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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 50 |
Langue | English |
Poids de l'ouvrage | 1 Mo |
Extrait
AVERTISSEMENT
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http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm F a c ul t é de s S c i e nc e s e t T e c hnol og i e s
E c ol e D oc t or a l e R P 2E
T hè s e
pr é s e n t é e pour l ’ obt e n t i on du t i t r e de
D oc t e ur de l ’ U ni v e r s i t é H e nr i P oi nc a r é , N a nc y I
e n G é os c i e nc e s
P a r Z H O U X i a oba i
E t ude eexx p é rrimim e nt a le dde e qquelquesuelques ppa a ra m è t res a f f ect a nt llaa
disdis s ipa t io n desdes hyhy dro ca rbures a ro m a t iques popo ly cy cliques ( H AP )
dda a ns llaa rrhizhiz o s ph è rree dde e pplala nt es m y co rhi z é ees s
E x perim en t a l s t udy o f s o m e ppaa ra m et ers a f f ect ing popo ly cy clic
a ro m a t ic hhyy dro ca rbo ns ( P AH s ) ddisis s ipa t io n iinn t he rrhizhiz o s phere o f
mm yy coco rrhirrhi zz aa ll pplala ntnt ssmm yy coco rrhirrhi zz aa ll plapla ntnt ss
S ou t e n an c e p u b l i q u e l e 22 N ove m b r e 2010 d e van t l e j u r y:
R a ppor t e ur s : M r E r i k J O N E R , C he r c he ur , B i of or s k S oi l a nd E n v i r onm e nt , O s l o
M r T hi e r r y L E B E A U , P r of e s s e ur , U H A C ol m a r
E xa m i na t e ur s : M m e A ni s s a L O U N E S H A D J S A H R A O U I , M a î t r e de C onf é r e nc e , U ni v e r s i t é du L i t t or a l
c ôt e d' O pa l e
M m e S y l vi e D ous s e t , P r of e s s e ur , U H P N a nc y
D i r e c t r i c e de t hè s e : M m e C or i nne L E Y V A L , D i r e c t r i c e de R e c he r c he , C N R S , N a nc y
L a bor a t oi r e de s I n t e r a c t i ons M i c r oor ga ni s m e s - M i né r a ux- M a t i è r e O r ga ni que da ns l e s S ol s
U M R 7137 N a nc y U ni v e r s i t é - C N R S , F a c ul t é de s S c i e nc e s
B P 70239, 54506 V a ndoe u v r e - l e s - N a nc y , C e de x, F r a nc eRRRR emememem ercierciercierci emememem entsentsentsents
C e t r a v a i l de t hè s e a é t é r é a l i s é a u L a bor a t oi r e de s I n t e r a c t i ons M i c r o- or ga ni s m e s - M i né r a ux - M a t i è r e
or ga ni que da ns l e s s ol s ( L I M O S ) . C e m a nus c r i t e s t a i ns i l e f r ui t du t r a v a i l r é a l i s é l or s de m on doc t or a t m a i s
i l e s t é ga l e m e nt i s s u de l a pa r t i c i pa t i on de l ’ e ns e m bl e de s pe r s onne l s du L I M O S , qui c ha c un à l e ur m a ni è r e ,
on t r e ndu c e t t e t hè s e pos s i bl e .
J e t i e ns t ou t d ’ a bor d à r e m e r c i e r C or i nne L e yv a l , m a di r e c t r i c e de t hè s e , di r e c t r i c e du L I M O S , qui m ’ a
donn é l ’ oppor t uni t é de v e ni r t r a v a i l l e r à N a nc y a u s e i n de s on l a bor a t oi r e e t d ’ a ppr e ndr e t ou t e s l e s f i c e l l e s
du m é t i e r de c he r c he ur . E l l e a s u m e c ons e i l l e r e t m ’ or i e n t e r pour que j e m è ne à bi e n m e s r e c he r c he s e n m e
l a i s s a n t une gr a nde pa r t de l i be r t é e t de r e s pons a bi l i t é s .
