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Fiche TD avec le logiciel course2

17 pages

  • fiche - matière potentielle : td avec le logiciel


Fiche TD avec le logiciel : course2 ————— Principal Component Analysis (PCA) A.B. Dufour ————— Contents 1 Introduction 2 2 A full example 2 2.1 Preparing the dataset . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 2.2 Visualizing the data in a 3-dimensional space . . . . . . . . . . . 3 2.3 Centring and reducing the variables . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.3.1 Centring the data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.3.2 Reducing the data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 3 The global shape of the cloud of points 6 3.1 Normed PCA in ade4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 3.2 Scatter plots in ade4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.2.1 Scatter plot of individuals . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.2.2 Scatter plot of variables .

  • all variables

  • ll ll

  • plot all

  • dudi

  • data analyses

  • scatter plot

  • correspondence analysis

  • all eigenanalyses

  • eigenanalyses such


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FicheTDaveclelogiciel:course2PrincipalComponentAnalysis(PCA)A.B.DufourContents1Introduction22Afullexample22.1Preparingthedataset........................22.2Visualizingthedataina3-dimensionalspace...........32.3Centringandreducingthevariables................42.3.1Centringthedata......................52.3.2Reducingthedata......................63Theglobalshapeofthecloudofpoints63.1NormedPCAinade4........................83.2Scatterplotsinade4.........................123.2.1Scatterplotofindividuals..................123.2.2Scatterplotofvariables...................143.2.3Simultaneousplotofindividualsandvariables.......154Yourturn!165Conclusion17References171