Diversification des rotations de grandes cultures avec des prairies temporaires : un moyen pour combiner la gestion de la flore adventice et la conservation de la biodiversité, Diversifying crop rotations with temporary grasslands : potentials for weed mangement and farmland biodiversity

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Sous la direction de Jacques Caneill, Rainer Waldhardt, Nicolas Munier-Jolain
Thèse soutenue le 05 juillet 2010: UNIVERSITE GIESSEN (ALLEMAGNE), Dijon
La rotation de cultures peut être utilisée pour empêcher la sélection continue d’espèces adventices adaptées à un type de culture. Elle pourrait favoriser la gestion des adventices, l’économie d’herbicides et la biodiversité. Les successions de cultures simples d’aujourd’hui pourraient être diversifiées par des cultures fourragères pérennes. Les impacts des ces cultures sur les adventices ont été étudié utilisant quatre approches : 1) Des relevés d’adventices sur 632 champs dans l’ouest de la France ont montré que la composition spécifique varie le plus entre des cultures fourragères pérennes et des cultures annuelles. Une comparaison des champs avant, pendant, et après des cultures fourragères pérennes a suggéré que la composition des communautés varie d’une manière cyclique pendant ces rotations. Plusieurs espèces problématiques dans des cultures annuelles ont été supprimées pendant et après les cultures pérennes, mais l’apparition d’autres espèces a produit une diversité de plantes comparable, voire supérieure. 2) Une expérimentation au champ de trois ans avec des modes de gestion contrastés a permis d’étudier les mécanismes sous-jacents: L’absence de travail du sol a réduit la levée des adventices, mais a augmenté la survie des plantes adultes. Le couvert végétal permanent et les fauches fréquentes ont réduit la croissance, la survie des plantes et la production de graines. 3) Des expérimentations sous serre analysant la croissance poste fauche de plantes individuelles ont montré des différences importantes entre espèces et groupes fonctionnels. Une expérimentation à deux facteurs a suggéré que les impacts négatifs de la fauche et de la compétition sur la croissance des adventices ont été additifs. 4) Des mesures spéciales de prédation de graines d’adventices sur l’expérimentation au champ ont montré des corrélations positives avec le couvert végétal et la prédation, indiquant une importance particulière de ce service écosystémique dans des cultures pérennes. La préférence des graines de certaines espèces montre que la prédation de graines peut être une autre cause des changements de communautés d’adventices.
-Agro-écologie
-Protection intégrée
-Rotation des cultures
-Prairie temporaire
-Culture pérenne fourragère
-Medicago sativa
-Composition de communauté de plantes
-Groupe fonctionnel
-Dynamique de population
-Croissance post-fauche
-Prédation de graines
-Granivorie
-Lutte biologique
-Service écosystémique
Crop rotation may be used to prevent the continuous selection of particular weed species adapted to one crop type. This might be useful for weed management, economy in herbicide applications and promoting biodiversity. Common simple crop sequences might be diversified by introducing perennial forage crops. Impacts of such perennial crops on weeds were studied with four approaches : 1) Large-scale weed surveys in 632 fields in western France showed that weed species composition differed most strongly between perennial alfalfa crops and annual crops. Comparisons of fields before, during and after perennial alfalfa suggested that community composition varies in a cyclic way during such crop rotations. Several weed species problematic in annual crops were suppressed during and after perennial crops, but the appearance of other species led to equal or even higher plant diversities. 2) A 3-year field experiment with contrasting crop management options allowed an investigation of the underlying mechanisms for this: The absence of soil tillage reduced weed emergence but increased the survival of established plants. The permanent vegetation cover and frequent hay cuttings reduced weed growth, plant survival and seed production. 3) Greenhouse experiments testing the regrowth ability of individual plants after cutting showed strong differences between species and functional groups. An two-factorial experiment suggested that the negative impacts of cutting and competition on weed growth were mainly additive. 4) Special measurements of weed seed predation in the field experiment showed positive correlations with vegetation cover, indicating that this ecosystem service may be particularly fostered by perennial crops. Consistent preferences of seed predators for certain weed species indicates that seed predation may be another cause of the observed weed community shifts.
-Agroecology
-Integrated weed management
-Crop rotation
-Temporary grassland
-Perennial forage crops
-Medicago sativa
-Plant community composition
-Functional group
-Population dynamics
-Post-cutting regrowth dynamics
-Seed predation
-Granivory
-Biological pest control
-Ecosystem service
Source: http://www.theses.fr/2010DIJOS018/document
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4 Mo

