Réponses d'une population aux forçages environnementaux et anthropiques : le suivi à long terme de la crevette Palaemon Longirostris de l'Estuaire de la Gironde (1979-2007)
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Thèse soutenue le 27 novembre 2009: Bordeaux 1
La population de la crevette blanche Palaemon longirostris, espèce résidente des estuaires faisant l’objet d’une pêche traditionnelle, est soumise à des forçages environnementaux (fluctuations naturelles du milieu, modifications du régime hydro-climatique de l’estuaire en lien avec le changement climatique) et anthropiques importants (aspiration dans les circuits du CNPE -Centre Nucléaire de production d’Electricité du Blayais-, pêche ciblée, pollutions etc.). Dans ce contexte et sur la base d’un suivi mensuel, réalisé depuis 1979, complété par des échantillonnages en 2007, cette thèse montre que cette population répond fortement aux changements environnementaux abiotiques et anthropiques. Ainsi, d’importantes fluctuations spatio-temporelles des abondances sont mises en évidence à diverses échelles temporelles, spatiales et biologiques. L’analyse de la série à long terme montre des fortes oscillations interannuelles régulières (période 5/10 ans) en partie liées aux facteurs environnementaux et aux variations du recrutement. Une diminution de l’abondance globale, ainsi qu’un déplacement vers l’amont de cette population, sont également constatés. Ce déclin est attribué aux fortes variations et nombreuses modifications des traits de vie de l’espèce –reproduction, -croissance, -mortalité, démontrées au cours de l’étude. La présence de déformations de l’exosquelette, étudiée aussi via un élevage de plusieurs mois, révèle par ailleurs, de forts impacts négatifs à l’échelle individuelle (mortalité). De plus, des simulations réalisées à partir d’un modèle matriciel de dynamique de population élaboré durant l’étude, montrent la synergie des pressions anthropiques par prélèvements (CNPE, pêche) et des forçages environnementaux, ainsi que l’importance des processus de déplacement dans le fonctionnement de cette population. Cette étude démontre finalement l’intérêt que revêt cette population et plus largement les populations de crevettes estuariennes, pour l’étude du fonctionnement et du diagnostic de l’état des écosystèmes estuariens. De nouvelles métriques originales sont proposées, lesquelles ouvrent vers la voie vers de nouveaux indicateurs.
-Palaemon longirostris
-estuaire de la Gironde
-dynamique de population
-changement global
-crevettes
-traits d’histoire de vie
-modèle matriciel
-déformations de l'exosquelette
The white shrimp, Palaemon longirostris, is an estuarine species and an important fishing resource. This species therefore encounters an important environmental forcing (natural fluctuations of the environment, modifications of the hydro-climatic regime of the estuary associated with the climate change) and an anthropological forcing (drawing up by the circuits of the CNPE - Nuclear center of electricity production of Blayais-, targeted fishing, pollutions etc.). In this context and on the basis of a monthly survey in place since 1979 and completed in 2007, this study shows that this population is strongly influenced by environmental and anthropological changes. Important spatio-temporal variations in the shrimp abundance are highlighted at different temporal, spatial and biological scales. A long-term analysis underlines strong regular interannual oscillations (5/10-year period) partially linked with environmental factors and recruitment variations. A decrease in the global abundance and a movement of this population towards the upstream part of the estuary are also displayed. In this study, the decline is attributed to strong variations and numerous modifications in the life history traits of the species - reproduction, - growth, - mortality. The presence of exoskeletal deformities, alternatively studied via a rearing of several months, reveals strong negative impacts at the individual scale (mortality). Furthermore, simulations based on a population-matrix model, developed during the study, show the synergy of the anthropological pressure by capture (CNPE, fishing) and the environmental forcing, as well as the importance of movement processes in the population dynamics. This study finally demonstrates the interest of this population, and more widely of the estuarine shrimp populations, in the understanding of the functioning and the diagnosis of the estuarine ecosystem state. New original metrics are proposed, opening the way towards new indicators.
