SELECCIÓN Y MULTIPLICACIÓN DE RECURSOS GENÉTICOS PORCINOS UTILIZANDO DATOS SIMULADOS (SELECTION AND MULTIPLICATION OF SWINE GENETIC RESOURCES UTILIZING SIMULATED DATA)

Cunha E.E.

Description

Resumen
El objetivo de este trabajo fue proporcionar alternativas de manejo reproductivo para la selección y multiplicación de pequeñas poblaciones de cerdos autóctonos. Mediante simulación fueron estudiados tres tipos de apareamientos considerando el control de consanguinidad en generaciones futuras, en dos tamaños efectivos de población Ne= 40,00 y 66,67. La estimación de consanguinidad fue obtenida para selección basada en BLUP durante 20 generaciones, utilizando el programa Genesys. Un genoma constituido por 32 pares de cromosomas de tamaños al azar permitió el estudio de una característica de heredabilidad igual a 0,20, gobernada por 150 loci. Con este genoma, fue construida una población base y, a partir de ésta, una población inicial que originó las seis poblaciones de selección. En cada tamaño efectivo de población, los tipos de apareamientos practicados entre los reproductores seleccionados para padres de la generación siguiente fueron apareamientos al azar, exclusión de apareamientos entre hermanos completos y exclusión de apareamientos entre medios hermanos y hermanos completos. El número de descendentes producidos por pareja y por generación fue de ocho, en todas las poblaciones. El proceso fue repetido por 30 veces para reducir la oscilación genética. Valores fenotípicos medios, varianza genética aditiva, consanguinidad media y límite de la selección fueron los parámetros genéticos evaluados. No hubo efecto de los tipos de apareamientos de mínimo parentesco en el control de la consanguinidad.
Abstract
The objective of this paper was to generate alternatives of reproductive management for selection and multiplication of small populations of autochthonous swines. It was studied three mating types sighting the control of inbreeding in the future generations, in two effective population sizes: Ne= 40.00 and 66.67, respectively, simulated for swine. The estimative of inbreeding was obtained for selection based on BLUP during 20 generations, using Genesys program. A genome constituted of 32 pairs of chromosomes of random sizes permitted the study of one trait of heritability equal 0.20, governed by 150 loci. With this genome, was constructed one base population and from this one initial population that originated the six selection populations. In each effective population size, the mating types practiced between the selected reproducers for parents of the next generation were: random mating, exclusion of mating between full sibs and exclusion of mating to half and full sibs. The number of descendants produced by mate by generation was eight, in all populations. The process was repeated by 30 times to reduce the genetic drift. Average phenotypic values, additive genetic variance, average inbreeding and selection limit were the evaluated genetic parameters. There was not effect of the mating types of minimum relationship in the inbreeding control.

Sujets

• Conservación
• Conservation
• Effective population size

Informations

• Publié par: erevistas
• Publié le: 01 janvier 2004
• Nombre de lectures: 48
• Langue: Español

