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Informations
Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 61 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 43 Mo |
Extrait
Universite Paris-Sud 11
Faculte des Sciences d’Orsay
Ecole Doctorale :
Innovation Therapeutique : Du Fondamental A l’Applique
^ Pole : Ingenierie des Proteines et Cibles Therapeutiques
These de Doctorat
soutenue le 29 avril 2011
par
Amandine GUELORGET
pour obtenir le grade de Docteur en Sciences de l’Universite Paris-Sud 11
Etude de la structure et de la region-speci cite de
1la m A57/58 methyltransferase d’ARNt de
l’archee Pyrococcus abyssi
Directrice de these Beatrice Golinelli-Pimpaneau
Composition du jury Herman Van Tilbeurgh President
Eric Westhof Rapporteur
Christiane Branlant Rapporteur
Dominique Fourmy Examinateur
Carine Tisne Examinateur
Beatrice Golinelli-Pimpaneau Directrice de these
These preparee au Laboratoire d’Enzymologie et Biochimie Structurales
UPR 3082 CNRS - B^ atiment 34
1 avenue de La Terrasse, 91198 Gif-sur-Yvette
tel-00612159, version 1 - 28 Jul 2011tel-00612159, version 1 - 28 Jul 2011Remerciements
Ce travail de these a ete realise dans l’equipe « Enzymes de modication
des ARN de transfert : etude mecanistique et structurale », dirigee par le
Dr. Beatrice Golinelli-Pimpaneau, au sein du Laboratoire d’Enzymologie
et Biochimie Structurales (LEBS) situe sur le campus du CNRS de Gif-sur-
Yvette.
Je tiens a remercier, en premier lieu, Beatrice Golinelli, pour son en-
cadrement pendant ces annees passees dans son equipe, pour l’attention et
la disponibilite dont elle a fait preuve tout au long de mon doctorat, et no-
tamment lors de la redaction de cette these. Tout en me laissant une grande
autonomie, elle a su me guider et m’aider pour faire avancer nos projets. J’ai
beaucoup apprecier son e cacite et sa rigueur lors de notre collaboration dans
l’ecriture de nos articles.
Je remercie Eric Westhof et Christiane Branlant pour avoir accepte
d’^etre rapporteurs de ce travail, et Herman Van Tilbeurgh, Dominique
Fourmy et Carine Tisne, qui m’ont egalement fait l’honneur de faire par-
tie du jury.
Je remercie egalement Sylvie Auxilien pour toute l’aide qu’elle m’a ap-
portee, tant au moment de mon apprentissage que pendant les annees qui ont
suivies. J’ai particulierement apprecie sa grande disponibilite, ses conseils et
sa gentillesse.
Je remercie Djemel Hamdane pour l’aide qu’il m’a apportee sur mes tra-
vaux, mais aussi pour nos discussions scientiques ou non, et surtout sa bonne
humeur et les rires partages.
Je remercie Vincent Guerineau de l’equipe de Spectrometrie de Masse
d’Alain Brunelle, a l’Institut de Chimie des Substances Naturelles, pour sa
collaboration tres fructueuse, sa disponibilite et son accueil toujours tres cha-
leureux lors de mes visites a l’ICSN.
i
tel-00612159, version 1 - 28 Jul 2011ii Remerciements
Je remercie tous mes collegues du LEBS, en particulier les membres de
l’equipe 07, pour m’avoir accueillie si souvent parmi eux a midi. Je tiens a
remercier chaleureusement Olivier et Jeremie pour leur tres grande capacite
d’ecoute, leur non moins grande disponibilite, leur bonne humeur et humour,
et pour tous les bon moments passes ensemble.
Je remercie Lucie Lecouflet, que j’ai eu le plaisir d’encadrer lors de ses
deux stages de BTS, pour sa gaiete et tous les bons moments que nous avons
passer ensemble.
Un grand merci a Ludovic, mon futur mari, pour ses encouragements, son
soutien indefectible et sa patience. Je le remercie d’avoir organise, en grande
partie, notre mariage, pendant que je me concentrais sur la redaction de ma
these.
Je remercie enn toutes les personnes qui m’ont encouragee et soutenue
durant ces trois annees, et notamment mes parents et mes s urs.
tel-00612159, version 1 - 28 Jul 2011Sommaire
Remerciements i
Liste des abreviations xvii
Avant-propos xix
I Introduction 1
1 Les acides ribonucleiques de transfert 3
1.1 Structure des ARNt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.1.1 Structure primaire des ARNt . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.1.2 Structure secondaire des ARNt . . . . . . . . . . . . . . 5
1.1.3 Structure tridimensionnelle des ARNt . . . . . . . . . . . 7
1.2 Fonction des ARNt dans la cellule . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1.2.1 Fonction des ARNt dans la traduction . . . . . . . . . . 10
1.2.2 Autres fonctions des ARNt . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
1.2.2.1 Les ARNt aminoacyles . . . . . . . . . . . . . . 12
Precurseurs pour la synthese d’autres aa-ARNt. . 12
Donneurs d’acides amines pour la synthese du
pont interpeptidique du peptidoglycane
bacterien. . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Leur ro^le dans la degradation des proteines. . . . 15
Donneur d’acides amines pour la modication des
lipides des membranes bacteriennes. . 16
Intermediaire dans la synthese d’antibiotique. . . 17
Leur r^ole dans la synthese des tetrapyrroles. . . . 17
1.2.2.2 Les ARNt non-aminoacyles . . . . . . . . . . . 18
Regulateurs de l’expression de certains genes. . . . 18
Ro^le catalytique dans les reaction de transpepti-
dation, aminoacylation et desacylation. 18
iii
tel-00612159, version 1 - 28 Jul 2011iv SOMMAIRE
Amorces lors de la replication inverse des retrovirus. 19
1.3 Biosynthese des ARNt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
1.3.1 Maturation des ARNt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
1.3.2 Modi