorale : je souhaite le remercier sincèrement pour sa disponibilité et pour la confiance en moi qu’il m’a
apportée ces derniers mois.
Et parce qu’il y a une vie hors du labo :
Charlotte, Nicolas, Caroline, Renaud, Katy, Sandra, Anne, Régis, Merci pour votre amitié de longue date, en souvenir
de soirées ECPM (et des après soirées aussi), en souvenir des Artefacts 2004, trop d’la Balle !! Sur ces quatres années
vous avez aussi été là quand j’ai eu besoin d’aide, c’est précieux les potes !
3Emilie, merci de ne pas être comme tout le monde, ton esprit large et tes envies de penser plus loin m’ont souvent
rassurée sur le monde de la Recherche… J’espère qu’on se retrouvera quand tu philosopheras et que j’écologiserai. Et
merci pour le coup de main de ces derniers mois !
Adrien D, merci, merci, je crois que tu sais pourquoi. Ne te décourage pas, la perle existe, tu la trouveras au moment
le plus inattendu.
Marie, Thomas D., Vincent V, Aurore, Francesca, et tous les passants de l’auberge St Gothard, merci pour les bonnes
soirées, les couchers de soleil sur le balcon, à refaire le monde (special thanks to MDJI !).
François-Xavier, Sandrine, Alex N, on est plus vraiment des souris, mais on reste des amis ?
Merci Jean Marc, parce que « On reconnaît quelqu’un d’intelligent à son sourire » et parce que « Tout sujet est digne
de curiosité ». Mais je ferai quand même pas l’ENA !!
Marie-Françoise, maman, grâce à toi une petite fille est devenue une grande fille… mais des fois tu lui manques
encore.
Emmanuel et Camille merci, simplement parce que vous êtes là. J’en reviens pas que vous soyez déjà si grands.
« You, and the night, and the music… »
Les mots ici ne diront pas tout. Thomas, merci de tout mon cœur.
4SOMMAIRE
AVANT PROPOS ..........................................................................................................................................................2
ABBRÉVIATIONS ET ACRONYMES.......................................................................................................................9
LISTE DES FIGURES ................................................................................................................................................11
PARTIE I......................................................................................................................................................................13
FONCTION DU CO-FACTEUR D’ACÉTYLATION TRRAP DANS LA RÉPARATION DES CASSURES
DOUBLE BRIN DE L’ADN........................................................................................................................................