Variabilidad genética en el ganado bovino Criollo Argentino de origen patagónico (Genetic variability in the Argentinian Creole cattle of Patagonic origin)

Martínez R.D

Description

Resumen
Se realizó la genotipificación de treinta y seis (36) bovinos criollos de origen patagónico para diecisiete microsatélites del panel recomendado por FAO para la caracterización de germoplasma bovino. Para cada microsatélite se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas, el contenido de información polimórfica (PIC), el estadístico FIS, el número de alelos (na), la heterocigosidad observada (ho) y la heterocigosidad esperada (he). Los desvíos del equilibrio Hardy-Weinberg (HWE), se analizaron mediante el test exacto de Haldane. A excepción del locus ILSTS6 (p<0,01), los loci restantes están en E-HW. Todos los loci fueron polimórficos. Los valores medios obtenidos fueron: na, 4,88
Ho: 0,6050, He: 0,6222, Fis: 0,0135 y PIC: 0,60. Las mayores heterocigosidades medias esperadas (he) se encontraron en los loci CSSM66 (0,7948) y TGLA227 (0,7878), información coincidente con la obtenida para los bovinos Criollos Uruguayos del Parque Nacional de San Miguel con valores de 0,80 y 0,75 respectivamente. Los resultados denotan una importante variabilidad genética en el bovino criollo patagónico.
Abstract
Thirty six Patagonian Creole bovines were genotyped using 17 of the STRs markers set recommended by FAO for bovine cattle germplasm characterization. Allelic and genotypic frequencies, PIC, FIS statistic, allele number (na), observed and expected heterocigosity (ho and He) were calculated for each STRs marker. Haldane exact test for measuring deviations from Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) was performed. HWE was found for every studied loci, except ILSTS6 (p<0.01). Polymorphisms for all loci were verified. Means values obtained were: na, 4.88, ho: 0.6050, he: 0.6222, Fis: 0.0135 and PIC: 0.60. Higher mean expected heterozigosity values were found at loci CSSM66 (0.7948) and TGLA227 (0.7878). This information was in agree with the Creole cattle of Parque Nacional San Miguel (Uruguay), with very similar values, 0.80 and 0.75 respectively for the same loci.This results suggest an important genetic variability in the Patagonian Creole cattle.

Sujets

• Microsatelites
• Polimorfismo
• Microsatellite
• Polymorphism
• Zygosity

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• Publié le: 01 janvier 2005
• Nombre de lectures: 27
• Langue: Español