Thèse de doctorat nouveau régime - cotutelle
Binationales Promotionsverfahren
Diversifying crop rotations with temporary grasslands:
potentials for weed management and farmland biodiversity
Thèse pour obtenir le grade de docteur de l’Université de Bourgogne (uB), Dijon, France

École doctorale : Environnement – Santé – STIC (E2S)
Spécialité : Agro-écologie, Biologie des Populations

Équipe : UMR 1210 Biologie et Gestion des Adventices
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), 17 rue Sully, F-21000 Dijon, France


Dissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Agrarwissenschaften (Dr. agr.)
der Justus-Liebig-Universität Gießen, Deutschland

Fachbereich 09 Agrarwissenschaften, Ökotrophologie und Umweltmanagement
Institut für Landschaftsökologie und Ressourcenmanagement

Professur für Landschaftsökologie und Landschaftsplanung
Heinrich-Buff-Ring 26-32, D-35392 Gießen, Deutschland


Presentée par : Vorgelegt von:
Helmut MEISS


Directeur de thèse (France) : Betreuer (Frankreich):
Prof. Dr. Jacques CANEILL

Co-directeur de thèse (France) : Ko-Betreuer (Frankreich):
Dr. Nicolas MUNIER-JOLAIN

Directeur de thèse (Allemagne) : Betreuer (Deutschland):
Prof. Dr. Rainer WALDHARDT


Date de soutenance : Tag der Disputation:
5 juillet 2010 5. Juli 2010


Jury : Prüfungskommission:

Dr. François BRETAGNOLLE Prof. Université de Bourgogne Président Vorsitz
Dr. Philippe DEBAEKE DR INRA Toulouse Rapporteur Gutachter
Dr. Bernd HONERMEIER Prof. Universität Gießen Rapporteur Gutachter
Dr. Vincent BRETAGNOLLE DR CNRS Chizé Examinateur Beisitzer
Dr. Bärbel GEROWITT Prof. Universität Rostock Examinatrice Beisitzerin
Dr. Nicolas MUNIER-JOLAIN IR INRA Dijon Encadrant Betreuer
Dr. Rainer WALDHARDT Prof. Universität Gießen Encadrant Betreuer
iologie. estion
dventices i ACKNOWLEDGEMENTS
Dugué, Dominique Meunier, Emilie Cadet,
I would like to thank the numerous people who
Hugues Busset, Alain Fleury, Gilles Louviot,
kindly helped me in realizing this PhD thesis. In
Delphine Ramillion and Sébastien for conducting
particular, I am deeply indebted:
and helping with the field and greenhouse
experiments; - to my supervisors Nicolas Munier-Jolain,
Rainer Waldhardt, and Jacques Caneill. Thank
Christiane Dupaty, Séverine Siblot, Claudine
you for your collaboration and confidence and
Chotel, Sandrine Geslain and Nathalie
during the whole project, the fertile discussions
Grandgirard for administration and network
on research questions, methods and results, the support to the “BNI”;
correction of the articles and the final thesis and
for finding compromises between the French and Xavier Reboud, Beryl Laitung, Sandrine Petit,
the German systems…, Fabrice Dessaint, Bruno Chauvel, Jacques
Gasquez, François Bretagnolle, Marie-Hélène
- to the members of the examination board,
Bernicot, Henri Darmency, and Christian Gauvrit
Philippe Debaeke, Rainer Waldhardt, and Bernd
for interesting discussions and helpful advice in
Honermeier for your reports on the thesis;
various areas;
Francois Bretagnolle, Bärbel Gerowitt, and
Vincent Bretagnolle for participating in the PhD Charles Schneider for programming the routine
defence (and the rehearsals for the video- of the plant image analysis software; and Arnaud
transmission system!), Coffin for running (and constructing) the plant
‘conveyor system’;
- and to the participants of the ‘comité de
pilotage de thèse’, Safia Médiène, Gilles Audrey Alignier, Frederic Henriot, Rémy
Lemaire, Xavier Reboud and Nathalie Colbach Bonnot, Lise Le Lagadec, and Cyril Naulin for
for your advice. being patient with their co-supervisor ;-) ;
Boris Fumanal, Antoine Gardarin, Yann Tricault,
Yongbo Liu, Delphine Mézière and others for
My thesis would not have been possible without
successively sharing the office, watering the
such good helpers in field and greenhouse plants and answering my numerous questions…;
work, as well as the people who always kindly
and many other PhD students and post-docs
answered my questions, assisted me in scientific
including Guillaume Fried, Aline Boursault,
reasoning, data analysis, writing, and
Richard Gunton, Bertrand Jacquemin, Valentine
bureaucracy…
Péllissier, Benjamin Borgy, Solène Bellanger,
Stéphane Cordeau, Mélanie Le Guilloux, In Dijon, I would like to thank the whole ‘weed
Dominique Jacquin, Cécile Petit, Clément science research’ group (UMR BGA) as well as
Tschudy, Muhammed Anés, Yacine Merabtine, the people from INRA-Epoisses, in particular
who helped me in a way or another. Florence Strbik, Denis Lapostolle, Pascal Farcy,
Philippe Chamois, Laurent Falcetto, François
ii In Chizé, I am indebted to all the people who I would like to thank Richard Gunton and
contributed to the large-scale weed surveys at another reviewer for improving the English
the CNRS-Chizé study site, including Damien spelling, grammar and style, and several
Charbonnier, Luc Bianchi, Laurent Grelet, anonymous reviewers and journal editors for
Anne-Caroline Denis, Safia Médiène, suggesting improvements to and ways to shorten
Dominique Le Floch, Florence Strbik, Emilie the articles. Undoubtedly I have forgotten a lot of
Cadet, Bruno Chauvel, Fabrice Dessaint and people who contributed in one way or another or
many others; I am also indebted to the numerous acted in the background making this PhD project
people who contributed to land-use monitoring possible.
and have maintained the database since 1995,

