ETUDE DE LA STRUCTURE DES PROTEINES VIRALES IMPLIQUEES DANS LA TRANSMISSION DU Cauliflower mosaic virus PAR VECTEUR

Yves Benyamin

Description

Niveau: Supérieur, Master, Bac+5
MINISTERE DE LA JEUNESSE, DE L'EDUCATION NATIONALE ET DE LA RECHERCHE ECOLE PRATIQUE DES HAUTES ETUDES Sciences de la Vie et de la Terre MEMOIRE présenté par UZEST BONHOMME Marilyne pour l'obtention du diplôme de l'Ecole Pratique des Hautes Études ETUDE DE LA STRUCTURE DES PROTEINES VIRALES IMPLIQUEES DANS LA TRANSMISSION DU Cauliflower mosaic virus PAR VECTEUR Soutenu le 27 septembre 2004 devant le jury suivant Mr BENYAMIN Yves - Président Mr BERGOIN Max - Rapporteur Mr BLANC Stéphane - Examinateur Mr CANDRESSE Thierry - Examinateur Laboratoire de Pathologie Comparée des Invertébrés Directeur : BERGOIN Max EPHE Laboratoire de Pathologie Comparée Responsable : BLANC Stéphane St Christol-lez-Alès Laboratoire de Biologie et génétique des interactions plantes-parasites pour la protection intégrée Baillarguet, Montpellier RESUME EPHE Banque de Monographies SVT 1

• protéine p3


• critique cryo-em


• transmission


• particule virale


• degré d'oligomérisation du peptide hp2-cter

Sujets

• Candresse
• Transmission

Informations

• Publié par: profil-afte-2012
• Publié le: 01 septembre 2004
• Nombre de lectures: 100
• Langue: Français

Extrait

MINISTERE DE LA JEUNESSE, DE L’EDUCATION NATIONALE ET DE LA RECHERCHE   ECOLE PRATIQUE DES HAUTES ETUDES Sciences de la Vie et de la Terre     MEMOIRE   présenté par   UZEST BONHOMME Marilyne   pour l’obtention du diplôme de l’Ecole Pratique des Hautes Études   ETUDE DE LA STRUCTURE DES PROTEINES VIRALES IMPLIQUEES DANS LA TRANSMISSION DU Cauliflower mosaic virus PAR VECTEUR     Soutenu le 27 septembre 2004 devant le jury suivant                        Mr BENYAMIN Yves - Président                Mr BERGOIN Max  - Rapporteur                          Mr BLANC Stéphane  Examinateur -                                      Mr CANDRESSE Thierry  - Examinateur     Laboratoire de Pathologie Comparée des Invertébrés Directeur : BERGOIN Max EPHE [e-mail]   Laboratoire de Pathologie Comparée Responsable : BLANC Stéphane St Christol-lez-Alès [e-mail] Laboratoire de Biologie et génétique des interactions plantes-parasites pour la protection intégrée Baillarguet, Montpellier

   

RESUME  

Le Cauliflower mosaic virus (CaMV) est un virus de plante à ADN double brin transmis par puceron sur le mode non-circulant selon la stratégie « FAT». C’est un virus icosaédrique dont la capside est composée de 420 capsomères de la protéine virale P4 (symétrie T=7). Deux protéines virales non-structurales sont nécessaires à sa transmission par vecteur, la protéine P3 qui décore la particule virale et la protéine P2, Facteur Assistant la Transmission (FAT), qui établit un pont entre un récepteur hypothétique dans les stylets de l’insecte et le virion décoré de P3. Une étude structurale du complexe transmissible P2 :P3 :virion, ainsi que de chacun de ses composants isolés, a été initiée pour comprendre au niveau moléculaire les mécanismes impliqués dans la formation et la régulation de ce complexe. Plusieurs approches ont été menées en parallèle. Nous avons obtenu un modèle 3D de la particule virale nue à 20 Å de résolution qui nous a permis de confirmer l’organisation de la capside virale en trois couches concentriques, la couche externe étant structurée en 12 pentamères et 60 hexamères. Nous avons obtenu un modèle 3D du complexe P3 :virion à 26 Å de résolution. La comparaison des modèles de la particule virale nue ou décorée de P3 nous a permis de localiser précisément la protéine P3 au sein du complexe. Nous avons montré que la protéine était présente à raison de 420 copies par capside. Nous avons défini l’orientation de la protéine grâce à des données biochimiques et nous proposons un modèle d’interactions P3/virion. Nous avons apporté la preuve que la protéine P3 subissait un changement conformationnel au cours de son attachement à la particule virale. Plusieurs auteurs avaient démontré que cette protéine se trouvait sous forme tétramérique en solution, alors que la reconstruction 3D montre un arrangement différent, avec trois domaines C-terminaux ancrés dans la capside, pouvant ainsi interagir avec l’ADN localisé au niveau des couches internes, et deux domaines N-terminaux de la protéine associés en dimères antiparallèles, susceptibles d’interagir avec d’autres partenaires. Ce changement de conformation pourrait permettre de réguler les différentes interactions de la protéine P3 au cours du cycle viral.     Mots clés :  CaMV, transmission, symétrie icosaédrique, cryo-microscopie électronique, cristallogenèse, reconstruction tridimensionnelle

TABLE DES MATIÈRES     Liste des abréviations 4   Liste des tableaux et figures 5   Liste des documents présentés en annexe 7     CHAPITRE I : Introduction à la thématique de l’équipe et au projet 8  

1. L ES   VIRUS   DE   PLANTE – G ÉNÉRALITÉS  8 2. T RANSMISSION   DES   VIRUS   DE   PLANTE  11 La transmission circulante 12 La transmission non-circulante 12 3. T HÉMATIQUE   DE   L ’ ÉQUIPE V ECTION  13