UNIVERSITE LOUIS PASTEUR MASTER VIE ET SANTE PROGRAMME DES COURS Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE Domaine : Sciences Master Mention Vie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Responsables pédagogiques du master : Dr G. Prévost Pr S. Bahram UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : 03 90 24 37 57 Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 03 88 25 11 13 Fax : 03 90 24 40 16 E-mail : gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr E-mail : siamak@hemato-ulp.u- strasbg.fr Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie • Types de profil admis dans cette formation Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire Les dossiers extérieurs à l’ULP seront évalués par la commission pédagogique (Juin, juillet, septembre de chaque année) Masters 2 accessible depuis ce Master : Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d’autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat. PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE ...
Domaine : Sciences Master Mention Vie et SantéSpécialité Physiopathologie Cellulaire et MoléculaireResponsables pédagogiques du master :Dr G. Prévost Pr S. Bahram UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : 03 90 24 37 57 Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 03 88 25 11 13 Fax : 03 90 24 40 16 E-mail :gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr : E-mailu.-siamak@hemato-ulp strasbg.fr
Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie • de profil admis dans cette formation Types Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire Les dossiers extérieurs à l ULP seront évalués par la commission pédagogique ’ (Juin, juillet, septembre de chaque année) Masters 2 accessible depuis ce Master : ’ Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat.
PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE LOUIS PASTEUR MASTER VIE ET SANTE Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE Vingt cinq unités de recherche (INSERM, CNRS, EA) soutiennent cette formationmultidisciplinaireàlarecherch’emédicalesurlesthèmesdelacancérologie, la génétique humaine, l immunologie, la microbiologie médicale, et de la biologie et médecine de la reproduction. La formation développe la transversalité, la communication scientifique et le rapprochement rapide vers le monde de la recherche avec des e’xpériencespratiquesenlaboratoirespermettantauxétudiantsd acquérir une vision précise et dynamique des possibilités de recherche etdesapprochesnécessa’irespouvantrépondreauxprobléma’tiques’dela Santé Humaine. Loin d être un enseignement médical, il s agit d un enseignement fondamental axé sur la biologie humaine et ses mécanismes pathologiques. La formation Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire est adaptée aux étudiants scientifiques, médecins, pharmaciens ou dentistes.BILAN d’exercice ’ Nombre d inscrits 2005-2006 M1 : 87 inscrits, soit 57 IA dont 19 étudiants scientifiques + 30 IP ; M2 : 23 étudiants (9 étudiants du secteur Santé)Résultats sessions 2006 : M1 : 17 reçus (étudiants scientifiques) en juin / 19 reçus définitifs. Le cas des étudiants du secteur Santé est particulier puisque validant M1 sur plusieurs années ; 68 étudiants du secteur Santé se sont inscrits, 54 étudiants ont validé de 3 à 30 crédits au cours de 2005-2006, 17 étudiants sont désormais titulaires du Master Vie et Santé, spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire au titre de 2005-2006.M2 : 16 reçus en juin, 23 reçus définitifs. ’ 11 étudiants continuent en thèse, 2 étudiants se réorientent vers d autres Masters,2étudiantschangentdevoie,1étudiante’stenrecherchedethèse ; 7 étudiants du secteur Santé poursuivent d abord leur formation professionnelle, 2 sont inscrits en thèse, 3 au moins envisagent une thèse ensuite. ’ Nombre d inscrits 2006-2007 M1 : >95 inscrits, soit > 66 IA dont 20 étudiants scientifiques, + 29 IP ; mais projection > 100 inscrits M2 : 23 étudiants (7 étudiants du secteur Santé).
