Adaptation et programmation d'un gestionnaire graphique de processus bioinformatiques

Ecole: aucune
Entreprise: aucune
Niveau: BAC + 5
Les outils informatiques utilisés voire développés par les biologistes sont de natures très diverses, il peut s'agir entre autres d'applications locales, de formulaires web, de scripts personnels ou de services web.
Pour répondre à leurs besoins il leur est souvent nécessaire d'enchaîner ces outils manuellement.
L'utilisation d'un workflow permettant l'enchaînement et l'exécution de ces outils devrait simplifier ce processus. De plus, une construction et une exécution graphiques permettent un meilleur contrôle dans la conception et dans l'enchaînement et offre des qualités pédagogiques.
Nous avons retenu d'utiliser Ptolemy II, un workflow non dédié à la bioinformatique auquel nous avons ajouté nos briques et celles d'autres projets.
Notre outil est initialement prévu pour analyser les bases de la reconnaissance des cytokines par leurs récepteurs en général au cours de l'évolution et plus précisément la conservation des résidus de l'interleukine-2 et de ses récepteurs.