Présentée l'Université Louis Pasteur Strasbourg I

Jean Michel Ubeda

Description

Niveau: Supérieur
THESE Présentée à l'Université Louis Pasteur, Strasbourg I Faculté des Sciences de la Vie pour obtenir le titre de : Docteur de l'Université Louis Pasteur Domaine : Biologie Moléculaire et Cellulaire Par Jean Michel UBEDA Les cellules sanguines de drosophile: Etude transcriptionnelle et analyse génétique de leur réponse à une infection parasitaire Soutenue le 12 octobre 2005 devant la commission d'examen: Mme Angela GIANGRANDE (examinatrice, IGBMC, Illkirch) M. Serge POTIER (rapporteur interne, Institut de Botanique, Strasbourg) M. Thierry JAFFREDO (rapporteur externe, Laboratoire de Biologie du Développement, Paris) Mme Marylène POIRIÉ (rapporteur externe, UMR 1112 INRA, Nice) Mme Marie MEISTER (directrice de thèse, IBMC, Strasbourg)

• activation des voies de régulation


• réponse immunitaire de la drosophile


• voie jak


• analyse de l'activité transcriptionnelle des hémocytes de la drosophile


• hématopoïèse de la drosophile


• drosophile pour la délétion de latran


• latran


• invalidation du gène latran par recombinaison homologue


• fréquence des évènements de recombinaison

Sujets

• Doucet
• Vincent
• Louis Pasteur University
• Potier
• Crozatier
• Toulouse
• Hoffmann

Informations

• Publié par: profil-nechor-2012
• Publié le: 01 octobre 2005
• Nombre de lectures: 49
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 40 Mo

