Sujet thèse ED 227 Chapuis

Abada

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• Publié par: Niphar
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• Langue: Français

Extrait

Appel à propositions de sujets de thèse pour l’obtention d’un contrat doctoral

à soumettre au

Conseil de l’Ecole doctorale 227 « Sciences de la Nature et de l’Homme »

Intitulé du sujet

Dynamique des communautés végétales d’îles de l’archipel de Kerguelen face au changement

climatique et aux invasions biologiques

Intitulé de l’équipe d’accueil

Conservation des espèces, restauration et suivi des populations

Départ. EGB, MNHN

Numéro, intitulé

in extenso

et nom du directeur de l’unité de recherche

UMR 7204 MNHN-CNRS-P6,

Directeur Denis COUVET

Encadrement

HDR directeur de thèse, rattaché à l’ED 227. (Rappel : le sujet sera refusé si l’HDR encadre

déjà 2,5 thèses à la date d’examen du sujet.)

Jean-Louis CHAPUIS,

MC (HDR, 1997)

Co-directeur éventuel

Co-encadrant(s) éventuel(s) non HDR

Marc LEBOUVIER, UMR 6553 ECOBIO, Univ. Rennes 1

Audrey MURATET, UMR 7204 CERSP, MNHN

Sujet (problématique, objectifs, déroulement du travail)

Les îles subantarctiques, aux communautés peu diversifiées, sensibles aux perturbations,

constituent des sites modèles pour analyser les conséquences des invasions biologiques dans

le fonctionnement des écosystèmes. Depuis le milieu des années 1990, une autre perturbation

majeure intervient sur la dynamique des communautés, le changement climatique (élévation

de la T°, sécheresses estivales très marquées et de plus en plus fréquentes).

Objectifs : Réponses des communautés végétales confrontées à des perturbations spatio-

temporelles différentes : introduction-élimination d’un herbivore, changement de la

pluviométrie-température, installation-explosion démographique de plantes introduites.

Travaux réalisés sur 3 îles en voie de restauration écologique après éradication du lapin (en

1992, 1994 et 1997) et sur 2 îles témoins, l'une avec lapins et l'autre sans lapin.

Méthodes : analyse transversale de l’évolution des communautés végétales : données acquises

sur 150 sites répartis sur 5 îles, avec la même méthode (points-contacts) et sans interruption

sur 15 à 20 ans selon les îles ; utilisation d’images satellitaires (extrapolation aux autres îles).

Etude sur le long terme :

- des mécanismes de dispersion, de colonisation des espèces végétales,

- des conséquences du changement climatique et des invasions biologiques sur la dynamique

des communautés,

- de la résilience des communautés végétales après élimination du lapin,

- des tendances d’évolution de la végétation

Contexte national et international

(importance du sujet pour l’avancement des

connaissances, équipes éventuellement en compétition, situation nationale et internationale de

l’unité sur cette problématique, caractère innovant)

Le sujet proposé s’insère dans le programme "Changements climatiques, actions anthropiques

et biodiversité des écosystèmes terrestres subantarctiques (Institut Polaire Français, n° 136

1984-2013) et dans la Zone Atelier CNRS (INEE) de "Recherches sur l’environnement

antarctique".

Pas d'équipe en compétition (l'équipe travaillant sur la végétation à Kerguelen est regroupée

au sein du programme).

Situation internationale : les îles Kerguelen sont parmi les îles subantarctiques celles qui sont

les plus affectées par les invasions biologiques et le changement climatique, différents

collaborateurs étrangers participants à nos recherches, notamment dans le cadre du

programme EBA- Evolution and Biodiversity in the Antarctic- http://www.eba.aq/ du SCAR.

Possibilité de réorientation

, notamment si le sujet comporte une grosse part de risque ou

d’imprévu (caractère très innovant, dépendance à l’obtention de matériels particuliers,…)

Le risque et les imprévus sont minimes, une part très importante des données étant acquise.

Celles récoltées en 2011, 2012, voire 2013 permettront de compléter certains aspects du projet

(tendances d'évolution de la végétation dans l'archipel).

