Présentée pour l'obtention du grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE DE STRASBOURG

Nicolas Barthélemy

Description

Niveau: Supérieur

• mémoire

THESE Présentée pour l'obtention du grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE DE STRASBOURG par Nicolas BARTHÉLEMY Protéomique qualitative et quantitative, une passerelle pour relier l'expression génomique à la construction des édifices biologiques. Application à la compréhension de la structure moléculaire du cheveu humain. Soutenue le 22 juin 2011 devant la commission d'examen : Dr Alain VAN DORSSELAER Directeur de thèse Dr Odile SCHILTZ Rapporteur Dr Thierry RABILLOUD Rapporteur Dr Olivier POCH Examinateur Dr Bruno BERNARD Examinateur

• précieux conseils sur les plans d'expérience


• compétences humaines


• échanges d'idées et d'expériences scientifiques


• encadrement au laboratoire


• compréhension de la structure moléculaire du cheveu humain


• laboratoire de spectrométrie de masse bio-organique

Sujets

• Chimie
• Mémoire
• Sabatier
• Barthélemy
• Lennon

Informations

• Publié par: profil-nechor-2012
• Publié le: 01 juin 2011
• Nombre de lectures: 99
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 14 Mo

Extrait

THESE



Présentée pour l’obtention du grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DE STRASBOURG

par

Nicolas BARTHÉLEMY




Protéomique qualitative et quantitative, une passerelle pour relier
l’expression génomique à la construction des édifices biologiques.
Application à la compréhension de la structure moléculaire du cheveu
humain.







Soutenue le 22 juin 2011 devant la commission d’examen :



Dr Alain VAN DORSSELAER Directeur de thèse
Dr Odile SCHILTZ Rapporteur
Dr Thierry RABILLOUD Rapporteur
Dr Olivier POCH Examinateur
Dr Bruno BERNARD Examinateur
A ma famille,
A la mémoire de mon grand-père Pierre Tabarant,