including Vincent Bretagnolle, Alban Thomas,
Rodolphe Bernard, Pablo Inchausti, Isabelle I would also like to thank several agencies and
Badenhausser, David Pinaud, Sylvie Houte, institutions that helped to finance this research
many other former short-term employees, including the French ANR projects ‘ECOGER-
master, and PhD students, and also more recent Chizé’ and ‘SYSTERRA-ADVHERB’, the UMR
ones including Adrien, Vincent, Boen, Olivier, BGA (INRA), AgroSup Dijon (Appel d’Offre
Steve, Alex, Frédéric, Thibault, Thomas, and Interne), the European ENDURE Network
Audrey; and to all the farmers that we met on ‘Diversifying crop protection’.
their fields…

In Gießen, I would like to thank Lutz Eckstein,
During these last few years I have been Tobias Donath, Birgit Reger, Ralf Schmiele,
supported by many friends and family members. Sandra Burmeier, Linda Jung, Arben Mehmeti
À Dijon, j’ai passé des moments excellents, en and Miriam Bienau for some interesting
particulier avec les ‘louploups’ et des musiciens. discussions and statistical advices; Prof. Otte,
Leider konnte ich meine Familie und Freunde in Ms Ackermann, Mr Trebitz, and Mr Frenger for
Deutschland nicht so oft sehen, wie ich es mir finding bureaucratic solutions for the bi-national
gewünscht hätte. Trotzdem haben sie mir von cotutelle project and the organisation of the
Ferne aus sehr geholfen, meine Arbeit zu video-conference for the defence; Gefion for
vollenden, besonders meine lieben Eltern Ruth hosting me in Gießen, Kathleen and David for
und Lothar, und mein Bruderherz Stefan, und accommodation half-way in Strasbourg, and
meine Oma, die es geschafft hat, wenige Tage Sören, Maja and Berny for that in Freiburg;
vor Abgabe der Arbeit 100 Jahre alt zu werden!
In Prague, Pavel Saska and Stanka Koprdová
Last but not least, I would like to thank Ann-gave some helpful advice for the seed predation
Katrin (Nadjenka) who put up with my strange studies.
research interests and backed and encouraged me
throughout this period.
iii CONTENTS
OVERVIEW
ACKNOWLEDGEMENTS .................................................................................................... II
CONTENTS ............................................................................................................................ IV
ABSTRACTS (ENGLISH, FRENCH & GERMAN) .......................................................... XI
CONTEXT AND FUNDING ............................................................................................ XVII
THESIS ORGANISATION ................................................................................................ XIX
A GENERAL INTRODUCTION ......................................................................................... 1
B OVERWIEW OF THE MATERIALS & METHODS ................................................. 38
C RESULTS (ARTICLES & MANUSCRIPTS) ............................................................... 47
D GENERAL DISCUSSION ............................................................................................. 152
E CITED REFERECES .................................................................................................... 183
AN

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