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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 56 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 6 Mo |
Extrait
UNIVERSITÉ VICTOR SEGALEN BORDEAUX 2
École Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé
Année 2010 Thèse n° 1798
THÈSE
pour le
DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ DE BORDEAUX 2
Mention : Sciences, Technologie, Santé
Option : Microbiologie
Présentée et soutenue publiquement
le 21 Décembre 2010
par
Fater YOUSSEF
Caractérisation génomique et développement d’outils de
construction de clones infectieux pour l’étude de flexivirus
Membres du jury :
M. Michel HERNOULD Professeur à l’université Bordeaux 2 Président
Mme Véronique BRAULT Directeur de recherche INRA Rapporteur
M. Benoît MOURY Directeur de recherche INRA Rapporteur
M. Emmanuel JACQUOT Chargé de recherche INRA Examinateur
M. Olivier LE GALL Directeur de recherche INRA Directeur de thèse
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" ...C’est ainsi que je suis devenu fou, mais grâce à ma folie
j’ai trouvé la liberté et la paix…
Bénis, bénis soient les voleurs qui m’ont
volé mes masques "
Gibran Khalil Gibran
ﻥﺍﺮﺒﺟ ﻞﻴﻠﺧ ﻥﺍﺮﺒﺟ
Remerciements
ﺮﻳﺪﻘﹾ ﺗ ﻭ ﺮﻜﹾ ﺷ
Ce travail a été réalisé au sein de l’équipe Virologie de l’UMR Génomique, Diversité
et Pouvoir Pathogène de l’INRA-Bordeaux et l’Université Victor Segalen Bordeaux 2.
Je tiens à remercier tout d’abord M. Thierry Candresse de m’avoir accueilli dans son
laboratoire au cours de mon stage M2 et mes quatre années de thèse. La qualité de son
encadrement, ses connaissances, sa rigueur scientifique font que je me sens très honoré
d’avoir appris à ses côtés. Thierry, je ne te remercierai jamais assez pour tout…et je
n’oublierai jamais ton passage tardif et régulier le soir et les week-ends dans le bureau
« Stagiaires » pour m’apporter ton soutien, les idées et les solutions aux problèmes quotidiens
de labo, sans toi je ne serais jamais arrivé là… Choukran aussi de m’avoir fait connaitre et
savourer tant de musiques diverses…
Je remercie également Mme Armelle Marais, codirectrice de thèse et de stage M2, un
immense et sincère merci pour ton soutien précieux pendant ces quatre années. Merci Armelle
tout particulièrement pour ta disponibilité et ton implication durant ces derniers mois pour tes
conseils et pour la correction de ce manuscrit.
Je souhaite exprimer toute ma reconnaissance au professeur Michel Hernould pour me
faire l’honneur de présider ce jury. Je remercie également Mme Véronique Brault, et M.
Benoît Moury pour avoir accepté d’examiner et de juger cette thèse. Mes remerciements vont
aussi à M. Emmanuel Jacquot (également remercié d’avoir participé au comité de thèse, pour
nos discussions et ses suggestions très utiles) pour participer à ce jury.
Je n’oublie pas de remercier Olivier dit OL, notre chef de département, la première
personne que j’ai contactée à Bordeaux et qui m’a accueilli. C’était un honneur pour moi que
tu sois mon directeur de thèse même si c’était juste administrativement et je suis très heureux
également que tu participes à ce jury.
Merci à Chantal, pour ta gentillesse et ton aide technique précieuse surtout pendant la
dernière année.
Merci à tous les thésards, qui m’ont précédé et avec qui j’ai partagé des moments
inoubliables : à Ophélie (je me rappelle toujours de tes plats marocains délicieux), à Grégoire
(après ton départ Dr.G, je n’ai plus fait de longues balades à vélo !!), à Anne-So (surtout pour
le week-end à Saint-Jean-de-Luz), à Anas, grâce à qui je n’ai pas encore oublié l’arabe, pour
ton soutien, nos discussions scientifiques et politiques.
À Sylvie, pour tes conseils, nos discussions, tes encouragements, ton amitié et d’avoir
enfin choisi une brésilienne, mais c’est trop tard ! Merci pour tes plats délicieux (tu cuisines
trop bien !!!!).
À Laurence, pour ta gentillesse, tes encouragements, et ton aide.
