DevelopmentandexperimentalvalidationofaproteindesignsoftwareDerNaturwissenschaftlichenFakultätderFriedrich-Alexander-UniversitätErlangen-NürnbergzurErlangungdesDoktorgradesvorgelegtvonMartinTillmannStiebritzausNürnbergAlsDissertationgenehmigtvonderNaturwissenschaftlichenFakultätderUniversitätErlangen-NürnbergTagdermündlichenPrüfung: 30.Juli2008VorsitzenderderPromotionskommission: Prof.Dr.EberhardBänschErstberichterstatter: Prof.Dr.YvesMullerZweitber: Prof.Dr.HeinrichStichtMeinenliebenElterngewidmet“Now we’ve taken this theory one stage fur-ther.Ifweincreasethesizeofthepenguinun-til it is the same height as the man and thencompare the relative brain sizes, we now findthat the penguin’s brain is still smaller. But,andthisisthepoint,itislargerthanitwas.”PROF. KEN ROSEWALLIVIchdankeProf. Yves Muller für die Vergabe dieses interessanten Themas und die gute und effektive Zusam-menarbeitbeiderProgrammierungvonMUMBO.BesondersmöchteichmichauchfürseineGeduldunddasmirentgegengebrachteVertrauenbedanken.Prof. Heinrich Sticht vom Institut für Biochemie der Universität Erlangen für viele wertvolleAnregungen bei der Implementierung des Kraftfeldes und für die freundliche Übernahme desZweitgutachtens.Prof.FranzX.SchmidvomLaboratoriumfürBiochemiederUniversitätBayreuthfürdieGelegen-heitCD-SpektrenundthermischeAuffaltungenderTetR-VarianteninseinerArbeitsgruppemessenzu können.