Extrait

THESE
Présentée à l’Université Louis Pasteur, Strasbourg I
Faculté des Sciences de la Vie pour obtenir le titre de :
Docteur de l’Université Louis Pasteur
Domaine : Biologie Moléculaire et Cellulaire
Par
Jean Michel UBEDA
Les cellules sanguines de drosophile:
Etude transcriptionnelle et analyse génétique de leur réponse à une
infection parasitaire
Soutenue le 12 octobre 2005 devant la commission d’examen:
Mme Angela GIANGRANDE
(examinatrice, IGBMC, Illkirch)
M. Serge POTIER
(rapporteur interne, Institut de Botanique, Strasbourg)
M. Thierry JAFFREDO
(rapporteur externe, Laboratoire de Biologie du Développement, Paris)
Mme Marylène POIRIÉ
(rapporteur externe, UMR 1112 INRA, Nice)
Mme Marie MEISTER
(directrice de thèse, IBMC, Strasbourg)-Remerciements-
J’exprime ma reconnaissance au Pr Jules Hoffmann pour m’avoir accueilli dans son
laboratoire, me donnant ainsi la chance de réaliser ce travail de thèse dans un environnement
scientifique de grande qualité. Je le remercie pour m’avoir soutenu durant les premières
années de mon doctorat.
Mes plus sincères remerciements à Mme Angela Giangrande, M. Serge Potier, M.
Thierry Jaffredo et Mme Marylène Poirié, pour avoir accepté de me faire don d’une partie de
leur temps pour lire et juger ce travail.
Tout particulièrement, je tiens à remercier Marie Meister pour m’avoir épaulé, guidé, et
conseillé tout au long de mon doctorat. Je te remercie également pour ta disponibilité et ton
aide au quotidien. Je suis content d’avoir pu effectuer ce travail à tes côtés, et d’avoir
bénéficié de tes qualités scientifiques et humaines. Le hasard a voulu que je sois ton dernier
étudiant, c’est dommage et je te souhaite bonne chance pour la suite.
Une grande partie de ce travail a pu exister grâce à une collaboration avec l’équipe
d’Alain Vincent et Michèle Crozatier à Toulouse. Je les remercie personnellement pour cette
interaction très enrichissante.
Quand on arrive en DEA, on a tout à apprendre et j’ai beaucoup appris avec le Dr Marie
Lagueux, je la remercie chaleureusement pour avoir contribué à ma formation pratique. Je
tiens aussi à remercier Daniel Doucet pour m’avoir appris toutes les “astuces” de la biologie
moléculaire…
Ce rapport représente quatre ans de travail, je le voulais complet et clair. Je suis
reconnaissant envers le Dr Jean-Luc Imler, mais aussi Vanessa et Catherine pour avoir lu ce
rapport et pour m’avoir fait part de leurs critiques. Je remercie Cécile pour sa maîtrise de
EndNote(6, pas plus).
Les années passées dans ce laboratoire m’ont permis de créer des liens et rencontrer des
personnes formidables. Je pense particulièrement à Vanessa, merci pour ton oreille, ton
amitié et ton soutien inconditionnel, ainsi qu’aux filles de notre “club très fermé” qui sont
Cécile V., Cécile F. et Catherine, merci pour m’avoir ouvert les yeux… et m’avoir rendu cette
dernière année si agréable!
Merci à Anne Braun pour ses conseils et à Richard pour sa bonne humeur dans l’équipe,
merci à vous deux pour votre participation au projet “Latran”.
Merci aux personnes qui m’ont facilité le travail au quotidien: Paule et Rachel, merci
pour votre gentillesse, Sebahat et Marie-Eve, mes deux voisines de paillasse, merci pour votre
aide.
Je suis heureux d’avoir pu profiter des conseils d’autres personnes au laboratoire au
cours des labmeetings mais également à d’autres occasions: Dominique Ferrandon, Jean-
Marc Reichhart, Vincent Leclerc, Jean-Luc Imler, Julien Royet, un grand merci à vous.Je suis également reconnaissant envers les “anciens jeunes” et les “nouveaux jeunes” du
laboratoire qui m’ont aidé à un moment donné: merci à Hana, Nadège, Vincent B., Jessica,
Emmanuel, Anne-Isabelle, Nadine, Marie G., Francine et David.
Chacun a contribué à la vie du laboratoire et directement ou indirectement à mes
travaux. Je ne vous nomme pas mais je vous remercie et vous souhaite à chacun bonne route.
Je remercie ma famille, mes parents, ainsi que mes frères et sœur qui ont toujours cru en
moi et sans qui je ne serais jamais parvenu jusqu’ici.-INTRODUCTION- __________________________________________________________ 3
I. La réponse immunitaire de la drosophile______________________________________ 6
A. La réponse humorale aux infections bactériennes et fongiques__________________ 6
1. Les peptides antimicrobiens ________________________________________________________ 6
2. Régulation des gènes codant les peptides antimicrobiens __________________________________ 7
3. Reconnaissance des microorganismes et activation des voies de régulation ___________________ 10
B. Les réponses cellulaires!: les hémocytes et leurs fonctions_____________________ 12
1. Les plasmatocytes et la phagocytose _________________________________________________ 13
2. Les cellules à cristaux et la mélanisation ______________________________________________ 15
3. Les lamellocytes et l’encapsulement _________________________________________________ 17
C. La coagulation ________________________________________________________ 19
1. La coagulation chez la limule ______________________________________________________ 19
2. La coagulation chez la drosophile ___________________________________________________ 20
II. L’hématopoïèse chez la drosophile_________________________________________ 21
A. Les processus hématopoïétiques __________________________________________ 21
1. L’hématopoïèse chez l’embryon ____________________________________________________ 21
2. L’hématopoïèse larvaire __________________________________________________________ 22
3. La double origine ontogénique des hémocytes de la drosophile ____________________________ 23
B. La régulation génétique de l’hématopoïèse _________________________________ 24
1. Le facteur GATA Serpent _________________________________________________________ 24
2. Les facteurs de lignage ___________________________________________________________ 25
3. La voie de signalisation Notch _____________________________________________________ 28
4. Le récepteur PVR (PDGF-VEGF Receptor) ___________________________________________ 29
5. La voie JAK/STAT ______________________________________________________________ 31
6. La voie Toll____________________________________________________________________ 33
C. Comparaison des systèmes hématopoïétiques des mammifères et de la drosophile 33
1. Les facteurs GATA, FOG et Runx dans l’hématopoïèse des mammifères_____________________ 34
2. Les facteurs à domaine Runt _______________________________________________________ 35
3. La voie JAK/STAT ______________________________________________________________ 35
4. La voie Notch __________________________________________________________________ 36
5. Les voies Ras/Raf et VEGFR dans l’hématopoïèse des mammifères_________________________ 37
III. Les interactions hôtes-parasitoïdes chez la drosophile _________________________ 37
A. Le parasitisme chez les Insectes __________________________________________ 37
B. Les Hyménoptères endoparasitoïdes et leurs hôtes___________________________ 39
C. La relation hôte-parasitoïde Drosophila melanogaster–Leptopilina boulardi ______ 40
IV. Objectif de ce travail ____________________________________________________ 42
-RESULTATS- _____________________________________________________________ 44
CHAPITRE I!: Analyse de l’activité transcriptionnelle des hémocytes de la drosophile __ 45
I. Introduction____________________________________________________________ 46
II. Article I!: New insights into Drosophila larval haemocyte functions through
genome-wide analysis. _______________________________________________________ 47
III. Résumé_______________________________________________________________ 49
1IV. Discussion ____________________________________________________________ 51
CHAPITRE II!: Etude du facteur Collier dans le développement hématopoïétique de la
drosophile _________________________________________________________________ 54
I. Introduction____________________________________________________________ 55
II. Article II!: Cellular Immune Response to Parasitization in Drosophila Requires the
EBF Orthologue Collier______________________________________________________ 56
III. Résumé_______________________________________________________________ 58
IV. Discussion ____________________________________________________________ 59
V. Objectifs!: A la recherche des partenaires de Col _____________________________ 63
CHAPITRE III!: Les homologues des récepteurs IL-6R des mammifères dans
l’hématopoïèse de la drosophile________________________________________________ 65
I. Introduction____________________________________________________________ 66
A. L