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AVERTISSEMENT



Ce document est le fruit d’un long travail approuvé par le jury de
soutenance et mis à disposition de l’ensemble de la communauté
universitaire élargie.
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version papier. Ceci implique une obligation de citation et de
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LIENS




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http://www.cfcopies.com/V2/leg/leg_droi.php
http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm

NANCY-UNIVERSITE, FRANCE
INSTITUT NATIONAL POLYTECHNIQUE DE LORRAINE
Ecole Nationale Supérieure d’Agronomie et des Industries Alimentaires
Laboratoire de Science et Génie Alimentaires

UNIVERSITE DE NGAOUNDERE, CAMEROUN
Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agro-Industrielles
Laboratoire de Microbiologie

THESE
Présentée devant l’Institut National Polytechnique de Lorraine
en vue d’obtenir les grades de

Docteur de l’INPL et Docteur/PhD de l’Université de Ngaoundéré
Spécialité : Procédés Biotechnologiques et Alimentaires
par
Hélène Carole Edima


Carnobacterium maltaromaticum : caractéristiques physiologiques et
potentialités en technologie fromagère

Soutenue publiquement à l’INPL le 20 septembre 2007 devant la commission d’examen

Rapporteurs

Paul Henri Amvam Zollo, Professeur, Recteur de l’Université de Ngaoundéré
Pascal Degraeve, Maître de conférences à l’Université Claude Bernard 1, Bourg-en-Bresse

Examinateurs

Jean-François Cavin, Professeur à L’ENS.BANA à Dijon
François-Xavier Etoa, Professeur à l’Université de Yaoundé 1 (Directeur de thèse)
Carl Moses Mbofung, Professeur, Directeur de L’ENSAI de Ngaoundéré (Directeur de thèse)
Jean-Bernard Millière, Professeur, LSGA, ENSAIA-INPL (Directeur de thèse)
Avant-propos

Les travaux consignés dans ce mémoire de thèse ont été réalisés au Laboratoire de
Science et Génie Alimentaires (LSGA) de l'ENSAIA-INPL de Nancy. Je remercie le
Professeur Stéphane Désobry pour m'avoir accueillie au sein de son laboratoire.

J’exprime ma vive reconnaissance au Professeur Jean-Bernard Millière (IUT Nancy-
Brabois, UHP-Nancy 1), Directeur de recherche au LSGA, équipe de Microbiologie
Alimentaire, qui a accepté de diriger ce travail. Je le remercie, ainsi que Madame
Catherine Cailliez-Grimal (Maître de conférences à l’IUT Nancy-Brabois), pour leur
disponibilité, leurs conseils, leurs qualités humaines et surtout pour la confiance
qu’ils m’ont accordés.

Mes remerciements s’adressent également à messieurs les professeurs François-
Xavier Etoa (Faculté des sciences de l’Université de Yaoundé 1) et Carl Moses
Mbofung (Directeur de l’ENSAI de l’Université de Ngaoundéré) d’avoir accepté de
diriger ce travail. Je tiens à les remercier pour la confiance qu’ils m’ont accordée,
leurs encouragements, et leurs conseils.

J’exprime également ma gratitude à Madame Anne-Marie Revol-Junelles, maître de
conférences à l’ENSAIA-INPL, qui a toujours accordé beaucoup d’attention à mon
travail.

Mes remerciements s’adressent aussi à Messieurs les Professeurs Paul Henri Amvam
Zollo, Pascal Degraeve et Jean-François Cavin qui ont accepté de juger ce travail.

Merci à Mesdames Sylvie Banon-Désobry (Maître de conférences à l’IUT Nancy-
Brabois) et Muriel Jacquot (maître de conférences à l’ENSAIA-INPL), au Professeur
Michel Linder (Directeur de recherche au LSGA) et à Monsieur Emmanuel Rondags
(maître de conférences à l’ENSAIA-INPL). Leur aide et leur conseil m’ont été très
précieux.


J’associe à mes remerciements la Société Bongrain-Gérard SAS qui a réalisé des
fabrications de fromages à pâte molle au sein de son laboratoire R&D au Tholy et
qui a également mis en place et participé aux séances de dégustation.

Je remercie également les personnes qui ont participé de près ou de loin à cette
étude ; Mlles Michèle Turban et Carine, Mme Delphine Roger, Mrs. Ahanda
Antoine, Jordane, Aboubakar, Abdou bouba, et tout le personnel du LSGA, sans
oublier les stagiaires. Qu’ils soient toutes assurés de ma sympathie.

