Le Monde invisible du vivant

Fabrice Hyber, Pascale Cossart

Description

Voici un livre qui vous plongera d’une façon inédite dans le monde incroyable des microbes. La scientifique Pascale Cossart, internationalement reconnue pour ses travaux en microbiologie, pose 73 questions et y répond de façon très simple, à la portée de tous. Originalité : chaque réponse est illustrée par les aquarelles et dessins particulièrement évocateurs et colorés de l’artiste Fabrice Hyber. Les auteurs invitent à découvrir les différences fondamentales entre bactéries, virus, protozoaires… D’une façon légère, parfois ludique, mais très précise, ils expliquent les rôles que jouent les micro-organismes dans notre alimentation – la fabrication du pain, par exemple –, dans l’environnement… Le blanchissement des coraux est évoqué. Ils montrent aussi que les micro-organismes sont présents partout et forment de grandes assemblées, des « microbiotes », dans les océans, les sols, sur les racines des plantes et dans notre organisme, et comment ceux-ci sont indispensables à la vie et protègent des agents pathogènes. Ce livre nous fait découvrir qu’un petit nombre seulement de ces micro-organismes provoque des maladies et comment le système immunitaire les combat. Cet ouvrage est un tour de force, un vaste voyage dans le monde de l’infiniment petit qui vous fera enfin comprendre pourquoi les microbes sont indispensables à toute forme de vie. Pascale Cossart, professeur à l’Institut Pasteur, titulaire de nombreux prix internationaux, est secrétaire perpétuel de l’Académie des sciences. Ses travaux ont porté sur l’élucidation des stratégies des bactéries pathogènes intracellulaires – notamment Listeria – et leurs mécanismes de régulations, en particulier par les ARN. Fabrice Hyber est né en Vendée en 1961. Plus jeune artiste ayant gagné le Lion d’or à la Biennale de Venise en 1997, il expose dans le monde entier : Tokyo, New York, San Francisco, Shanghai, Tel-Aviv, Zurich, Guadalajara, Abou Dabi, Moscou… Il s’intéresse aux rapports entre art et science et toutes les formes du vivant, en particulier les arbres. 

Sujets

• Science
• Sciences et techniques
• Life Sciences
• Biological Diversity

Informations

• Publié par: Odile Jacob
• Date de parution: 28 avril 2021
• Nombre de lectures: 2
• EAN13: 9782738155207
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 4 Mo

Extrait

L e monde
in visibl e
du viv ant
Bactér ies, ar chées,
le vur es / champignons,
micr o algue s,
pr o t o z oaire s e t…
virus
Pas cal e Coss art Fabrice Hyber
 

T ext es de Pascal e Cossart
Dessins de Fabrice Hyber
Maquett e de Gilles Beaujar d
© O J  ,   2021
15, rue Souot, 75005 Paris
 .odilejacob . fr
ISBN : 978-2- 738 1-5520- 7
Le Code de la pr opriét é intellec tuelle n ’autoris ant, aux termes de l’ article L. 122-5, 2° et 3°a, d’une part, que les « copies
ou repr oductions s trict ement r éservées à l’usage priv é du copist e et non destinées à une utilisa tion collec tive » et,
d’ autre part, que les analy ses et l es courtes cita tions dans un but d’ exempl e et d’illus tration, « tout e repr ésentation
ou repr oduction int égrale ou partielle f aite s ans le consent ement de l’ aut eur ou de ses ayant s droit ou ay ants cause
est illicite » (art. L. 122-4). Cett e repr ésentation ou r eproduction, par quelque pr océdé que ce soit, cons tituerait donc
une contre f açon sanctionnée par les articles L. 335-2 et suivant s du Code de la propriét é intell ectuelle.
 

À Sophie et Olivier
 
 

A vant -propos
de Pas cale Coss art
p . 1 1
A vant -propos
de Fabrice Hyber
p . 1 3
I.
L es microbes
dans l e monde
du vivant
p . 1 7
II.
Micr o-organismes
unicellulair es (bact éries,
ar chées, pr o tist es –
champignons/l evur es,
a lgu e s et p rotozoa i re s) ,
virus e t micr obiot es
p . 3 5
III.
Micr obes
e t alimenta tion
p . 7 5
I V.
Micr obes et envir onnement
p . 9 1
V.
Pathogènes e t sant é
p . 105
Anne xes
p . 1 7 8
Inde x
p . 185
R emerciement s
p . 1 8 7
Sommai r e
 
 
 
 

