N VUE DE LOBTENTION DU

Asma Zened

Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
? ?%N?VUE?DE?LOBTENTION?DU? ?%0$5035%&-6/*7&34*5?%&506-064& ? $ÏLIVRÏ?PAR? $ISCIPLINE?OU?SPÏCIALITÏ? ? ? ? ? 0RÏSENTÏE?ET?SOUTENUE?PAR?? ? ? ?4ITRE? ? ? ? ? ? ? ? ? %COLE?DOCTORALE? 5NITÏ?DE?RECHERCHE? $IRECTEURS ?DE?4HÒSE? 2APPORTEURS? LE? MEMBRES ?DU?JURY?: Institut National Polytechnique de Toulouse (INP Toulouse) Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingénieries (SEVAB) Particularités du microbiote et son activité lors de la déviation de la biohydrogénation ruminale de l'acide linoléique de la voie trans-11 à la voie trans-10 mardi 15 novembre 2011 Asma ZENED Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition Joël DORÉ Michel DOREAU Francis ENJALBERT Taha NAJAR UMR 1289 INRA-INP/ENSAT-ENVT 'TANDEM' Philippe SCHMIDELY Joël DORÉ Michel DOREAU Francis ENJALBERT Taha NAJAR

• magnifique expérience scientifique


• merci


• énorme merci aux futurs thésards


• déviation de la biohydrogénation ruminale de l'acide linoléique


• bout d'excellentes conditions matérielles

Sujets

• Glasser
• Dufresne
• Mariette
• Raymond
• Fernández
• Combes
• Sabiha
• Moose Cree First Nation

Informations

• Publié par: profil-feym-2012
• Publié le: 01 novembre 2011
• Nombre de lectures: 77
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 1 Mo

Extrait

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REMERCIEMENTS

Voici la fin d’une magnifique expérience scientifique et humaine très riche, pour laquelle
j’aimerai remercier toutes les personnes ayant contribué à l’aboutissement de ce projet.


Je remercie vivement Monsieur Joël DORÉ (Unité Ecologie Physiologie Système
Digestif, INRA) et Monsieur Michel DOREAU (Unité de Recherche sur les Herbivores,
INRA) pour m’avoir fait l’honneur d’être rapporteurs de cette thèse. Merci également à
Monsieur Philippe SCHMIDELY (Sciences de la Vie et Santé, AgroParicTech) pour avoir
accepté de participer à ce jury.

Je tiens à exprimer ma gratitude à mon directeur de thèse, Professeur Francis
ENJALBERT, pour son encadrement et ses qualités scientifiques et pédagogiques qui m’ont
permis de mieux structurer mes idées. Merci d’avoir assuré jusqu’au bout d’excellentes
conditions matérielles qui m’ont permis de travailler dans un environnement favorable. Merci
pour m’avoir fait confiance jusqu’à la fin de ma thèse et pour m’avoir dirigé sur ce sujet
passionnant.

Merci à Monsieur Taha NAJAR, mon co-directeur de thèse, pour m'avoir fait
confiance et laissé une grande liberté d'action tout au long de ce projet de recherche.

Je suis très reconnaissante envers le gouvernement tunisien et l’INRA qui m’ont
attribué une bourse pour réaliser mes travaux.

Je tiens à remercier chaleureusement Monsieur Xavier FERNANDEZ, Directeur de
l’UMR TANDEM, et Thierry GIDENNE, animateur de l’équipe NED, pour m’avoir
accueillie dans leur équipe et pour m’avoir ouvert la porte de leur laboratoire.

J’adresse mes remerciements aux membres de mon comité de pilotage pour le temps
consacré et les discussions : Pascale MOSONI (Unité de microbiologie, INRA) et Frédéric
GLASSER (Unité de Recherche sur les Herbivores, INRA).

Je tiens à exprimer ma reconnaissance à Annabelle TROEGELER-MEYNADIER
(UMR TANDEM) qui m'a encadrée tout au long de ma thèse. Merci pour ses conseils, sa
disponibilité et son aide. Merci pour ta patience, ta gentillesse et ton efficacité.

Je remercie sincèrement Sylvie COMBES pour l'investissement permanent dont elle a
fait preuve dans ce projet. Complice et confidente auprès de qui j'ai trouvé une oreille
attentive et toujours de bons conseils. Merci pour son soutien inconditionnel.

Un grand merci à Laurent CAUQUIL. Que dire à part que sans toi une grande partie
de ce travail n'aurait pas été possible. Merci de t’être investi à fond et de m’avoir consacré ton
temps si précieux. Ce fut un réel plaisir de travailler avec toi.