Extrait

SELECCIÓN Y MULTIPLICACIÓN DE RECURSOS
GENÉTICOS PORCINOS UTILIZANDO DATOS SIMULADOS
SELECTION AND MULTIPLICATION OF SWINE GENETIC RESOURCES UTILIZING
SIMULATED DATA
1 2 3 3 4Cunha, E.E. , P.L.S. Carneiro , R.F. Euclydes , R.A. Torres , J.R.B. Sereno y
5M.V.G.B. da Silva
1Universidade Federal de Viçosa -UFV. CEP: 36.571-000. Viçosa-MG, Brasil. E-mail: [e-mail]
2Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia - UESB. Jequié, BA. Brasil.
3Universidade Federal de Viçosa - UFV. Viçosa, MG. Brasil.
4Embrapa Pantanal. Caixa Postal 109. CEP 79.320-900. Corumbá, MS. Brasil.
5Núcleo de Pesq. Zootec. Geraldo J.R. Alckmin/IZ/APTA/SAA. Pindamonhangaba, SP. Brasil.
PALABRAS CLAVE ADICIONALES ADDITIONAL KEYWORDS
Conservación. Tamaño efectivo de la población. Conservation. Effective population size. Mating
Tipos de monta. types.
RESUMEN
El objetivo de este trabajo fue proporcionar ción siguiente fueron apareamientos al azar,
alternativas de manejo reproductivo para la se- exclusión de apareamientos entre hermanos
lección y multiplicación de pequeñas poblacio- completos y exclusión de apareamientos entre
nes de cerdos autóctonos. Mediante simulación medios hermanos y hermanos completos. El
fueron estudiados tres tipos de apareamientos número de descendentes producidos por pareja
considerando el control de consanguinidad en y por generación fue de ocho, en todas las
generaciones futuras, en dos tamaños efectivos poblaciones. El proceso fue repetido por 30
de población Ne= 40,00 y 66,67. La estimación de veces para reducir la oscilación genética. Valo-
consanguinidad fue obtenida para selección res fenotípicos medios, varianza genética aditiva,
basada en BLUP durante 20 generaciones, utili- consanguinidad media y límite de la selección
zando el programa Genesys. Un genoma cons- fueron los parámetros genéticos evaluados. No
tituido por 32 pares de cromosomas de tamaños hubo efecto de los tipos de apareamientos de
al azar permitió el estudio de una característica mínimo parentesco en el control de la consangui-
de heredabilidad igual a 0,20, gobernada por 150 nidad.
loci. Con este genoma, fue construida una pobla-
ción base y, a partir de ésta, una población inicial
que originó las seis poblaciones de selección. En SUMMARY
cada tamaño efectivo de población, los tipos de
apareamientos practicados entre los reproduc- The objective of this paper was to generate
tores seleccionados para padres de la genera- alternatives of reproductive management for
Arch. Zootec. 53: 273-280. 2004.CUNHA, CARNEIRO, EUCLYDES, TORRES, SERENO Y DA SILVA
selection and multiplication of small populations sobre todo, para evitar la extinción. En
of autochthonous swines. It was studied three grandes poblaciones comerciales so-
mating types sighting the control of inbreeding in metidas a programas de selección, pro-
the future generations, in two effective population bablemente esa no sea la preocupa-
sizes: Ne= 40.00 and 66.67, respectively, ción inmediata, teniendo en cuenta el
simulated for swine. The estimative of inbreeding propio tamaño de la población, y la
was obtained for selection based on BLUP during posibilidad de obtención de gaños
20 generations, using Genesys program. A genéticos considerables en las prime-
genome constituted of 32 pairs of chromosomes ras generaciones. Sin embargo, sí que
of random sizes permitted the study of one trait hay que considerar el hecho de que
of heritability equal 0.20, governed by 150 loci. una alta intensidad de selección aliada
With this genome, was constructed one base a la utilización de metodología basada
population and from this one initial population that en las informaciones de la familia, como
originated the six selection populations. In each el índice de selección y el BLUP con
effective population size, the mating types
uso del modelo animal, favorecen la
practiced between the selected reproducers for
reducción del tamaño efectivo de la
parents of the next generation were: random
población y consecuente aumento en
mating, exclusion of mating between full sibs and
los niveles de consanguinidad. Esosexclusion of mating to half and full sibs. The
factores y sus implicaciones deberíannumber of descendants produced by mate by
ser considerados desde el inicio delgeneration was eight, in all populations. The
