Développement de paquets R et valorisation de la recherche en ...
47 pages
Catalan

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Description

D´eveloppement de paquets R et valorisation de la
recherche en statistique appliqu´ee
C. Ambroise
´CNRS, Laboratoire Statistique & G´enome, Evry, FRANCE
http://stat.genopole.cnrs.fr/∼cambroise Outline
Statistique et R
R, un langage de script adapt´e aux statistiques
´Ecrire un paquet R
De l’id´ee au code
SIMoNe
MixER
Conclusion Statistique appliqu´ee : media de diffusion des r´esultats
Quelle est la nature du travail?
I Comprendre les donn´ees et le probl`eme
I Mod´eliser (mod`eles et param`etres)
I Etudier les propri´et´es du mod`ele
I Estimer les param`etres (algorithme)
I Revenir `a des donn´ees r´eelles (appliquer, comparer)
Comment faire connaˆıtre ses algorithmes?
I Communication orale
I Commu ´ecrite
I Code r´eutilisable impl´ementant les algorithmes Plan
Statistique et R
R, un langage de script adapt´e aux statistiques
´Ecrire un paquet R
De l’id´ee au code
SIMoNe
MixER
Conclusion Une popularit´e grandissante
Data Analysts Captivated by R’s Power (”New York Times”, 6 janvier 2009)
Max Kuhn, directeur adjoint des tests non cliniques chez Pfizer :
R has really become the second language for people
coming out of grad school now, and there’s an amazing
amount of code being written for it....
You can look on the SAS message boards and see there is
a proportional downturn in traffic. Pourquoi R? I
Fig.: Ross Ihaka (gauche) et Robert Gentleman (droite), d’apr`es le ”New
York Times”. Pourquoi R? II
Fig.: Diff´erentes ´etapes de d´eveloppement, d’apr`es ”The R journal” ...

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Langue Catalan
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Extrait

De´veloppementdepaquetsRetvalorisationrechercheenstatistiqueapplique´eC.AmbroiseCNRS,LaboratoireStatistique&Ge´nome,E´vry,FRANCEtht:p//sat.tegonplo.encsrf./rcambroiseedal
OutlineStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’ide´eaucodeSIMoNeiMRExConclusionadapt´exuastatistiques
Statistiqueapplique´e:mediadediffusiondesre´sultatsQuelleestlanaturedutravail?IComprendrelesdonne´esetleproble`meIMode´liser(mode`lesetparame`tres)IEtudierlesproprie´te´sdumode`leIEstimerlesparame`tres(algorithme)IRevenira`desdonne´esre´elles(appliquer,comparer)Commentfaireconnaıˆtresesalgorithmes?ICommunicationoraleICommunicatione´criteICodere´utilisableimple´mentantlesalgorithmes
nalPStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’ide´eaucodeSIMoNeRExiMConclusionadapte´xuastatistiques
Unepopularite´grandissanteDataAnalystsCaptivatedbyR’sPower(”NewYorkTimes”,6janvier2009)MaxKuhn,directeuradjointdestestsnoncliniqueschezPfizer:Rhasreallybecomethesecondlanguageforpeoplecomingoutofgradschoolnow,andthere’sanamazingamountofcodebeingwrittenforit....YoucanlookontheSASmessageboardsandseethereisaproportionaldownturnintraffic.
PourquoiiF.g:RssoR?IIakahYorkTimes”.(gauche)teRobertGentleman(droite),d’apr`eselweN
PourquoiiF.g:R?IIDiffe´rentesde´cembre2009.e´tapesedde´veloppement,d’apre`sehTRjournal”,
PourquoiR?IIIFig.:LenombredepaquetssurleCRANaconnuunecroissanceexponentielle(gauche)etmontreunre´centde´clin(droite),d’apre`sRjournal”,de´cembre2009.IRestaussitre`sdiffuse´deparl’enseignementehT
PourquoiunpaquetR?IDiffuser:encomple´mentd’unarticleICentraliser:lestravauxd’unlaboratoireIPourlareconnaissanceetlabeaut´edelachose....ExemplesIGeneNetdeKorbinianStrimmer,Ie1071dude´partmentdestatistiquedelaTUWien,IlatticedeDeepayanSarkar.
alPnStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’id´eeaucodeSIMoNeRExiMConclusionadapte´xuastatistiques
Del’ide´eaubrouillondeprogrammeEcriturerapidedechosescomplexes1.Misesurlepapierdel’algorithme2.ProgrammebrouillonIC,Fortran,...:1a`2semainesIR,matlab:1/2a`1journe´e.
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