RAPPORT DE STAGE Présenté par

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• rapport de stage - matière potentielle : présenté

RAPPORT DE STAGE Présenté par Florent ABRAHAMI Promotion 2003-2005 Variations dans l'abondance et la composition du microphytoplancton de la baie de Sainte-Marie (Nouméa). Relations avec les développements de la cyanobactérie filamenteuse Trichodesmium erythraeum. Mesure et interprétation des échantillons prélevés lors de la campagne océanographique FRONTALIS 3 relative à l'étude de la zone frontale située dans le Pacifique Equatorial Institut National des Sciences et Techniques de la Mer CNAM- Cherbourg Pour l'obtention du : DIPLOME DE TECHNICIEN SUPERIEUR DE LA MER (DTSM) Délivré par : Le Conservatoire national des arts et métiers (Cnam) Stage placé sous la responsabilité de Robert Le Borgne et de Martine Rodier,

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• relations avec les développements de la cyanobactérie filamenteuse
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Sujets

• rapport de stage

Informations

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• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 2 Mo

Extrait

RAPPORT DE STAGE
Présenté par
Florent ABRAHAMI
Promotion 2003-2005
Variations dans l'abondance et la composition du microphytoplancton de la baie de
Sainte-Marie (Nouméa). Relations avec les développements de la cyanobactérie
filamenteuse Trichodesmium erythraeum.
Mesure et interprétation des échantillons prélevés lors de la campagne
océanographique FRONTALIS 3 relative à l’étude de la zone frontale située dans le
Pacifique Equatorial
Institut National des Sciences et Techniques de la Mer
CNAM- Cherbourg
Pour l'obtention du :
DIPLOME DE TECHNICIEN SUPERIEUR DE LA MER (DTSM)
Délivré par :
Le Conservatoire national des arts et métiers (Cnam)
Stage placé sous la responsabilité de Robert Le Borgne et de Martine Rodier, effectué
du 17/04 au 31/08/2005 au Centre IRD de Nouméa BP A5 98848 Nouméa cédex
Nouvelle Calédonie, tel: [phone], fax: [phone]. Institut de recherche pour
le développementCe stage réalisé au centre IRD de Noumea, en Nouvelle
Calédonie, se divise en deux parties distinctes. La première partie
de ce stage a été entreprise sous la responsabilité de Mr Robert Le
Borgne et s’intitule : "Variations dans l'abondance et la
composition du microphytoplancton de la baie de Sainte-Marie
(Nouméa). Relations avec les développements de la cyanobactérie
filamenteuse Trichodesmium erythraeum".
La seconde partie de ce stage dirigée par Mme Martine Rodier
s’intitule : " Mesure et interprétation des échantillons prélevés lors
de la campagne océanographique FRONTALIS 3 relative à
l’étude de la zone frontale située dans le Pacifique Equatorial "
2REMERCIEMENTS
Je remercie la direction du Centre IRD de Nouméa et l'Unité de Recherche Camélia, grâce à qui j’ai
pu effectuer ce stage dans de très bonnes conditions.
Mes remerciements vont aussi tout particulièrement à mes maîtres de stage. Tout d’abord Mr
Robert Le Borgne qui m’a permis de faire ce stage de cinq mois et surtout pour son sérieux, ses
enseignements et l’aide très précieuse qu’il m’a apportée pour la rédaction du rapport.
A Mme Martine Rodier, pour m’avoir fait confiance pour les nombreuses manipulations effectuées
pendant ce stage et pour son aide dans la conception du rapport. De même pour sa présence
chaleureuse et la bonne humeur avec laquelle elle a fait en sorte que se déroule ce stage.
Merci également, au reste de l’équipe IRD, notamment Hervé Jourdan, Andrés Vega, Jean Pierre
Lefèbvre pour leurs précieux conseils et aides.
Je suis pareillement reconnaissant à Charlie Zongo, qui a tenté de m’insérer dans la culture
Mélanésienne autant que faire se peut et qui m’a ainsi permis de faire de très nombreuses et
agréables rencontres.
Je remercie particulièrement mes parents sans qui je n’aurais pas pu faire ce stage, de m’avoir fait
confiance et de me permettre de faire des études agrémentées de magnifiques voyages ô combien
enrichissants.
Enfin, un grand merci à tous les membres de la tribu du « loft » pour leur bonne humeur et leurs
conseils d’amis.
3²
Stage Partie 1
"Variations dans l'abondance et la composition du
microphytoplancton de la baie de Sainte-Marie (Nouméa).
Relations avec les développements de la cyanobactérie
filamenteuse Trichodesmium erythraeum"
Résumé /Abstract
Cette étude, faite à partir de comptages en microscopie inversée, concerne le suivi spatio-temporel
de l’abondance et de la composition du microplancton en relation avec les paramètres chimiques du
milieu (sels nutritifs, chlorophylle"a"), d'une part, et la relation des cyanobactéries filamenteuses
Trichodesmium avec le reste du microphytoplancton, d’autre part. L'étude a été réalisée à la station
