Le virus du Nil occidental
264 pages
Français

Le virus du Nil occidental

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Description

Depuis une trentaine d’années, on constate partout dans le monde une recrudescence des zoonoses, ces infections transmises entre les animaux et capables de contaminer des populations humaines de plus en plus nombreuses.

Dans ce contexte, que savons-nous du virus du Nil occidental(West Nile virus) ? Certains aiment à croire que Alexandre le Grand, élève d’Aristote,en serait mort à son retour à Babylone en 323 avant J.-C. après son péripleasiatique. De nos jours, ce virus, transmis par des moustiques, est devenu un vrai problème de santé publique sur le continent américain, notamment aux États-Unis depuis son apparition à New York en 1999. Quelle est la situation en France ? Des cas de fièvre West Nile ont-ils été identifiés ? Quels sont les systèmes de surveillance et les axes de recherches ?

En France, le virus West Nile a été décrit pour la première fois à l’occasion de la découverte de cas humains et d’épizooties équines dans les années 1960. Après presque quarante ans de silence apparent, le virus a réapparu dans le sud du pays (Camargue, Var, Pyrénées-Orientales) au début des années 2000.

Destiné aux spécialistes des zoonoses et aux chercheurs, ainsi qu’aux enseignants et aux étudiants, cet ouvrage fait l’état des lieux de nos connaissances sur ce virus, notamment en France. Il ouvre des pistes de réflexion et d’investigation sur de cette maladie. Organisé en neuf chapitres, il est construit à partir des contributions de scientifiques, intégrant des travaux de recherche en master et en thèse, et des acteurs qui étudient les différents aspects de l’éco-épidémiologie du virus West Nile.


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Date de parution 31 mai 2013
Nombre de lectures 8
EAN13 9782759219698
Licence : Tous droits réservés
Langue Français

Informations légales : prix de location à la page €. Cette information est donnée uniquement à titre indicatif conformément à la législation en vigueur.