-Palaemon longirostris
-Gironde estuary
-population dynamic
-global change
-shrimps
-life history traits
-matrix model
-exoskeletal deformities
Source: http://www.theses.fr/2009BOR13884/document
THESE PRESENTEE A L’UNIVERSITE BORDEAUX I
ECOLE DOCTORALE SCIENCES ET ENVIRONNEMENT
par
Mélanie Béguer
pour obtenir le grade de Docteur
spécialité Ecologie Aquatique
RÉPONSES D’UNE POPULATION AUX FORÇAGES ENVIRONNEMTENAUX
ET ANTHROPIQUES : LE SUIVI À LONG TERME DE LA TCTREVE E
PALAEMON LONGIROSTRIS
DE L’ESTUAIRE DE LA GIRONDE (1979-2007)
Soutenue publiquement le 27 novembre 2009
Devant le jury composé de :
Rapporteurs : B. SAINTE-MARIE, Directeur de recherche, Pêches et Océans, Canada
P. VENDEVILLE, Directeur de recherche, IfremerS,è te
Examinateurs : G. BACHELET, Directeur de recherche, CNRS, Université Bordeaux I, Arcachon
F. TRAVADE, Ingénieur de recherche, EDF, Chatou
P. CHARDY, Professeur, Université Bordeaux I
Directeur de Thèse : P. BOËT, Directeur de recherceh,C emagref, Bordeaux
Co-directeur : M. GIRARDIN, Ingénieur d’études, Cemagref, Bordeaux
N° d’ordre : 3884
1
P. longirostris par O.Pon
2 Avant Propos
Cette thèse a pu être réalisée grâce au soutien financier de l’ANRT par le dispositif CIFRE entre le Cemagref
et le CNPE du Blayais, grâce également au soutien financier du Conseil régional d’Aquitaine, et grâce à la
participation de nombreuses personnes aux échantillonnages (Jean‐François Bigot, Bernard Ballion,
Aymeric Guibert, Romaric Le Barh, Michel Girardin, Christine Gazeau, Mario Lepage, Philippe Jatteau,
Gérard Castelnaud, etc.)
3 Remerciements
Une thèse n’est pas le fruit d’une seule personne : c’est l’aboutissement du travail de nombreuses
personnes, durant de nombreuses années, synthétisé et mis en valeur par l’auteur. Le déroulement d’une
thèse dépend également du soutien et des moments d’évasion procurés par toutes les personnes de mon
entourage. C’est pourquoi la page des remerciements est une tradition à laquelle je ne vais pas faillir. Je
garde un excellent souvenir de ces quelques années de thèse au Cemagref, et j’ai donc beaucoup de
personnes à remercier.
Je tiens donc à remercier Paul Gonthier, chef de l’unité Ecosystèmes estuariens et Poissons Migrateurs
amphihalins du Cemagref. Merci de m’avoir accueilli et merci en particulier pour la partie administrative,
compliquée mais nécessaire pour le financement inhabituel de cette thèse pour l’unité, en convention
Cifre. Ce ne fût pas une tâche aisée et je sais que vous y avez passé beaucoup de temps. Merci donc pour
cela mais aussi pour votre sympathie au quotidien.
Je remercie également mon chef du côté du CNPE du Blayais, Didier Lundy, pour avoir participé à
l’initiation de ce travail et pour son accueil au CNPE. J’en profite également pour remercier mes collègues
du CNPE, en particulier Karine Le Lous, mais aussi Jean‐Louis Mazoyer et Isabelle Mestivier pour leur
accueil et aide lors des prélèvements. On en a trié des crevettes sortant des tuyaux ! Je garde un très bon
souvenir de ces campagnes d’échantillonnages, aussi bien dans le froid que sous un soleil de plomb !
Pour continuer avec les remerciements des personnes m’ayant aidé sur le terrain, je remercie vivement
Aymeric Guibert (« shrimp assistant ») et Romaric Le Barh, pour leur bonne humeur et leur
professionnalisme lors des sorties Esturial et CNPE. Votre aide était précieuse et vous avez fait de ces
échantillonnages des moments fort sympathiques et agréables.
Merci également à Jean‐François Bigot, le capitaine de l’Esturial et à son fidèle matelot/cuistot Bernard
Ballion, sans qui les échantillonnages n’auraient pas été possibles. Merci également à Gérard Castelnaud,
Philippe Jatteau et Michel Girardin, qui m’ont accompagné durant mon année d’échantillonnage sur
l’estuaire et qui vont régulièrement sur le terrain recueillir les précieuses données qui constituent ensuite
les longues séries que nous exploitons.
Je remercie vivement tous les membres de mon comité de thèse, qui se sont déplacés, de très loin pour
certains, afin d’assister à la présentation de mes avancées et donner leur avis : Guy Bachelet, Philippe
Vendeville (merci aussi pour votre avis de soutenance), François Travade, Alexandra Cartaxana et Pierre
Noël.
Merci à Bernard Sainte‐Marie pour son avis de soutenance, sa lecture détaillée de mon manuscrit et ses
remarques très intéressantes, merci d’être venu de si loin pour ma soutenance. Merci également à Pierre
Chardy, qui a accepté de venir présider mon jury de soutenance. Merci à François Travade, pour l’aide sur
l’étude mortalité due au CNPE, et pour m’avoir accueilli à Chatou pour la recherche des données brutes
stockées aux archives, et merci pour sa sympathie.
4 Un grand merci bien sûr à mes deux encadrants de thèse, Philippe Boët et Michel Girardin, qui m’ont fait
confiance dès le début et tout au long de mes travaux, merci aussi pour votre disponibilité et réactivité.
Un merci particulier à Patrick Lambert, pour son aide indispensable lors de la modélisation, pour sa
formidable