MASTER PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIREOPTION CANCEROLOGIE jocelyn.ceraline@ircad.u-strasbg.fr ;.frgreaj.bergrern-pierretsarbsuotac@rh-u ;J-Emmanuel.KURTZ@chru-strasbourg.frCalendrier Intitulé du cours Enseignant Date Salle Me 14h00noduégonemereortnigatisartSutcureaiulllvidteNecnoisiD. BURNOUF91AanotaSlle13h0ueiqogolthpaemi 24.09.08Réplication de l’AD 15h30 et maturation de l’ARN StructureJ. STEVENIN2h00 Je 25.09.08 17h00Régulation de la transcriptionF. COIN 19 Anatomie pathologique2h00 SalleMe 14h00quesnétisgéadiesecoéiassMcénasiemsedréponsecellulairuaeodxgammdsesanADl'etNlmF. DANTZER0h021elnA9laS a atomie pathologique01.10.0816h00Surveillance de l’intégrité du génomeT. LAVAUX2h00 C Me 14h00ytosagocmobeetuqletyso,hpteetieternttiacsontilidAéiséhsnoecllluiaersE. GUERINeipt2a1ho0ho0l9ingAutqaSalle 08.10.0816h00alullecenarbmeMnaiamerbnamssrtportransettirellecialuiicrantsreafTrN. BOEHMm0o0e1h re Me 14h00Régulation du cycle cellulaireJ-P. BERGERAT2h00 15.10.08Salle 19 Anatomie pathologique 16h00 Biologie moléculaire des sarcomesJ-E KURTZ2h00 MORAS22.M10e.0814h00Physiologie des récepteurs nucléairesD.SlealS002hnimino Récepteurs et transduction des signaux mitogènes etJ. CERALINE2h00 16h00 antiprolifératifs
14h00Cinétique tumorale 29.1M0e.0816h00 de l’apoptose Mécanismes 17h00Gènes, environnement et cancérogenèse Calendrier Intitulé du cours
J-P. BERGERAT2h00 J. CERALINE1h00 J. CERALINE1h00 Enseignant
14h00daléfficneritaiRé.laguontiedonllulaireeCsselullorilseptnseéfareseouchllultceL. MAUVIEUX ce
Me15h00Biologie moléculaire des leucoses myéloïdes 05.11.08
L. MAUVIEUX
J-P. FRICKER F. STOLL-KELLER
16h00Syndromes de prédisposition héréditaire au cancer 14h00Cancérogenèse virale Me 12.11.08 16h00Hormones et cancersJ. CERALINE 14h00Implications du phénotypage moléculaire dans le dépistage, le pronostic etM-P. GAUB le traitement des cancers Me 19.11.08 16h00Biologie de l’invasion et de la métastaseM-C. RIO e : des lésions pré-Meessréueaccnomotanastcepsa:setaasétmlaàtgiquese-patholoesétapesdelaLlerahecl’zmmhogorpssernoiomutM-P. CHENARD 26.11.08 14h00moléculaires
17h30Mécanismes de résistance aux agents anti-cancéreux 1h00I. LELONG 14h00Antigènes tumoraux et immuno-surveillance 2h00M. RADOSAVLJEVIC MeSalle 19 Anatomie 03.12.08Hormonothérapies : interactions avec les autres voies de signalisation pathologique16h00cellulaire et nouvelles orientations thérapeutiquesJ. CERALINE 2h00
Calendrier Intitulé du cours Radiothérapie14h00effets biologiques des radiations ionisantes : optimisation des effets ue Me,scbialegetthérapeutiqffesteloibqigotepoiantsaliontieppolevédteseuneonayresdntmeluiatrcisapemtnres10.12.08 16h00Chimiothérapies cytotoxiques Je : ement euti ue théra 18.12.08 17h15Dévelo• Vaccinations anti-tumorales Développement thérapeutique : • 14h00 moléculaire et nouveaux traitements anticancéreux Ciblage Développement thérapeutique : MeThérapie génique 17.12.08 16h00•Développement thérapeutique : 17h00• Thérapie cellulaire
