RemerciementsToute these, ou presque, est accompagnee de ses remerciements. Une fois n’est pas coutume,je ne derogerai pas a la regle. Il s’agira l a sans doute, du texte le plus lu de ce document... m^emesi j’ai parfois l’espoir (scienti que) qu’il n’en soit pas ainsi. J’espere que je n’oublierai personnedans ce perilleux exercice, et je m’excuse par avance aupres des malheureux ecarte de cette liste,qui ne saurait de toutes fa cons ^etre exhaustive.Avant de vous plonger dans la lecture de ce texte, notez que cette enumeration n’est absolu-ment ordonnee et que je me refuse a penser qu’un ordre puisse lui ^etre impose. La liste est doncvolontairement desordonnee et parfois redondante. Je souhaite que vous y trouviez votre nom.Certaines personnes seront peut-^etre etonnees de s’y retrouver, quelques autres se chercheronttoujours et d’autres encore ne les liront jamais alors qu’ils ont peut-^etre ete ecrits pour eux.Il est naturel de commencer par celui qui a inspire et dirige ce travail, mais plus loin quecela, appris a grandir dans le monde de la recherche. Jean-Marc Steyaert a ete mon directeurde these et plus encore mon mentor. Je commence a peine a mesurer la chance que j’ai eud’e ectuer ma these sous sa direction. Outre la profondeur rare de sa pensee scienti que, j’aidecouvert quelqu’un d’integre et sincere, qualites eminement rares et precieuses. Si j’ajoute acela son incroyable erudition et les tres bon ...
Toutethese,oupresque,estaccompagneedesesremerciements.Unefoisn’estpascoutume, jenederogeraipasalaregle.Ils’agiralasansdoute,dutexteleplusludecedocument...meˆme sij’aiparfoisl’espoir(scientique)qu’iln’ensoitpasainsi.J’esperequejen’oublieraipersonne dansceperilleuxexercice,etjem’excuseparavanceaupresdesmalheureuxecartedecetteliste, quinesauraitdetoutesfaconsˆetreexhaustive. Avantdevousplongerdanslalecturedecetexte,notezquecetteenumerationn’estabsolu-mentordonneeetquejemerefuseapenserqu’unordrepuisseluieˆtreimpose.Lalisteestdonc volontairementdesordonneeetparfoisredondante.Jesouhaitequevousytrouviezvotrenom. Certainespersonnesserontpeut-ˆetreetonneesdes’yretrouver,quelquesautressechercheront toujoursetd’autresencoreneleslirontjamaisalorsqu’ilsontpeut-eˆtreeteecritspoureux. Ilestnatureldecommencerparceluiquiainspireetdirigecetravail,maisplusloinque cela,apprisagrandirdanslemondedelarecherche.Jean-MarcSteyaertaetemondirecteur detheseetplusencoremonmentor.Jecommenceapeineamesurerlachancequej’aieu d’eectuermathesesoussadirection.Outrelaprofondeurraredesapenseescientique,j’ai decouvertquelqu’und’integreetsincere,qualiteseminementraresetprecieuses.Sij’ajoutea celasonincroyableeruditionetlestresbonmomentspassesaveclui,enparticulierpendantles conferences,plusencorequ’ungrandscientique,Jean-MarcSteyaertestungrandHomme. Jetiensaremerciertressincerementlesmembresdemonjurydethese,pourl’honneur qu’ilsm’ontaccordes.Enpremierlieu,sonpresidentChristianChorut,pourlajustessede sescommentaires,sonsoucidecoherence,maisaussilesagreablesdiscussionsquej’aipartage aveclui.Mesrapporteurs,Marie-FranceSagotpourlaprecisiondesesremarquesetl’incroyable attentionqu’elleaporteealalecturedemondocument,etPeterClotepoursoneruditionet saprofondecomprehensiondesenjeuxdenotrediscipline.Ennmesexaminateurs,Phillippe Dessenpoursonenthousiasme,sonouvertured’espritetsareellevolonteaconcilierl’Informa-tiqueetlaBiologie.ThomasSimonson,poursesprecieusesexpertisesdumodeleetsonsouci d’integrationdecesmethodesaumondedelaBiologie.AlessandraCarbone,pouravoiraccepte defairepartidemonjuryetporteunelectureattentivedecedocument. Avant de poursuivre ce texte, je tiens a appuyer mes remerciements a Peter Clote qui m’aensuiteacceuillidanssonequipeauBostonCollege.J’aipugrˆacealuieectuerunreel travailinter-disciplinairemelantlaBiologie,lesMathematiques,l’InformatiqueetlaPhysique. Maisoutrecela,jepenseaussiauxagreablesmomentspassesajouerdelamusiqueaveclui. Meprouvantunefoisdeplus,qued’excellentsmusicienssecachentparmilesscientiques.Je souhaiteennleremercierainsiquesonepouse,MarieClote,pourlagentillessedeleuracceuil etlestresbonmomentspassesenleurcompagnie. i