Extrait

VARIABILIDAD GENÉTICA EN EL GANADO BOVINO CRIOLLO
ARGENTINO DE ORIGEN PATAGÓNICO
GENETIC VARIABILITY IN THE ARGENTINIAN CREOLE CATTLE OF
PATAGONIC ORIGIN
1 1 2 3 3Martínez, R.D , E.N. Fernández , A.M. Bróccoli , A. Martínez y J.V. Delgado
1Genética Animal. Facultad de Ciencias Agrarias. U.N.L.Z. Ruta 4, km 2. 1836 Llavallol. Argentina.
E-mail: [e-mail]
2Mejoramiento Vegetal. Facultad de Ciencias Agrarias. U.N.L.Z. Ruta 4, km 2. 1836 Llavallol. Argentina.
3Departamento de Genética. Facultad de Veterinaria. Universidad de Córdoba. Campus de Rabanales. Ed.
C-5. 14071 Córdoba. España.
PALABRAS CLAVE ADICIONALES ADDITIONAL KEYWORDS
Microsatélites. Polimorfismo. Heterocigosidad. Microsatellite. Polymorphism. Heterozygosity.
RESUMEN
Se realizó la genotipificación de treinta y seis te variabilidad genética en el bovino criollo
(36) bovinos criollos de origen patagónico para patagónico.
diecisiete microsatélites del panel recomendado
por FAO para la caracterización de germoplasma
bovino. Para cada microsatélite se calcularon las SUMMARY
frecuencias alélicas y genotípicas, el contenido
de información polimórfica (PIC), el estadístico Thirty six Patagonian Creole bovines were
F , el número de alelos (n ), la heterocigosidad genotyped using 17 of the STRs markers setIS a
observada (h ) y la heterocigosidad esperada recommended by FAO for bovine cattle
o
(h ). Los desvíos del equilibrio Hardy-Weinberg germplasm characterization. Allelic and genotypic
e
(HWE), se analizaron mediante el test exacto de frequencies, PIC, F statistic, allele number (n ),
IS a
Haldane. A excepción del locus ILSTS6 (p<0,01), observed and expected heterocigosity (h and
o
los loci restantes están en E-HW. Todos los loci H) were calculated for each STRs marker.
e
fueron polimórficos. Los valores medios obteni- Haldane exact test for measuring deviations from
dos fueron: n , 4,88; H:0,6050, H: 0,6222, F Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) was
a o e is:
0,0135 y PIC: 0,60. Las mayores heterocigosida- performed. HWE was found for every studied
des medias esperadas (h ) se encontraron en los loci, except ILSTS6 (p<0.01). Polymorphisms fore
loci CSSM66 (0,7948) y TGLA227 (0,7878), in- all loci were verified. Means values obtained
formación coincidente con la obtenida para los were: n , 4.88, h :0.6050, h : 0.6222, F :0.0135
a o e is
bovinos Criollos Uruguayos del Parque Nacional and PIC: 0.60. Higher mean expected hetero-
de San Miguel con valores de 0,80 y 0,75 respec- zigosity values were found at loci CSSM66
tivamente. Los resultados denotan una importan- (0.7948) and TGLA227 (0.7878). This information
Arch. Zootec. 54: 415-421. 2005.
VariabilidadMartinez.p65 415 13/12/2005, 8:45MARTÍNEZ, FERNÁNDEZ, BRÓCCOLI, MARTÍNEZ Y DELGADO
was in agree with the Creole cattle of Parque ner la población genéticamente cerra-
Nacional San Miguel (Uruguay), with very similar da bajo selección natural, con un alto
values, 0.80 and 0.75 respectively for the same grado de adaptación a condiciones
loci.This results suggest an important genetic ambientales extremas. Lirón et al.
variability in the Patagonian Creole cattle. (2002) observaron, como una caracte-
rística importante del ganado bovino
Criollo americano, un patrón genético
INTRODUCCIÓN heterogéneo, como consecuencia de la
subdivisión en grupos aislados con nulo
En el período prehispánico no exis- o bajo flujo génico entre ellos. Por otro
tían bovinos en América. Los primeros lado, la variabilidad genética es el ca-
bovinos ingresados a la Argentina, fue- pital fundamental de cualquier pobla-
ron introducidos por los colonizadores ción natural, ya que asegura su adapta-
españoles en 1549 (Carrazzoni, 1998). ción y su supervivencia a largo plazo
A partir de ellos se desarrolló la raza (Rabasa, 1995; Aranguren Méndez,
bovina Criolla en la Argentina. Con 2001).
motivo del intercambio comercial con El objetivo del trabajo es cuantifi-
grupos indígenas y la radicación de car la variabilidad genética intrapo-
poblaciones humanas estables, se tras- blacional del bovino Criollo Argentino
ladaron bovinos Criollos hacia la Pata- de origen Patagónico, empleando die-
gonia argentina. Con la introducción cisiete microsatélites del conjunto re-
de las razas británicas, la raza Criolla comendado por FAO.