DBSM, située à l’entrée de la Baie de Ste Marie (Nouméa, Nouvelle Calédonie) à partir
d'échantillons prélevés à 0.5m et 6m et à l’extérieur (station HBSM) uniquement à 0.5m.
L’étude des abondances révèle aux deux sites, une forte dominance du microphytoplancton
(représentant 80% des individus dénombrés), constitué de plus de 80% de Diatomées. Les
variations temporelles d’abondance de ces dernières sont corrélées à la concentration en nitrate du
milieu, les Diatomées contribuant ainsi à la production nouvelle. Ces mêmes abondances sont
également corrélées positivement à la concentration en Chla>20µm, mesurée dans le milieu et à
l’abondance des Trichodesmium. L'origine de cette dernière association doit être recherchée dans le
rôle joué par l'excrétion des Diatomées dans la production primaire de régénération à laquelle
participent les cyanobactéries filamenteuses.
La comparaison des deux profondeurs échantillonnées met en évidence l'effet du mélange important
existant au sein de la colonne d’eau, avec une absence de différence significative des valeurs
d'abondance et de composition taxonomique. Enfin, une différence ambiguë, bien que
statistiquement significative, apparaît entre HBSM et DBSM et fait l'objet d'une discussion portant
sur la représentativité des échantillons considérés.
This study, based on inverted microscopy counts, deals with spatio-temporal survey of the
abundance and composition of microphytoplankton linked to chemical parameters (nutrients,
chlorophyll"a") on the one hand, and with the relation between filamentous cyanobacteria and the
microphytoplankton, on the other hand. The study has been conducted in two stations near Nouméa,
New Caledonia: the DBSM station, located inside of the “St Marie Bay” (samples from 0.5m and
6m depth) and the HBSM station located outside the bay (sample from 0.5m depth only).
The study reveals at both stations, a great predominance of microphytoplankton (representing 80%
of all counted individuals), made up of more than 80% by Diatoms. Their abundance temporal
variability is linked to in situ nitrate concentration (as Diatoms contribute to the new production).
Diatom abundances are positively correlated to the concentration of Chla>20µm and to
Trichodesmium abundance. Origin of this association may be linked to the role played by Diatoms
in the regenerated primary production (in which filamentous cyanobacteria are involved) through
their organic compound release.
The comparison between the two depths sampled at DBSM, illustrates the mixing effect existing in
the water column, with a non significant difference regarding abundance values and taxonomic
composition. Finally, an ambiguous difference, although statistically significant, appears between
HBSM and DBSM stations. The latter observation is the matter of a discussion about the considered
samples representativity.
4·
Table des matières
1 But de l étude................................................................................... 6
2 Matériels et méthodes......................................................................... 7
1.1. Site d’étude......................................................................................................................7
1.2. Prélèvements et préparations des échantillons de microphytoplancton (>20µm)...............8
1.3. Identifications..................................................................................................................8
1.4. Traitements statistiques.................................................................................................. 11
3. Résultat e Discussion .................................................................. 12
3.1. Généralités sur les résultats des comptages .................................................................... 12
3.2. Comparaison du microphytoplancton à 0,5 et 6m: peut on mélanger l'ensemble des
échantillons?.............................................................................................................................12
3.3. Variations des abondances des principaux taxons et relation avec les variables du milieu
(station DBSM).........................................................................................................................13
3.4. Importance relative des différents taxons.......................................................................14
3.5. Comparaison entre l'intérieur et l'extérieur de la baie: la station DBSM est-elle
représentative du milieu lagonaire de la région de Nouméa ?..................................................... 16
3.6. Comparaison des abondances de Diatomées et de Trichodesmium: y-a-t-il concurrence?17
3.7. Relation entre les données des comptages et les valeurs de chlorophylle "a&qu