À Maryline pour ta gentillesse, nos discussions, nos échanges à propos de la flore et la
faune, et pour les deux journées mémorables de bienvenue à la ferme.
À Yannick, mon premier ami ici à Bordeaux, grâce à qui les moments très difficiles de
M2 ont été remplacés par des beaux souvenirs.
Aux amis ici à Bordeaux ou ailleurs pour tous les moments que nous avons pu passer
ensemble, pour nos soirées, sorties, plages, piscine… j’avais de la chance de vous avoir près
de moi : à Béné, Gérald (grâce à qui nous avons passé des bons moments à Bordeaux et à
Nantes). À Gaëlle, Carole, Stéphanie (un grand merci pour nos discussions et tes
encouragements, heureux d’avoir fait ta connaissance, je te souhaite la meilleure des choses
parce que tout simplement tu le mérites…) et à David (c’est à toi maintenant de prendre ma
place pour la piscine). Aux deux gentils Brésiliens Nelson et Flavio. À Darein, Labib, Saossan,
Karim, Randa, Evlin, et Riad. À Nsrein et Manu (je vous souhaite une vie pleine d’amour).
Enfin à Daniela, tu es venue au bon moment, en si peu de temps tu es devenue une amie très
chère, merci pour tes encouragements.
À Luc, l’ami des étrangers, merci pour toutes les soirées que nous avons organisées
chez toi, pour nos discussions et tes encouragements tout au long de cette thèse, un très grand
choukran pour ton amitié M. Qualité « chou hal faoda ».
À Claire et Christophe (choukran famille Garcion), c’est vraiment un grand plaisir
pour moi de vous avoir connus et d’avoir le premier cadeau de Noël de la belle Clémentine,
un grand merci.
Merci aux familles Breton, Sofer, Svanella, et Retana avec qui j’ai senti, même avec le
peu de temps que j’ai passé avec vous, que j’ai de la famille ici.
Merci à tous ceux qui ont partagé le bureau avec moi à travers ces années, Hien, Salma,
Pauline, Ann, Germain (le surfeur fou), Julie (pour les points divers des matins), Sylvain et
Maud (vous êtes les meilleurs, vous allez y arriver …).
À l’ensemble de l’équipe Virologie : à Véro, Timi, Geneviève, Jos, Fred, Marie
Mension, Mélodie, Patrick, Valérie, Claudine, Ye’chan, Noëlle, Michel, Pascal, Thierry
Aurélie, Marie-Christine, et à Marie-Lou. Merci à vous tous pour vos encouragements et votre
sympathie. Merci également à Pascal de m’avoir aidé à faire quelques manips au Ctifl.
Ma gratitude va également envers la Syrie, mon pays qui m’a tout offert pour faire
cette formation et passer une période mémorable de ma vie. Que toutes les personnes qui ont
contribué à réaliser cette étude dans les meilleures conditions possibles trouvent ici le
témoignage de ma sincère reconnaissance. Un grand merci également à tous les membres de
l’ambassade de la Syrie à Paris, à Mlles Mazina et Mourshida du ministère de l’enseignement
supérieur en Syrie, pour leur disponibilité, sympathie et aide, à tous les personnels du service
BGF du Crous de Bordeaux et en particulier à Mme Laué pour leur aide et leur disponibilité.
Et par-dessus tout, mes remerciements vont à mes parents, mes frères et sœurs, à mon
oncle Firass et à mes amis en Syrie qui ont cru en moi et qui ont su me soutenir et
m’encourager même à trois milles kilomètres de distance. Production scientifique
Production scientifique
Publication dans des journaux à comité de lecture
Youssef, F., Marais, A. and Candresse, T. (2008). Partial genome sequence of Bidens mottle
virus sheds light on its taxonomy. Archives of Virology 153, 227-228.
Youssef, F., Marais, A., Faure, C., Barone, M., Gentit, P. and Candresse, T. Characterization
of Prunus-Infecting Apricot latent virus–like foveaviruses: Evolutionary and taxonomic
implications. Virus research In Press.
Youssef, F., Marais, A., Faure, C., Gentit, P. and Candresse, T. Strategies to facilitate the
development of uncloned or cloned infectious full-length cDNAs : Apple chlorotic leaf spot
virus as a case study. To submit in Journal of virological methods.
Youssef, F