solo se conservó en estado de pureza
racial en ambientes donde las introdu-
cidas no eran productivas por su falta MATERIAL Y MÉTODOS
de adaptación al clima (Sal Paz, 1986).
El bovino Criollo Argentino Patagónico, Diecisiete microsatélites, ubicados
ha quedado reducido a una pequeña en 12 cromosomas distintos, fueron
población asilvestrada en el Parque analizados en 36 animales Criollos ex-
Nacional Los Glaciares al S.O de la traídos del Parque Nacional Los
Provincia de Santa Cruz a 50º de lati- Glaciares (tabla I). Se recogieron
tud sur y 72º de longitud oeste (Rodrí- muestras de pelo para cada uno de
guez y Martínez, 1992). El número ellos, que fueron identificadas y guar-
actual es inferior a mil individuos y en dadas herméticamente hasta su proce-
retroceso, por lo cual este recurso samiento en el laboratorio. Luego de la
genético se considera en riesgo de extracción del ADN genómico, los
extinción, acrecentando su vulnerabili- microsatélites seleccionados fueron
dad el hecho de que están ocupando un amplificados mediante la técnica de
espacio declarado intangible por la Ad- reacción en cadena de la polimerasa
ministración de Parques Nacionales. (PCR), en el laboratorio del Departa-
Los animales se encuentran aislados mento de Genética de la Universidad
geográficamente por barreras natura- de Córdoba. Se realizaron tres reac-
les desde hace aproximadamente un ciones Múltiplex: MI= (BM1314,
siglo. Este hecho ha permitido mante- CSSM66; ILST011; INRA37; ETH10);
Archivos de zootecnia vol. 54, núm. 206-207, p. 416.
VariabilidadMartinez.p65 416 13/12/2005, 8:45VARIABILIDAD DEL BOVINO PATAGÓNICO
M2= (BM1818; BM2113; BM8125; (6 p.100) en secuenciador automático
INRA32; MM12); M3= (HAUT27; AB1377XL. El análisis de los frag-
HEL13; HEL9; CSRM60; ILST006; mentos y la tipificación alélica se rea-
INRA63; TGLA227). Los fragmentos lizó mediante los programas informáti-
amplificados se separaron mediante cos Genescan Análisis 3.1.2 y
electroforesis en gel de poliacrilamida Genotyper 2.5.2 respectivamente. Para
Tabla I. Microsatélites bovinos. (Bovine microsatellytes).
Microsatélite Cromosoma Iniciadores directo y reverso
BM 8125 17 CTCTATCTGTGGAAAAGGTGGG
GGGGGTTAGACTTCAACATACG
BM 1314 26 TTCCTCCTCTTCTCTCCAAAC
ATCTCAAACGCCAGTGTGG
BM1818 23 AGCTGGGAATATAACCAAAGG
AGTGCTTTCAAGGTCCATGC
BM2113 2 GCTGCCTTCTACCAAATACCC
CTTCCTGAGAGAAGCAACACC
CSSM66 14 ACACAAATCCTTTCTGCCAGCTGA
AATTTAATGCACTGAGGAGCTTGG
ETH10 5 GTTCAGGACTGGCCCTGCTAACA
CCTCCAGCCCACTTTCTCTTCTC
ILSTS 011 14 GCTTGCTACATGGAAAGTGC
CTAAAATGCAGAGCCCTACC
INRA032 11 AAACTGTATTCTCTAATAGCTAC
GCAAGACATATCTCCATTCCTTT
INRA037 11 GATCCTGCTTATATTTAACCAC
AAAATTCCATGGAGAGAGAAAC
MM12 9 CAAGACAGGTGTTTCAATCT
ATCGACTCTGGGGATGATGT
CSRM60 10 AAGATGTGATCCAAGAGAGAGGCA
AGGACCAGATCGTGAAAGGCATAG
HAUT27 26 TTTTATGTTCATTTTTTGACTGG
AACTGCTGAAATCTCCATCTTA
HEL13 11 TAAGGACTTGAGATAAGGAG
CCATCTACCTCCATCTTAAC
HEL9 8 CCCATTCAGTCTTCAGAGGT
CACATCCATGTTCTCACCAC
ILSTS006 7 TGTCTGTATTTCTGCTGTGG
ACACGGAAGCGATCTAAACG
INRA063 18 ATTTGCACAAGCTAAATCTAACC
AAACCACAGAAATGCTTGGAAG
TGLA227 18 CGAATTCCAAATCTGTTAATTTGCT
ACAGACAGAAACTCAATGAAAGCA
Archivos de zootecnia vol. 54, núm. 206-207, p. 417.
VariabilidadMartinez.p65 417 13/12/2005, 8:45MARTÍNEZ, FERNÁNDEZ, BRÓCCOLI, MARTÍNEZ Y DELGADO
probar la hipótesis de unión aleatoria o más alelos, o el método de enumera-
de gametos se empleó el test exacto de ción completa para aquellos loci con
Haldane (1954), utilizando el algoritmo menos de cuatro alelos (Louis and
de cadenas de Markov (Guo and Dempster, 1987). La correlación entre
Thompson, 1992) para loci con cuatro gametos dentro de individuos en la
Tabla II. Frecuencias alélicas. Entre paréntesis figura el número de cada variante. (Allelic
frequencies. Number of each variant between brackets).
variantes alélicas
Locus 1 2 3 4 5 6 7 8
BM8125 0,6528 0,1528 0,1944
(116) (118) (122)
BM1314 0,0972 0,5972 0,222 0,0833
(157) (159) (161) (169)
BM1818 0,1667 0,6667 0,1528 0,0139
(256) (260) (264) (268)
BM2113 0,0833 0,3333 0,4861 0,0833 0,0139
(126) (134) (136) (138) (140)
CSSM66 0,1250 0,1944 0,2778 0,0417 0,0278 0,2639 0,0278 0,0417
(179) (181) (183) (185) (187) (189) (193) (197)
ETH10 0,2917 0,1111 0,5139 0,0833
(215) (217) (219) (221)
ILSTS011 0,1735 0,2794 0,5441
(268) (270) (272)
INRA32 0,0500 0,3167 0,4000 0,1167 0,1167
(176) (178) (180) (182) (184)
IN