Biodiversity of marine-derived fungi and identification of their metabolites [Elektronische Ressource] = Biodiversität von Pilzen mariner Herkunft und Identifizierung ihrer Sekundärstoffe / vorgelegt von Ine Dewi Indriani

Ine Vanhaaren-Dresens

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• Biologie

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• Publié par: heinrich-heine-universitat_dusseldorf
• Publié le: 01 janvier 2007
• Nombre de lectures: 73
• Langue: Deutsch
• Poids de l'ouvrage: 21 Mo

Extrait

Biodiversity of marine-derived fungi
and identification of their metabolites


Biodiversität von Pilzen mariner Herkunft und
Identifizierung ihrer Sekundärstoffe






Inaugural-Dissertation
zur Erlangung des Doktorgrades
der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät
der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf











vorgelegt von
Ine Dewi Indriani
aus Bandung


Düsseldorf, 2007 Aus dem Institut für Pharmazeutische Biologie und Biotechnologie
der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf









Gedruckt mit der Genehmigung der
Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät der
Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf

Gedruckt mit Unterstützung des
Deutschen Akademischen Austauschdienstes (DAAD)


Referent : Prof. Dr. Peter Proksch
Koreferent : Dr. Rainer Ebel, Juniorprofessor

Tag der mündlichen Prüfung: 11.12.2007
Erklärung




Hiermit erkläre ich ehrenwörtlich, dass ich die vorliegende Dissertation mit dem Titel
“Biodiversität von Pilzen mariner Herkunft und Identifizierung ihrer Sekundärstoffe“
selbständig angefertigt und keine anderen als die angegebenen Quellen und
Hilfsmittel benutzt habe. Ich habe diese Dissertation in gleicher oder ähnlicher Form in
keinem anderen Prüfungsverfahren vorgelegt. Außerdem erkläre ich, dass ich bisher
noch keine weiteren akademischen Grade erworben oder zu erwerben versucht habe.





Düsseldorf, den 30.10.2007




Ine Dewi Indriani
i Acknowledgements

I would like to express my deep gratitude and sincere appreciation to Juniorprofessor
Dr. Rainer Ebel for his excellent supervision, guidance, continuous support, fruitful
discussions and deep encouragement during my doctoral study until the very end.

I wish to thank Prof Dr. Peter Proksch for giving me the chance and opportunity to
conduct my doctoral research at his institute, also for his support and excellent
guidance.

I would like to show my deep gratitude and thanks to Dr. RuAngelie Edrada-Ebel for
sharing her deep expertise especially in NMR interpretation and also for her help
elucidating the spectra.

I am indebted to Prof. Dr. W.E.G Müller and his team (Institut für Physiologische
Chemie und Pathobiochemie, Universität Mainz) for conducting the cytotoxicity
assays, and Dr. Michael Kubbutat and his co-workers (ProQinase GmbH, Freiburg) for
the protein kinase inhibition assay. I would like to acknowledge Dr. Yudi Rusman, Mrs.
Clécia Freitas-Richard, and Mr. Abdessamad Debbab (Institut für Pharmazeutische
Biologie und Biotechnologie, Heinrich-Heine Universität Düsseldorf) for conducting
antimicrobial assay.

I wish to thank Dr. W. Peters and his co-workers (Institut für Anorganische und
Strukturchemie, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf) for NMR measurements and
Dr. Victor Wray (Helmholtz Center for Infection Research, Braunschweig) for NMR
measurements and discussion for spectra elucidation. My deep acknowledgement is
headed to Dr. H. Keck and Dr. P. Tommes (Institut für Anorganische und
Strukturchemie, Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf) for conducting EI experiments.

I am indebted to Prof. Dr. Franz Brümmer (Biologisches Institut, Universität Stuttgart)
and Prof. Dr. R. Batel (Center for Marine Research Rudjer Boskovic Institute, Rovinj,
Croatia) for giving me the chance to collect the sponge samples in Limski Kanal,
Croatia.
ii
I would like to thank Mr. Reinhard Ueberschär (Underwater No.1, Düsseldorf) for
equipping the field trip to Croatia with scuba gear and breathing gases.

I would like to show my deep thankfulness to Dr. Chaidir (Agency for the Assessment
and Application of Technology BPPT, Indonesia) and Dr. Yasman (Biology
Department, University of Indonesia) for giving me the possibility to collect algae
samples in Seribu Island, Indonesia.

I would like to thank Prof. Dr. Sangkot Marzuki and Dr. Nurjati Chaerani Siregar at
Eijkman institute for molecular biology, Jakarta, Indonesia who allowed and put trust
on me to pursue my doctor research in this ‘new field’.

I would like to express my deep thanks to Ms. Mareike Thiel for great help and friendly
assistance during my doctoral study, Mrs. Katrin Rohde, Mrs. Waltraud Schlag, Mrs.
Eva Müller, Mrs. Sabine Borstel, Ms. Katja Rätke and Mr. Klaus-Dieter Jansen for
providing me help, laboratorium equipment and material during the work.

