Docteur de l'Université Louis Pasteur Strasbourg I

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Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
Thèse présentée pour obtenir le titre de      Docteur de l'Université Louis Pasteur Strasbourg I      Discipline : Sciences du Vivant  Spécialité : Bioinformatique        par      Aurélie LARDENOIS      Development and applications  of an integrated bioinformatics approach   for promoter analysis.          Soutenue publiquement le 1er décembre 2006 devant le jury :      Rapporteur externe  Donald J. ZACK  Rapporteur externe  Uwe STRAHLE  Rapporteur interne  Claude KEDINGER  Examinateur  Dino MORAS  Examinateur  Thierry LEVEILLARD  Directeur de thèse  Oliver POCH   

• je  remercie  chaleureusement 


• oliver poch   


• à claudine  pour 


• dino moras  examinateur 


• et  une 


• équipe  de 


• merci à  tous mes collaborateurs pour  cette 


•  zack  rapporteur externe 

Informations

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Extrait

Thèseprésentéepourobtenirletitrede Docteurdel’UniversitéLouisPasteurStrasbourgI Discipline:SciencesduVivant Spécialité:Bioinformatique par AurélieLARDENOIS Developmentandapplications ofanintegratedbioinformaticsapproach forpromoteranalysis. er Soutenuepubliquementle1décembre2006devantlejury: RapporteurexterneDonaldJ.ZACK RapporteurexterneUweSTRAHLE RapporteurinterneClaudeKEDINGER ExaminateurDinoMORAS ExaminateurThierryLEVEILLARD DirecteurdethèseOliverPOCH

àmesparents,

Remerciements

Avanttout,jetienstoutparticulièrementàremercierlesProfesseursDonaldJ.Zack,Uwe Strahle,ClaudeKedinger,DinoMorasetThierryLéveillardpouravoiracceptédejugerce travaildethèse. JeremercieégalementDinoMoras(doublementdonc)pourm’avoiraccueillidansson laboratoire.MerciégalementàJeanClaudeetAnnetteThierrypourleursympathieetpour laqualitéirréprochabledeleurcuisinebourguignonne.

JeremerciechaleureusementOlivierPochpourm’avoirdonnécesujetpassionnantet m’avoirfaitconfiancetoutaulongdecettethèse.Mêmes’ilresteunHimalayaàescalader avantl’excellence,jenesuisdéjàpluslamêmequ’ilyaquatreansetc’estengrandepartie grâceàvous.MerciaussiàClaudinepoursabonnehumeur,sesencouragementsetses visitestoujourssympathiques. Merciàtousmescollaborateurspourcettesynergie,pourleurefficacitéetleuraide.Tout particulièrementàNicolas,David,PascaletEmmanueldel’équipedeJean‐MarcEgly,à SophieetSachadel’équipedeThierryLéveillard,àl’équipedeDanielBoujard,àMichael Primig,àValeriaRoni,àKatiaetJérômedel’équipedeBrigitteKieffer,àGrettaetYvon Trottier.

Gretta,c’étaitunvraiplaisirdetravailleravectoi.Jetesouhaitebonnechancepourlasuiteet espèreterevoirbientôtauLiban.

Valéria,àquandunenouvellevisitedeBigAppleetuncongrèsentrefilles! Merciàtoutel’équipedebioinfoauseindelaquelleilfaitsibontravailler!

UngrandmerciàRaymond,l’hommeauxmilleetunefacettes,programmeurlejouret réparateurdecitröenAXlanuit.Isabelle,FrançoisetSophie,merciégalementpourvotre sympathie,pournousavoirfaitdécouvrirlescoursderocketpournossoiréeschaleureuses enchansonjusqu’àpasd’heure! MerciM’sieurLucpourtoutesnosconversationsdetravailettoncôtéfraterneltoujours appréciabledanslesmomentsdedoute.J’oubliais,merciégalementpourcesbeuglantes

soiréescheztoiaugranddésarroidetesvoisins.Ah,aufait,iln’yapasdedouteleroi Louis….c’esttoi!

MerciJuliepourtonaideaucoursdemathèse.Millemercispourtouteslescorrections d’anglaisetl’investissementquetuasfaitsurcemanuscrit,aveclesourire,sansjamaiste plaindreetentrouvanttoujourslesbonsmotspourmesoutenir!

MerciOdilepourtagentillesseetpourm’avoirréconfortéàchaquefoisquej’enaieubesoin aucoursdecettethèse.Beaucoupdebonheuràlapetitenouvelledulabo:Maëlle!

