Systematics, phylogeny and biogeography of Cousinia (Asteraceae) [Elektronische Ressource] / Iraj Mehregan

Iraj Mehregan

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• Publié par: johannes_gutenberg-universitat_mainz
• Publié le: 01 janvier 2008
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Extrait

 
 
SYSTEMATICS, PHYLOGENY AND BIOGEOGRAPHY 
OF COUSINIA (ASTERACEAE) 
 
 
 
 
 
Dissertation 
Zur Erlangung des Grades 
Doktor der Naturwissenschaften 
 
 
 
 
 
 
 
 
am Fachbereich Biologie 
der Johannes Gutenberg‐Universität Mainz 
 
 
 
 
 
 
Iraj Mehregan 
geb. in Gachsaran, Iran 
 
 
 
 
 
Mainz, 2008 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Dekan:  
1. Berichterstatter:  
2.   
Tag der mündlichen Prüfung: 10. 07. 2008 
 
II  
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Kapitel  2  (chapter  2)  dieser  Arbeit  ist  im  Druck  bei  “Taxon“:  López‐Vinyallonga,  S., 
Mehregan, I.*, Garcia‐Jacas, N., Tscherneva, O., Susanna, A. & Kadereit, J. W.*: Phylogeny 
and evolution of the Arctium‐Cousinia complex (Compositae, Cardueae‐Carduinae).  
* Von den Autoren Mehregan, I und Kadereit, J. W.: Die Generation der ITS‐Sequenzen von 
113 Taxa (Appendix 1), die Bayesische Analyse der ITS‐ und rpS4‐trnT‐trnL‐Sequenzen, das 
Rechnen der Molekularen Uhr sowie der Partition‐Hemogenity Test und die Analyse des 
Cousinioid Clade wurde in Rahmen dieser Dissertation ausgeführt. Das Manuskript wurde 
in Zusammenarbeit aller Autoren geschrieben. 
 
Kapitel 3 (chapter 3) diese Arbeit wird bei “Willdenowia” eingereicht: Mehregan, I. & 
Kadereit, J. W.: The role of hybridization in the evolution of Cousinia s.s. (Asteraceae). 
 
Kapitel 4 (chapter 4) dieser Arbeit ist im Druck bei “Willdenowia“: Mehregan, I. & Kadereit, 
J. W.: Taxonomic revision of Cousinia sect. Cynaroideae. 
III Contents 
SUMMARY............................................................................................................................................................................1 
ZUSAMMENFASSUNG.....................................................................................................................................................2 
CHAPTER 1...........................................................................................................................................................................3 
GENERAL INTRODUCTION............................................................................................................................................3 
1.1 COUSINIA WITHIN ASTERACEAE........................................................................................................................3 
1.2 TAXONOMY OF COUSINIA....................................................................................................................................5 
1.3 CENTRES OF BIODIVERSITY...............6 
1.4 HYBRIDIZATION......................................................................................................................................................7 
1.5 SPECIES NUMBERS IN COUSINIA.........................................................................................................................8 
1.6 AIMS OF THIS WORK...............................................................................................................................................8 
1.7 ACKNOWLEDGEMENTS........................................................................................................................................9 
1.8 REFERENCES......................................10 
CHAPTER 2.........................................................................................................................................................................13 
PHYLOGENY AND EVOLUTION OF THE ARCTIUM‐COUSINIA COMPLEX (COMPOSITAE, 
CARDUEAE‐CARDUINAE).............................................................................................................................................13 
2.1 ABSTRACT................................................................................................................................................................13 
2.2 INTRODUCTION.....................................................................................................................................................14 
2.3 MATERIAL AND METHODS................................................................................................................................17 
2.3.1 Plant material..............................17 
2.3.2 DNA extraction, amplification and sequencing..................................................................................................17 
2.3.3 Analyses.......................................18 
2.4 RESULTS............................................20 
2.4.1 Partition homogeneity test..................................................................................................................................20 
2.4.2 Phylogenetic analysis...................20 
2.4.3 Molecular Clock Analysis............27 
2.5 DISCUSSION............................................................................................................................................................29 
2.5.1 The Arctium‐Cousinia complex..29 
2.5.2 The Arctioid clade...............................................................................................................................................30 
2.5.3 The Cousinioid clade.................32 
2.5.4 Cousinia tenella...................................................................................................................................................36 
2.6 ACKNOWLEDGEMENTS......................................................................................................................................37 
2.7 LITERATURE CITED.....................37 
2.8 APPENDIX 1.............................................................................................................................................................42 
2.9 APPENDIX 246 
CHAPTER 3...........................................48 
THE ROLE OF HYBRIDIZATION IN THE EVOLUTION OF COUSINIA S.S......................................................48 
3.1 ABSTRACT................................................................................................................................................................48 
3.2 INTRODUCTION.....................................................................................................................................................49 
3.3 MATERIAL AND METHODS.................................................................................................................................50 
3.4 RESULTS............................................50 
3.5 DISCUSSION.............................................................................................................................................................54 
3.6 ACKNOWLEDGEMENTS......................................................................................................................................60 
3.7 REFERENCES......................................60 
2.8 APPENDIX 1.............................................................................................................................................................62 
CHAPTER 4...........................................68 
TA