I wish to thank my colleagues Mrs. Julia Kjer, Ms. Annika Putz, Mrs. Katrin Rohde, Ms.
Mareike Thiel, Dr. Sofia Ortlepp, and Dr. Nadine Weber (‘the shopping team’) for their
kindly help, support, discussions, many nice conversations during the working time,
the lunch time, the coffee time, even in the shopping time.

I am deeply indebted to Dr. Amal Hassan for her help, support and her friendship
especially in the beginning of my study time.

I wish also to express my thankfulness to Prof. Dr. Shu-Ming Li, Prof. Dr. Claus
Passreiter, Dr. Jandirk Sendker, Mrs. Anke Suckow-Schnitker, Mr. Sven Ruhl, Mr.
Ehab Moustafa, Mr. Ashraf Hamed, Mr. Mirko Bayer, Mr. Frank Riebe, Mr. Edi Sri
Mulyono, Mr. Yao Wang, Mr. Sabri Younes, Ms. Nicola Steffan, Mr. Alexander
Grundmann, Ms. Anika Kremer, Mr. Wenbing Yin for the nice friendship, as well as the
nice working atmosphere.

iii I would like to thank the former colleagues, Drs. Hefni Effendi, Gernot Brauers, Gero
Eck, Carsten Thoms, Yudi Rusman, Yosi Bayu Murti, Bärbel and Jan Hiort, Ziyad
Baker and Mohamed Ashour for their help, friendship and encouragement in the first
beginning of my study time, and especially Dr. Franka Teuscher for also providing me
mangrove samples.

I would like to thank my best friends Dr. Triana Hadna, Mrs. Sophi Damayanti, Mrs.
Metta Yuniati, Ms. Indrawati Yudhasmara, and Dr. Neni Nuraeni for their friendship,
encouragements, supports and help that I can always count on.

I would like to express my deep appreciation for my husband, as well as my beloved
colleague, Arnulf Diesel for his everlasting love, continuous support, great patience,
long discussion and also for his guidance in the beginning of my doctoral study. I am
indebted to my father and my mother who always give me love, support and prayers
even from afar, also to the Diesel family, Mama Doris, “Vadder” Ingolf, Roland and
Suzan for all the love, support and encouragement.

Financial support by the DAAD through a PhD fellowship is gratefully acknowledged.



iv Zusammenfassung

Insgesamt wurden 31 Verbindungen aus Pilzen isoliert, die aus 12
verschiedenen marinen Organismen stammen, darunter Vertreter unterschiedlicher
Substanzklassen wie Alkaloide, Polyketide und Terpene. Eine Verbindung, ein
Pyranacetal, erwies sich dabei als neuer Naturstoff. Die Strukturen der Verbindungen
wurden durch massenspektrometrische Verfahren sowie ein- und zweidimensionale
NMR-Spektroskopie aufgeklärt.

1. Pilze aus der Klasse Eurotiomycetes
Sechs stickstoffhaltige Verbindungen wurden aus Penicillium polonicum, isoliert
aus dem marinen Schwamm Tethya sp., erhalten. Fünf davon, Cyclopenin,
Cyclopenol, Viridicatol, Viridicatin sowie 3-Methylviridicatin waren biogenetisch
verwandt.
Meleagrin, Roquefortin, Citrinin, Citrininhydrat und die Diastereomere
Quinolactacin A1 und A2 wurden aus Penicillium citrinum erhalten, welcher aus der
marinen Alge Sargassum sp. isoliert wurde. Meleagrin, Roquefortin und Citrininhydrat
zeigten eine beachtliche zytotoxische Wirkung gegen die murine Lymphomazelllinie
L5178Y, wohingegen Citrinin nicht aktiv war.
Das Anthrachinon Skyrin und die Preanthrachinone Atrovirin B1 und B2 wurden
aus einem Extrakt des aus dem Schwamm Aplysina aerophoba isolierten
Talaromyces wortmanii erhalten.
Zwei bekannte Verbindungen, Tenuazonsäure und Alternariol, wurden aus dem
Pilz Alternaria compacta erhalten, der aus dem marinen Schwamm Suberites
domuncula isoliert wurde.

2. Pilze aus der Klasse Sordariomycetes
Drei verwandte Alkaloide, Chaetomin, Cochliodinol und Semicochliodinol wurden
vom aus dem marinen Schwamm Tethya sp. isolierten Pilz Chaetomium sp. erhalten.
Alle zeigten starke zytotoxische Aktivität gegenüber L5178Y-Zellen und zeigten
inhibitorische Aktivität gegenüber Proteinkinasen.
Ein neues, mit der Familie der Cholesterolsynthesehemmstoffe Agistatine
verwandtes Pyranacetal wurde vom Pilz Xylaria sp. erhalten, der aus der marinen
v Alge Padina australis isoliert wurde. Diese Verbindung wurde 3-Methyl-
methoxyagistatin D genannt, basierend auf der Methylmethoxygruppe in Position C-3.
Daldinia escholzii aus der marinen Alge Halimeda berneoensis produzierte die
bekannte Verbindung 4,4’,5,5’-tetrahydroxy-1,1’-binaphthyl. Dies