MerciàYannpourlesbonsmomentspassésaucoursderocketdelindy!Boncouragepour tathèse,maisfaisattentionànepaspassertoutestesnuitsaulabo…

MerciVéropourtajoiedevivreettapêchenaturelle.J’aiétévraimentheureusedepouvoir montreraugarsdulaboqu’enping‐pongnousn’étionspasdesfillettes;‐)(commeeux!).

MerciAnnaïckpourtagentillesse,tonsoutienetnosdiscussionspendantlespausesthé. MerciAnnepourtabonnehumeuretcouragepourtouslesarticlesetbouquinsquetu rédigesenanglaisbiensûretaussipourlasuitedetathèse! MerciNicolaspourtongoûtinvétérépourlesfilmsexotiquesquicontribueàlabonne humeurdulabo. Merciauxtravailleursducouloirinfernalpourleursympathieetleurbonnehumeur: Guillaume,ManuetLaetitia.

FredetLaurent,mercipournosdiscussionsauRUetvotreaideprécieusepourles installationsdebanques,deprogrammesetautresanalysesdepromoteurs.

Merciàmonpremiervoisindebureau,àsavoirlemaîtreJediDrFintonSirockinpoursa sympathieetsonhumour.

MerciWolfgangpournosdiscussionsenrichissantesetd’avoirpartagécebureau.

Ravi,bonnechancepourcettedernièreannéedethèse!

MerciàChristiane,Anne,LaetitiaetOdilepourvotregentillesseetvotreefficacité. MerciàSergeetGuillaumepourvotreaideprécieuse.

Courageaussiàceuxquireprendrontleflambeaudelapromotologie;‐).N’oubliezsurtout jamaisd’avoirunaimantsurvousafinderetrouverl’aiguille…

MerciàWiwi(BP)etMuriellepourvotresympathie,vosencouragementsetvosbonplans restosetautres(jen’incluspaslesblaguestéléphoniques;‐))

MerciàAnneetRachelle(etCéline)pournosfollessoirées«poule»,tricotetcompagnie… Mercipourvotregentillesse,votrebonnehumeuretvotresoutien!Etmaintenantcélébrons l’arrivéed’unetoutenouvellepouletteAnna!

DianeetEmeric(leslapinsJoeBarretleurpanthère),MélindaetThierry,VivietOlive,tous bienloindugrandestetpourtanttoujoursaussiencourageants.Mercipourvotreamitié…

JeanetCéline,parquoicommencer…Mercipournosrepas«MadeinStrasbourg»,nos soiréesdejeuxendiablées,nosfranchesrigolades(SansrancuneJeansic’estsouventtoiqui trinque;‐)).Mercisurtoutpourvotreamitiéetcommediraitl’autre«Pourvuqueçadure!». Enfin,bienvenueàAnnaetbeaucoupdebonheuràvoustrois!euuuuh…,quedis‐je…à vousquatre,avecSullybiensûr!

Merciàma«joliefamille»:Marinette,Yvounet,Toto,PierrotlaLuneetNanoupourvotre soutiendepuistoutescesannées.

Unénormemerciàmesparentspourtout,votresoutiensansfailledepuistoujours.Merci d’avoiraccepté,soutenusansréservemesorientationsetdem’avoirpermisd’enarriver là,…Jevousensuistrèsreconnaissanteetvousaimeprofondément.

Merciàmonfrèreadoré,Gastonpourtonsoutiendepuistoutessesannées,pourm’avoir donnél’envied’allerplusloinetdemarchersurtestraces.MerciàtoietàAgnèspourvos encouragements. Ungrandmerciàmesgrands‐parents,lesmomentspassésauprèsdevoussontraresmais tellementimportants! Merciàmoncœur…monamour!Monamour…,moncœur!...monclown,monprofesseur, montout.Tonsoutienettonaideontétéprimordiauxpourcetravail.Toutaulongdecette thèse,tuastoujourssumeredonnerlemoraletm’encourager.Anousmaintenantd’en profiteretderenouvelerlesmomentsmerveilleuxquel’onapasséàl’autreboutdela terre…

Enfin,merciàmonsieurRoycoquim’aaccompagnétoutaulongdecettethèseainsiqu’à MonsieurPicardetMlleC.Vitaminequinousontpermisdesurvivrecesderniersmois.

MespenséesvontaussiàJacquelineetJacquesquinousontquittésbeaucouptropviteau coursdecettethèseetnousmanquentprofondément.

“Nothingmakessenseinbiologyexceptinthelightofevolution”

TheodosiusDobzhanskyȇsdictum