Thèse présentée pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Louis Pasteur

Adrien Eberlin

Description

Niveau: Supérieur

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Thèse présentée pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Louis Pasteur Strasbourg I Discipline : Sciences du vivant Spécialité : Aspects Moléculaires et Cellulaires de la Biologie Par Adrien EBERLIN Caractérisation d'une conformation de la queue N-terminale de l'histone H3 modifiée en mitose et Étude des modifications post-traductionnelles du facteur de transcription TAF10 : deux mécanismes impliqués dans la régulation de l'expression des gènes Soutenue publiquement le 9 Novembre 2007 Membres du jury : Directeur de thèse : Dr László TORA, IGBMC, Illkirch Rapporteur Interne : Dr Régine LOSSON, IGBMC, Illkirch Rapporteur Externe : Dr Annick HAREL-BELLAN, Institut A Lwoff, Villejuif Rapporteur Externe : Dr Didier TROUCHE, LBME, Toulouse Examinateur : Pr Stéphane VIVILLE, IGBMC, Illkirch

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Sujets

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Informations

• Publié par: profil-nechor-2012
• Publié le: 01 novembre 2007
• Nombre de lectures: 62
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 8 Mo

Extrait

Thèse présentée pour obtenir le grade de
Docteur de l’Université Louis Pasteur
Strasbourg I


Discipline : Sciences du vivant
Spécialité : Aspects Moléculaires et Cellulaires de la Biologie

Par Adrien EBERLIN


Caractérisation d’une conformation de la queue
N-terminale de l’histone H3 modifiée en mitose
et Étude des modifications post-traductionnelles
du facteur de transcription TAF10 : deux
mécanismes impliqués dans la régulation de
l’expression des gènes



Soutenue publiquement le 9 Novembre 2007


Membres du jury :

Directeur de thèse : Dr László TORA, IGBMC, Illkirch
Rapporteur Interne : Dr Régine LOSSON
Rapporteur Externe : Dr Annick HAREL-BELLAN, Institut A Lwoff, Villejuif Dr Didier TROUCHE, LBME, Toulouse
Examinateur : Pr Stéphane VIVILLE, IGBMC, Illkirch REMERCIEMENTS
___________________________________________________________________________
REMERCIEMENTS

Je tiens tout d’abord à remercier le Dr László Tora de m’avoir accueilli dans son
équipe dès la sortie de ma maîtrise et de m’avoir permis d’y effectuer également ma thèse.
Merci aussi pour sa disponibilité, ses conseils et son soutien lorsque les résultats se faisaient
attendre.

Je remercie les membres du jury, le Dr Annick Harel-Bellan, le Dr Régine Losson, le
Dr Didier Trouche et le Pr Stéphane Viville d’avoir accepté de juger mon travail de thèse.

Merci à toutes les personnes qui ont contribué de près ou de loin à ce travail de thèse :
Merci Eli pour ton aide notamment sur le sujet TAF10 mais surtout pour m’avoir
guidé durant les premiers jours au laboratoire, pour ta bonne humeur quotidienne, pour nos
discussions sur le cinéma (on ne peut pas toujours parler de science !), bref pour ton immense
contribution au bon fonctionnement et à la bonne ambiance du labo.
Mille mercis Maria-Elena pour toute l’aide que tu m’as apporté en si peu de temps que
tu es parmi nous. Merci aussi d’avoir osé te lancer dans une lecture critique de ce long
manuscrit.
Merci beaucoup Manuela pour tout ce temps que tu as passé sur les expériences de
spectrométrie de masse sur TAF10. Merci pour ta patience, pour ton aide, et pour ton soutien.
Merci à mon homonyme, Pascal Eberling, pour avoir toujours pris mes commandes de
peptides avec le sourire. « Quand y en a plus, y en a encore ! ».
Merci Pascal (Kessler cette fois-ci) et Marc du service imagerie pour leur sympathie et
leur aide sur les expériences de microscopie confocale et de Time lapse.
Merci Didier pour avoir eu le courage de lire ce manuscrit et pour les conseils que tu
m’as donnés.
Merci Flavie pour l’aide que tu m’as apporté sur le sujet 51TA2H12.
Merci à nos collaborateurs qui ont participé au projet 51TA2H12 : Cédric, le Dr
Annick DeJaegere, le Dr Roland Stote, le Dr Danièle Spehner, le Dr Patrick Schultz, le Dr
Jean-Marie Würtz et le Dr Mustapha Oulad-Abdelghani.

Merci aussi à tous les autres membres passés et présents de l’équipe Tora :
Merci Laure d’avoir réussi à supporter mes taquineries quasi quotidiennes sans
m’avoir obligé à faire un tour à la médecine du travail.
1REMERCIEMENTS
___________________________________________________________________________
Thanks Emese for your kindness, your frankness and your patience when we talk in
french. Stay yourself !
Merci Tonie pour la bonne humeur que tu as apportée au labo le temps de ton DEA.
Merci aussi pour la petite info sur TFIIC !
Merci à Mattia pour avoir répondu à mes questions et pour son soutien lorsqu’il fallait
embêter notre très chère collègue.
Thanks Bill, Máté, Zita, Meritxell. Merci Sara, Nathalie, Arnaud, Guillaume, Céline et
Jacques.

