Biogéochimie benthique : processus communs et divergences entre les sédiments littoraux et ceux des marges continentales : comparaison entre le Bassin d’Arcachon et le Golfe de Gascogne

N° d’ordre : 3844






THÈSE

PRÉSENTÉE A

L’UNIVERSITÉ BORDEAUX 1

ÉCOLE DOCTORALE DES SCIENCES ET ENVIRONNEMENTS

Par Aurélia MOURET

POUR OBTENIR LE GRADE DE

DOCTEUR
SPÉCIALITÉ : Biogéochimie et Ecosystèmes

BIOGEOCHIMIE BENTHIQUE : PROCESSUS COMMUNS ET
DIVERGENCES ENTRE LES SEDIMENTS LITTORAUX ET
CEUX DES MARGES CONTINENTALES
Comparaison entre le Bassin d’Arcachon et le Golfe de Gascogne

Directeur de thèse : Pierre Anschutz



Soutenue le : 2 octobre 2009

Après avis de :

M. RAGUENEAU, Olivier Directeur de recherche CNRS, UBO-IUEM, Brest Rapporteur
M. LUDWIG, Wolfgang Professeur, Université de Perpignan Rapporteur

Devant la commission d’examen formée de :

M. LECROART, Pascal Professeur, Université Bordeaux 1 Président du jury
M. ANSCHUTZ, Pierre Professeur, Université Bordeaux 1 Directeur de thèse
M. RAGUENEAU, Olivier Directeur de recherche CNRS, UBO-IUEM, Brest Rapporteur
M. LUDWIG, Wolfgang Professeur, Université de Perpignan Rapporteur
Mme HOWA, Hélène Maître de conférence, Université d’Angers Examinatrice
M. VIOLLIER, Eric Maître de conférence, LGE-IPGP, Paris VII Examinateur
Mme SCHMIDT, Sabine Chargée de recherche CNRS, Université Bordeaux I Membre invitée
Université Bordeaux 1
Les Sciences et les Technologies au service de l’Homme et de l’environnement
!


Remerciements


Trois années ont passé, trois années à la découverte du milieu scientifique et de
l’enseignement, trois années dans un laboratoire ponctuées de très très belles rencontres, trois
années qui m’ont permis d’apprendre, de grandir et d’évoluer.
Il y a de nombreuses personnes que j’aimerais remercier. Mais la première qui va
inaugurer ces pages c’est Pierre Anschutz. Tout d’abord, c’est grâce à lui que j’ai eu envie de
econtinuer en géochimie à la fin de ma 3 année de licence et, de retour d’une année au Canada
qui a confirmé mes choix, c’est après notre rencontre fortuite dans les couloirs d’EPOC que la
grande aventure a démarré. Pierre, tu as été plus qu’un directeur de thèse, tu as été le meilleur
des « grands chefs ». Ton humanité, ta gentillesse, ta simplicité et ton grand respect des autres
font l’unanimité chez tous tes nombreux stagiaires, thésards, membres de ton équipe et
collaborateurs. Merci pour tout ce que tu m’as appris, mais aussi pour ton écoute, tes conseils,
ta bonne humeur et tous les litres de café qui m’ont permis de tenir la barre jusqu’au bout (et
je vais la faire avant toi, non pas « le bar »… je t’entends déjà te marrer).
Je voudrais également remercier Hélène Howa, THE chef de mission, notre maman poule à
tous sur les bateaux comme en témoigne notre œuvre picturale de Forclim 7 et qui a accepté
d’être membre de mon jury de thèse. Tu as toujours su motiver tes troupes quels que soient les
conditions climatiques et les problèmes techniques (et pourtant on en a essuyé des tempêtes et
des câbles électroporteurs qui ne marchaient pas…). Merci pour tout ce que tu m’as appris sur
les bateaux, mais également pour ton enthousiasme, ta franchise, ta confiance, tes
encouragements, ton soutien et tes conseils qui m’ont été très utiles dans les moments de
doute…
Un grand merci également à Bruno Deflandre, alias mister high-tech. Depuis nos premières
manips ensemble à Cassy, tu m’as appris et tu m’apprends encore beaucoup de choses sur le
monde de la géochimie et c’est toujours avec plaisir que je viens dans ton bureau taper la
discut tout en partageant un p’tit repas maison et quelques princes.
Et qu’auraient été ces 3 années sans mon p’tit Domi !!! Ah Domi, tu es la coqueluche de
etous les stagiaires et notre rayon de soleil du couloir est du 2 étage grâce à ta bonne humeur
et tes blagues ! Merci pour ta gentillesse, ton écoute, ton aide et ton soutien dans les moments
difficiles. Tu es vraiment quelqu’un de formidable et je te souhaite encore tout plein de
bonheur à toi et ta p’tite famille et puis… viva la vaca libre !!!
Un grand merci également à Jonathan Deborde. C’est grâce à toi que j’ai fait mes
premières armes au laboratoire et dans la vase de Cassy. Tu as été un super prof et je te
remercie également pour toute ton aide et tes conseils quand j’ai débuté la thèse et le
monitorat. Continue à profiter de la vie et du surf et à bientôt j’espère !
Merci également à Pascal Lecroart, président de mon jury et grand sage parmi les sages, à
Gwen Abril, le baroudeur de l’équipe et Henri Etcheber et ses espadrilles devenues célèbres.
Quelle ambiance dans cette équipe !! Bravo à vous tous et continuez longtemps comme ça !
Un grand merci également à l'ensemble des autres membres de mon jury pour leurs
remarques, leurs conseils et leur intérêt au cours de la soutenance. Merci à Wolfgang Ludwig
et Olivier Ragueneau d'avoir accepté d'être rapporteurs de ces travaux, à Eric Viollier et
Sabine Schmidt qui ont examiné cette thèse.
Et puis ces trois années ont été ponctuées de grands moments de science et de fous rires
avec les nombreux p’tits loulous stagiaires qui sont passés par là ! Un clin d’oeil plus
particulier à la p’tite Marie, alias ma pitchounette, j’espère que tu continueras à rire et à
chanter chez m’sieur hulot à Paris et je vous souhaite que du bonheur à toi et Arnaud ton
namoureux. Merci également à Célinette la mistinguette qui bosse déjà comme un chef,
!