11
Cet ouvrage est né de la l ectur e d’ un commentair e écrit
dans l’une des publica tions int ernes de l’Institut Pas teur ,
et concernant l’ article que v enait de publier Olivier Sch wartz
dans la re vue Science en 2019 «IFITM pr ot eins inhibit placental
s yncytio tr ophoblast f ormation and pr omot e f etal demise» . Il était
illustr é par un dessin de Fabrice Hyber qui me plut particulièr ement.
Je contac tai Fabrice qui vint r apidement me voir à l’ Académie.
En une heure, Je lui v endais l es bac téries, leurs multipl es f acéties,
je lui parlais de microbio tes, du microbio te int estinal,
des microbio tes racinair es, je lui parlais de la vie sociale
des bact éries, de leurs petit es conv ersa tions privées, de leurs vies
en concubinage a v ec d’ autr es organismes. Son enthousiasme
m ’ enthousiasma. Il était d’ accor d pour f air e un livre gr and public
av ec moi… et j’ étais d’ accor d aussi.
 rès vit e, nous prenons r ende z -v ous av ec Odile Jacob qui,
elle aussi, s ’ enthousiasma. C ’ était le 30 jan vier 2020 . Le c orona virus
était en route depuis Wuhan. Le 17 mars commence le pr emier
confinement e t, très vit e, je me rends c ompt e que je ne dois pas
res treindre mon ouvr age aux bac téries mais qu ’il f aut aussi parl er
de virus, de parasit es, et c. Ce livre port e sur l e monde in visible
du viv ant. Il décrit l’immense biodiv ersité des micr o-or ganismes
et des virus. Il porte aussi sur la f açon dont on les utilise, les dif ér ents
mécanismes de lutte c ontr e ceux qui sont pa thogènes ou nocifs…
On m ’a vait dit que La Nouvel le Microbiol ogie que j’ ai publié
en 2016 n ’ était pas un livr e grand public , contrair ement à ce que
j’ avais espér é ! Cett e fois, j’ espère que ce t ouvrage sera c ompris
de tous, car je l’ ai fait lire e t relir e par des non-scientifiques
que je remer cie très viv ement ! C ’ est surtout Fabrice qui m ’ a posé
le plus de ques tions ! Merci à lui !
Pascal e C .
A v ant - pr opo s
de Pa s cale Cos s ar t
 
 

13
C ’ était au t out début de l’ année 2020 , en
janvier , Pascal e Cossart m ’ av ait donné r ende z -
vous à l’ Académie des s ciences. J’y cr oisai
Sophie Ler oi, chef de cabine t des secr étair es
perpétuel s, que j’a vais déjà renc ontrée à
l’Institut Pasteur en 2010 : je n ’ étais pas en t err e
inconnue…
Pascal e Cossart me pr oposa de
l’ accompagner dans la réalis ation d’ un livr e sur
la microbiol ogie. J’allais dir e oui, mais je voulais
en sa voir plus. Elle me parlait de micr obes, puis
me dit qu ’ elle n ’ aimait pas ce mot, elle me parlait
de vul garisation, mais surtout évit er l e vul gair e,
puis de bact éries sympa thiques e t de virus
«non viv ant s» : ces doutes m ’ enchantaient.
Bingo ! J’ ai eu envie de me plonger dans
ce monde e t d’ apprendr e en même t emps.
Puis une pandémie s ’ en mêla. Après un
premier confinement, en juin le pr emier t e xte
arriva, puis une premièr e maque tte puis deux,
puis trois, puis quatr e et cinq maquettes.
Soucieux de ne pas fair e d’ erreurs,
je demandais l es corr ections à Pas cal e
s ys tématiquement ! L ’ échelle, les formes,
les inter actions, cinq cents à six cent s dessins
plus tard, une v ersion dé finitiv e vit l e jour …
J’ ai fait une bell e randonnée en Microbie.
Fabrice H  .
A v ant - pr opo s
de F abrice Hy ber
 
 
 
 

I.
Les m i c r o b es
d an s l e mo nd e
du vi v an t
 

18
1  C ’EST QUOI UN MICROBE  ?
Le m ot microbe veut dire pe tit
être viv ant (du gr ec μιχροσ
«petit » et βιοσ «vie» ), invisibl e à l’ œil nu mais
visible a v ec un micros cope.
Il y a plusieurs catégories de micr obes :
les bac t éries, les archées, les pro tis tes
(le vur es/ champignons , algues et
protozo ai re s ). Ces microbes se nourrissent,
grandissent et se divisent pour produir e une
descendance.
Pour beaucoup , le mo t « microbe » é voque
un agent inf ec tieux responsabl e d’ une
maladie. C ’ est pour cett e raison qu ’ on met les
virus dans cett e cat égorie. Mais les virus ne
sont pas des ê tr es viv ants. Ils ne se
nourrissent pas e t ne grandissent pas
Ils ne pr oduisent une descendance que
s ’il s sont entr és dans une cellule (v oir 3).
Exac tement comme l e mot « microbe »,
le m ot micr o-organisme décrit aussi un
organisme viv ant très pe tit, mais il n ’ a pas
la connotation néga tive du mo t micr obe.
Les virus ne sont pas des
micro-or ganismes !
Comme on le v erra dans ce t ouvr age, il y a beauc oup
de micro-or ganismes qui ne donnent pas de maladies et sont
au contrair e bénéfiques.
 