Merci à toutes ces personnes de l’institut avec lesquelles j’ai pu partager quelques
discussions scientifiques ou non, ou quelques repas au restaurant universitaire : Marielle,
Johan, Konstantin, Florence, Philippe, Anas, Lucas, Rafaella, Emilie, Gabrielle, Pierre et tous
ceux que j’ai pu oublier.
Merci aussi à Maïté et Hélène pour leurs encouragements (notamment pour les petits
chocolats lors de l’écriture de la thèse à la bibliothèque) mais aussi pour leur gentillesse tout
au long de l’année. Merci encore à Maïté pour son aide dans l’impression de ce manuscrit.

Merci à tous mes amis qui m’ont permis de m’aérer l’esprit quand je n’étais pas au
laboratoire et qui ont parfois du subir quelques monologues scientifiques toutefois bien vite
interrompus. Merci donc à Fab, Laety, Matteo, Phil, Marie, Seb, Laurence, Lolo, Gilbert,
Khaly, Anne-So, Klara, Lionel, Youri, Martin, Eva, Mélanie, Gaëlle, Louis, Christelle, Seb et
pardon à ceux que j’aurai oublié ici.

Merci à toute ma famille et plus particulièrement à toi papa et à toi maman qui m’avez
toujours encouragé dans cette voie sans jamais m’y pousser. Sans vous, je ne serai pas là
(biologiquement, ça tient la route puisque vous êtes mes parents !).

Mes derniers remerciements, et non des moindres, iront à ma fille et à ma femme, sans
lesquelles tout cela n’aurait aucun sens. Merci Olivia pour tous ces moments de bonheur que
tu nous offres depuis maintenant près d’un an, pour ces sourires du matin qui m’ont toujours
mis du beaume au cœur pour aller travailler et pour ceux du soir qui m’ont souvent fait
oublier la fatigue et les soucis d’une journée au laboratoire. Merci enfin à toi Monika d’avoir
été à l’écoute toutes ces années, d’avoir été patiente lorsque les expériences ratées
déteignaient sur mon humeur, de m’avoir toujours encouragé, et de m’avoir autant facilité les
choses notamment durant ces trois derniers longs mois. Merci infiniment.
2AVANT-PROPOS
___________________________________________________________________________



AVANT-PROPOS


Ce manuscrit sera divisé en trois parties distinctes, la première introduisant les notions
de biologie moléculaire et cellulaire auxquelles font référence les deux autres parties portant
sur les deux projets majeurs qui ont constitué mon travail de thèse.
Le premier de ces projets reposait sur l’identification de modifications post-
traductionnelles de la sous-unité TAF10 (pour TBP Associated Factor) et de leurs variations
en fonction du cycle cellulaire et du complexe dans lequel se trouve la sous-unité, le facteur
général de transcription TFIID ou le facteur TFTC (pour TBP-Free TAF-Containing
complex). Ces travaux démontrent l’existence de nombreuses modifications touchant la sous-
unité TAF10 et leur variation selon, notamment, le cycle cellulaire. Par ailleurs, c’est au cours
de ces recherches qu’un anticorps dirigé contre une forme diméthylée de TAF10 a été
synthétisé et s’est finalement avéré reconnaître l’histone H3 en mitose.
La caractérisation de ce nouvel anticorps a conduit au deuxième projet qui fut consacré
à la détermination d’une conformation particulière que la queue N-terminale de l’histone H3,
à la fois diméthylée en lysine 9 et phosphorylée en sérine 10, adopte en mitose. C’est sur cette
étude que s’est orientée la plus grande partie de mes recherches au cours de mon doctorat et
c’est donc celle qui sera la plus détaillée dans ce manuscrit. Les résultats expérimentaux ainsi
obtenus comprennent un manuscrit de publication récemment soumis pour publication et
actuellement en révision.
Dans un souci de clarté, la section « matériel et méthodes » ainsi que la discussion et
les perspectives de chacune de ces études figureront à la suite des résultats au sein de leur
partie respective.
3
4SOMMAIRE
___________________________________________________________________________
SOMMAIRE


REMERCIEMENTS...........................................................................1

AVANT-PROPOS...............................................................................3

SOMMAIRE........................................................................................5

LISTES DES FIGURES ET TABLEAUX......................................11

LISTE DES ABREVIATIONS ET ACRONYMES ......................13

INTRODUCTION.............................................................................19
I. LA REGULATION DE L’EXPRESSION DES GENES OU COMMENT
L’INFORMATION GENETIQUE EST MODULEE POUR S’ADAPTER AUX
BESOINS DE LA CELLULE ............................................................................................... 19