[inria-00386766, v1] Nouvelle méthode statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip

Salipante, Florian Et Al

Description

Manuscrit auteur, publié dans "41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux (2009)"´Nouvelle methode statistique pour l’analyse de´donnees de ChIP-chip1,3 2 3 1Florian Salipante , Christelle Reynes , Laurent Journot & Robert Sabatier1 Laboratoire de Physique Industrielle et Traitement de l’Information, EA 2415, Facult´ede Pharmacie 15 Avenue Charles Flahault BP 14491, 34093 MONTPELLIER Cedex 5,France2 MTi - Unite Inserm - Paris 7 Diderot U973, Bat Lamarck 5`eme ´etage, 35, rue H´el`eneBrion, 75205 Paris Cedex 13, FRANCE3 Institut de G´enomique Fonctionnelle du CNRS, 141, rue de la Cardonille, 34094MONTPELLIER Cedex 5, FranceR´esum´eLa m´ethode de Chromatin ImmunoPrecipitation on chip (ChIP on chip ou ChIP-chip) apour but de d´etecter les sites de fixation des prot´eines (g´en´eralement des facteurs de tran-scription) sur la mol´ecule d’ADN. L’analyse statistique des donn´ees consiste a rechercherdesr´egionsdepicssignificatifssynonymesdesitesdefixation. Lam´ethodequenousavons´elabor´ee est issue de la th´eorie des valeurs extrˆemes et particuli`erement de la m´ethodePOT (Peaks Over Threshold). Cette m´ethode consiste a` mod´eliser les donn´ees de queuesde distribution, en ne retenant que les valeurs d´epassant un certain seuil μ, elle a la par-ticularit´e de mod´eliser d’une part les intensit´es de d´epassement de seuil, mais aussi lespositions d’occurrences de ces d´epassements de seuil. Cette m´ethode va nous ...

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Manuscrit auteur, publié dans "41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux (2009)"