Maintenant, comment exprimer ma reconnaissance à mes parents, à la famille
Bekono Messanga Siméon, à la famille Jourdan Roland, à la famille Toulou Bidima
Pascal, à Mr. Joachim Ndi, dont le soutien m’a été tellement précieux ? Je leur dédie
cette thèse dont ils sont aussi les auteurs et les acteurs.

Et enfin, que dire à Joël et à Merveille qui ont subi le pire...Recevez ici le
témoignage de toute ma gratitude et de tout mon amour.




Sommaire
Table des matières

Liste des publications et communications (Annexe 5)....................................................-i-
Liste des tableaux..............................................................................................................-ii-
Liste des figures................................................................................................................-iv-
Liste des abréviations......................................................................................................-vii-
Introduction........................................................................................................................-1-

Chapitre I. Revue bibliographique............................................................-5-

I.1. Les bactéries lactiques ..............................................................................................- 0 -

I.1.1. Connaissances générales ......................................................................................- 5 -
I.1.2. Intérêts des bactéries lactiques .............................................................................- 6 -
I.1.3. Le genre Carnobacterium ....................................................................................- 7 -
I.1.3.1. Systématique bactérienne..............................................................................- 7 -
I.1.3.2. Caractères physiologiques ............................................................................- 8 -
I.1.3.3. Production de bactériocines .........................................................................- 8 -
I.1.3.4. Habitats du genre Carnobacterium .............................................................- 12 -
I.1.3.5. Position taxonomique..................................................................................- 13 -

I.2. Méthodes d’identification de Carnobacterium sp.................................................- 14 -
I.2.1. Identification génotypique du genre Carnobacterium ......................................- 14 -
I.2.2. Identification phénotypique du genre Carnobacterium .....................................- 15 -
I.2.2.1. Intérêt des différents constituants du milieu de culture ..............................- 16 -

I.3. Le fromage et les bactéries lactiques.....................................................................- 17 -
I.3.1. Le fromage .........................................................................................................- 17 -
I.3.2. Incidence des bactéries lactiques atypiques en fabrication fromagère...............- 18 -
I.3.3. Présence opportuniste de C. maltaromaticum dans des fromages .....................- 20 -


Sommaire
I.4. Production de composés sapides par des bactéries lactiques..............................- 20 -
I.4.1. Hydrolyse du lactose et des lipides ....................................................................- 21 -
I.4.2. Métabolisme des acides aminés .........................................................................- 22 -
I.4.2.1. Les composés aromatiques dans les fromages............................................- 25 -
I.4.3. Les bactéries lactiques et composés aromatiques .............................................- 27 -
I.4.3.1. Production de composés maltés par C. maltaromaticum............................- 28 -
I.4.4. Application en industrie fromagère....................................................................- 28 -
I.4.5. Les amines biogènes...........................................................................................- 29 -
I.4.5.1. Rôle des amines biogènes............................................................................- 30 -
I.4.5.2. Toxicité des amines biogènes ......................................................................- 31 -
I.4.6. Les bactéries impliquées dans la production des amines biogènes....................- 31 -

I.5. Texture du gel lactique ...........................................................................................- 33 -
I.5.1. Acidification du lait............................................................................................- 33 -
I.5.2. Détermination des propriétés rhéologiques........................................................- 34 -


Chapitre II. Matériel et méthodes.............................................................-36-