Table des matières
Couverture Le virus du Nil occidental Préface Remerciements
Avant-propos
Chapitre 1 - Histoire et épidémiologie de la fièvre West Nile
Histoire d’un virus globe-trotter
Découverte d’un virus supposé peu pathogène Les cycles de transmission découverts en Égypte Un virus non pathogène ?
Du Caire au Cap, de l’Atlantique à l’océan Indien
Regain d’activité dans l’Ancien Monde
Le cas de la France : une histoire en deux temps
Le passage dans le Nouveau Monde
Les cycles de transmission
Les oiseaux, hôtes naturels du virus
Les moustiques, vecteurs du virus Le rôle éventuel des mammifères dans les cycles de transmission D’autres cycles de transmission du virus ?
La circulation du virus dans le monde
Chapitre 2 - Description du virus
Classification du virus
Parenté antigénique
Position phylogénétique au sein du genre Flavivirus
Protéines virales
Diversité génétique
Évolution de la classification des virus West Nile
Flavivirus proches du virus West Nile
Épidémiologie moléculaire
Polymorphisme génétique et pouvoir pathogène
Variabilité intra-isolats (quasi-espèces)
Variabilité génétique et perspectives prophylactiques et thérapeutiques Conclusion Chapitre 3 - Les oiseaux, hôtes naturels du virus
Implication des oiseaux dans la transmission
Notion de compétence d’hôte
Notion de capacité d’hôte Rôles des oiseaux dans l’épidémiologie de la fièvreWest Nile Rôle d’amplification du virus
Rôle de transport du virus
Rôle de réservoir du virus
Rôle de sentinelle
Rôle d’hôte sensible Conclusion Chapitre 4 - Les moustiques, vecteurs du virus Diversité des moustiques sur le littoral méditerranéen Description du littoral méditerranéen Diversité des moustiques et de leurs comportements Quelles sont les espèces vectrices du virus ?
Dis-moi qui tu piques, je te dirai ce que tu peux transmettre Une espèce trouvée infectée sur le terrain est-elle vectrice ? Comment évaluer le niveau de compétence d’une espèce ?
Les vecteurs du virus sur le littoral méditerranéen
Les espèces et leurs rôles probables
Les préférences trophiques, un paramètre clé de la transmission
Le rôle des moustiques dans le maintien du virus
Influence des changements du milieu dans la transmission Conclusion Chapitre 5 - Les mammifères, des hôtes accidentels du virus
La fièvreWest Nilechez l’homme
Signes cliniques
Facteurs de gravité de la maladie
Traitement et prophylaxie
La fièvreWest Nilechez le cheval
Traitement et prophylaxie
Pathogénie de l’encéphalite à virusWest Nile
Les autres mammifères
Hôtes potentiels
Autres modes de transmission : transmission non vectorielle Conclusion Chapitre 6 - Diagnostic de l’infection
Rappels taxinomiques
Diagnostic clinique
Diagnostic clinique et paraclinique chez l’homme
Diagnostic clinique chez le cheval
Cinétique des marqueurs virologiques au cours de l’infection
Diagnostic biologique
Méthodes de diagnostic
Prélèvements, transport
Diagnostic direct
Diagnostic indirect Discrimination des infections récentes et anciennes Domaines d’application du diagnostic de l’infection
Diagnostic différentiel des méningo-encéphalites virales
Surveillance des cas d’importation
Transfusion et transplantation
Conclusion – Perspectives
Chapitre 7 - La surveillance du virus en France
Organisation et méthodes de surveillance de l’infection
Volet humain Volet équin
Volet aviaire
Volet entomologique
Traitement des données et mesures prises
Surveillance passive de l’infection de 2000 à 2008
Surveillance clinique chez l’homme
Surveillance clinique chez le cheval Surveillance des mortalités d’oiseaux sauvages Surveillance active de l’infection de 2000 à 2008
Surveillance sérologique d’oiseaux sentinelles
Surveillance sérologique dans l’espèce équine
Surveillance entomologique
Bilan des actions de surveillance
Intérêts et limites de la surveillance mise en place en France
Expériences américaine et italienne
Axes d’amélioration des protocoles actuels
Besoins en recherche pour mieux identifier les sites de surveillance
Chapitre 8 - Facteurs de risques environnementaux pour la circulation du virus Analyse des épizooties passées en France par approches de modélisation statistique Épidémiologie descriptive : la Camargue en 2000 et le Var en 2003 Caractérisation de zones à circulation régulière du virus Intérêt de la télédétection et des systèmes d’information géographique dans l’étude et la modélisation du risque de circulation
Cartographie des milieux par télédétection : exemple en Camargue
Cartes des habitats et gîtes des vecteurs
Autres facteurs de risque
Facteurs climatiques
Facteurs liés aux populations d’oiseaux
Modifications environnementales, anthropogéniques et socio-économiques Conclusion Chapitre 9 - Apport de la modélisation à la compréhension de l’épidémiologie du virus
Cinétique des anticorps IgG chez les chevaux
Modélisation de l’épizootie de 2000 en Camargue : rôles des vecteurs
Réservoirs oiseaux
Hôtes accidentels
Risque d’amplification enzootique et de transmission aux hôtes accidentels
Résultats des simulations numériques
Environnement et interactions oiseaux/vecteurs Conclusion Conclusion générale
Sur le virus
Les cycles de transmission
Préférences trophiques des vecteurs Compétence d’hôte des oiseaux Facteurs environnementaux et météorologiques
D’autres pistes de recherche
La récurrence des épisodes La surveillance et les stratégies de lutte Au-delà des frontières de la France Annexe I Références bibliographiques
Liste des auteurs
Le virus du Nil occidental
Dominique J. Bicout, coord. Avec la collaboration de Thomas Balenghien ISSN : 1777-4624 — ISBN : 978-2-7592-2037-3 © éditions Quæ, 2013 RD 10 78026 Versailles Cedex
www.quae.com