E ns ui t e j ’ a dr e s s e un gr a nd m e r c i a ux c he r c he ur s e t e ns e i gna n t s c he r c he ur s du L I M O S a v e c qui j ’ a i e u de s
c on v e r s a t i ons e t de s c ons e i l s de qua l i t é , qui m ’ on t pe r m i s de m i e ux c e r ne r m on s uj e t e t d ’ ou v r i r de s
hor i z ons da ns d’ a u t r e s dom a i ne s de l a s c i e nc e du s ol e t de l a m i c r obi ol ogi e . T ou t d' a bor d, j e t i e ns à
r e m e r c i e r T hi e r r y B e gui r i s t a i n e t A ur é l i e C é br on pour l e ur a i de da ns l a bi ol ogi e m ol é c ul a i r e qui m ' a pe r m i s
d' a v a nc e r da ns l a c om pr é he ns i on de s c om m una ut é s ba c t é r i e nne s . J e v e ux a us s i r e m e r c i e r T hi e r r y pour s on
a i de da ns m a v i e pr a t i que . Q ua nd j ’ a i be s oi n d’ a i de , i l e s t t ou j our s l à . E ns ui t e , j e v e ux r e m e r c i e r D a v i d
B i l l e t e t H e r v é M a r m i e r , qui m ' on t a i dé e pour l ’ a na l y s e de s é c ha n t i l l ons . J e v e ux r e m e r c i e r a us s i
G e ne v i è v e e t C hr i s t i ne , qui m ' a i de nt a v e c m e s e xp é r i e nc e s s ur l e s m y c or hi z e s . P our c on t i nue r , j e v oudr a i s
r e m e r c i e r t ous l e s a u t r e s doc t or a n t s , pos t - doc s : M a r i e - P a ul e N or i ni , P a ul - O l i v i e r R e don, E m i l e B oul ou B i ,
C l a r i s s e B a l l a nd, A r s è ne S a non, B r i c e L ouv e l , N or be r t O ndo, M a l gor z a t a G r y bos , A n t oi ne J oube r t ,
I s a be l l e P a s ki e w i c z , I s a be l l e A u v r a y , R e m y A l br e c h t , V e r oni c a L a nde r os , F a bi e n L a ur e n t , C e c i l e C a upe r t ,
D j i ha d O ul dka di e t c .. I l s on t c on t r i bu é a u bon dé r oul e m e nt de c e t r a v a i l . J e t i e ns à r e m e r c i e r l e s uns e t l e s
a u t r e s pour l e ur a i de e t l e ur b onne hum e ur quot i di e nne . J e t i e ns à r e m e r c i e r C hr i s t i a n M us t i n, D om i ni que
G oe pf e r , C ha n t a l G i ns bur ge r , L a e t i t i a D e s pou y e t c . pour l e ur a i de da ns m on t r a v a i l e t m a v i e à N a nc y . D e
bonne s r e l a t i ons e t une a m bi a nc e c ha l e ur e us e da ns l e bur e a u, c ’ e s t a us s i c e qui m ’ a pe r m i s d’ e f f e c t ue r m a
t hè s e da ns l e s m e i l l e ur e s c ondi t i ons .E nf i n, j e ne pe ux t e r m i ne r s a ns r e m e r c i e r de t ou t c oe ur m e s a m i s e t m a f a m i l l e , e n pa r t i c ul i e r m e s pa r e n t s ,
pour l e ur s ou t i e n a f f e c t i f e t é c onom i que , da ns l e s bons c om m e l e s m a uv a i s m om e n t s , qui m ’ a pe r m i s de
m e ne r c e t r a v a i l à s on t e r m e . M e r c i pour t ou t v ot r e a m our !SOM M A I R E
P A G E
A B B R E V I A T I O N 10
L I S T E D E S T A B L E A U X 12
L I S T E D E S F I G U R E S 14
I n t r od u c t i on g é n é r al e 1 6
P ar t i e 1: S yn t h è s e b i b l i ogr ap h i q u e - B i b l i ogr ap h i c r e vi e w 23
1.1 D i s t r i but i on a nd t r a ns por t a t i on of P A H s on e a r t h 24
1.1.1 A t m os phe r e 24
1.1.2 W a t e r 25
1.1.3 S oi l 25
1.2 S t r uc t ur e a nd pr ope r t y of P A H s 26
1.3 T oxi c i t y of P A H s 28
1.4 P A H e x t r a c t i on a nd a s s e s s m e nt 29
1.5 P A H pol l ut e d s oi l r e m e di a t i on m e t hods 30
1.5.1 P hy s i c a l a nd c he m i c a l m e t hods 30
1.5.2 B i or e m e di a t i on 31
1.6 B i ode g r a da t i on of P A H s 32
1.6.1 P a r a m e t e r s i nf l ue nc e t he P A H s bi ode g r a da t i on i n s oi l 33
1.6.1.1 P A H m ol e c ul a r w e i g h t 33
1.6.1.2 A g i ng of P A H s 42
1.6.1.3 A r om a t i c r i ng - h y d r ox y l a t i ng di ox y ge n a s e ( P A H - R H D α ) 421.6.1.4 E nvi r onm e n t a l pa r a m e t e r s a f f e c t i ng P A H bi ode g r a da t i on 43
1.6.2 A ppr oa c he s t o i m pr ove P A H bi ode g r a da t i on i n c ont a m i na t e d 45
S i t e s
1.6.2.1 B i oa ug m e nt a t i on 45
1.6.2.2 B i os t i m ul a t i on 46
1.7 P hy t or e m e di a t i on 47
1.7.1 F a t e of P A H s i n pl a nt r hi z os ph e r e 48
1.7.1.1 P l a nt upt a ke of P A H s ( phy t o a c c um ul a t i on, phy t oe x t r a c t i on) 49
1.7.1.2 P A H r hi z ode g r a da t i on 50
1.7.1.3 P A H phy t os t a bi l i z a t i on 52
1.7.1.4 P A H phy t ovol a t i l i z a t i on 53
1.7.2 P a r a m e t e r s a f f e c t i ng P A H di s s i pa t i on i n r hi z os ph e r e 53
1.7.2.1 S oi l pa r a m e t e r s 53
1.7.2.2 P A H pr ope r t y 54
1.7.2.3 P l a nt s pe c i e s 55
1.7.2.4 S ur f a c t a nt s 58
1.7.2.5 S y m bi ot i c m i c r oor ga ni s m s 58
1.8 F a t e of P A H s i n t he r hi z os ph e r e of m y c o r r hi z a l pl a nt s 59
1.8.1 M y c or r hi z a l f ung i 59
1.8.2 T he e f f e c t of A M f ung i on phy t or e m e di a t i on 60
1.8.3 C ont r i but i on of A M f ung i t o P A H phy t or e m e di a t i on 63
1.9 O bj e c t i ve s of t he s t udy 65
P ar t i e 2: M at é r i e l e t m é t h od e s - M at e r i al an d m e t h od s 67
2.1 M a t e r i a l s 682.1.1 P l a nt pr e pa r a t i on 68
2.1.2 A M f ung i pr e pa r a t i on 68
2.1.3 P A H pol l ut e d s oi l pr e pa r a t i on 69
2.1.4 H e w i t t s ol ut i on 70
2.2 M