Présentée la faculté des Sciences de la Vie

Frédéric Dardel

Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
THESE Présentée à la faculté des Sciences de la Vie De l'Université Louis Pasteur STRASBOURG-I Pour l'obtention de titre de : DOCTEUR DE L'UNIVERSITE LOUIS PASTEUR DE STRASBOURG Specialité : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Par Anass JAWHARI -------------------------- Etude structure-fonction du facteur de transcription / réparation TFIIH --------------------------- Soutenue le 4 Décembre 2003 devant le Jury composé de : Pr Frédéric Dardel Rapporteur externe Dr Bertrand Séraphin Rapporteur externe Pr Eric Westhof Rapporteur interne Dr Dino Moras Directeur de Thèse Dr Jean Marc Egly Examinateur Dr Arnaud Poterszman Examinateur

• complexe tbp


• cristallisation en batch


• promoteurs de l'arn polymérase


• lumiére de la structure


• structure de l'arn polymérase


• chromatographie sur colonne d'interactions hydrophobes


• remodelage de la chromatine par modifications covalentes


• chromatine

Sujets

• Thierry
• Kieffer
• Rapporteur
• Schultz
• Samama

Informations

• Publié par: profil-zyak-2012
• Publié le: 01 décembre 2003
• Nombre de lectures: 123
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 39 Mo

Extrait

THESE


Présentée à la faculté des
Sciences de la Vie
De l’Université Louis Pasteur
STRASBOURG-I

Pour l’obtention de titre de :




DOCTEUR DE L’UNIVERSITE
LOUIS PASTEUR DE STRASBOURG



Specialité : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Par

Anass JAWHARI


--------------------------

Etude structure-fonction du facteur
de transcription / réparation TFIIH

---------------------------


Soutenue le 4 Décembre 2003 devant le Jury composé de :

Pr Frédéric Dardel Rapporteur externe
Dr Bertrand Séraphin Rapporteur externe
Pr Eric Westhof Rapporteur interne
Dr Dino Moras Directeur de Thèse
Dr Jean Marc Egly Examinateur
Dr Arnaud Poterszman Exam
Liste des abréviations.............................................................................................................................................. 1

Avant-propos ......................................................................................................................................................... 3

Chapitre I- Régulation de la transcription.......................................................................................................... 6
1- La transcription de base .................................................................................................................................. 6
1.1-Les promoteurs de l’ARN polymérase II .................................................................................................. 7
1.2-L’assemblage séquentiel des facteurs de transcription.............................................................................. 8
1.2.1- Le facteur TFIID........................................................................................................................... 11
1.2.2- Le facteur TFIIB........................................................................................................................... 12
1.2.3- Le facteur TFIIF et l’ARN polymérase II..................................................................................... 12
1.2.4- Le facteur TFIIE et TFIIH ............................................................................................................ 14
1.3-Modèle de l’holoenzyme......................................................................................................................... 15
1.4- L’élongation........................................................................................................................................... 16
2- Facteurs de transcription spécifiques ............................................................................................................ 17
2.1- Activateurs transcriptionnels.................................................................................................................. 18
2.2- Coactivateurs transcriptionnels .............................................................................................................. 19
2.2.1- TFIIA............................................................................................................................................ 19
2.2.2- Les TAFs ...................................................................................................................................... 20
2.2.3- Le médiateur................................................................................................................................. 20
3- Chromatine et Transcription ......................................................................................................................... 22
3.1- Structure de la chromatine ..................................................................................................................... 22
3.2- Remodelage de la chromatine par modifications covalentes ................................................................. 25
3.2.1- Acétylation des histones ............................................................................................................... 26
3.2.2- Autres modifications des histones ................................................................................................ 27
3.3- Remodelage de la chromatine par modifications non covalente............................................................ 28

Chapitre II- Transcription à la lumiére de la structure................................................................................... 30
1-La structure du nucléosome ........................................................................................................................... 30
2-Le promoteur avant l’ARN polymérase II ..................................................................................................... 32
2.1- TBP........................................................................................................................................................ 32
2.2- Complexe TBP/ boîte TATA. ................................................................................................................ 32
2.3- Complexe TBP/ADN/TFIIB.................................................................................................................. 34
2.4- Complexe TBP/ADN/TFIIA.................................................................................................................. 36
2.5- Complexe TBP/TAF230 ........................................................................................................................ 38
2.6-Complexe TBP/ADN/NC2 ..................................................................................................................... 38
3- Structure de l’ARN polymérase.................................................................................................................... 41
3.1- Structure du core ARN polymérase II.................................................................................................... 41
3.2- Conservation structurale ........................................................................................................................ 43
3.3- Structure de l’ARN polymérase II entière.............................................................................................. 45
3.4- Elongation de l’ARN polymérase II ...................................................................................................... 47
4- Le médiateur ................................................................................................................................................. 48
5- Structures moléculaires de facteurs de transcription multiprotéiques........................................................... 51
5.1- Le facteur TFIID.................................................................................................................................... 51
5.2- Le facteur TFIIH.................................................................................................................................... 54
5.3- Le facteur TFIIE .................................................................................................................................... 56

Chapitre III- TFIIH, facteur multiprotéique.................................................................................................... 57
1- Les sous unités du core TFIIH ...................................................................................................................... 57
1.1- L’hélicase p89/XPB............................................................................................................................... 57
1.2-La sous unité p62 .................................................................................................................................... 59
1.3-La sous unité p52 .................................................................................................................................... 62
1.4-La sous unité p44 .................................................................................................................................... 62
1.5-La sous unité p34 .................................................................................................................................... 64
2-Les sous unités du CAK................................................................................................................................. 64
2.1-La sous-unité Cdk7 ................................................................................................................................. 64
2.2-La sous-unité Cyclin H ........................................................................................................................... 66

2.3-La sous-unité Mat1 ................................................................................................................................. 67
3- La sous-unité p80/XPD................................................................................................................................. 68
Chapitre IV- TFIIH à l’interfa