Préface La fièvre du Nil occidental, ou fièvreWest Nile, est une infection virale qui fut identifiée dans la province West Nile en Ouganda en 1937 avec l’isolement du virus à partir du sang d’une patiente fébrile. Les études éco-épidemiologiques réalisées en Égypte en 1952-1954 ont permis de déterminer le cycle de transmission du virus avec implications des moustiques notamment lesCulexcomme vecteurs, des oiseaux comme hôtes amplificateurs et disséminateurs, et de l’homme et des chevaux comme des hôtes sensibles. Peu après furent décrits les premiers cas d’encéphalites chez l’homme en Israël démontrant l’importance de cette arbovirose considérée initialement comme mineure. Le virus fut ensuite retrouvé en Europe, en Afrique et en Asie. En France, la présence du virus s’est manifestée en Camargue en 1962-1963 affectant à la fois l’homme et les chevaux. Après une phase d’éclipse d’une trentaine d’années, plusieurs épidémies humaines ont été signalées en Europe du Sud et dans le bassin méditerranéen avec des cas mortels d’encéphalite survenant principalement chez les personnes âgées en Roumanie, Tunisie, Russie, Israël et des épizooties équines en Italie, Maroc, et France. Entre-temps, plusieurs études sérologiques ont montré que le virusWest Nileavait circulé de manière silencieuse dans plusieurs régions d’Europe.
D’autres faits marquants furent l’apparition d’une souche virale induisant une mortalité inhabituelle chez diverses espèces d’oiseaux dont des migrateurs en 1997-1998 en Israël et l’émergence d’un virus très similaire dans l’est des États-Unis en 1999 et sa propagation rapide à travers le continent américain. En Europe, une circulation accrue de différentes souches de virusWest Nileobservée depuis ces dernières années est avec un nombre de pays croissants rapportant des cas humains et/ou équins. En conséquence de ces foyers multiples, plusieurs programmes multidisciplinaires de surveillance et de recherche sur la fièvreWest Nileont été lancés en Europe, et plus particulièrement en France.
Cinquante ans après l’émergence du virusWest Nileen France, le présent ouvrage fait l’état des avancées des connaissances notamment sur le rôle des oiseaux migrateurs et résidents dans la dissémination et la persistance du virus, les interactions des vecteurs dans le cycle et le passage à l’homme ou aux chevaux, les caractéristiques phylogéniques des virus isolés et relations avec la pathogénie, l’organisation de la surveillanceWest Nile, et les approches en matière de modélisation afin d’identifier des marqueurs environnementaux prédictifs de risque de transmission. Néanmoins de nombreuses interrogations demeurent. L’ouvrage reflète l’approche multisectorielle indispensable pour mieux connaître le virusWest Nileafin de prévenir les infections chez l’homme et les équidés en optimisant la surveillance et avec des activités de contrôle adaptées.
Hervé Zeller
Coordinateur du programme Emerging and vector-borne diseases de l’European Centre for Disease Prevention and Control, anciennement responsable du Centre national de référence des arbovirus et fièvres hémorragiques
Remerciements
Nous souhaitons remercier tous les auteurs pour leur confiance et pour avoir répondu présent dès le début de ce projet jusqu’à sa réalisation finale. Merci pour la profondeur et la qualité scientifique et pédagogique de leurs contributions. Nous remercions la direction générale de l’Alimentation du ministère en charge de l’Agriculture, la direction générale de la Santé du ministère en charge de la Santé pour leur soutien financier dans la réalisation de cet ouvrage. Nous remercions aussi Renaud Lancelot, coordinateur du projet EDENext (EU grant FP7-261504 EDENext), qui a soutenu financièrement ce projet. Ce livre est catalogué par le Steering Committee d’EDENext avec le numéro EDENext118 (http://www.edenext.eu ). Le contenu de ce livre est de la seule responsabilité de ses auteurs et ne reflètent pas nécessairement l’opinion de la Commission européenne. Enfin, nos remerciements vont aussi à l’équipe éditoriale des éditions Quæ, en particulier Claire Jourdan-Ruf et Caroline Dandurand, pour leur aide et assistance pendant la réalisation de cet ouvrage.
Avant-propos
Que savons-nous de la fièvreWest Nile,ce n’est qu’il s’agit d’une maladie si transmise par des moustiques, devenue un problème majeur de santé publique aux États-Unis et sur le continent américain depuis son apparition à New York en 1999 ? Il paraîtrait même que Alexandre le Grand, élève d’Aristote, en serait mort à son retour à Babylone en 323 avant J.C. après son périple asiatique. Qu’en est-il de la France ? Y a-t-il des cas en France et comment cette maladie s’y exprime-t-elle ? Quel est l’état de la recherche et des systèmes de surveillance dans un contexte où les peurs et angoisses du passé sont réveillées par la crainte d’une pandémie de grippe aviaire ? Et en fait, de quoi s’agit-il ?
Toutes ces questions font écho à l’actualité dans un contexte où tous les spécialistes s’accordent à dire qu’on assiste depuis une vingtaine d’années, partout dans le monde, à une recrudescence des zoonoses, ces infections transmises chez les animaux et capables de contaminer des populations humaines de plus en plus nombreuses. Comme exemple d’arboviroses émergentes, la fièvre du Nil occidental (fièvreWest Nile) fait partie de ces zoonoses en pleine expansion qui conquiert de nouveaux territoires. En effet, depuis la première épidémie de fièvreWest Nile aux États-Unis en 1999, ce virus est devenu un problème de santé publique en Amérique du Nord. En Europe, le virusWest Nilea été identifié dans de nombreux pays tels que la France, l’Espagne, le Portugal, la Russie, la République tchèque, la Roumanie et l’Italie… Il a été ainsi noté une augmentation de la fréquence et de la gravité des épizooties de fièvreWest Nile depuis les années 1990.
Figure 0.1. Nombre de publications sur leWest Nile par année (courbe continue « Monde ») répertoriées dans Pubmed. L’histogramme « France » représente les publications mentionnant le mot « France » dans le titre et/ou résumé. Extraction mise à jour le 4 janvier 2013 de Pubmed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedet ), utilisant les phrases : « ("west nile"[Title] NOT "district" [Title]) AND "année/01/01"[EDAT] : "année/12/31"[EDAT] » pour le « Monde » et « ("west nile"[Title] NOT "district" [Title] AND "france"[Title/Abstract]) AND "année/01/01" [EDAT] : "année/12/31"[EDAT] » pour la « France », avec l’« année » allant de 1946 à 2012.
Comme l’illustre la figure 0.1, l’évolution de l’intérêt pour la fièvreWest Nile s’est faite par vagues successives d’intensité croissante. Depuis sa découverte en 1937 en