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Fiche TD avec le logiciel tdr334

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fiche - matière potentielle : td avec le logicielFiche TD avec le logiciel : tdr334 ————— Tailles des testicules et systemes d'appariement D. Pontier, A.B. Dufour & D. Chessel ————— La fiche permet de se familiariser avec l'analyse de covariance et la methode des contrastes a partir d'un probleme biologique. Les donnees presentees sont issues d'un article actuellement soumis : Say L. & Pontier D. “ What determines testis size in the domestic cat (Felis catus L.)? ”. Une approche experimentale de la manipulation des contrastes sur un facteur est proposee. Table des matieres 1 La problematique 2 2 Les populations 2 3 Preparation des donnees 3 4 L'effet global de deux facteurs 8 4.1 La taille des testicules en fonction du poids . . . . . . . . . . . . 8 4.2 La taille des testicules en fonction des populations . . . . . . . . 8 4.3 Interaction ? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 5 Coefficients et contrastes d'un facteur 15 6 Importance statistique des contrastes 23 7 Contrastes et hypotheses biologiques 28 1 meme femelle durant la periode de reproduction volume des testicules sjt sjt competition spermatique bac bac taille des testicules theoretical quantiles ker ker
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Français

Fiche TD avec le logiciel :tdr334 Taillesdestesticulesetsyste`mesdappariement D. Pontier, A.B. Dufour & D. Chessel
La fiche permet de se familiariser avec l’analyse de covariance et lamethodedescontrastes`apartirdunprobl`emebiologique.Les ´ donneespresent´eessontissuesdelarticle:SayL.&PontierD. ´ ´ (2006) “ What determines testis size in the domestic cat (Felis catus L.)?.Uneapprocheexp´erimentaledelamanipulationdescontrastes surunfacteurestpropose´e.
Tabledesmati`eres 1Laproble´matique2 2 Les populations 2 3Pre´parationdesdonn´ees3 4 L’effet global de deux facteurs 7 4.1 La taille des testicules en fonction du poids . . . . . . . . . . . . 7 4.2 La taille des testicules en fonction des populations . . . . . . . . 8 4.3 Interaction ? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 5 Coefficients et contrastes d’un facteur 15 6 Importance statistique des contrastes 22 7Contrastesethypothe`sesbiologiques25
1
D. Pontier, A.B. Dufour & D. Chessel 1Laprobl´ematique Lobjectifdecette´etudeestdanalyserunedespr´edictionsdelath´eoriedela s´electionsexuelleconcernantlesvariationsdetailledestesticules.Latailledes testiculesestpositivementlie´e`alaproductiondespermeet,commere´sultat, ellea´evolu´´onserisquedecomp´etitionspermatique,quivarieavecle e en rep au syst`emedappariement.Lacompe´titionspermatiquerepre´sentelacompe´tition entrespermesdedie´rentsmaˆlespourfertiliserle(s)ovule(s)delameˆmefemelle. Unme´canismedelacompe´titionspermatiqueestdaugmenterlenombrede spermatozoıdesdefac¸ona`surpasserceuxdesmˆalesconcurrents.Lesplus ¨ grostesticulesfabriquantplusdespermatozoı¨des,onattenddestesticulesde tailleplusimportantedanslessituationsou`lacompe´titionspermatiqueestla plus forte. Hypothe`sedetravail:lacompe´titionspermatiqueetlatailledestesticules sontli´ees. Cetterelationchezlesverte´bre´sae´te´e´valu´eea`le´chelleinterspe´ciqueetles r´esultatssontconformesa`lath´eorie,a`quelquesexceptionspres.Onamontre´ ` aussiquelepoidsetleseetsphyloge´n´etiquesontuneinuenceconside´rable surlavariabilite´delatailledestesticules.LechatdomestiqueFelis catusL. constitueunexcellentmod`elepourre´alisera`l´echelleintraspe´ciqueuntestori-ginaldespr´edictionsdelathe´oriedelacompe´titionspermatiqueconcernantla relationentresystemedappariementettailledetesticules.Laplasticite´phe´no-` typiqueintrasp´eciquedevraitconduireaumeˆmepatron,lesplusgrostesticules devantˆetreobserve´sdanslessituationso`ulacomp´etitionspermatiqueestlaplus forte. C’est ce que nous allons analyser. 2 Les populations Cinqpopulationsdechatsdomestiquessonte´tudie´es.Ellessedistinguent parlatailledugroupesocialetlesyste`medappariement. Deux populations sontrurales: Saint-Just Chaleyssin (SJT) et Barisey-la-Coˆte(BAC).Lesfemellesviventsolitairesouenpetitgroupede2ou3femelles apparente´es.Ladensite´estfaible(200chats/km2sifagesssrenoss`rttmseLelaˆ). etsebattentpourmonopoliserlesfemellesenoestrus.Lesyste`medappariement estlapolygynie:unmˆalemonopolis`lsieursfemell e avec succes une ou p u es ; lensembledeschatonsdunemeˆmeport´eeontunseulp`ere.oitinp´etacomL spermatique est attendue faible. Deux populations sonturbaines: Lyon Croix-Rousse (CxR) et Rome (ROM). Mˆalesetfemellesviventengrandsgroupessociauxa`tre`sfortedensit´e(1000 chats/km2). Au moment de la reproduction, plusieur ˆles s’accouplent avec la s ma meˆmefemelledurantlap´eriodedereproduction,sansaucuneagressivite´entre lesmaˆles.Lesyst`emedappariementestlapromiscuit´e:uneport´eeest,dans 80%descas,engendre´eparplusieursmaˆles.mocaLrmatnspeitiop´etsetqieu attendue forte. Une population estinsulairetnoss:KreugleneK(RE.)eLsmˆalesetfemelle solitairesoccupantdetre`sgrandsdomainesvitaux.Ladensite´esttr`esfaible (1 chat/km2). Au moment de la reproduction, des couples peuvent se former.
LogicielRversion2.7.0(2008-04-22)tdr334.rnwPage2/28Compile´le2008-04-29 Maintenance : S. Penel, URL :l.bi/p:/yo-livunptth1nf./r/Rifhcsedt/tdr334.pdf
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