Faisabilité en trois ans, échéancier

. (Rappels. Le doctorant est un collaborateur salarié, en

apprentissage de la recherche par la recherche ; il intègre une équipe pour la durée de son

contrat et seulement celle-ci. Il doit, à la fois, recevoir une formation et avoir une autonomie

favorisant créativité, inventivité et innovation. Aucune autre mission que celles qui sont

prévues dans son contrat et dans une éventuelle mission doctorale complémentaire ne peut lui

être confiée. Une quatrième inscription reste possible mais est dérogatoire. Il convient alors de

prendre contact avec la direction de l’ED au plus tard vers le milieu de la troisième année. S’il

s’agit d’un simple délai pour soutenance, cette dernière doit s’effectuer avant le premier

janvier de la quatrième année, sinon, la quatrième inscription est conditionnée à l’existence

d’un financement.)

Au cours des 3 années de la thèse, l’étudiant(e) aura la possibilité d’effectuer au moins un

séjour de 2 à 3 mois sur le terrain, une campagne d’été étant acceptée par l’IPEV en janvier-

février-mars 2011. Une 2

nde

campagne d'été est envisagée pour 2012.

Il (elle) sera aidé(e) sur le terrain par 2 volontaires à l’aide civile attribués chaque année par

l’IPEV au programme 136 (classé A+ par le CS). Au laboratoire, il (elle) bénéficiera de

moyens de fonctionnement attribués par le CNRS (Zone atelier) et de l'appui d'autres

collaborateurs dont M. Robin (Pr, géographe, UMR 6554, Univ. Nantes : évolution de la

végétation d'après images satellitaires).

Même si le sujet paraît ambitieux, il est réalisable en 3 années.

Publications du (des) encadrant(s)

. Indiquer les références, comprenant le titre

in extenso

,

d’un maximum de trois publications récentes en rapport avec le sujet pour chacune des

personnes indiquées au § Encadrement

Jean-Louis CHAPUIS

CHAPUIS J.-L., HENNION F., LE ROUX V. & LE CUZIAT J. (2000). Growth and

reproduction of the endemic Cruciferous species Pringlea antiscorbutica in Kerguelen Islands.

Polar Biology, 23: 196-204.

COURCHAMP F., CHAPUIS J.-L. & PASCAL M. (2003). Mammals invaders on islands :

impact, control and control impact. Biological Reviews, 78: 247-283.

SANTIN-JANIN H., GAREL M., CHAPUIS J.-L. & PONTIER D. (2009). Toward a

generalized non linear approach to relate NDVI and field vegetation data. Polar Biology, 32:

861-871.

Marc LEBOUVIER

CHAPUIS J.-L., FRENOT Y. & LEBOUVIER M. (2002). Une gamme d’îles de référence, un

atout majeur pour l’évaluation de programmes de restauration dans l’archiplel de Kerguelen.

Revue d’Ecologie (Terre Vie), Supl. 9 : 121-130.

CHAPUIS J.-L., FRENOT Y. & LEBOUVIER M. (2004). Recovery of native plant

communities after eradication of rabbits from the subantarctic Kerguelen islands, and

influence of climate change. Biological Conservation, 117: 167-179.

LEBOUVIER M., CHAPUIS J-L., GLOAGUEN J.-C. & FRENOT Y. (2002). Résilience des

communautés insulaires subantarctiques: facteurs influençant la vitesse de restauration

écologique après éradication de mammifères introduits. Revue d’Ecologie (Terre Vie), Supl.

9: 189-198

Audrey MURATET

MAUREL N., SALMON S., PONGE J.-F., MACHON N., MORET J. & MURATET A.

(2010). Does the invasive species, Reynoutria japonica, have an impact on soil and flora in

urban wastelands? Biological invasions (in press)

MURATET A., PORCHER E., ABADIE J.-C., PONCET L., MORET J. & ROBERT A.

(2009).

Use of extensive habitat inventories in biodiversity studies. Biodiversity and

Conservation 18: 3115-3125

MURATET A., PORCHER E., DEVICTOR V., ARNAL G., MORET J., WRIGHT S. &

MACHON N. (2008). Evaluation of floristic diversity in urban areas as a basis for habitat

management. Applied Vegetation Science, 11: 451-460.

Profil du candidat recherché

Le (la) candidat(e) devra disposer de solides connaissances théoriques en dynamique des

communautés, en invasion biologique, maîtriser les outils statistiques ("R"), et accepter

d'effectuer des missions de longue durée dans les îles Kerguelen.

Avis du directeur d’unité

.

Sujet très sérieux et prometteur qui répond bien au projet de l'unité. Excellent modèle,

données déjà en partie récoltées, collaborations solides, autant d'atouts pour que la thèse soit

une réussite. Avis très favorable.