Enseignant Durée Salle
G. NOEL 2h00 Salle 19 Anatomie pathologiqueB. DUCLOS 2h00 D. LIPSKER 1h30Salle 19 Anatomie pathologiqueJ-E. KURTZ 2h00 J-Mh00Salle 19 Anatomie pathologiqueLIM.ACHER1 B. LIOURE 1h00
Cours : 6 crédits TP en laboratoire de recherche (35h) : 3 crédits
Evaluation
Ecrit 3 h
Rapport Tech
Unité d’Enseignement GENETIQUE HUMAINE (Pr H. Dollfus)
Helene.DOLLFUS@chru-strasbourg.frDATE HEURECOURS
INTERVENAN SALLE T Vendredi 26 septembre 14.00 16.00Introduction générale au M1 de génétique humaine. DOLLFUS H. Vendredi 26 septembre 16.00 18.00Caryotype normal Anomalies cytogénétiques de nombre et de structure (I). E. FLORI Lundi 29 septembre 8.30 10.30Le diagnostic moléculaire des maladies monogéniques. V. BIANCALANA Vendredi 3 octobre 14.00 16.00sednmonétéqieuescytogAnomali.eru)II(stectruebrdetaCyperyotalnormE. FLORI Vendredi 3 octobre 16.00 18.00Syndrome microdélétionnel (I). FLORI E. 14 00 16.00Ataxies et paraplégies spastiques héréditaires et mitochondriopathies : aspects Vendredi 10 octobre . C. TRANCHANT cliniques et pathologiques.Vendredi 10 octobre 16.00 18.00 Maladies de laréparation et transcription. V. LAUGEL Vendredi 17 octobre 14.00 16.00Maladies à polyglutamnies : chorée de Huntington et ataxies dominantes. D. DEVYS Vendredi 17 octobre 16.00 18.00CGH sur chromosomes. DUMANOIR S. Vendredi 24 octobre 14.00 16.00Le diagnostic moléculaire des maladies monogéniques. VINCENT M.C. Ataxi ochondrio at : aspectsVendredi 24 octobre 16.00 18.00es et paraplégies spastiques héréditaires et mit p hiesM. KOENIG génétiques et moléculaires.Vendredi 31 octobre 14.00 18.00Génétique multifactorielle.J.L. MANDEL
Vendredi 28 novembre 16.00 18.00
Craniosténoses et FGFR.
Vendredi 7 novembre 14.00 16.00Diagnostic pré-implantatoire et biologie moléculaire. MOUTOU C. Vendredi 7 novembre 16.00 18.00Cytogénétique Moléculaire et DPI par FISH. GOSSET P. Vendredi 14 novembre 14.00 16.00Biochimie du Vieillissement. N. DALI-YOUCEF Vendredi 14 novembre 16.00 18.00Démences héréditaires, Parkinson héréditaire et chorée de Huntington : aspects C. TRANCHANT cliniques et pathologiques.Vendredi 21 novembre 14.00 16.00Syndrome microdélétionnel (II). FLORI E. Vendredi 21 novembre 16.00 18.00La thérapie génique. PUCCIO H. Vendredi 28 novembre 14.00 16.00Anomalies de développement des membres. DORAY B. F. PERRIN-SCHMITT, B. DORAY B. DORAY E. FLORI, B. DORAY, H. DOLLFUS M.C. VINCENT H. DOLLFUS M. KOENIG M. KOENIG
Vendredi 5 décembre 14.00 16.00Troubles de la détermination et de la différenciation sexuelles.
Vendredi 5 décembre 16.00 18.00Situations classiques du conseil génétique et difficultés éthiques liées au diagnostic des maladies génétiques.