proceso selectivo, cuando se inicia laprocess was repeated by 30 times to reduce the
fijación de alelos con consecuente des-genetic drift. Average phenotypic values, additive
censo en la varianza genética disponi-genetic variance, average inbreeding and
ble.selection limit were the evaluated genetic
Ducos et al. (1992) a través delparameters. There was not effect of the mating
censo realizado en distintos países,types of minimum relationship in the inbreeding
involucrando empresas públicas y pri-control.
vadas de mejora genética de cerdos,
constataron que pocas empresas eva-
INTRODUCCIÓN luaron los animales con base en la
metodología BLUP. En la mayoría de
Recientes investigaciones enfo- los países evaluados, la práctica de
cadas a la preservación de la diversi- selección era basada solamente en los
dad genética muestran una preocupa- índices de selección. Esos autores tam-
ción creciente relacionada con los pro- bién compararon los sistemas de eva-
cesos selectivos y el mantenimiento de luación del Canadá, Dinamarca, Esta-
la variabilidad genética, principalmen- dos Unidos y Bélgica, considerados los
te en pequeñas poblaciones de anima- más avanzados con relación al tamaño
les domésticos. de la población, manejo del flujo de
En las poblaciones naturales de es- informaciones, modelo de análisis y
pecies raras sometidas a la conserva- parámetros usados, y finalmente pre-
ción o en pequeños núcleos comercia- sentaron perspectivas de adopción del
les cerrados, la preservación de la BLUP concretamente en Francia.
variabilidad genética es fundamental, Perez-Enciso y Gianola (1992)
Archivos de zootecnia vol. 53, núm. 203, p. 274.SELECCIÓN Y MULTIPLICACIÓN DE RGP CON DATOS SIMULADOS
realizaron estimaciones de parámetros 1992, la Conferencia de las Naciones
genéticos para tamaño de la camada Unidas sobre Ambiente y Desarrollo
(característica de baja heredabilidad) reconoció la necesidad esencial de ase-
en seis líneas de cerdos ibéricos, utili- gurar la conservación de los recursos
zando el modelo animal y el método de genéticos de los animales de granja, en
estimativa REML (máxima verosimili- la Convención de Diversidad Biológi-
tud restringida) de los componentes de ca. Actualmente, existe un amplio con-
la varianza. Según esos autores, Dobao senso en relación a la conservación de
et al. (1988b) habían discutido tres los recursos genéticos animales a tra-
métodos para mejorar el tamaño de la vés del mantenimiento de la variabili-
camada de los cerdos ibéricos, consi- dad genética de las razas locales den-
derando las situaciones de manejo ex- tro de sus sistemas de producción
tensivas de la época: 1) cruzamiento (Gandini y Oldenbroek, 1999).
entre líneas ibéricas; 2) cruzamiento Notter (1999), revisando la impor-
con razas chinas, y 3) selección dentro tancia del mantenimiento de la diversi-
de razas puras utilizando informacio- dad genética en poblaciones de anima-
nes de parientes por medio de un mo- les domésticos, enfatizó que la tasa de
delo animal. Para la última opción, declinación en la diversidad genética
diseñaron resultados prometedores, depende de la uniformidad en los obje-
bajo el punto de vista teórico. tivos de la selección dentro del rebaño
Según Gandini y Villa (2003), hasta o en las especies. Hill et al. (2000)
la primera mitad del siglo 20, existía en relataron los desafíos económicos
Europa, debido a su tamaño, una gran involucrados en el desarrollo de pro-
diversidad de razas de animales do- gramas para mantenimiento de diver-
mésticos con papel representativo en sidad genética y conservación de re-
la economía de varios países euro- cursos genéticos disponibles.
peos. Sin embargo, en la segunda mi- Como alternativa para preserva-
tad del mismo siglo, como resultado de ción de la variabilidad genética, Weigel
la industrialización y, en particular, por (2001) resalta que, actualmente, los
causa de la distribución de unas pocas programas de apareamientos están
razas altamente promocionadas y se- siendo bastante difundidos, y pueden
leccionadas, las antiguas razas locales ser modificados con el objetivo de evi-
del continente, en su mayoría, sufrie- tar la depresión por consanguinidad en
ron un descenso gradual en número, la generación siguiente, de modo que el
con lo cual, en algunos casos casi mante