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Exercices avec le logiciel ´ EpreuveBiologie&Mod´elisation-Controˆle terminal - 2 juin 2010
M. Bailly-Bechet & S. Mousset
Dur´ee1h30(2×)nim54
Tousdocumentsautoris´es-´echangesstrictementinterdits.
Re´pondredirectementsurlafeuille
Nom : Pr´enom: Nume´rodelacarted´etudiant:
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Statistiques et
.
1.1 Introduction DansunarticledAvril2006[1],deschercheursam´ericainsontcherche´a`esti-merlimpactdelaprie`resurlesconse´quencesduneope´rationducœur.Plus pre´cisement,ilsontcherch´ea`savoirsi: ?s,apoireuner`esncdeciinneaure`eirpaLerat-op´postncesqeeuno´selcsseru op´erationdepontagecoronarien(op´erationconsistant`ad´evierleuxsan-guinautourdunezonemaladedelart`erecoronairepre`sducoeur). ?ccevariovased,edgeesedqudetutierLmalaurlet,poefaie´oprusnnoptir lui, a un effet sur sa convalescence. Lesauteurspr´ecisentbienqueleurbutestpurementscientique,etqueleur ´etudenapase´te´con¸cuepour,etnepourraitre´pondre`aungrandnombrede questionsreligieuses,tellesquelexistencedeDieu,lefaitqueDieur´epondeaux pri`eres,ouencorelefaitquelespri`eresdungroupereligieuxparticulierontle 1 mˆemeeetquecelledunautregroupe. Le´tudeestdivise´eentroisgroupesdetaillesrespectivesn1= 604,n2= 597, etn301=6nosrepselsetuoT.endsnacssertiogsroupesontsubilamemeˆ ope´rationducoeur.Laseuledie´rencere´sidedanslefaitquelespatientssavent ou pas que l’on prie pour eux, et que c’est effectivement le cas : ?Les gens du premier groupe ne savent pas que l’on prie pour eux, mais un groupedepri`ereaeectivementprie´pendant14jourspoureux,`apartir delaveilledeleurope´ration. 1 En anglais dans l’article original.
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?Les gens du groupe 2 ne savent pas si l’on prie pour eux, et aucun groupe depri`erenaprie´poureuxdurantl´etude. ?vente3saonpquelgsneeLorpudsgumeˆeougrdepepeireruoe,xumelt prie`requeceluidugroupe1a´egalementpri´epoureuxpendantlamˆeme dure´e. Ilesttoujourspossiblequedesprochesaientpri´epourdesmaladesdurant l´etude,maiscecie´tantimpossible`a´evaluereta priorisimilaire pour les 3 groupes,onlesn´egligedansle´tude. L´etudecomparelescons´equencespost-ope´ratoires,etnotammentlescom-plications,danslestroisgroupes,pourparvenir`auneconclusionstatistique.Le jeudedonne´espr´esent´eicia´ete´reconstruit`apartirdesparame`tresstatistiques del´etude,lesdonn´eesoriginellese´tantjalousementgarde´esparlesme´decins. Touslesr´esultatsstatistiquespr´esent´esdanscedocumentcorrespondentauplus pre`s`aceuxtrouv´eslorsdel´etudeoriginelle.
1.2 Questions Lejeudedonne´essepre´sentedelafac¸onsuivante: head(data) Age Complications Groupe 1 68 FALSE 3 2 56 FALSE 1 3 61 FALSE 3 4 67 TRUE 3 5 83 TRUE 3 6 64 TRUE 3
Lapremie`recolonnecontientlagedespatients,lacolonneComplicationscontientTRUEvenus,etlacolonneserpsdil`obesemstpop´-otareerionossrust Groupecontientlenume´rodugroupe. Quellecommandedonneraitlemˆemer´esultatquehead(), en utilisant les op´erateursdindexation[]? R´eponse:
Quelle commande permet de savoir groupe,etdonneler´esultatssuivant: 1 2 3 604 597 601 R´eponse:
combien d’individus contient chaque
Que calcule la commande : mean(data$Complications[data$Groupe == 1]) [1] 0.5215232
R´eponse:
LogicielRversion2.11.0(2010-04-22)exbm201006.rnwPage2/11Compile´le 2010-06-02 Maintenance : S. Penel, URL :http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pdf/exbm201006.pdf
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Unedespremi`ereside´es`ave´rierpourlesauteurs,pourve´rierqueleur e´tudeestcorrecte,estquelestroisgroupessontbiensimilairesendehorsdes caract´eristiquespr´esent´eesplushaut.Notamment,ilfautv´erierquelaˆgedes patientsdanslestroisgroupesestglobalementsimilaire.Onpeutlev´erieravec une figure comme celle-ci :
Quellecommandepermetdobtenirlegraphiquepre´c´edent? Re´ponse:
Sanseectuerdetest,quepouvez-vousconclure,graˆce`acettegure,quant `aladie´rencedaˆgemoyenentrelestroisgroupeschoisis? R´eponse:
Lesauteursr´ealisentunteststatistiquepoursavoirsilapri`ereelle-meˆme auneetsurlapparitiondecomplications.Pourcela,ilscomparentlafr´e-quence d’apparition des complications entre les groupes 1 et 2. Le test a pour hypothe`ses:
LogicielRversion2.11.0(2010-04-22)exbm201006.rnwPage3/11Compil´ele 2010-06-02 Maintenance : S. Penel, URL :http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pdf/exbm201006.pdf