Abstract In this study we assigned two sorts of Type 11 markers on to horse chromosomes by fluorescent in situ hybridization technique. We identified the novel microsate I lite loci from a cosmid library and ten Not I linking sites from another cosmid library. The loci identified above were mapped by FISH using the cosmid clones as the probe. Resumen Hemos asignado dos clases de marcadores Tipo 11 sobre cromosomas de caballo mediante la técnica de hibridación in situ con fluorescencia (F1SH). Hemos identificado un nuevo loci para microsatél¡les a partir de una librería de cósmidos y diez lugares de ligamiento Not l de otra librería de cósmidos. Los foci identif icados fueron mapeados mediante FISH usando clanes cósmidos como sonda.