Je tiens à remercier Marie Claude NICOT qui m'a transmis son savoir-faire avec une
grande générosité et qui a toujours été disponible pour répondre à mes questions.

Merci à Marie-Luce CHEMIT qui m’a appris une infinité de choses. Merci pour sa
sympathie et son soutien.
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Un grand merci à Yves FARIZON et à Jean-Philippe VERGNES pour leur aide et leur
disponibilité. Que de bons moments en votre compagnie.

Je tiens à exprimer ma vive reconnaissance à toute l’équipe du Domaine de Borret en
particulier, Brigitte SANTA-CRUZ et Caroline DUFRESNE qui m’ont aidée lors des
prélèvements, parfois très contraignants. Merci pour leur ‘super’ boulot et pour tous les
efforts qu’elles ont fournis pour me faciliter la tâche.

Un grand merci à tout le personnel de l’UMR TANDEM, qui de près ou de loin a
participé à ce travail. En particulier, Béatrice GABINAUD et Muriel SEGURA pour leur
patience à m'enseigner les notions essentielles des analyses de laboratoire.

J’adresse également mes remerciements à Viviane BATAILLER pour son aide
administrative au cours de ces 3 années.

Merci aux bioinformaticiens (Christine ROUSSEAU et Jérôme MARIETTE) qui
m'ont aidée à analyser les données du pyroséquençage, un domaine qui ne relève pas de mes
compétences.

Un énorme merci aux futurs thésards, particulièrement Muhammad KALEEM et Yapo
Magloire YAPI, avec qui j'ai partagé de bons moments.


Un grand merci à Céline Domange pour sa gentillesse, son soutien, son aide et sa
disponibilité. Merci également à Nathalie Priymenko pour sa sympathie.

Merci à tous mes collègues, thésards et stagiaires de l’UMR TANDEM, en particulier,
Christine JULIEN, pour son aide et sa disponibilité. Merci à Lionel RAYMOND qui a
participé aux analyses d’une partie de ce travail.

Merci à Madame Sabiha (INAT), pour son aide administrative et sa gentillesse.


















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Dédicaces



Je dédie cette thèse en premier lieu à ma grand-mère. J'aurais tant aimé qu'elle soit
encore là pour assister à la fin de cette longue aventure. Je ne doute pas qu'elle aurait
été fière de moi.

A mon papa,
A ma maman,
A ma soeur,

Merci pour votre soutien tous les jours malgré la distance qui nous sépare. Merci
d’avoir toujours cru en moi. C'est à vous que je dédie cette thèse.

A Blaise,

Personne ne sait aussi bien que toi, m’écouter, me comprendre et me donner confiance
Merci d’être là …si proche de moi et de m’avoir encouragée pour aller de l’avant.

A Celia, Dalia et Valentina,

Auprès de qui j'ai trouvé une oreille attentive et toujours de bons conseils quand j'étais
dans une impasse. Merci pour notre belle complicité, merci d’être là quand j’avais
besoin de vous, pour votre soutien et votre affection.

A tous mes amis,

Pour leur soutien inconditionnel dans les pires et les meilleurs moments.








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PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES ET COMMUNICATIONS ISSUES
DE LA THÈSE


PUBLICATIONS DANS DES REVUES A COMITÉ DE LECTURE DE RANG A

Article 1 - Starch plus sunflower oil addition in the diet of dry dairy cows results in
a trans-11 to trans-10 shift of biohydrogenation associated with a decrease of the
diversity of ruminal bacterial community (en préparation, Journal of Dairy
107 Science).

Article 2 - In vitro study of dietary factors affecting the biohydrogenation shift from
trans-11 to trans-10 fatty acids in the rumen of dairy cows (accepté, Animal). 133

Article 3 - Starch and oil in the donor cow diet and starch in substrate differently
affect the in vitro ruminal biohydrogenation of linoleic and linolenic acids (accepté,
159 Journal of Dairy Science).

12 9 Article 4 - Effects of pH and donor cow diet on ruminal linoleic acid - and -
187 isomerisation (soumis, British Journal of Nutrition).

Article 5 - Microbial ecology of the rumen evaluated by 454 GS FLX
199 pyrosequencing is affected by starch and oil supplementation of diets (en
preparation, Environmental Microbiology).

Article 6 - Trans11 to trans10 shift of fatty acids ruminal biohydrogenation is
associated with changes of rumen microbiota evaluated by 454 GS FLX
233 pyrosequencing (en préparation, ISME Journ