Gestion forestière : implications dans le fonctionnement et la biodiversité des écosystèmes lotiques associés. 20 novembre 2003.

Universite Toulouse, Cnrs, Ecofor

Description

Ce rapport se compose de quatre parties, développées sous la forme de chapitres en français ou de manuscrits en anglais :
- Diversity of riparian vegetation and aquatic fungi in woodland streams.
- Diversity of riparian vegetation and fungal populations in woodland streams : genetic diversity in tetrachaetum elegans, a mitosporic aquatic fungus.
- Effet de la diversité forestière sur la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés de macroinvertébrés benthiques.
- Effet de la diversité forestière sur la décomposition des litières.
Chauvet (Eric). Paris. http://temis.documentation.developpement-durable.gouv.fr/document.xsp?id=Temis-0071030

Sujets

• Environnement
• Biotope
• Forêt
• Végétation

Informations

• Publié par: temis-developpement-durable
• Publié le: 01 janvier 2003
• Nombre de lectures: 25
• Licence : En savoir +
  Paternité, pas d'utilisation commerciale, partage des conditions initiales à l'identique
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 1 Mo

Extrait

LAboratoire
DYnamique de la
BIOdiversité




ECOFOR
ECOSYSTEMES FORESTIERS

BIODIVERSITE ET GESTION FORESTIERE





Gestion forestière :
implications dans le fonctionnement
et la biodiversité des écosystèmes lotiques associés



Rapport final: 20 novembre 2003



Responsable du projet : Eric Chauvet
SABATIER
Q ucki Tim e™ et un décom pr esseur TI FF ( non com pr essé) sont r equs i pour visionner cet t e mi age.
UNIVERSITE
Q uickTmi e™ et un décom pr esseur TI FF ( non com pr essé) sont r equs i pour visionner cet t e im age.PAUL
CENTRE NATIONAL TOULOUSE III DE LA RECHERCHE
SCIENTIFIQUE

Contributions : Sébastien Brosse, Jean-Yves Charcosset, Eric Chauvet, Lounes Chikhi, Nicolas
Féau, Katia Fève, Monique Gardes, Karine Guilhem, Beryl Laitung, Antoine Lecerf, Sophie
Millot et Prolet Pichmanova.
2 SOMMAIRE


INTRODUCTION GENERALE .......................................................................................................................... 5
RESUME DU PROJET ............................................ 5
ETAT DE L ’ART ................... 7
PRESENTATION DES RESULTATS .......................................................................................................................... 9
Objectifs ......................................................... 9
Méthodologie générale ................................ 12
RÉFÉRENCES ..................... 14
CHAP. 1: .......... DIVERSITY OF RIPARIAN VEGETATION AND AQUATIC FUNGI IN WOODLAND
STREAMS ........................................................................................................................................................... 16
ABSTRACT ......................... 16
INTRODUCTION.................. 16
MATERIALS AND METHODS ............................................................................................................................... 17
RESULTS ........................................................... 20
Abundance, richness and diversity of aquatic hyphomycetes ...................................... 20
Species assemblages and site comparisons . 21
Litter manipulation ...................................................................................................... 23
DISCUSSION ....................................................... 24
Hierarchical diversity .................................. 24
Fungal assemblages and substrate preference ............................................................................................ 25
ACKNOWLEDGEMENTS ...................................... 27
REFERENCES ..................................................... 27
CHAP. 2: DIVERSITY OF RIPARIAN VEGETATION AND FUNGAL POPULATIONS IN
WOODLAND STREAMS: GENETIC DIVERSITY IN TETRACHAETUM ELEGANS, A MITOSPORIC
AQUATIC FUNGUS........................................................................................................................................... 37
ABSTRACT ......................... 37
INTRODUCTION.................. 37
MATERIALS AND METHODS ............................................................................................................................... 39
Population sampling and cultivation of fungal isolates .............................................. 39
DNA extraction ............................................................................................................ 40
AFLP analysis ............. 41
Reproducibility tests on AFLP bands .......... 41
Scoring procedures ...................................... 41
Intrapopulation variation ............................................................................................................................ 44
Population differentiation and substructuring 45
Linkage disequilibrium 45
RESULTS ........................................................... 46
Characteristics of AFLP markers ................................................................................................................ 46
Intrapopulation genetic and haplotypic diversity ........................ 46
Cluster analysis ........................................... 49
Population differentiation and substructuring ............................................................................................ 49
Linkage disequilibrium (LD) ....................................................... 52
DISCUSSION ................................ 52
Genetic diversity .......................................................................................................... 52
Gene flow and isolation between sampling sites ......................... 53
Substrate specificity and selection ............... 53
Linkage disequilibrium and clonality .......... 54
CONCLUSION AND PERSPECTIVES ...................................................................................................................... 54
ACKNOWLEDGEMENTS ...................................................................................................................................... 55
REFERENCES ..................... 56
3 CHAP. 3 : EFFET DE LA DIVERSITE FORESTIERE SUR LA DIVERSITE SPECIFIQUE ET
FONCTIONNELLE DES COMMUNAUTES DE MACROINVERTEBRES BENTHIQUES ................... 58
INTRODUCTION.................................................................................................................................................. 58
MATERIEL ET METHODES .................................................................................................................................. 58
Sites ............................. 58
Echantillonnage........... 59
Traitement des données ............................... 59
RESULTATS ....................................................................................................................................................... 60
Classification des sites ................................. 60
Influence de la diversité spécifique des litières végétales ........... 65
Diversité fonctionnelle et groupes trophiques ............................. 68
DISCUSSION ....................................................................................................................................................... 69
REFERENCES ..................... 72
CHAP. 4 : EFFET DE LA DIVERSITE FORESTIERE SUR LA DECOMPOSITION DES LITIERES .. 74
INTRODUCTION.................................................................................................................................................. 74
MATERIEL ET METHODES .................................................................................................................................. 74
Site d’étude .................. 74
Physico-chimie de l’eau .............................. 75
Décomposition des litières ........................... 75
Analyses des données .................................................................................................................................. 76
RESULTATS ....................................................... 77
Physico-chimie ............ 77
Vitesse de décomposition ............................. 77
DISCUSSION ....................................................................................................................... 79
REFERENCES ..................................................... 80
CONCLUSION GENERALE ............................ 82
REFERENCES ..................................................................................................................... 83
PRODUCTION SCIENTIFIQUE ...................... 84
4 Introduction générale
1Résumé du projet
Le présent projet s‟adresse à la biodiversité et au fonctionnement de l’écosystème forestier
dans sa composante aquatique. Les milieux d‟eau courante, ou écosystèmes lotiques, sont
fortement tributaires de leur environnement terrestre. La litière produite par les arbres
riverains et interceptée par la rivière constitue en effet la source majeure de matière organique
pour les cours d‟eau forestiers. L‟incorporation de cette matière organique dans le réseau
trophique aquatique est réalisée par le processus de décomposition de la litière impliquant des
bactéries, des champignons (hyphomycètes aquatiques) et des macroinvertébrés aquatiques.
La forêt a donc une influence globale sur le fonctionnement biogéochimique et la productivité
des rivières qui la traversent. Cependant, on ignore si la diversité des litières forestières peut
influencer l‟activité des décomposeurs ainsi que la structure des populations et des
communautés aquatiques.
Nous testerons l‟hypothèse selon laquelle la gestion forestière qui contrôle la diversité de la
ripisylve affecte : (1) le processus de décomposition des litières et (2) la diversité des
communautés aquatiques impliquées dans la décomposit