II.1. Techniques de microbiologie ................................................................................- 36 -
II.1.1. Souches bactériennes ........................................................................................- 36 -
II.1.2. Préparation de l’inoculum.................................................................................- 36 -
II.1.3. Milieux de culture.............................................................................................- 37 -
II.1.3.1. Bouillon de laboratoire TSB-YE ................................................................- 37 -
II.1.3.2. Lait .............................................................................................................- 37 -
II.1.3.3. Milieux de dénombrement..........................................................................- 37 -
II.1.4. Elaboration du milieu sélectif pour Carnobacterium sp...................................- 38 -
II.1.4.1. Caractéristiques du milieu.........................................................................- 38 -
II.1.4.2. Antibiogramme...........................................................................................- 38 -
II.1.4.3. pH et températures d’incubation ...............................................................- 39 -
II.1.5. Plans d’expériences selon la matrice de Doehlert.............................................- 40 -
II.1.5.1. Plan de Doehlert à trois facteurs...............................................................- 41 -
Sommaire
II.1.5.2. Analyses statistiques et graphiques ...........................................................- 41 -
II.1.5.3. Méthodologie des surfaces de réponse ......................................................- 42 -
II.1.6. Plan d’expériences incluant les antibiotiques ..............................................- 43 -
II.1.7. Validation du milieu sélectif de numération pour C. maltaromaticum ............- 44 -
II.1.7.1. Vis-à-vis de C. maltaromaticum LMA 28...................................................- 44 -
II.1.7.2. Vis-à-vis d’un consortium de souches présentes dans l’environnement
fromager ..................................................................................................................- 44 -
II.1.8. Cinétiques d’acidification de C. maltaromaticum LMA 28, de Lc. lactis DSM
20481 et de S. thermophilus INRA 302 en culture pure..............................................- 44 -
II.1.8.1. En TSB-YE .................................................................................................- 45 -
II.1.8.2. En lait.........................................................................................................- 45 -
II.1.9. Cinétique d’acidification de C. maltaromaticum LMA 28 en co-culture avec Lc.
lactis DSM 20481 ou avec S. thermophilus INRA 302 dans du lait ...........................- 45 -
II.1.10. Impact de la combinaison pH-température sur la cinétique d’acidification du lait
par C. maltaromaticum LMA 28, Lc. lactis DSM 20481 et S. thermophilus INRA 302
(plan d’expériences) ....................................................................................................- 46 -
II.1.11. Recherche de bactériocines produites par C. maltaromaticum LMA 28........- 47 -
II.1.11.1. Méthode de détection en milieu solide.....................................................- 47 -
II.1.12. Analyse bactériologique des fromages ...........................................................- 48 -

II.2. Techniques de biochimie.......................................................................................- 49 -
II.2.1. Profil carboné de C. maltaromaticum (LMA 28, « Réo », « Pérail » et DSM
T
20730 ) sur galeries API 50 CHL ...............................................................................- 49 -
II.2.2. Dosages du glucose, du galactose, du fructose, du lactose et de l’acide lactique en
milieu TSB-YE............................................................................................................- 49 -
II.2.2.1. A l’aide de kits enzymatiques....................................................................- 49 -
II.2.2.2. Par chromatographie liquide haute performance (HPLC) .......................- 50 -
II.2.3. Profils enzymatiques de C. maltaromaticum (LMA 28 « Réo » « Pérail » et DSM
T
20730 ), de Lc. lactis DSM 20481 et de S. thermophilus INRA 302..........................- 50 -
II.2.3.1. Sur galerie API ZYM..................................................................................- 50 -
II.2.3.2. Sur milieux gélosés spécifiques..................................................................- 51 -
II.2.3.3. Recherche de l’activité -galactosidasique...............................................- 52 -

bSommaire
II.2.4. Production de composés aromatiques par C. maltaromaticum LMA 28, Lc. lactis
DSM 20481 et S. thermophilus INRA 302..................................................................- 53 -
II.2.4.1. Dosage de composés aromatiques.............................................................- 53 -
II.2.5. Dosage des amines biogènes.............................................................................- 54 -
II.2.5.1. Dansylation................................................................................................- 54 -
II.2.5.2. Dosage par HPLC......................................................................................- 55 -

II.3. Techniques rhéologiques.......................................................................................- 55 -

II.3.1. Détermination de paramètres rhéologiques de laits acidifiés par C.
maltaromaticum LMA 28, Lc. lactis DSM 20481 et S. thermophilus INRA 302.......- 55 -

II.4. Evaluation sensorielle............................................................................................- 57 -

II.4.1. Préparation des solutions ..................................................................................- 57 -
II.4.2. Entraînement du jury.........................................................................................- 58 -

II.5. Techniques de biologie moléculaire .....................................................................- 58 -
II.5.1. Extraction de l’ADN bactérien .........................................................................- 58 -
II.5.1.1. A partir d’une colonie................................................................................- 58 -
II.5.1.2. A partir d’un bouillon de culture...............................................................- 58 -
II.5.1.3. A partir du fromage ...................................................................................- 59 -
II.5.2. Amplification par PCR avec les amorces spécifiques de genre Cb1/Cb2R et
d'espèce Cpis/23S-7 : identification génotypique de C. maltaromaticum LMA 28....- 59 -
II.5.3. Recherche de C. maltaromaticum dans 30 fromages français..........................- 60 -
II.5.4. Amplification par PCR des gènes impliqués dans la production des
carnobactériocines B2 et BM1 ....................................................................................- 62 -
II.5.5. Electrophorèse en gel d’agarose .......................................................................- 62 -

II.6. Fabrications fromagères .......................................................................................- 63 -
II.6.1. Fabrication des « petits suprêmes vitalité » 10 Mai 2005.................................- 63 -