Remerciements
Commentpourrais-jetrouverlesmotspourremercierLaurentSchwartzdel’amitiequ’ilm’a accordee?Ilm’estpratiquementimpossiblededecrirelebienquem’ontapportenosdiscussions. Comprendrelesveritablesenjeuxdelascienceetdeceuxquilafont,trouversavoiedanscet environnemment, dicerner le vrai du faux, le bon du mal. Ces questions fondamentales, qui nous hantenttous,ontetealabasedenombreusesdenosconversations.Jenesuispascertainque sanssonaidej’auraipudigerercorrectementlesdierentesepreuvesquim’onteteimposees pendantladureedemathese.Parsoucidesobriete,jenem’etendraipasplussurtoutes les raisons pour lesquelles je souhaiterai le remercier. Je souhaite simplement a quiconque de rencontrer un jour quelqu’un comme lui. J’auraidicilementputerminermathesedansdebonnesconditionssansl’aidedeDo-minique Rossin. Il a su m’orienter et me soutenir lorsque la situation devenait critique, pour m’orirparlasuitedesouverturesquejen’auraipuimaginer.Maisc’estcertainementencore pluspourleplaisirdesdiscussionsquenousavonspartageesquejeleremercie.Jen’aipas manque,grˆacealui,d’ameliorermacultureeninformatique,jeuxvideo,bricolageoucuisine... Quedirealorsdel’aidequem’aoertKarimaAndreanienm’hebergeantuneanneeentiere, puisenm’aidantatrouverunlogementsurParis.J’aurailaencoreeutrespeudechance dem’ensortirsibiensanselle.Jen’oubliepaslestresbonmomentspassechezelle...nison excellentecuisine!JetiensparlamˆemeoccasionaremercierSamiAndreanipoursonentrain etlesmultiplesfacetiesdontilalesecret...Meˆmes’ilanalementdecidedenepassuivreune carrierescientique,jeluisouhaite(etn’endoutepas)d’atteindresesobjectifs. J’entamemaintenantleperilleuxexercicederemerciementdespersonnesquej’aieulachance derencontrerdanslesdierentslaboratoiresquej’aifrequentedurantmathese. Je remercie donc chaleureusement Michel Weinfeld et Jean-Pierre Jouannaud, les deux di-recteurssuccessifsayantdirigeleLIXaucoursdemondoctorat.Jemesouviendraittoujoursde Michel Weinfeld qui fut un des premier, sinon le premier, a m’acceuillir dans le laboratoire. Sa gentillesse,sadisponibiliteetsonhumourappreciedetous,agrandementcontribueauplaisirque j’aieuavivreencelieu.Ceplaisirs’estprolongeal’arriveedeJean-PierreJouannaud,puisque j’aipuparticulierementproterdufortsoutienqu’ilaaccordeauxdoctorant.J’aiconscience quec’estenpartiegrˆacealuiquenousbenecionsicid’undesmeilleursenvironnementpossible pourunthesard. Parlasuite,alandemaboursedethese,ilm’afallutrouverunsecondlaboratoire d’acceuilpourmesactivitesd’enseignementetderecherche.J’aiainsipartiellementmigrevers leLIAFAdirigeparJean-EricPin.Laencore,sonacceuil,sagentillesse,maisaussiledynamisme qu’ilinsueacelaboratoire,ontgrandementfalicitemonintegration.Jedoisavouerquele lieuetl’ambianceysontsiagreablequej’hesitesouvent,quandj’enaileloisir,amerendrea Chevaleret ou a Palaiseau. MatheseauraitcertainementeteradicalementdierentesansmarencontreavecBehshad Behzadi.Commentaurais-jepumedouterqu’undemespremiersetudiants(TDd’algorithmique al’X)allaitbrulertouteslesetapes,pourdevenirunanplustardmonpremierco-auteur?Il n’enrestepasmoinsquej’aieuunplaisirenormeatravailleraveclui,etqu’ilestdevenudepuis un de mes plus proches amis. Outre sa grande intelligence, il est aussi un des principal animateur duLIX.J’esperequenousparviendronsaprolongerunjourl’aventure,etl’ambiance,entamees ici. Ils’enestfalludetrespeupourqu’ilnenissesatheseavantmoi!Malgrecettepetite frayeur,jen’aipassequedetresbonmomentsavecArnaudDartois.QuecesoitaRome,Nice ou Paris! AjoutantencorealadiversiteculturelleduLIX,SimonBliudzeetDmitriLebedev,ne manquentpasd’apporterlarusstouchanotreequipedethesards.Nousavonseugrˆacea euxlapreuvequel’artdelafˆeten’estpasqu’unespecialitefrancaise.Jeleurdoisatouslesdeux ii