Vendredi 12 décembre 14.00 16.00Inactivation de l'X.Vendredi 12 décembre 16.00 18.00Ciliopathies. Génétique et Rétinopathies.Vendredi 19 décembre 14.00 16.00Liaisons Génétiques.Vendredi 19 décembre 16.00 18.00Démences et Parkinson héréditaires : aspects génétiques et moléculairesDate de l’examen :9 janvier 2008, Petit Amphithéâtre Faculté de Médecine
’M1semestre1Unité d enseignement TD de BioInformatique Acquisitions de données expérimentales et banques de données (3crédits - 3 ects) . G. Prévost, P. Riegel Gilles Prévostde la Faculté de Médecine de(MCU-PH). Institut de Bactériologie Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email :gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr) Séance 1/2 - 25.09.2008 8h30 11h30. Reherches documentaires PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), scd (http://www-scd-ulp.u-strasbg.fr/ ) et valeur d’une recherche. Recherche de séquences nucléotidiques, reprise sous format FASTA, comparaisons BLAST Séance 2/3 02.10.2008 8h 11h00. Recherche de motifs dans les séquences nucléotidiques, sites de restrictionshttp://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php), traduction en protéine. Sensibilisation au site http://www.expasy.org/tools/ Séance 4 06.10.2008 8h 10h00. Séquençage, rabouttagede fragments séquencés, repérage de mutations, contigs Séance 5 09.10.2008 8h 10h00. Multi-alignements deséquences nucléotidiques, applications à la phylogénétique (P. Riegel) Séance 6 13.10.2008 8h 10h00. Contrôle continu cour.tEtude des protéines, recherche de paramètres physicochimiques sur http://www.expasy.org/tools/ Séance 7 16.10.2008 8h 10h00. Etudes des protéines, recherche de paramètres physicochimiques, alignements, recherche de motifs. Séance 8 - 20.10.2008. 8h00 10h00 PDB database,WebLab Viewer. Visualisation des structures, remplacement de résidus, distances atome-atome, charges organisation structurale d’une protéine Séance9.-23.10.2008.8h0010h00.StructuredesProtéinesII.DémonstrationsurlogicielSigmaPlot Séance 10 - 27.10.2008. 8h00 10h00. Traitement dedonnées numériques via Sigma PlotTM. Séance 11- 10.11.2008. 8h00 10h00. Structure des protéines III. Séance 12 13.11.2008. 8h00 10h00.. Contrôle terminal Evaluation2ContConti3neuxse+rc1icceosntterminal:
M1 1er semestre Unité d'Enseignement "Technologies de la Biologie Cellulaire et Moléculaire" G. Prévost -B. Jaulhac Gilles Prévost(MCU-PH). Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email :gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr)Benoît Jaulhac(PU-PH) Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 80. Fax : 03 88 25 11 13. Email :benoit.jaulhac@medecine.u-strasbg.fr)Cours - conférences sur les principes, applications et limites des Techniques en Biologie Moléculaire et Cellulaire1- Enzymes de la Biologie Moléculaire / séquençage d'ADN- G. Prévost (9h00-12h00) 26-09-2008 Ana.Path S19 2- Purification des protéines et marquages - G. Prévost (9h00-11h00) 03-10-2008 Ana.Path S19 3- Spectrométrie de masse et biologie : grands principes et applications aux problèmes posés S. Sanglier (9h00 11h00) 10.10.2008 Ana.Path S19 4- Polymérases thermostables et applications - B. Jaulhac (10h00 12h00) 17-10-2008 Ana.Path S19 5- Vecteurs et systèmes d'expression procaryote/eucaryote - Prof A. Pereira à confirmer (9h00-11h00) 24.10.2008 Ana.Path S19 6- Cultures cellulaires P. Simon-Assman (10h15-12h15) 27.10-2008 Ana.Path S19 7- Cytométrie en flux A.S. Korganow (9h00-11h00)13-11-2008 Ana.Path S19 8- Techniques d'étude de l'apoptose - F. René (9h00-11h00) 14-11-2008 Ana.Path S19 9- Contrôle transcriptionnel chez les Eucaryotes L. Tora 21-11-2008 9h00-11h00 Ana.Path S19 10- RNA silencing G. Prévost (8h30-10h30) 27-11-2008 Ana.Path S19 11- Transgenèse N. Ghyselinck(9h00-11h00) 28-11-2008 Ana.Path S19 Ouvrage conseillé : Principes de biologie moléculaire en biologie clinique. Ameziane, Bogard, Lamoril. Editions Elsevier Campus Référence ISBN2-84299-685-2 -Ces conférences feront l’objet d’un examen écrit (09.12.2008, 9h00-11h00 Ana path S14-15). Exposés sur les démarches scientifiques (16-19.12.2008, Forum S208, matinées)Les conférenciers ci-dessus proposent quatre à six articles liés au thème traité. Deux articles développant des techniques semblables ou parallèles seront remis à chaque étudiant. Les étudiants auront un délai de deux mois environ pour produire un résumé oral technologique (10 min) des articles distribués (tirage au sort 16.10) présenté si possible avec un support PW Point. Deux à trois questions de compréhension ou de regard critique sur les approches technologiques pourront ensuite leur être posées par le Jury (3-4 personnes les 16-19.12.2008). Les documents envoyés pourront nous être adressés auparavant.
Evaluation
Ecrit 1h30 Résumé-Exposé Tech indiv + questions = 10+5 min