« On ne trouve que ce qu’on a idée de chercher. »
Cours de chimie analytique d’Alain Tchapla, IUT d’Orsay Remerciements
Ce travail de thèse a été réalisé au Laboratoire de Spectrométrie de Masse Bio-Organique, au sein du
Département Sciences Analytiques de l’Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien de Strasbourg (IPHC, CNRS-UdS
7178).
Tout d’abord, je tiens à remercier Alain Van Dorsselaer pour m’avoir permis de bénéficier des moyens
techniques et des compétences humaines et scientifiques de son laboratoire.
Je tiens également à adresser ma reconnaissance à L’ORÉAL et personnellement à Dominique Julien pour
avoir soutenu financièrement ce travail. Mes remerciements s’adressent particulièrement à Nükhet Cavusoglu et
Georges Hussler pour avoir suivi mon travail tout au long de ces années. J’ai une pensée pour Franck Zerbib grâce
à qui j’ai mis les doigts dans l’engrenage.
Je suis profondément reconnaissant à Olivier Poch, président du jury, Odile Schiltz et Thierry Rabilloud,
rapporteurs, et Bruno Bernard, examinateur, pour m’avoir fait l’honneur d’évaluer ce travail de thèse.
Merci à Christine Schaeffer-Reiss pour le temps consacré à mon encadrement au laboratoire.
Un remerciement spécial à Christine Carapito pour son aide, son écoute et ses encouragements tout au
long de mon périple docto «râle».
Merci tout particulièrement à Cyril Colas pour m’avoir fait bénéficier de ses inestimables connaissances
entre autres des couplages LC-MS et pour toutes les manips faites jour et surtout nuit pour entrevoir la rationalité
du séquençage en protéomique.
Je remercie René Brennetot pour m’avoir permis de faire une collaboration extra-capillaire et pour ses
précieux conseils sur les plans d’expérience.
Merci aux cadres du laboratoire : Jean Marc Strub (qui est le plus fort : l’Alien, la Mammoet PTC 35 DS ou
le Prédator ?), Danièle Thierse (Grrr… encore un coup des Snockeles), François Delalande (il est à tout le monde le
canap’…), Agnès Hovasse, Hélène Diemer, Fabrice Varrier, Fabrice Bertile, Sarah Sanglier-Cianférani et Laurence
Sabatier. Merci à Alexandre Burel et Patrick Guterl (toc, toc, toc, c’est ici pour les macros ?) et aussi à Véronique
Trimbour et Kévin Jeanpert pour leur travail qui nous a simplifié la vie et les départs en congrès.
Mes sincères remerciements aux deux équipes de grouillots d’étudiants, post-docs, contractuels qui ont
accompagné mon séjour au LSMBO rythmé par la bonne humeur et les échanges d’idées et d’expériences
scientifiques. Courage, encore un peu de négociations et il y aura des lits pliants à la cave (avec planning de
réservation intégré au CEI).
Les Pouilleux : Sébastien Gallien (dit le grand chef, guide spirituel dans mon parcours initiatique à la
protéomique), Audrey Bednarczyck, Cédric Atmanène (maître suprême non-covalentiste), Thierry Wasselin (697
heures de PD-Quest et 18 palettes de REM au compteur), Daniel Ayoub, Céline Heng, Stéphanie Petiot-Becard et
François Debaene.
Les Précieux : Guillaume Béchade (précieux parmi les précieux), Véronique Delval-Dubois, Laëtitia
Fouillen, Jean-Michel Saliou, Christel Husser, Antoine Zieger, Amandine Bœuf (l’exilée), Tchilabalo Dilezitoko
’’Elie’’ Alayi (une question ?), Sarah Lennon et Magali Rompais (56 blagues et mises en scène de bureau à leur
actif, série en cours), Diego Bertaccini et Marine Plumel.
Merci à l’ensemble des membres de la section volley de la Fraternelle pour tous les bons moments extra
labo sportifs et non sportifs (principalement au MB…). Enfin, j’ai une pensée pour mes professeurs de la Licence Professionnelle de Chimie Analytique de l’IUT
d’Orsay et du Master Instrumentation et Méthodes d’Analyse Moléculaire de l’Université Paris Sud pour la qualité
de leurs formations. Je pense également à tous ceux qui ont pris de leur temps pour me transmettre de leurs
connaissances et de leur savoir-faire pendant mes stages et particulièrement à Michel Tabarant, Jean-Marie
Duda, Patrick Dupuis et Laurent Verreman.
Plan du manuscrit

Introduction générale ................................................................................................... …..1

Partie I Introduction à la biologie et à l’état de l’art des connaissances de la fibre
capillaire
Chapitre I Avant propos ..................................................................................................... 4
1. Des cheveux et des hommes ............................................................................................................................ 4
2. Universalité de la structure chez les mammifères ........................................................................................... 5
3. Histoire de la science du cheveu ...................................................................................................................... 6
Chapitre II Biologie du cheveu............................................................................................ 9
1. Morphogénèse ................................................................................................................................................. 9
a) Le follicule ..................................................................................................................................................... 9
b) Les différentes étapes de différenciation folliculaire ................................................................................. 10
2. Structure du cheveu humain .......................................................................................................................... 11
a) Structure générale de la section du cheveu ............................................................................................... 11
b) Ultrastructure du cortex ............................................................................................................................. 12
c) Ultrastructure de la cuticule ....................................................................................................................... 14
d) Ultrastructure de la médulla ...................................................................................................................... 15
3. Les origines du polymorphisme des fibres capillaires de l’espèce humaine .................................................. 15
4. Diversité des structures chez les mammifères ............................................................................................... 17
Chapitre III Aspects moléculaires de la structure du cheveu ............................................. 19
1. Notion d’homologie de séquence et de famille multigénique ....................................................................... 19
a) Définition et origine de l’homologie de séquence ..................................................................................... 19
b) Famille multigénique et isoformes ............................................................................................................. 20
2. La découverte des protéines du cheveu et leur caractérisation .................................................................... 20
a) L’isolement des protéines .......................................................................................................................... 20
b) La recherche des gènes .............................................................................................................................. 21
c) L’évidence de l’expression des gènes en protéine ..................................................................................... 22
3. Les kératines ................................................................................................................................................... 23
a) Les kératines, des protéines des filament