Brubru avec qui on a dompté l’AX (pas toujours avec succès !) et bravé les tempêtes à
Marennes Oléron, Sandrinette, Alexandre, Elodie, Thomas, Géraud, David, Adrien, Jessy…
Et puis bien sûr il y a les incontournables, les compagnons des bons moments comme des
moins bons, ceux avec qui on a ri, on a pleuré et on a (beaucoup) bu aussi, mes p’tits
poulets !!! Grâce à vous ces trois années ont été bien plus que l’apprentissage du monde
scientifique, ça a été une superbe aventure humaine avec des moments forts et de très belles
amitiés !!! Tout d’abord, une spéciale dédicace à mes copaings du bureau Caraïbes, Caro et
son Soulac qui réchauffe les cœurs, Aurélie qui attend les extraterrestres à Arès avec Tonio et
la p’tite Irène et Rafoufou et ses inoubliables rafaelleries. Je n’oublierai jamais nos karaokés
du midi sur Marylou, nos quarts d’heures de folie sur Franky ou un bon vieux morceau de
disco ou de funk (hein foufounet !), les très fameux apéros Caraïbes et j’en passe !!!! Et tous
ces moments de joie, de délire (comme par exemple l’histoire devenue célèbre de
Pegggyyyyyyy !!!!!), de danses endiablées (aie aie aie le genou…) avec Juju et le Sidyhouff
power, Elo ma poulette relookeuse préférée, Fifine qui s’est occupée de moi comme une p’tite
maman quand mon genou m’a lâché la première fois, Nico qui boit la bière plus vite que son
ombre, Lolo le mérignacais, Mr Chassagne ou l’homme qui a toujours la classe, Mathieu
organisateur de sorties terrain dans des conditions terribles (dur dur les huîtres/loupiac/foie
gras sur le bassin !!), Emilie membre de l’expédition bretonne avec feu la batmobile, Manu et
ses bébés pigeons, Samy et Mariiiiine, la p’tite Marion, François le râleur au cœur tendre, la
p’tite Marie Lisette, Laurie, Aurélie, Samuel, Florient, Florent, Pierre, Laurent, Bruno, les
Vincents, Filipa, Cons… Que de belles rencontres !! Et même si pour le moment nos chemins
à tous se séparent et que vous allez tous me manquer, je suis sure qu’on se retrouvera tôt ou
tard (le plus tôt possible quand même !!).
Un grand merci aussi à toutes les personnes avec qui j’ai partagé de bons moments pendant
les missions et sur le terrain. Merci tout d’abord aux marins du Côtes de la Manche, du
Téthys, de la Thalia et du Sarmiento de Gamboa. Merci ensuite aux habitués des missions
PECH, FORCLIM et BEHEMOTH (et oui y en a qui aiment ça !!), c’est à dire les Sophie