 

20
2  QUI A INVENTÉ LE MO T MICROBE ?
ET LE MO T MICROBIE ?
Microbie es t le mo t qu ’ a utilisé Émil e Roux,
le c ollaborat eur de Pas teur , pour nommer
le cours qu ’il organisa dès 1888 : « Cours
de microbie pr atique » . À l’Institut Pas t eur ,
à l’ étage des labora toir es d’ enseignement,
il y av ait une sall e d’ études de « Microbie
fondamental e » et une sall e d’ études de
« Micr obie appliquée » . Ce terme micr obie
n ’ est plus utilisé.
Il y a plus de 350 ans, en 1656,
Antoni Van L eeuwenhoek, à Del
aux Pay s-Bas, utilisait un micros cope pour
év aluer la qualit é des tissus qu’il vendait.
Il l’ utilisait aussi pour regar der d’ autres
choses. Un jour , dans l’ eau qu’il a v ait pr éle vée
de sa mar e, il vit de tr ès pe tits obje ts bouger
et l eur donna le nom d’ animalcules . Il
s ’ agissait de bac téries et de protozoa i res …
Le m ot microbe n ’ a ét é inv ent é que deux
siècles plus tar d, à la fin du 
e
siècle
(en 1878) par le chirur gien militair e français
Charles-Emmanuel Sédill o t qui vivait à la
même époque que Louis Pas t eur et Robert
K och, les deux grands s av ants qui é taient en
train de montr er que beaucoup de maladies
étaient dues à ce qu ’ils appelaient,
indistinc t ement , petits or ganismes vivant s,
corpus cules, vibrions, virus , levu res ,
parasit es , germes, bac téridies… C’ est à cause
de ce flou dans la nomencla ture que l e mot
« micr obe » a été tr ès facil ement adopt é et
aussi qu’il es t généralement associé à une
maladie.
A vec Past eur , K och et l eurs discipl es, la fin
du 
e
siècle a vu la naissance de la
microbiol ogie qui es t maint enant partagée
en quatre grands domaines la bac tériol ogie
– l’ étude des bac t éries – , la vir ologie – l’ étude
des virus – , la parasitol ogie – l’ étude des
parasit es – et la my col ogie – l’ étude des
le vur es et des champignons .
 
 

22
Les virus ne sont pas des
organismes vivant s. Leur taill e
ne change pas. Ils peuv ent se multiplier , mais
ne le f ont que s ’ils sont entrés dans un
organisme viv ant. Les virus ne sont pas
stric t o sensu des microbes. Néanmoins
dans le langage courant (nous le
regr e ttons !), microbe = agent infec tieux.
Les virus sont ainsi considér és comme
appartenant à la grande f amille des micr obes
qui pro voquent des maladies, comme
certaines bact éries, certains champignons
et certains prot o zoair es .
3  LES VIRUS SONT ILS DES MICR OBES ?
SONT ILS DES MICRO ORGANISMES
Les virus ne sont pas des micr o-organismes.
 

Les virus infec t ent t outes les ca tégories d’ espèces viv antes, y c ompris les bact éries.
23
C ’ est ex act : tous les micr obes
ne sont pas des or ganismes
vivant s car , comme cela a ét é dit en 2 et en 3,
l’habitude a placé dans la cat égorie
« microbe » non seulement des micr o-
organismes, c ’ est -à-dire de petit s
organismes vivant s, mais aussi les virus !
Les virus sont considér és comme des
« microbes » , car il s sont pe tits e t donnent
des maladies mais, encore une f ois, ce ne
sont pas des or ganismes vivant s. Ce sont
des agents inf ec tieux « nocifs » ; on dit qu ’il s
sont pa thogènes. Ils ne peuvent vivre e t agir
que s ’il s sont dans un autr e organisme vivant.
Ils entr ent dans les cellul es et utilisent l es
composant s de cell es-ci pour se multiplier .
Les virus sont, sauf e x ception, beaucoup plus
petit s que l es bact éries, qui sont l es plus
petit s organismes vivant s.
Les bac téries sont des êtr es unicellulair es.
Les bac t éries n ’ ont qu ’une seul e cellul e .
Les levu res qui ont à peu pr ès la taille des
bact éries sont aus